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Festkörper und Flüssig-NMR biomolekularer Metallkomplexe

Solids and liquids NMR of biological metal complexes

Wolfgang Schöfberger (ORCID: 0000-0002-8055-8906)
  • Grant-DOI 10.55776/P18384
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 02.01.2006
  • Projektende 01.01.2011
  • Bewilligungssumme 315.792 €
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Chemie (60%); Physik, Astronomie (40%)

Keywords

    Nuclear magnetic resonance spectroscopy, Nucleic acid oligoplexes, Quadrupolar nuclei, Porhyrinoids, Paramagnetic nuclei, Telomers

Abstract Endbericht

Metallionen wie z.B Natrium, Magnesium, Zink oder Cobalt sind wichtige Kofaktoren in Enzymen oder Nukleinsäuren. Die Metallionen spielen hierbei eine bedeutende Rolle in der Strukturgebung sowie während Katalysevorgängen. Neben Platin wird mit einer Vielzahl von anderen Metallen (z.B. Cu, Co, Zn, Ni, Mn oder Erdalkalimetallen) gearbeitet, zum einen aufgrund der jeweiligen biologischen Funktion der Metalle, zum anderen da sie spezielle spektroskopische Methoden erlauben. Das Ziel dieses Projektantrages soll die Beschreibung der Metall-Ligand Wechselwirkungen in porphyrinartigen Verbindungen und RNA/DNA quadruplex/duplex Systemen mit Hilfe von Festkörper- und Flüssig-NMR Methoden sein. Dipolare Wechselwirkungen in Verbindung mit quadrupolaren bzw. paramagnetischen Wechselwirkungen können zur Distanzmessung herangezogen werden. Klassische NOE-Spektroskopie und "through the bond heteronuclear correlation" können zur Messung von Distanzen zwischen spin-1/2 Kernen verwendet werden. Diese Methoden sind aber nur sehr limitiert zur Beschreibung von quadrupolaren Kernen (spin>1/2) oder paramagnetischen Systemen anwendbar. In paramagnetischen Systemen kann die Pseudo-Kontakt Shift, Relaxations Enhancement und die kreuzkorrelierte Curie-Spin Relaxation Strukturinformationen in flüssiger Phase liefern. Bereits erste vielversprechende Resultate zur Beschreibung von Metall-Ligand Wechselwirkungen mittels Festkörper NMR Spektroskopie wurden vom Projektantraeger erzielt. Neue Multiple Quantum Magic Angle Spinning Recoupling (MQMAS-REDOR) Techniken ermöglichen nun im Festkoerper Distanzen zwischen Metallionen mit quadrupolarem Spin (spin>1/2, e.g. 23Na, 25Mg, 67Zn, 51V, 59Co) zu Spin-1/2 Kernen ( 1 H, 15N, 31P, 13C) in größeren, biologisch interessanten Verbindungsklassen, zu messen. Die unterschiedlichen Bindungsstellen der Metallionen soll zusätzlich mit der bereits sehr gut bekannten Multiple Quantum Coherence Spectroscopy (MQMAS) im Festkörper durchgeführt werden. Zusätzlich sollen Konformationsuntersuchungen an RNA bzw. DNA-quadruplex/duplex Systemen, anhand der Änderung der Chemical Shift Anistropy (CSA), durchgeführt werden. Kooperationen werden im Rahmen dieses Projektantrages mit dem Chemistry Department an der New York University und dem New York Structural Biology Center angestrebt. Weiters wird eine neue Kooperation zum "Department of Molecular Biology" an der "Unversity of South Bohemia" in Budweis aufgebaut, um in Zusammenarbeit die RNA bzw. DNA quadruplex/duplex Syteme darzustellen. Die für das Projekt weiters notwendigen prophyrinoiden Systeme werden an der Johannes Kepler Unversität Linz synthetisiert. Ab-initio Rechnungen werden an der Johannes Kepler Universität Linz durchgeführt, um die berechneten mit den experimentellen Parameter zu vergleichen.

In Bezug auf ihre funktionellen Eigenschaften lassen sich Porphyrine in zwei Gruppen einteilen. Die erste Gruppe zeichnet sich dadurch aus, dass die Substanzen auf Grund ihres Porphyrin Grundgerüsts bevorzugt in Tumorzellen aufgenommen werden ohne dass eine vorherige Aktivierung des entsprechenden Porphyrins stattfinden muss. Durch die Interaktion mit nukleärer DNA der Tumorzelle wird programmierter Zelltod induziert, was zu einer Inhibierung des Tumorzellwachstums führt. Neben dem apoptotischen Zelltod der mit der Aktivierung von proteolytischen Enzymen, den Caspasen, einhergeht, sind eine Reihe alternativer Formen des caspase- unabhängigen programmierten Zelltods wie Paraptose oder Autophagie bekannt. An der Ausführung des Zelltodprogramms sind verschiedene Organellen, wie z.B. die Mitochondrien, Lysosomen und das Endoplasmatische Reticulum beteiligt. Durch das Einfügen verschiedenartiger meso- Substituenten kann sowohl das Eindringen, als auch die Lokalisation der Porphyrine in den Tumorzellen beeinflusst werden. Zur zweiten Substanzklasse gehören Photosensibilisatoren, welche in der Photodynamischen Therapie (PDT) eingesetzt werden. In der klinischen Onkologie wird die PDT seit über 25 Jahren eingesetzt. Nach Aktivierung durch Licht passender Wellenlänge setzen diese Photosensibilisatoren reaktive Sauerstoffspezies frei die in der Folge Tumorgewebe zerstören. Die Applikation des Photosensibilisators ist üblicherweise systemisch, durch die präzise Aktivierung mittels Bestrahlung kann man allerdings eher von einer lokalen Anwendung sprechen. Obwohl sich einige Substanzen in der klinischen Praxis im Einsatz befinden, gibt es nur wenige Porphyrine, die vollständig wasserlöslich sind und eine Anregungswellenlänge nahe dem infraroten Wellenlängenbereich besitzen. Hauptziel des vorliegenden Projekts ist die Weiterentwicklung und Charakterisierung neuartiger wasserlöslicher Porphyrin- und Corrol- Komplexe und die detaillierte Untersuchung der Wirkungsweise auf neuroendokrine Tumore und Melanome. Im Projekt (FWF-P18384; "Festkörper und Flüssig- NMR biomolekularer Metallkomplexe) wurden Porphyrinderivate synthetisiert, charakterisiert und deren Interaktionen mit DNA mittels Kernresonanzspektroskopie (NMR) und Circulardichroismus Spektroskopie (CD) bestimmt. Die wachstumshemmende Wirkung auf Dünndarmkarzinom Zelllinien (neuroendokrine SI-NET) und Schilddrüsenkarzinom Zelllinien (MTC-SK) wurde untersucht und in ersten Versuchen konnten selektive antiproliferative Effekte an den entsprechenden Zelllinien nachgewiesen werden. Jedoch ist noch wenig darüber bekannt, welche Porphyrin induzierten Mechanismen zu einer Aktivierung eines spezifischen Zelltodprogramms führen. Die Wirkmechanismen der verschiedenen Porphyrine auf SI-NET- und MTC-Zelllinien bzw. maligne Tumore müssen deshalb noch näher untersucht werden. Die Ergebnisse wurden zuerst in einem Patent zusammengefasst und als Europäisches Patent angemeldet (EP- 09003727-6-2117): Erfinder: Martin Haeubl, Bernhard Svejda, Roswitha Pfragner, Norbert Mueller, Wolfgang Schoefberger). Danach wurde die Arbeit mit dem Titel "Asymmetrically substituted cationic indole- and fluorene porphyrins inhibit tumor proliferation in small intestinal neuroendocrine tumors and medullary thyroid carcinomas" erfolgreich im European Journal of Medicinal Chemistry publiziert. Weiters wurde die Arbeit mit dem Titel "DNA- Interactions and Photocatalytic Strand Cleavage by Artificial Nucleases based on Water-Soluble Gold(III) Porphyrins" in der Fachzeitschrift Journal of Biological Inorganic Chemistry publiziert. Resultierend aus der sehr erfolgreichen Zusammenarbeit mit Frau Prof. Dr. Roswitha Pfragner (MedUni Graz) wurde ein FWF- Folgeprojektantrag verfasst und wird im April 2011 neu eingereicht. In Kooperation mit Dr. Stefan Müllegger vom Institut der Festkörperphysik an der JKU-Linz wurden "Scanning Tunneling Microscopy" (STM) Untersuchungen und quantenmechanische Rechnungen durchgeführt um mechanistische Details der Reaktivität der Goldporphyrine zu klären. Aus dieser Arbeit entstanden Publikationen mit dem Titel "Spectroscopic STM Studies of Single Gold(III) Porphyrin Molecules" und "Asymmetric saddling of single porphyrin molecules on Au(111)" und wurden in der Fachzeitschrift Journal of the American Chemical Society und Physical Review B veröffentlicht.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Lukas Trantirek, University of South Bohemia - Tschechien
  • Alexej Jerschow, New York University - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 473 Zitationen
  • 20 Publikationen
Publikationen
  • 2018
    Titel Single-molecule chemical reduction induced by low-temperature scanning tunneling microscopy: A case study of gold-porphyrin on Au(111)
    DOI 10.1016/j.susc.2018.04.018
    Typ Journal Article
    Autor Müllegger S
    Journal Surface Science
    Seiten 157-162
  • 2013
    Titel Water-soluble metalated and non-metalated A2B- and A3-corrole/amino acid conjugates: syntheses, characterization and properties
    DOI 10.1002/aoc.2992
    Typ Journal Article
    Autor Schmidlehner M
    Journal Applied Organometallic Chemistry
    Seiten 395-405
  • 2011
    Titel Asymmetric saddling of single porphyrin molecules on Au(111)
    DOI 10.1103/physrevb.83.165416
    Typ Journal Article
    Autor Müllegger S
    Journal Physical Review B
    Seiten 165416
  • 2011
    Titel Backbone assignment and secondary structure of the PsbQ protein from Photosystem II
    DOI 10.1007/s12104-011-9293-6
    Typ Journal Article
    Autor Hornicáková M
    Journal Biomolecular NMR Assignments
    Seiten 169-175
  • 2011
    Titel Preserving Charge and Oxidation State of Au(III) Ions in an Agent-Functionalized Nanocrystal Model System
    DOI 10.1021/nn201708c
    Typ Journal Article
    Autor Mu¨Llegger S
    Journal ACS Nano
    Seiten 6480-6486
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Spectroscopic Scanning Tunneling Microscopy Studies of Single Surface-Supported Free-Base Corroles
    DOI 10.1021/ja209225f
    Typ Journal Article
    Autor Rashidi M
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 91-94
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Synthesis and Characterization of a Stable Bismuth(III) A3–Corrole
    DOI 10.1021/ic200840m
    Typ Journal Article
    Autor Reith L
    Journal Inorganic Chemistry
    Seiten 6788-6797
  • 2009
    Titel Characterization of the sodium binding sites in microcrystalline ATP by 23Na-solid-state NMR and ab initio calculations
    DOI 10.1016/j.ica.2008.05.030
    Typ Journal Article
    Autor Nausner M
    Journal Inorganica Chimica Acta
    Seiten 1071-1077
  • 2009
    Titel Spectroscopic STM Studies of Single Gold(III) Porphyrin Molecules
    DOI 10.1021/ja908157j
    Typ Journal Article
    Autor Mu¨Llegger S
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 17740-17741
  • 2007
    Titel Homonuclear long-range correlation spectra from HMBC experiments by covariance processing
    DOI 10.1002/mrc.2013
    Typ Journal Article
    Autor Schoefberger W
    Journal Magnetic Resonance in Chemistry
    Seiten 583-589
  • 2011
    Titel A water soluble tri-cationic porphyrin–EDTA conjugate induces apoptosis in human neuroendocrine tumor cell lines
    DOI 10.1016/j.bioorg.2011.09.006
    Typ Journal Article
    Autor Schwach G
    Journal Bioorganic Chemistry
    Seiten 108-113
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Electronic spectra and photochemical reactivity of bismuth corrole complexes
    DOI 10.1016/j.jphotochem.2011.01.008
    Typ Journal Article
    Autor Reith L
    Journal Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry
    Seiten 247-253
  • 2012
    Titel BiIII–Corroles: A Versatile Platform for the Synthesis of Functionalized Corroles
    DOI 10.1002/ejic.201200697
    Typ Journal Article
    Autor Reith L
    Journal European Journal of Inorganic Chemistry
    Seiten 4342-4349
  • 2011
    Titel Suzuki–Miyaura cross-coupling reaction on copper-trans-A2B corroles with excellent functional group tolerance
    DOI 10.1016/j.tet.2011.04.024
    Typ Journal Article
    Autor König M
    Journal Tetrahedron
    Seiten 4243-4252
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Determination of 3J(1H3'?31P) couplings in a DNA oligomer with enhanced sensitivity employing a constant-time TOCSY difference experiment
    DOI 10.1002/mrc.2729
    Typ Journal Article
    Autor Reith L
    Journal Magnetic Resonance in Chemistry
    Seiten 125-128
  • 2010
    Titel Lead corrole complexes in solution: Powerful multielectron transfer reagents for redox catalysis
    DOI 10.1016/j.inoche.2010.06.047
    Typ Journal Article
    Autor Schöfberger W
    Journal Inorganic Chemistry Communications
    Seiten 1187-1190
  • 2009
    Titel DNA interactions and photocatalytic strand cleavage by artificial nucleases based on water-soluble gold(III) porphyrins
    DOI 10.1007/s00775-009-0547-z
    Typ Journal Article
    Autor Haeubl M
    Journal JBIC Journal of Biological Inorganic Chemistry
    Seiten 1037-1052
  • 2009
    Titel Asymmetrically substituted cationic indole- and fluorene porphyrins inhibit tumor proliferation in small intestinal neuroendocrine tumors and medullary thyroid carcinomas
    DOI 10.1016/j.ejmech.2009.11.025
    Typ Journal Article
    Autor Haeubl M
    Journal European Journal of Medicinal Chemistry
    Seiten 760-773
  • 2009
    Titel Proisocrinins A-F, Brominated Anthraquinone Pigments from the Stalked Crinoid Proisocrinus ruberrimus
    DOI 10.1021/np900171h
    Typ Journal Article
    Autor Wolkenstein K
    Journal Journal of Natural Products
    Seiten 2036-2039
  • 2009
    Titel Conformation of Receptor Adopted upon Interaction with Virus Revealed by Site-Specific Fluorescence Quenchers and FRET Analysis
    DOI 10.1021/ja807917t
    Typ Journal Article
    Autor Wruss J
    Journal Journal of the American Chemical Society
    Seiten 5478-5482

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