Antikörper gegen das Mikrobiom
Antibody repertoires against the microbiome
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (50%); Informatik (25%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)
Keywords
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Antigens,
Eptitopes,
Microbiome,
Humoral Immune Response,
Microbiota,
Antibodies
Der menschliche Körper ist übersät mit Mikroorganismen (Bakterien, Hefen etc.), die unter anderem auf der Haut und im Verdauungstrakt leben und als Mikrobiom bezeichnet werden. Diese Mikroorganismen erfüllen zum Teil als Symbionten wichtige Aufgaben und helfen bei der Verdauung, synthetisieren zusätzliche Nährstoffe, schützen gegen Krankheitserregern und regulieren das menschliche Immunsystem. Ein Ungleichgewicht in der Mikrobiom Zusammensetzung kann autoimmun oder autoinflammatorische Erkrankungen auslösen (also Reaktionen des Immunsystems, die irrtümlicherweise gegen den menschlichen Körper gerichtet sind). Trotz wachsender Anstrengungen die Interaktionen zwischen dem Mikrobiom und dem menschlichen Immunsystem zu untersuchen, gibt es gegenwärtig in Ermangelung potenter experimenteller Systeme wenige systematische Studien dazu. Als wichtiger Teil des Immunsystems spielen Antikörper eine wesentliche Rolle den menschlichen Körper vor Infektionen zu schützen. Immunoglobulin A (IgA) Antikörper sind eine bedeutende Komponente des Immunsystems in Schleimhäuten wie z.B. der Darm Mucosa. Abgesehen vom Darm, gibt es aber auch im Blut Antikörper gegen Mikrobiom Mitglieder, die aus dem Gastrointestinaltrakt in das Blut entkommen sind. Unlängst wurde gezeigt, dass auch IgG Antikörper im Blut gegen Darm-Mikrobiom Bakterien den menschlichen Körper vor Infektionen schützen. Dieses Forschungsergebnis unterstreicht, dass das Mikrobiom das Immunsystem auch außerhalb des Gastrointestinaltrakts formt. Hier wird ein neues experimentelles System verwendet um die Interaktion zwischen dem Mikrobiom und dem Immunsystem zu charakterisieren. Bis zu einer Million mikrobieller Elemente werden in hohem Durchsatz analysiert, basierend auf Systemen, die typischerweise im Biotechnologiesektor Anwendung finden. Die Kombination von komplementären Biotechnologie und DNA-Sequenziermethoden wird neue Möglichkeiten eröffnen die Interaktionen zwischen dem Mikrobiom und dem Immunsystem zu erforschen. Die Etablierung dieses Systems wird das Fundament legen um breitgefächerte Forschung bezüglich verschiedener biologischer Fragestellungen durchzuführen. Nebst Erkenntnissen zu grundlegenden biologischen Prozessen, werden diese Bestrebungen auch neue Biomarker identifizieren und den Weg für die Entwicklung neuartiger therapeutischer Zugänge ebnen.
Der menschliche Körper ist übersät mit Mikroorganismen, die vor allem auf der Haut und im Verdauungstrakt leben und als Mikrobiom bezeichnet werden. Ein Ungleichgewicht in der Mikrobiom Zusammensetzung kann autoimmun oder autoinflammatorische Erkrankungen auslösen (also Reaktionen des Immunsystems, die irrtümlicherweise gegen den menschlichen Körper gerichtet sind). Trotz wachsender Anstrengungen die Interaktionen zwischen dem Mikrobiom und dem menschlichen Immunsystem zu verstehen, gibt es gegenwärtig in Ermangelung geeigneter experimenteller Systeme kaum systematische Studien dazu. Mit konventionellen Methoden (wie Antikörper Tests für Corona) werden meist nur Immunantworten gegen eine exemplarische Struktur gemessen. Das Mikrobiom besteht aber aus tausenden Mikroorganismen und hunderttausenden Strukturen, die noch nie analysiert wurden. In dieser Arbeit, haben wir eine neue Technologie angewandt um Immunantworten gegen 244000 mikrobielle Strukturen gleichzeitig zu analysieren. Wir haben gezeigt, dass auch gesunde Menschen verschiedene Antiköroper gegen ihr eigenes Mikrobiom bilden, die diemenschliche Gesundheit beeinflussen.DieseTechnologie hat breite Anwendungsmöglichkeiten um autoimmun oder autoinflammatorische Erkrankungen besser zu verstehen und neue Therapien zu entwickeln.
Research Output
- 288 Zitationen
- 27 Publikationen
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2021
Titel Genetic, environmental and intrinsic determinants of the human antibody epitope repertoire DOI 10.1101/2021.12.07.471553 Typ Preprint Autor Andreu-Sánchez S Seiten 2021.12.07.471553 Link Publikation -
2021
Titel In-depth characterization of the serum antibody epitope repertoire in inflammatory bowel disease using phage-displayed immunoprecipitation sequencing DOI 10.1101/2021.12.07.471581 Typ Preprint Autor Bourgonje A Seiten 2021.12.07.471581 Link Publikation -
2020
Titel Cross-reactive antibody responses against SARS-CoV-2 and seasonal common cold coronaviruses DOI 10.1101/2020.09.01.20182220 Typ Preprint Autor Klompus S Seiten 2020.09.01.20182220 Link Publikation -
2021
Titel Cross-reactive antibodies against human coronaviruses and the animal coronavirome suggest diagnostics for future zoonotic spillovers DOI 10.1126/sciimmunol.abe9950 Typ Journal Article Autor Klompus S Journal Science Immunology Link Publikation -
2021
Titel Population-wide diversity and stability of serum antibody epitope repertoires against human microbiota DOI 10.1038/s41591-021-01409-3 Typ Journal Article Autor Vogl T Journal Nature Medicine Seiten 1442-1450 -
2023
Titel Phage display sequencing reveals that genetic, environmental, and intrinsic factors influence variation of human antibody epitope repertoire DOI 10.1016/j.immuni.2023.04.003 Typ Journal Article Autor Andreu-Sánchez S Journal Immunity Link Publikation -
2022
Titel Systemic antibody responses against human microbiota flagellins are overrepresented in chronic fatigue syndrome patients DOI 10.1126/sciadv.abq2422 Typ Journal Article Autor Vogl T Journal Science Advances Link Publikation -
2023
Titel Phage-display immunoprecipitation sequencing of the antibody epitope repertoire in inflammatory bowel disease reveals distinct antibody signatures DOI 10.1016/j.immuni.2023.04.017 Typ Journal Article Autor Bourgonje A Journal Immunity Link Publikation -
2022
Titel Antibody signatures in inflammatory bowel disease: current developments and future applications DOI 10.1016/j.molmed.2022.05.004 Typ Journal Article Autor Bourgonje A Journal Trends in Molecular Medicine Seiten 693-705 Link Publikation -
2022
Titel Allergenic food protein consumption is associated with systemic IgG antibody responses in non-allergic individuals DOI 10.1016/j.immuni.2022.11.004 Typ Journal Article Autor Leviatan S Journal Immunity Link Publikation -
2021
Titel Synergistic optimisation of expression, folding, and secretion improves E. coli AppA phytase production in Pichia pastoris DOI 10.1186/s12934-020-01499-7 Typ Journal Article Autor Navone L Journal Microbial Cell Factories Seiten 8 Link Publikation -
2021
Titel Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.1186/s13068-021-01936-8 Typ Journal Article Autor Navone L Journal Biotechnology for Biofuels Seiten 80 Link Publikation -
2021
Titel Additional file 7 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355337.v1 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 1 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355319 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 1 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355319.v1 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 2 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355322 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 2 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355322.v1 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 3 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355325 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 3 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355325.v1 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 4 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355328 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 4 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355328.v1 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 5 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355331 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 5 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355331.v1 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 6 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355334 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 6 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355334.v1 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel Additional file 7 of Disulfide bond engineering of AppA phytase for increased thermostability requires co-expression of protein disulfide isomerase in Pichia pastoris DOI 10.6084/m9.figshare.14355337 Typ Other Autor Navone L Link Publikation -
2021
Titel SARS-CoV-2 antibody testing for estimating COVID-19 prevalence in the population. DOI 10.1016/j.xcrm.2021.100191 Typ Journal Article Autor Leviatan S Journal Cell reports. Medicine Seiten 100191