Archaeen auf der Haut
Archaea on skin
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (85%); Gesundheitswissenschaften (10%); Klinische Medizin (5%)
Keywords
-
Microbiome,
Skin,
Archaeome,
Thaumarchaeota
Die Mehrzahl aller Zellen im menschlichen Körper sind Mikroorganismen. Änderungen in diesem unsichtbaren Organ, dem sogenannten Mikrobiom, gehen häufig mit gesundheitlichen Problemen, z.B. entzündlichen Darmerkrankungen oder Fettleibigkeit einher. Das menschliche Mikrobiom setzt sich aus Bakterien, Pilzen, Viren und Archaeen zusammen. Archaeen ähneln Bakterien in ihrer Form, Größe und Organisationsform als Einzeller, jedoch bilden sie, mit ihren eigenen molekularen Funktionen, im Stammbaum des Lebens einen eigenen Abzweig. Obwohl Archaeen im menschlichen Mikrobiom bis zu 10% ausmachen können und sie sogenannte Schlüsselmikroben darstellen, ist das Wissen über sie enorm eingeschränkt, hauptsächlich aufgrund methodischer Probleme. So ist bislang kein einziger pathogener Vertreter bei den Archaeen bekannt. Während der letzten Jahre haben wir die Detektionsmethoden für Archaeen verbessert, und wir konnten zeigen, dass das menschliche Archaeom deutlich diverser ist, als ursprünglich angenommen. Archaeen wurden als substantielle Komponente der Nase, Lunge, Verdauungstraktes identifiziert, sowie der Haut. Die Haut ist hauptsächlich von sogenannten Thaumarchaeota bevölkert, die auch in der natürlichen Umgebung (wie z.B. Erde) vorkommen, und dort für effiziente Ammonium-Oxidation verantwortlich sind. Der Anteil der Archaeen auf der Haut variiert von unterhalb des Detektionslimits bis 12% Der Anteil und die Diversität der Archaeen scheint von mehreren Parametern abhängig zu sein, so z.B. dem Alter oder der Hautphysiologie. Zudem konnten wir Archaeen in erkrankten Hautstellen (Prurigo/Psoriasis) nachweisen. Obwohl wir erste Einblicke bereits bekommen konnten, stehen wir jedoch einer enormen Wissenslücke gegenüber, die nun im Rahmen des Projektes geschlossen werden soll. Hypothesen: Wir sind überzeugt, dass die Archaeen eine stabile Komponente des menschlichen Hautmikrobioms sind. Wir wollen zeigen, dass sie mit Bakterien interagieren, und dass ihr Vorkommen mit der Hautnische und physikalischen Parametern wie Feuchtigkeit, PH, oder Gesundheitsstatus korreliert. Wir sind überzeugt, dass die Hautarchaeen physiologisch aktiv sind und sich deutlich von ihren Verwandten in den natürlichen Biotopen unterscheiden, um ihnen eine Persistenz auf der menschlichen Haut zu ermöglichen. Wir sind überzeugt, Archaeen sind in die Prozesse von Krankheit und Gesundheit des menschlichen Körpers involviert. Methoden: Wir kombinieren verschiedene modernste Methoden, z.B. Sequenzierungstechnologie der nächsten Generation mit verbesserter Anreicherung und Kultivierung. Zusätzlich verwenden wir modernste bildgebende Verfahren um Informationen auf verschiedenen Ebenen zu erhalten. Innovation: Dieses Projekt ist sehr innovativ, da es verschiedenste Disziplinen zusammenbringt, incl. medizinischer Forschung (Dermatologie), Mikrobiomforschung (Erforschung der Interaktion des menschlichen Körpers mit Mikroorganismen) und Archaeen- Grundlagenforschung. Mit diesem interdisziplinären Ansatz, studieren wir das wenig erforschte Archaeom in gesunden und erkrankten Personen, und wir werden wichtige Informationen erhalten bzgl. der Funktion, Genom und Physiologie dieser ungewöhnlichen Mikroben auf der menschlichen Haut. Unsere Ergebnisse werden dann eine erste Risikoabschätzung erlauben, ob Archaeen eine wichtige Rolle in der menschlichen Krankheit spielen.
- Medizinische Universität Graz - 2%
- Medizinische Universität Graz - 79%
- Universität Wien - 19%
- Peter Wolf, Medizinische Universität Graz , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Christa Schleper, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 342 Zitationen
- 12 Publikationen
- 4 Methoden & Materialien
- 10 Disseminationen
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2018
Titel Exploring the archaeome: detection of archaeal signatures in the human body DOI 10.1101/334748 Typ Preprint Autor Csorba C -
2020
Titel The host-associated archaeome DOI 10.1038/s41579-020-0407-y Typ Journal Article Autor Borrel G Journal Nature Reviews Microbiology Seiten 622-636 Link Publikation -
2018
Titel The human archaeome: methodological pitfalls and knowledge gaps. DOI 10.1042/etls20180037 Typ Journal Article Autor Mahnert A Journal Emerging topics in life sciences Seiten 469-482 -
2024
Titel Interindividual differences in aronia juice tolerability linked to gut microbiome and metabolome changes—secondary analysis of a randomized placebo-controlled parallel intervention trial DOI 10.1186/s40168-024-01774-4 Typ Journal Article Autor Lackner S Journal Microbiome Seiten 49 Link Publikation -
2022
Titel Reduced olfactory performance is associated with changed microbial diversity, oralization and accumulation of dead biomaterial in the nasal olfactory area DOI 10.21203/rs.3.rs-2251236/v1 Typ Preprint Autor Kumpitsch C Link Publikation -
2022
Titel The sanitary indoor environment—a potential source for intact human-associated anaerobes DOI 10.1038/s41522-022-00305-z Typ Journal Article Autor Pausan M Journal npj Biofilms and Microbiomes Seiten 44 Link Publikation -
2022
Titel Archaeal key-residents within the human microbiome: characteristics, interactions and involvement in health and disease DOI 10.1016/j.mib.2022.102146 Typ Journal Article Autor Mohammadzadeh R Journal Current Opinion in Microbiology Seiten 102146 Link Publikation -
2019
Titel Exploring the Archaeome: Detection of Archaeal Signatures in the Human Body DOI 10.3389/fmicb.2019.02796 Typ Journal Article Autor Pausan M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 2796 Link Publikation -
2024
Titel Targeted isolation of Methanobrevibacter strains from fecal samples expands the cultivated human archaeome DOI 10.1038/s41467-024-52037-7 Typ Journal Article Autor Duller S Journal Nature Communications Seiten 7593 Link Publikation -
2024
Titel Reduced olfactory performance is associated with changed microbial diversity, oralization, and accumulation of dead biomaterial in the nasal olfactory area DOI 10.1128/spectrum.01549-23 Typ Journal Article Autor Kumpitsch C Journal Microbiology Spectrum Link Publikation -
2020
Titel A comprehensive analysis of the global human gut archaeome from a thousand genome catalogue DOI 10.1101/2020.11.21.392621 Typ Preprint Autor Chibani C Seiten 2020.11.21.392621 Link Publikation -
2021
Titel A catalogue of 1,167 genomes from the human gut archaeome DOI 10.1038/s41564-021-01020-9 Typ Journal Article Autor Chibani C Journal Nature Microbiology Seiten 48-61 Link Publikation
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2022
Link
Titel The human archaeome catalogue Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel The human archaeome catalogue Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
Link
Titel Improved detection of archaea in various samples. Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich Link Link -
2019
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Titel Improved detection of archaea in various samples. Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich Link Link
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2018
Titel Children university lecture: Ohne Bakterien geht es nicht. Typ A talk or presentation -
2018
Titel Children university lecture: Ohne Bakterien geht es nicht. Typ A talk or presentation -
2018
Titel Forum Alpbach Seminar: Microbiome diversity vs. microbiological control Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2018
Titel Forum Alpbach Seminar: Microbiome diversity vs. microbiological control Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2018
Titel MiniMed lecture: Der Mensch und seine Mikroorganismen Typ A talk or presentation -
2018
Titel MiniMed lecture: Der Mensch und seine Mikroorganismen Typ A talk or presentation -
2014
Link
Titel Organization of the yearly Theodor Escherich Symposium on Medical Microbiome Research Typ Participation in an activity, workshop or similar Link Link -
2014
Link
Titel Organization of the yearly Theodor Escherich Symposium on Medical Microbiome Research Typ Participation in an activity, workshop or similar Link Link -
2018
Titel Teaching at the ICGEB Seminar, Trieste, Italy Typ Participation in an activity, workshop or similar -
2018
Titel Teaching at the ICGEB Seminar, Trieste, Italy Typ Participation in an activity, workshop or similar