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Lipidmetabolische Mechanismen EMT/ZEB1-abhängiger Ferroptose

Lipid metabolic mechanisms in EMT/ZEB1-dependent ferroptosis

Andreas Koeberle (ORCID: 0000-0001-6269-5088)
  • Grant-DOI 10.55776/P36299
  • Bewilligungs­summe Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projekt­beginn 01.02.2023
  • Projektende 31.01.2027
  • Bewilligungs­summe 385.140 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)

Keywords

  • Lipid,
  • Ferroptosis,
  • Cell Death,
  • Metabolism,
  • Lipidomics,
  • Pharmacology
Abstract

Das Zelltodprogramm Ferroptose schädigt Phospholipide oxidativ und verändert dadurch die Membranarchitektur. Um Ferroptose einzugrenzen, werden in zellulären Membranen die leicht (per)oxidierbaren mehrfach- und die weniger empfindlichen einfachungesättigten Fettsäuren im Gleichgewicht gehalten. Jüngste Erkenntnisse deuten darauf hin, dass die epitheliale-mesenchymale Transition (EMT) Krebszellen anfälliger für Ferroptose macht. Dieser Befund ist von hoher therapeutischer Relevanz, da Krebszellen sich des embryonalen Programms der EMT bedienen, um zu metastasieren, der Immunüberwachung zu entgehen und Resistenzen zu entwickeln. Die Induktion von Ferroptose in Krebszellen gilt daher als vielversprechende Strategie zur Bekämpfung von aggressivem, metastasierendem Krebs. Warum EMT die Zellen gegenüber Ferroptose sensitiviert, ist weitgehend unbekannt. Vor kurzem konnten wir zeigen, dass bestimmte EMT-Transkriptionsfaktoren den Fettsäure- und Phospholipidstoffwechsel umprogrammieren, die Fettsäurezusammensetzung von Membranen grundlegend verändern und die Krebszellen gegenüber Ferroptose sensibilisieren. Durch kombinierte Lipidom- und Transkriptomanalysen konnten wir sechs potentielle Stoffwechselwege identifiziert, die wir nun funktionell untersuchen. Diese Wege werden genetisch oder pharmakologisch manipuliert und der Stoffwechselfluss durch sie hindurch verfolgt. Wir klären, ob eine Regulation dieser Signalwege für die nach EMT gesteigerte Ferroptosesensitivität verantwortlich ist. Außerdem suchen wir nach bioaktiven Lipidspezies und erforschen, ob ein Eingriff in ihre Biosynthese dabei hilft, Tumorresistenzen zu überwinden. Wir machen uns die jüngsten Fortschritte in der differentiellen Ionenmobilitätsspektrometrie zunutze, um zwischen isobaren Lipiden (mit derselben nominalen Masse) zu unterscheiden, und analysieren ein breites Spektrum an Membranlipiden sowie tumor- und immunmodulatorischen Signallipiden. Kinetische Aspekte und die subzelluläre Lokalisation von Lipiden werden geprüft, insbesondere ob bestimmte Schwellenwerte oder Pulse an einzelnen Lipidspezies erforderlich sind, um den ferroptotischen Zelltod auszulösen. Auch greifen wir auf Modellsysteme unterschiedlicher Komplexität zurück und berücksichtigen die Heterogenität von Tumoren. Herangezogen werden i) vier Krebszelllinien unterschiedlichen Ursprungs, ii) Brustkrebszelllinien, die in genetischem Hintergrund, Ferroptose-Sensitivität und erworbenen Resistenzen variieren, iii) aus Tumoren gewonnene Bauchspeicheldrüsenkrebs-Zelllinien, iv) und ein Mausmodell zu metastasierendem Bauchspeicheldrüsenkrebs. Wir erwarten von diesem Projekt grundlegende Einblicke in die Mechanismen der Therapieresistenz und Hinweise auf mögliche pharmakologische Strategien, um die aggressive Fraktion metastasierender Krebszellen vom Mesenchym-Typ zu bekämpfen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Simone Brabletz, Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg - Deutschland
  • Thomas Brabletz, Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg - Deutschland

Research Output

  • 414 Zitationen
  • 19 Publikationen
  • 10 Datasets & Models
  • 7 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2026
    Titel NMR-Guided Discovery of Luvunga D: A Novel Propellane-Type Limonoid from Luvunga scandens That Functions as a Non-Classical Ferroptosis Inhibitor.
    DOI 10.3390/antiox15030402
    Typ Journal Article
    Autor Bui Hm
    Journal Antioxidants (Basel, Switzerland)
  • 2026
    Titel Chronic enteritis triggered by diet westernization is driven by epithelial ATG16L1-mediated autophagy.
    DOI 10.1080/15548627.2025.2600906
    Typ Journal Article
    Autor Mayr L
    Journal Autophagy
    Seiten 391-408
  • 2026
    Titel Aging-associated decline of phosphatidylcholine synthesis is a malleable trigger of natural mitochondrial aging.
    DOI 10.1038/s41467-026-71508-7
    Typ Journal Article
    Autor Li Y
    Journal Nature communications
  • 2024
    Titel Development of a Synthetic Platform for Ent-Pimaranes Reveals their Potential as Novel Non-Redox Active Ferroptosis Inhibitors
    DOI 10.1002/chem.202403811
    Typ Journal Article
    Autor Plangger I
    Journal Chemistry – A European Journal
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Iron(III)-salophene catalyzes redox cycles that induce phospholipid peroxidation and deplete cancer cells of ferroptosis-protecting cofactors
    DOI 10.1016/j.redox.2024.103257
    Typ Journal Article
    Autor Su F
    Journal Redox Biology
    Seiten 103257
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Zeb1 mediates EMT/plasticity-associated ferroptosis sensitivity in cancer cells by regulating lipogenic enzyme expression and phospholipid composition
    DOI 10.1038/s41556-024-01464-1
    Typ Journal Article
    Autor Schwab A
    Journal Nature Cell Biology
    Seiten 1470-1481
    Link Publikation
  • 2023
    Titel a-Tocopherol-13'-Carboxychromanol Induces Cell Cycle Arrest and Cell Death by Inhibiting the SREBP1-SCD1 Axis and Causing Imbalance in Lipid Desaturation
    DOI 10.3390/ijms24119229
    Typ Journal Article
    Autor Liao S
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 9229
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Reorganization of innate immune cell lipid profiles by bioinspired meroterpenoids to limit inflammation
    DOI 10.1101/2024.05.24.595516
    Typ Preprint
    Autor Waltl L
    Seiten 2024.05.24.595516
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Regulation and targeting of SREBP-1 in hepatocellular carcinoma
    DOI 10.1007/s10555-023-10156-5
    Typ Journal Article
    Autor Su F
    Journal Cancer and Metastasis Reviews
    Seiten 673-708
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Metabolic stress sensing by epithelial RXRa links westernization of diet with Crohn’s disease
    DOI 10.1016/j.cmet.2025.11.008
    Typ Journal Article
    Autor Meyer M
    Journal Cell Metabolism
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Attenuated growth factor signaling during cell death initiation sensitizes membranes towards peroxidation.
    DOI 10.1038/s41467-025-56711-2
    Typ Journal Article
    Autor Gollowitzer A
    Journal Nature communications
    Seiten 1774
  • 2025
    Titel Host-specific platelet-activating factor acetylhydrolase selectively remodels diacylglycerophospholipids to control schistosome development
    DOI 10.1101/2025.04.16.649075
    Typ Preprint
    Autor Ertl J
    Seiten 2025.04.16.649075
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Mediterranean diet component oleic acid decreases systemic impact of periodontal Porphyromonas gingivalis-infection in age: addressing role of stress resistance and microbiome
    DOI 10.1038/s41514-025-00248-7
    Typ Journal Article
    Autor Döding A
    Journal npj Aging
    Seiten 54
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Loss of apolipoprotein E contributes to inflammatory macrophage activation and ferroptosis in NSAID-exacerbated respiratory disease
    DOI 10.1016/j.jaci.2025.06.010
    Typ Journal Article
    Autor Schmiz G
    Journal Journal of Allergy and Clinical Immunology
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Alkylglycerol monooxygenase represses prostanoid biosynthesis in a sex-dependent manner
    DOI 10.1186/s13578-025-01419-5
    Typ Journal Article
    Autor Rao Z
    Journal Cell & Bioscience
    Seiten 80
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Reducing the metabolic burden of rRNA synthesis promotes healthy longevity in Caenorhabditis elegans
    DOI 10.1038/s41467-024-46037-w
    Typ Journal Article
    Autor Sharifi S
    Journal Nature Communications
    Seiten 1702
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Ferroptosis-modulating small molecules for targeting drug-resistant cancer: Challenges and opportunities in manipulating redox signaling
    DOI 10.1002/med.21933
    Typ Journal Article
    Autor Koeberle S
    Journal Medicinal Research Reviews
    Seiten 614-682
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The MTORC1-AHR pathway sustains translation and autophagy in tumours under tryptophan stress
    DOI 10.1101/2023.01.16.523931
    Typ Preprint
    Autor Holfelder P
    Seiten 2023.01.16.523931
    Link Publikation
  • 2026
    Titel Context-dependent Activities of Mitrephorone Link Lipid Redirection, Anti-inflammatory Action, and Ferroptosis Control to Hepatocyte Protection.
    DOI 10.7150/thno.127100
    Typ Journal Article
    Autor Waltl L
    Journal Theranostics
    Seiten 5406-5439
Datasets & Models
  • 2026
    Titel Modulation of cellular lipid profiles and lipid mediator biosynthesis by natural and bioinspired compounds
    DOI 10.21228/m8vn9m
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
  • 2026
    Titel Declining phosphatidylcholine synthesis drives mitochondrial dysfunction during aging
    DOI 10.21228/m83k12
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
  • 2025 Link
    Titel Regulation of the stress proteome by SCD1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2025 Link
    Titel PUFA supplementation-dependent incorporation of ω-3 and ω-6 fatty acids into phospholipids and triglycerides in the intestinal epithelium of Gpx4⁺/⁻IEC mice on a Western diet
    DOI 10.5281/zenodo.17775130
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2025 Link
    Titel Alkyglycerol monooxygenase represses prostanoid biosynthesis in a sex-dependent manner
    DOI 10.21228/m8j53q
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2025
    Titel Alkyglycerol monooxygenase represses prostanoid biosynthesis in a sex-dependent manner
    DOI 10.21228/m8j53q
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
  • 2025
    Titel Changes in phospholipid fatty acid composition under cytotoxic stress facilitate peroxidation
    DOI 10.21228/m8pr7b
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
  • 2025
    Titel Impact of stress-regulated growth factor signaling on lipidomic profiles
    DOI 10.48323/22gty-xjr51
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
  • 2024
    Titel Zeb1-mediated control of the phospholipid PUFA/MUFA ratio in EMT/plasticity-associated 1 cancer cell ferroptosis
    DOI 10.21228/m85238
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
  • 2024
    Titel Iron(III)-salophene catalyzes redox cycles that induce phospholipid peroxidation and deplete cancer cells of ferroptosis-protecting cofactors
    DOI 10.21228/m8423z
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2026
    Titel Seminar Series at Boehringer Ingelheim
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2025
    Titel JOINT EUFEPS - ÖPhG MEETING
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2025
    Titel DocDay of the Insitute of Pharmaceutical Sciences / University of Graz - Award for the best oral presentation
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2025
    Titel International SPP 2306 Meeting
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2025
    Titel PRC Webinar Series
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2025
    Titel Lipidomics Forum 2025
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Annual symposium of the Austrian Proteomics and Metabolomics Association
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad National (any country)

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