Erstellung einer multimodalen Landkarte von Tumormetastasen

Metastasen sind eine der Hauptursachen für ungünstige Überlebenschancen bei Patienten mit Krebserkrankungen. Obwohl es bei zahlreichen Krebsarten zur Bildung von Metastasen im Knochenmark kommt, wo normalerweise die Zellen des Immunsystems gebildet werden, ist wenig bekannt darüber, welche Veränderungen normale und Tumorzellen aufweisen, wenn diese ins Knochenmark metastasieren. In diesem Projekt untersuchen wir die zelluläre Zusammensetzung von Knochenmarksmetastasen beim Neuroblstom, einer Tumorerkrankung, die nur bei Kindern und Jugendlichen auftritt. Um mehr über Veränderungen in Tumorzellen zu lernen, erforschen wir wie sich die Vielfalt (Heterogenität) in Primärtumoren von jener in Metastasen unterscheidet und welche Auswirkungen die Therapie darauf hat. Weiters möchten wir mehr darüber wissen, wie sich die Zusammensetzung der Tumorzellumgebung sowie Biomarker auf Immunzellen verändern, wenn Tumorzellen ins Knochenmark einwandern. Dazu kombinieren wir mehrere Methoden, die eine hochaufgelöste Analyse von Tumorgewebe auf Einzelzellebene ermöglichen: automatisierte Floureszenzmikroskopie, bildgebende Zytometrie mittels Massenspektrometrie und RNA-Sequenzierung. Die Bildprozessierung und -analyse wird durch Deep Learning Algorithmen unterstützt, die bei der Zellklassifikation und Messung von Biomarkern helfen. Dieses multidisziplinäre Projekt wird zu einem besseren Verständnis der Metastasierung von Tumorerkrankungen bei Kindern und Jugendlichen beitragen und somit die Diagnose betroffener Patienten verbessern.