Stammzellmodulation in neuronaler Entwicklung und Regeneration
Stem cell modulation in neural development and regeneration
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Tissue Growth,
Neural Tube,
Pattern Formation,
Morphogen
Die Organe unseres Körpers werden durch so genannte Stammzellen am Leben erhalten. Stammzellen sind einzigartig, weil sie sich selbst erneuern können. Diese Eigenschaft erlaubt es ihnen, identische Kopien von sich selbst zu erzeugen, aber gleichzeitig auch andere Zellen zu erzeugen, die sich spezialisieren und wichtige Aufgaben in den verschiedenen Organen übernehmen. Dadurch bleiben die Stammzellen selbst über lange Zeit erhalten während sie ständig absterbende oder beschädigte Zellen ersetzen. In unserem Gehirn und Rückenmark jedoch ist die Situation jedoch etwas anders. Hier erfüllen sehr viele verschiedene Arten hoch spezialisierter Nervenzellen ganz individuelle Aufgaben. Einige aktivieren und andere hemmen neuronale Schaltkreise. Woher wissen die Stammzellen, welche Arten von Nervenzellen sie an welchen Orten und zu welchem Zeitpunkt erzeugen sollen? Wie verändern sich die Stammzellen während der Zeit, so dass sie die richtigen neuronalen Subtypen erzeugen können? Ziel unseres SFB ist es, die Mechanismen zu verstehen, die neurale Stammzellen in Raum und Zeit modulieren. Wir wollen herausfinden, wie neuronale Stammzellen es schaffen, sich einerseits selbst zu erhalten, andererseits aber zu verändern, um grundlegend verschiedene Arten von Nervenzellen zu erzeugen. Um dieses Problem anzugehen, kombiniert unser Konsortium zahlreiche methodische Ansätze, die um einige zentrale Schlüsseltechnologien gruppiert sind. Wir setzen eine Reihe verschiedener Modelle ein - von Meereswürmern bis hin zu menschlichen 3D-Zellkulturen. Wir konzentrieren uns auf Einzelzelltechnologien, die es uns ermöglichen, Stammzellen in Raum und Zeit genau zu verfolgen und für jede Zelle eine Liste aller aktiven Gene zu erzeugen. Im Mittelpunkt unseres Konsortiums steht eine zentrale Bioinformatik Einheit, die es uns erlaubt, die großen dabei entstehenden Datensätze zu interpretieren und in Verbindung zu setzen. Gemeinsam wollen wir einen zentralen Drehpunkt für die neurale Stammzellbiologie in Österreich aufbauen, der eine einzigartige, vereinheitlichende biologische Frage mit Hilfe modernster Technologien an der Spitze des technologisch Möglichen angeht.
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2024 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2024 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2020 -)
-
Konsortiumsmitglied (01.03.2024 -)
- IMBA – Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH
- Daniela D. Pollak-Monje Quiroga, Medizinische Universität Wien , nationale:r Kooperationspartner:in
- Ana Martin-Villalba, Deutsches Krebsforschungszentrum - Deutschland
- Andreas Trumpp, Deutsches Krebsforschungszentrum Heidelberg - Deutschland
- Florian Heyd, Freie Universität Berlin - Deutschland
- Wolfgang Enard, Ludwig-Maximilians-Universität München - Deutschland
- Barbara Treutlein, Max-Planck-Gesellschaft - Deutschland
- Kent Duncan, Universität Hamburg - Deutschland
- Guillaume Balavoine, Université Paris Diderot - Paris 7 - Frankreich
- Molly M. Stevens, Imperial College of London - Großbritannien
- Stefano Pluchino, University of Cambridge - Großbritannien
- Cesare Indiveri, Università di Calabria - Italien
- Jens C. Schwamborn, Université du Luxembourg - Luxemburg
- Andras Simon, Karolinska Institute - Schweden
- Rolf Zeller, University of Bern - Schweiz
- Matthias Lütolf, École polytechnique fédérale de Lausanne - Schweiz
- Ahmet Okay Caglayan, Istanbul Bilim University - Türkei
- Fritz J. Sedlazeck, Baylor College of Medicine - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 399 Zitationen
- 47 Publikationen
-
2025
Titel Probing Cell-Type Specificity of Mutant Phenotype at Transcriptomic Level Using Mosaic Analysis with Double Markers (MADM). DOI 10.1007/978-1-0716-4310-5_7 Typ Journal Article Autor Cheung G Journal Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Seiten 139-151 -
2025
Titel SOX2+ sustentacular cells are stem cells of the postnatal adrenal medulla DOI 10.1038/s41467-024-55289-5 Typ Journal Article Autor Kemkem Y Journal Nature Communications -
2025
Titel Guiding Light: Mechanisms and Adjustments of Environmental Light Interpretation with Insights from Platynereis dumerilii and Other Selected Examples DOI 10.2108/zs240099 Typ Journal Article Autor Wulf P Journal Zoological Science -
2025
Titel A cost- and time-efficient method for high-throughput cryoprocessing and tissue analysis using multiplexed tissue molds DOI 10.1016/j.crmeth.2025.101023 Typ Journal Article Autor Reumann D Journal Cell Reports Methods Seiten 101023 Link Publikation -
2025
Titel Advancing autism research: Insights from brain organoid modeling DOI 10.1016/j.conb.2025.103030 Typ Journal Article Autor Li C Journal Current Opinion in Neurobiology Seiten 103030 Link Publikation -
2025
Titel The role of microheterogeneity in cell fate decisions in neural progenitors and neural crest DOI 10.1016/j.conb.2025.103031 Typ Journal Article Autor Kamenev D Journal Current Opinion in Neurobiology Seiten 103031 Link Publikation -
2025
Titel How radial glia progenitor lineages generate cell-type diversity in the developing cerebral cortex DOI 10.1016/j.conb.2025.103046 Typ Journal Article Autor Pipicelli F Journal Current Opinion in Neurobiology Seiten 103046 Link Publikation -
2025
Titel Adeno-associated viruses for efficient gene expression in the axolotl nervous system DOI 10.1073/pnas.2421373122 Typ Journal Article Autor Lust K Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2025
Titel ß-catenin-driven endomesoderm specification is a Bilateria-specific novelty DOI 10.1038/s41467-025-57109-w Typ Journal Article Autor Lebedeva T Journal Nature Communications Seiten 2476 Link Publikation -
2021
Titel Autophagy in a-Synucleinopathies—An Overstrained System DOI 10.3390/cells10113143 Typ Journal Article Autor Fellner L Journal Cells Seiten 3143 Link Publikation -
2021
Titel Neurotransmitter signaling regulates distinct phases of multimodal human interneuron migration DOI 10.15252/embj.2021108714 Typ Journal Article Autor Bajaj S Journal The EMBO Journal Link Publikation -
2024
Titel Assessing the precision of morphogen gradients in neural tube development DOI 10.1038/s41467-024-45148-8 Typ Journal Article Autor Zagorski M Journal Nature Communications Seiten 929 Link Publikation -
2024
Titel Modeling early phenotypes of Parkinson’s disease by age-induced midbrain-striatum assembloids DOI 10.1038/s42003-024-07273-4 Typ Journal Article Autor Barmpa K Journal Communications Biology Seiten 1561 Link Publikation -
2024
Titel Protocol for fabricating elastomeric stencils for patterned stem cell differentiation DOI 10.1016/j.xpro.2024.103187 Typ Journal Article Autor Lehr S Journal STAR Protocols Seiten 103187 Link Publikation -
2024
Titel Self-organized pattern formation in the developing mouse neural tube by a temporal relay of BMP signaling DOI 10.1016/j.devcel.2024.10.024 Typ Journal Article Autor Lehr S Journal Developmental Cell Link Publikation -
2024
Titel Adeno-associated viral tools to trace neural development and connectivity across amphibians DOI 10.1016/j.devcel.2024.10.025 Typ Journal Article Autor Jaeger E Journal Developmental Cell Link Publikation -
2024
Titel Alternative lengthening of telomere-based immortalization renders H3G34R-mutant diffuse hemispheric glioma hypersensitive to PARP inhibitor combination regimens DOI 10.1093/neuonc/noae228 Typ Journal Article Autor Laemmerer A Journal Neuro-Oncology Seiten 811-827 Link Publikation -
2024
Titel Reconstitution of Human Brain Cell Diversity in Organoids via Four Protocols DOI 10.1101/2024.11.15.623576 Typ Preprint Autor Naas J Seiten 2024.11.15.623576 Link Publikation -
2024
Titel Molecular profiles, sources and lineage restrictions of stem cells in an annelid regeneration model DOI 10.1038/s41467-024-54041-3 Typ Journal Article Autor Stockinger A Journal Nature Communications Seiten 9882 Link Publikation -
2024
Titel Applying single-cell and single-nucleus genomics to studies of cellular heterogeneity and cell fate transitions in the nervous system DOI 10.1038/s41593-024-01827-9 Typ Journal Article Autor Adameyko I Journal Nature Neuroscience Seiten 2278-2291 -
2024
Titel Protocol for mapping cell lineage and cell-type identity of clonally-related cells in situ using MADM-CloneSeq DOI 10.1016/j.xpro.2024.103168 Typ Journal Article Autor Cheung G Journal STAR Protocols Seiten 103168 Link Publikation -
2024
Titel Protocol for quantitative reconstruction of cell lineage using mosaic analysis with double markers in mice DOI 10.1016/j.xpro.2024.103157 Typ Journal Article Autor Cheung G Journal STAR Protocols Seiten 103157 Link Publikation -
2024
Titel The chromatin regulator Ankrd11 controls cardiac neural crest cell-mediated outflow tract remodeling and heart function DOI 10.1038/s41467-024-48955-1 Typ Journal Article Autor Kibalnyk Y Journal Nature Communications Seiten 4632 Link Publikation -
2024
Titel Motor innervation directs the correct development of the mouse sympathetic nervous system DOI 10.1038/s41467-024-51290-0 Typ Journal Article Autor Erickson A Journal Nature Communications Seiten 7065 Link Publikation -
2024
Titel Time me by the moon DOI 10.1038/s44319-024-00196-5 Typ Journal Article Autor Ritter A Journal EMBO Reports Seiten 3169-3176 Link Publikation -
2024
Titel Spinal neuron diversity scales exponentially with swim-to-limb transformation during frog metamorphosis DOI 10.1101/2024.09.20.614050 Typ Preprint Autor Vijatovic D Seiten 2024.09.20.614050 Link Publikation -
2024
Titel Dynamics of morphogen source formation in a growing tissue DOI 10.1371/journal.pcbi.1012508 Typ Journal Article Autor Ho R Journal PLOS Computational Biology Link Publikation -
2024
Titel Lineage tracing of Shh+ floor plate cells and dynamics of dorsal–ventral gene expression in the regenerating axolotl spinal cord DOI 10.1111/dgd.12945 Typ Journal Article Autor Arbanas L Journal Development, Growth & Differentiation Seiten 414-425 Link Publikation -
2024
Titel Joint single-cell genetic and transcriptomic analysis reveal pre-malignant SCP-like subclones in human neuroblastoma DOI 10.1186/s12943-024-02091-y Typ Journal Article Autor Olsen T Journal Molecular Cancer Seiten 180 Link Publikation -
2024
Titel A polarized FGF8 source specifies frontotemporal signatures in spatially oriented cell populations of cortical assembloids DOI 10.1038/s41592-024-02412-5 Typ Journal Article Autor Bosone C Journal Nature Methods Seiten 2147-2159 Link Publikation -
2024
Titel Increased cholesterol synthesis drives neurotoxicity in patient stem cell-derived model of multiple sclerosis. DOI 10.1016/j.stem.2024.09.014 Typ Journal Article Autor Ionescu Rb Journal Cell stem cell -
2024
Titel A framework for neural organoids, assembloids and transplantation studies DOI 10.1038/s41586-024-08487-6 Typ Journal Article Autor Arlotta P Journal Nature -
2024
Titel Morphological Analysis of Neurons and Glia Using Mosaic Analysis with Double Markers; In: Neuronal Morphogenesis - Methods and Protocols DOI 10.1007/978-1-0716-3969-6_19 Typ Book Chapter Verlag Springer US -
2024
Titel Dynamic microvilli sculpt bristles at nanometric scale DOI 10.1038/s41467-024-48044-3 Typ Journal Article Autor Ikeda K Journal Nature Communications Seiten 3733 Link Publikation -
2024
Titel Cerebral organoids display dynamic clonal growth and tunable tissue replenishment DOI 10.1038/s41556-024-01412-z Typ Journal Article Autor Lindenhofer D Journal Nature Cell Biology Seiten 710-718 Link Publikation -
2024
Titel ARID1B controls transcriptional programs of axon projection in an organoid model of the human corpus callosum DOI 10.1016/j.stem.2024.04.014 Typ Journal Article Autor Martins-Costa C Journal Cell Stem Cell Link Publikation -
2024
Titel Human enteric nervous system progenitor transplantation improves functional responses in Hirschsprung disease patient-derived tissue DOI 10.1136/gutjnl-2023-331532 Typ Journal Article Autor Jevans B Journal Gut Seiten 1441-1453 Link Publikation -
2024
Titel Mouse neural tube organoids self-organize floorplate through BMP-mediated cluster competition DOI 10.1016/j.devcel.2024.04.021 Typ Journal Article Autor Krammer T Journal Developmental Cell Link Publikation -
2024
Titel Molecular circadian rhythms are robust in marine annelids lacking rhythmic behavior DOI 10.1371/journal.pbio.3002572 Typ Journal Article Autor Häfker N Journal PLOS Biology Link Publikation -
2024
Titel Neutral competition explains the clonal composition of neural organoids DOI 10.1371/journal.pcbi.1012054 Typ Journal Article Autor Pflug F Journal PLOS Computational Biology Link Publikation -
2020
Titel The Still Dark Side of the Moon: Molecular Mechanisms of Lunar-Controlled Rhythms and Clocks DOI 10.1016/j.jmb.2020.03.009 Typ Journal Article Autor Andreatta G Journal Journal of Molecular Biology Seiten 3525-3546 Link Publikation -
2023
Titel Odontodes: The Developmental and Evolutionary Building Blocks of Dentitions Typ Book Autor Chen Donglei Verlag Taylor & Francis Ltd -
2020
Titel A human tissue screen identifies a regulator of ER secretion as a brain-size determinant DOI 10.1126/science.abb5390 Typ Journal Article Autor Esk C Journal Science Seiten 935-941 Link Publikation -
2024
Titel Single-cell Profiling of Reprogrammed Human Neural Stem Cells Unveils High Similarity to Neural Progenitors in the Developing Central Nervous System DOI 10.1007/s12015-024-10698-3 Typ Journal Article Autor Spathopoulou A Journal Stem Cell Reviews and Reports Seiten 1325-1339 Link Publikation -
2023
Titel Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus DOI 10.1016/j.neuron.2023.11.009 Typ Journal Article Autor Cheung G Journal Neuron Link Publikation -
2023
Titel The promise of genetic screens in human in vitro brain models DOI 10.1515/hsz-2023-0174 Typ Journal Article Autor Beirute-Herrera J Journal Biological Chemistry Seiten 13-24 Link Publikation -
2023
Titel Protocol for sorting cells from mouse brains labeled with mosaic analysis with double markers by flow cytometry DOI 10.1016/j.xpro.2023.102771 Typ Journal Article Autor Amberg N Journal STAR Protocols Seiten 102771 Link Publikation