Peptidbibliotheken als Wirkstoffe für zelluläre Rezeptoren
Nature-derived peptide libraries for GPCR ligand discovery
Wissenschaftsdisziplinen
Chemie (20%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (80%)
Keywords
-
Peptidomics,
Gpcr,
Peptide,
Drug Discovery,
Cyclotide
Naturstoffe dienen als Leitstrukturen der Wirkstoffentwicklung. Sie existieren in großer Anzahl und Vielfalt in verschiedenen Tieren, Pflanzen und Mikroorganismen. Eine wichtige Gruppe pflanzlicher Biomoleküle, sogenannte Cyclotide, sind kleine Eiweißstoffe mit besonderen strukturellen Eigenschaften. Aufgrund einer zyklischen Ringbildung (die erste und letzte Aminosäure der Peptidkette sind verbunden) besitzen Sie extrem hohe Stabilität. Daher wird ihnen, sowohl für die Grundlagenforschung als auch für die Entwicklung neuer Medikamente, großes Potential eingeräumt. Kürzlich wurde in unserem Labor der erste Cyclotid-Rezeptor der Familie der G-Protein-gekoppelten Rezeptoren (im englischen: G protein-coupled receptors, GPCRs) entschlüsselt. Sie gelten als eine der wichtigsten Rezeptorklassen der Pharmakologie, da etwa 30% aller Arzneimittel auf diese biologischen Zelloberflächenmoleküle wirken. Die Identifizierung eines solchen Rezeptors für Cyclotide eröffnet daher neue Möglichkeiten diese biochemische Interaktion im Detail zu untersuchen. Ziel dieser Arbeit ist es, mittels pharmakologischer Verfahren zu untersuchen, ob Cyclotide aufgrund ihrer Sequenzvielfalt als Ligandenbibliothek für GPCRs dienen können. Darüber hinaus wollen wir die pharmakologischen Eigenschaften von Cyclotiden verbessern, indem wir mit Hilfe moderner peptid- chemischer Methoden Cyclotide als Vorlage verwenden, um neuartige Rezeptorliganden herzustellen und deren Wirksamkeit zu analysieren. Letztlich wollen wir mit den Ergebnissen dieser Arbeit dazu beitragen, diese zyklischen Biomoleküle als Wirkstoffkandidaten für klinisch-relevante Rezeptoren zu entwickeln.
Unser Projekt "Nature-derived peptides as libraries for GPCR ligand discovery" konzentriert sich auf die Erforschung zirkulärer Peptide aus Pflanzen zur Entwicklung neuer Liganden für G-Protein-gekoppelte Rezeptoren (GPCRs), eine Schlüsselkategorie therapeutischer Zielmoleküle. Unsere Arbeit vereint fortschrittliche pharmakologische, chemische und bioanalytische Methoden. Wesentliche Fortschritte umfassen die Etablierung von peptidbasierten GPCR-Liganden aus diversen Pflanzenextrakten und das Design von Peptiden, die die Aktivität wichtiger Rezeptoren wie Kappa-Opioid- und Cannabinoid-Rezeptoren modulieren. Besonders hervorzuheben ist unsere Entdeckung neuer Peptidliganden mit potenziellen therapeutischen Anwendungen gegen Schmerzen oder Autoimmun Erkrankungen, was das enorme Potenzial naturabgeleiteter Moleküle in der medizinischen Wissenschaft aufzeigt
- David J. Craik, University of Queensland - Australien
- Liliane Schoofs, Katholieke Universiteit Leuven - Belgien
Research Output
- 3716 Zitationen
- 35 Publikationen
- 1 Patente
- 1 Ausgründungen
- 1 Methoden & Materialien
- 1 Datasets & Models
- 4 Disseminationen
- 6 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2024
Titel Discovery and development of macrocyclic peptide modulators of the cannabinoid 2 receptor DOI 10.1016/j.jbc.2024.107330 Typ Journal Article Autor Tomaševic N Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 107330 Link Publikation -
2024
Titel Plant-Derived Peptides: (Neglected) Natural Products for Drug Discovery # DOI 10.1055/a-2219-9724 Typ Journal Article Autor Gruber C Journal Planta Medica Seiten 627-630 Link Publikation -
2024
Titel Flipping the GPCR Switch: Structure-Based Development of Selective Cannabinoid Receptor 2 Inverse Agonists DOI 10.1021/acscentsci.3c01461 Typ Journal Article Autor Kosar M Journal ACS Central Science Seiten 956-968 Link Publikation -
2024
Titel Discovery and development of macrocyclic peptide modulators of the cannabinoid 2 receptor DOI 10.26434/chemrxiv-2024-15qkc Typ Preprint Autor Tomasevic N Link Publikation -
2024
Titel Chemical synthesis of grafted cyclotides using a “plug and play” approach DOI 10.1039/d4cb00008k Typ Journal Article Autor Koehbach J Journal RSC Chemical Biology Seiten 567-571 Link Publikation -
2023
Titel Development of Melanocortin 4 Receptor Agonists by Exploiting Animal-Derived Macrocyclic, Disulfide-Rich Peptide Scaffolds DOI 10.1021/acsptsci.3c00090 Typ Journal Article Autor Muratspahic´ E Journal ACS Pharmacology & Translational Science Seiten 1373-1381 Link Publikation -
2023
Titel Peptidomics DOI 10.1038/s43586-023-00205-2 Typ Journal Article Autor Hellinger R Journal Nature Reviews Methods Primers Seiten 25 Link Publikation -
2023
Titel Peptide modulators of cell migration: Overview, applications and future development DOI 10.1016/j.drudis.2023.103554 Typ Journal Article Autor Gattringer J Journal Drug Discovery Today Seiten 103554 Link Publikation -
2023
Titel Multiplexed neuropeptide mapping in ant brains integrating microtomography and three-dimensional mass spectrometry imaging DOI 10.1093/pnasnexus/pgad144 Typ Journal Article Autor Geier B Journal PNAS Nexus Link Publikation -
2021
Titel Genome Mining-Based Discovery of Blenny Fish-Derived Peptides Targeting the Mouse ?-Opioid Receptor DOI 10.3389/fphar.2021.773029 Typ Journal Article Autor Muratspahic E Journal Frontiers in Pharmacology Seiten 773029 Link Publikation -
2021
Titel Discovery and design of cyclic nature-derived peptides targeting -opioid receptor Typ PhD Thesis Autor Edin Muratspahic -
2021
Titel Importance of the Cyclic Cystine Knot Structural Motif for Immunosuppressive Effects of Cyclotides DOI 10.1021/acschembio.1c00524 Typ Journal Article Autor Hellinger R Journal ACS Chemical Biology Seiten 2373-2386 Link Publikation -
2020
Titel Isolation of Cysteine-Rich Peptides from Citrullus colocynthis DOI 10.3390/biom10091326 Typ Journal Article Autor Shahin-Kaleybar B Journal Biomolecules Seiten 1326 Link Publikation -
2020
Titel Harnessing cyclotides to design and develop novel peptide GPCR ligands DOI 10.1039/d0cb00062k Typ Journal Article Autor Muratspahic E Journal RSC Chemical Biology Seiten 177-191 Link Publikation -
2020
Titel The oxytocin receptor signalling system and breast cancer: a critical review DOI 10.1038/s41388-020-01415-8 Typ Journal Article Autor Liu H Journal Oncogene Seiten 5917-5932 Link Publikation -
2022
Titel Discovery of the cyclotide caripe 11 as a ligand of the cholecystokinin-2 receptor DOI 10.1038/s41598-022-13142-z Typ Journal Article Autor Taghizadeh M Journal Scientific Reports Seiten 9215 Link Publikation -
2022
Titel Ipecac root extracts and isolated circular peptides differentially suppress inflammatory immune response characterised by proliferation, activation and degranulation capacity of human lymphocytes in vitro DOI 10.1016/j.biopha.2022.113120 Typ Journal Article Autor Falanga C Journal Biomedicine & Pharmacotherapy Seiten 113120 Link Publikation -
2022
Titel Multiplexed neuropeptide mapping in ant brains integrating microtomography and 3D mass spectrometry imaging DOI 10.1101/2022.11.02.514707 Typ Preprint Autor Geier B Seiten 2022.11.02.514707 Link Publikation -
2019
Titel Nature-Derived Peptides: A Growing Niche for GPCR Ligand Discovery DOI 10.1016/j.tips.2019.03.004 Typ Journal Article Autor Muratspahic E Journal Trends in Pharmacological Sciences Seiten 309-326 Link Publikation -
2019
Titel I8-arachnotocin–an arthropod-derived G protein-biased ligand of the human vasopressin V2 receptor DOI 10.1038/s41598-019-55675-w Typ Journal Article Autor Duerrauer L Journal Scientific Reports Seiten 19295 Link Publikation -
2023
Titel Design, synthesis, conformational analysis, and biological activity of C1-to-C6 1,4- and 4,1-disubstituted 1H-[1,2,3]triazol-1-yl-bridged oxytocin analogues DOI 10.6084/m9.figshare.24182237.v1 Typ Other Autor Larregola M Link Publikation -
2023
Titel Design, synthesis, conformational analysis, and biological activity of C1-to-C6 1,4- and 4,1-disubstituted 1H-[1,2,3]triazol-1-yl-bridged oxytocin analogues DOI 10.6084/m9.figshare.24182237 Typ Other Autor Larregola M Link Publikation -
2023
Titel Design and structural validation of peptide–drug conjugate ligands of the kappa-opioid receptor DOI 10.1038/s41467-023-43718-w Typ Journal Article Autor Muratspahic E Journal Nature Communications Seiten 8064 Link Publikation -
2023
Titel Development of a Selective Peptide ?-Opioid Receptor Antagonist by Late-Stage Functionalization with Cysteine Staples DOI 10.1021/acs.jmedchem.3c00426 Typ Journal Article Autor Muratspahic´ E Journal Journal of Medicinal Chemistry Seiten 11843-11854 Link Publikation -
2023
Titel Flipping the GPCR Switch: Structure-Based Development of Selective Cannabinoid Receptor 2 Inverse Agonists DOI 10.26434/chemrxiv-2023-w3ggn Typ Preprint Autor Carreira E -
2023
Titel Design, synthesis, conformational analysis, and biological activity of Ca1-to-Ca6 1,4- and 4,1-disubstituted 1H-[1,2,3]triazol-1-yl-bridged oxytocin analogues DOI 10.1080/14756366.2023.2254019 Typ Journal Article Autor Nuti F Journal Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry Seiten 2254019 Link Publikation -
2021
Titel Isolation and functional diversity of Bowman–Birk type serine proteinase inhibitors from Hyacinthus orientalis DOI 10.1042/bcj20201005 Typ Journal Article Autor Aoki-Shioi N Journal Biochemical Journal Seiten 1287-1301 Link Publikation -
2021
Titel Cyclotides from Brazilian Palicourea sessilis and Their Effects on Human Lymphocytes DOI 10.1021/acs.jnatprod.0c01069 Typ Journal Article Autor Pinto M Journal Journal of Natural Products Seiten 81-90 Link Publikation -
2021
Titel Nature-inspired dimerization as a strategy to modulate neuropeptide pharmacology exemplified with vasopressin and oxytocin DOI 10.1039/d0sc05501h Typ Journal Article Autor Dekan Z Journal Chemical Science Seiten 4057-4062 Link Publikation -
2021
Titel Natural products in drug discovery: advances and opportunities DOI 10.1038/s41573-020-00114-z Typ Journal Article Autor Atanasov A Journal Nature Reviews Drug Discovery Seiten 200-216 Link Publikation -
2022
Titel Ipecac root extracts and isolated circular peptides differentially suppress inflammatory immune response characterised by proliferation, activation and degranulation capacity of human lymphocytes in vitro DOI 10.5451/unibas-ep88523 Typ Other Autor Falanga Link Publikation -
2021
Titel Plant-Derived Cyclotides Modulate ?-Opioid Receptor Signaling DOI 10.1021/acs.jnatprod.1c00301 Typ Journal Article Autor Muratspahic´ E Journal Journal of Natural Products Seiten 2238-2248 Link Publikation -
2021
Titel Design of a Stable Cyclic Peptide Analgesic Derived from Sunflower Seeds that Targets the ?-Opioid Receptor for the Treatment of Chronic Abdominal Pain DOI 10.1021/acs.jmedchem.1c00158 Typ Journal Article Autor Muratspahic´ E Journal Journal of Medicinal Chemistry Seiten 9042-9055 Link Publikation -
2021
Titel Cyclotides Isolated From Violet Plants of Cameroon Are Inhibitors of Human Prolyl Oligopeptidase DOI 10.3389/fphar.2021.707596 Typ Journal Article Autor Gattringer J Journal Frontiers in Pharmacology Seiten 707596 Link Publikation -
2020
Titel Discovery of a Beetroot Protease Inhibitor to Identify and Classify Plant-Derived Cystine Knot Peptides DOI 10.1021/acs.jnatprod.0c00648 Typ Journal Article Autor Retzl B Journal Journal of Natural Products Seiten 3305-3314 Link Publikation
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2023
Titel Selective cyclized peptide kappa-opioid receptor ligands Typ Patent / Patent application Website Link
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2024
Link
Titel CCDC 2310248: Experimental Crystal Structure Determination DOI 10.5517/ccdc.csd.cc2hk047 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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Titel Press release MUW Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview -
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Titel PRess release MUW Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview -
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Titel Radio Interview, Science Podcast Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview -
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Titel VHS Vortrag Typ A talk or presentation
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2023
Titel Best Poster Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2022
Titel Invited speaker Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel Schrödinger Fellowship Typ Prestigious/honorary/advisory position to an external body Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel STMS Typ Research prize Bekanntheitsgrad Continental/International -
2021
Titel Editor Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series Bekanntheitsgrad Continental/International -
2019
Titel Invited speaker Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International