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Detaillierte Studien von actinobakterieller ChdC

In-depth studies of actinobacterial coproheme decarboxylases

Stefan Hofbauer (ORCID: 0000-0003-3375-7715)
  • Grant-DOI 10.55776/P34934
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.12.2021
  • Projektende 30.11.2025
  • Bewilligungssumme 386.925 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Chemie (20%)

Keywords

    Heme Biosynthesis, Coproheme Decarboxylase, Gram-positive bacteria, Protein structure and function, Enzyme Reaction Mechanism, Spectroscopy

Abstract

Häm ist für das Überleben der meisten Bakterien unerlässlich. Gram-positive Organismen stellen Häm auf eine Art und Weise her, die sich grundlegend von dem Biosyntheseweg Gram-negativer Organismen oder dem der Säugetiere unterscheidet. Viele mechanistische Fragen im Zusammenhang mit diesem erst vor wenigen Jahren beschriebenen Häm-Biosyntheseweg sind derzeit noch offen. In diesem Projekt wird das Enzym "Coprohämdecarboxylase" im Detail untersucht, um die Struktur- Funktions-Beziehungen aufzuklären. Coprohämdecarboxylasen katalysieren den letzten Schritt des Häm-Biosyntheseweges von Gram-positiven Bakterien. Sie wandeln Coproheme in das Endprodukt Häm b um, indem sie zwei Propionatgruppen zu Vinylgruppen decarboxylieren. Einige mechanistische Details sind bereits bekannt, aber alles in allem ist die Reaktion noch lange nicht vollständig erforscht. In diesem Projekt wollen wir spezielle, wichtige mechanistische Details verstehen, die während der Redoxreaktion auftreten, indem wir fortgeschrittene strukturelle und mechanistische Studien an dem aktinobakteriellen Vertreter des Erregers Corynebacterium diphteriae durchführen. Aus diesen Untersuchungen lassen sich wesentliche Rückschlüsse auf die Wirkungsweise dieses Enzyms ziehen und mit seinen strukturellen Eigenschaften verknüpfen. Die Kenntnis des Reaktionsmechanismus von Coprohämdecarboxylasen ist notwendig, um weitere Studien zu konzipieren, die versuchen, die enzymatische Aktivität zu hemmen. Eine Substanz, die spezifisch den Häm-Biosyntheseweg pathogener Gram-positiver Bakterien hemmen kann, ist ein vielversprechender Ansatzpunkt für die Entwicklung dringend benötigter neuer Antibiotika.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%

Research Output

  • 30 Zitationen
  • 12 Publikationen
Publikationen
  • 2024
    Titel Entrance channels to coproheme in coproporphyrin ferrochelatase probed by exogenous imidazole binding
    DOI 10.1016/j.jinorgbio.2024.112681
    Typ Journal Article
    Autor Dali A
    Journal Journal of Inorganic Biochemistry
    Seiten 112681
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Initial Steps to Engineer Coproheme Decarboxylase to Obtain Stereospecific Monovinyl, Monopropionyl Deuterohemes
    DOI 10.3389/fbioe.2021.807678
    Typ Journal Article
    Autor Michlits H
    Journal Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
    Seiten 807678
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Insights into the flexibility of the domain-linking loop in actinobacterial coproheme decarboxylase through structures and molecular dynamics simulations
    DOI 10.1002/pro.70027
    Typ Journal Article
    Autor Patil G
    Journal Protein Science
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Coproheme decarboxylase from Bacillus subtilis is required for bacterial growth and heme b biosynthesis under anaerobic conditions
    DOI 10.1016/j.freeradbiomed.2025.08.046
    Typ Journal Article
    Autor Falb N
    Journal Free Radical Biology and Medicine
  • 2025
    Titel Insights into heme degradation and hydrogen peroxide-induced dimerization of human neuroglobin
    DOI 10.1042/bsr20241265
    Typ Journal Article
    Autor Cassiani A
    Journal Bioscience Reports
    Seiten 1-13
    Link Publikation

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