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Detaillierte Studien von actinobakterieller ChdC

In-depth studies of actinobacterial coproheme decarboxylases

Stefan Hofbauer (ORCID: 0000-0003-3375-7715)
  • Grant-DOI 10.55776/P34934
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.12.2021
  • Projektende 30.11.2025
  • Bewilligungssumme 386.925 €
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Chemie (20%)

Keywords

    Heme Biosynthesis, Coproheme Decarboxylase, Gram-positive bacteria, Protein structure and function, Enzyme Reaction Mechanism, Spectroscopy

Abstract

Häm ist für das Überleben der meisten Bakterien unerlässlich. Gram-positive Organismen stellen Häm auf eine Art und Weise her, die sich grundlegend von dem Biosyntheseweg Gram-negativer Organismen oder dem der Säugetiere unterscheidet. Viele mechanistische Fragen im Zusammenhang mit diesem erst vor wenigen Jahren beschriebenen Häm-Biosyntheseweg sind derzeit noch offen. In diesem Projekt wird das Enzym "Coprohämdecarboxylase" im Detail untersucht, um die Struktur- Funktions-Beziehungen aufzuklären. Coprohämdecarboxylasen katalysieren den letzten Schritt des Häm-Biosyntheseweges von Gram-positiven Bakterien. Sie wandeln Coproheme in das Endprodukt Häm b um, indem sie zwei Propionatgruppen zu Vinylgruppen decarboxylieren. Einige mechanistische Details sind bereits bekannt, aber alles in allem ist die Reaktion noch lange nicht vollständig erforscht. In diesem Projekt wollen wir spezielle, wichtige mechanistische Details verstehen, die während der Redoxreaktion auftreten, indem wir fortgeschrittene strukturelle und mechanistische Studien an dem aktinobakteriellen Vertreter des Erregers Corynebacterium diphteriae durchführen. Aus diesen Untersuchungen lassen sich wesentliche Rückschlüsse auf die Wirkungsweise dieses Enzyms ziehen und mit seinen strukturellen Eigenschaften verknüpfen. Die Kenntnis des Reaktionsmechanismus von Coprohämdecarboxylasen ist notwendig, um weitere Studien zu konzipieren, die versuchen, die enzymatische Aktivität zu hemmen. Eine Substanz, die spezifisch den Häm-Biosyntheseweg pathogener Gram-positiver Bakterien hemmen kann, ist ein vielversprechender Ansatzpunkt für die Entwicklung dringend benötigter neuer Antibiotika.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%

Research Output

  • 30 Zitationen
  • 11 Publikationen
Publikationen
  • 2025
    Titel Insights into heme degradation and hydrogen peroxide-induced dimerization of human neuroglobin
    DOI 10.1042/bsr20241265
    Typ Journal Article
    Autor Cassiani A
    Journal Bioscience Reports
    Seiten 1-13
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Insights into the flexibility of the domain-linking loop in actinobacterial coproheme decarboxylase through structures and molecular dynamics simulations
    DOI 10.1002/pro.70027
    Typ Journal Article
    Autor Patil G
    Journal Protein Science
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Entrance channels to coproheme in coproporphyrin ferrochelatase probed by exogenous imidazole binding
    DOI 10.1016/j.jinorgbio.2024.112681
    Typ Journal Article
    Autor Dali A
    Journal Journal of Inorganic Biochemistry
    Seiten 112681
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Proximal ligand tunes active site structure and reactivity in bacterial L. monocytogenes coproheme ferrochelatase
    DOI 10.1016/j.saa.2024.124120
    Typ Journal Article
    Autor Dali A
    Journal Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy
    Seiten 124120
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Structural aspects of enzymes involved in prokaryotic Gram-positive heme biosynthesis
    DOI 10.1016/j.csbj.2023.07.024
    Typ Journal Article
    Autor Falb N
    Journal Computational and Structural Biotechnology Journal
    Seiten 3933-3945
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The Molecular Evolution, Structure, and Function of Coproporphyrinogen Oxidase and Protoporphyrinogen Oxidase in Prokaryotes
    DOI 10.3390/biology12121527
    Typ Journal Article
    Autor Zámocký M
    Journal Biology
    Seiten 1527
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The Role of the Hydrogen Bond Network in Maintaining Heme Pocket Stability and Protein Function Specificity of C. diphtheriae Coproheme Decarboxylase
    DOI 10.3390/biom13020235
    Typ Journal Article
    Autor Sebastiani F
    Journal Biomolecules
    Seiten 235
    Link Publikation
  • 2023
    Titel The role of the distal cavity in carbon monoxide stabilization in the coproheme decarboxylase enzyme from C. diphtheriae
    DOI 10.1016/j.jinorgbio.2023.112243
    Typ Journal Article
    Autor Sebastiani F
    Journal Journal of Inorganic Biochemistry
    Seiten 112243
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Reactivity of Coproheme Decarboxylase with Monovinyl, Monopropionate Deuteroheme
    DOI 10.3390/biom13060946
    Typ Journal Article
    Autor Patil G
    Journal Biomolecules
    Seiten 946
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Spectroscopic evidence of the effect of hydrogen peroxide excess on the coproheme decarboxylase from actinobacterial Corynebacterium diphtheriae
    DOI 10.1002/jrs.6326
    Typ Journal Article
    Autor Sebastiani F
    Journal Journal of Raman Spectroscopy
    Seiten 890-901
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Initial Steps to Engineer Coproheme Decarboxylase to Obtain Stereospecific Monovinyl, Monopropionyl Deuterohemes
    DOI 10.3389/fbioe.2021.807678
    Typ Journal Article
    Autor Michlits H
    Journal Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
    Seiten 807678
    Link Publikation

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