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Phylogenie und Evolution essbarer Seeigel (Echinoidea: Camarodonta)

Phylogeny and evolution of edible sea urchins (Echinoidea: Camarodonta)

Andreas Kroh (ORCID: 0000-0002-8566-8848)
  • Grant-DOI 10.55776/P29508
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.12.2016
  • Projektende 30.11.2021
  • Bewilligungssumme 418.647 €
  • Projekt-Website
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (75%); Geowissenschaften (25%)

Keywords

    Phylogeny, Evolution, Sea Urchins, Systematics, Camarodonta, Phylogenomics

Abstract

Seeigel der Ordnung Camarodonta sind wichtige Mitglieder bodenbewohnender Flachwasser- Lebensgemeinschaften. Sie werden intensiv für Studien im Bereich der Fortpflanzungs- und Entwicklungsforschung genutzt und sind häufig verwendete Modellorganismen in der biologischen Ausbildung. Ihre Fortpflanzungsorgane gelten als Delikatessen, weshalb jedes Jahr Seeigel im Wert von Hunderten Millionen Dollar gefischt oder gezüchtet werden. Es existieren zahlreiche Studien zu verschiedensten Aspekten der Lebensweise dieser Seeigelgruppe, ihre Evolution ist allerdings noch schlecht verstanden. Dies ist vor allem bedingt durch das Fehlen von Studien, die Daten von fossilen und lebenden Vertretern im gleichen Maße berücksichtigen. Das geplante Projekt zielt darauf ab, Stammesgeschichte der camarodonten Seeigel zu entschlüsseln. Um dies zu erreichen, ist geplant, sowohl morphologische als auch genetische Daten zu analysieren. Im Gegensatz zu früheren Studien werden diese Untersuchungen auf Genom-Ebene stattfinden. Die dabei gewonnene umfangreichere Datenmenge läßt robuste Ergebnisse erwarten. Das Erstauftreten von camarodonten Seeigeln im Fossilbericht wird ermittelt und für die Datierung des Ursprungs der einzelnen Gruppen verwendet werden. Neue analytische Methoden, generell unter dem Begriff Next Generation Sequencing zusammengefasst, haben die Menge an genetischer Information, die gewonnen werden kann, drastisch erhöht. Um robuste und korrekte Stammbäume zu erhalten, ist eine große Menge an Sequenzdaten alleine unzureichend. Das Problem liegt vielmehr in der Identifikation vergleichbarer Bereiche innerhalb der DNA-Sequenzen. Im geplanten Projekt wird eine innovative Methode verwendet, um dieses Problem zu lösen. Durch die Verwendung und Anreicherung von speziellen Bereichen der DNA so genannten Ultrakonservierten Elementen, die in nahezu unveränderter Form in verschiedenen Organismen vorkommen können identische Partien im Genom verschiedener Organismen identifiziert werden. Die unmittelbar an die konservierten Elemente angrenzenden Regionen enthalten phylogenetisch wertvolle Informationen, die sich für genetische Analysen einsetzen lassen. Dieser Ansatz wurde erstmals 2012 für das Studium von Wirbeltier-Verwandtschaftsverhältnissen genutzt und hat sich in darauffolgenden Studien als sehr erfolgreich herausgestellt. Nur wenige dieser Studien betrafen jedoch wirbellose Tiere und keine davon Echinodermen. Das Forschungsprojekt ist für eine Dauer von drei Jahren geplant und wird am Naturhistorischen Museum Wien von Andreas Kroh, Elisabeth Haring und Omri Bronstein in Kooperation mit einem internationalen Team durchgeführt werden. Innerhalb des ersten Halbjahres wird die neue, auf Ultrakonservierten Elementen beruhende Analysemethode für die Verwendung bei Echinodermen angepasst werden. In den darauffolgenden eineinhalb Jahren werden die genetischen Untersuchungen durchgeführt und die ältesten Mitglieder der Camarodonta identifiziert werden. Für das letzte Projektjahr sind die Zusammenführung der Ergebnisse und die Rekonstruktion des Stammbaumes der Camarodonta geplant. Anhand der gewonnenen Daten kann festgestellt werden, wann und wo die einzelnen Gruppen erstmals auftraten.

Forschungsstätte(n)
  • Naturhistorisches Museum Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Marc Eléaume, Muséum National d´Histoire Naturelle - Frankreich
  • Libby Liggins, Massey University - Neuseeland
  • Rich Mooi, California Academy of Sciences - Vereinigte Staaten von Amerika
  • R. Andrew Cameron, California Institute of Technology - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Gustav Paulay, University of Florida - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 181 Zitationen
  • 13 Publikationen
  • 1 Policies
  • 3 Disseminationen
Publikationen
  • 2017
    Titel Cryptic speciation in pan-tropical sea urchins: a case study of an edge-of-range population of Tripneustes from the Kermadec Islands
    DOI 10.1038/s41598-017-06183-2
    Typ Journal Article
    Autor Bronstein O
    Journal Scientific Reports
    Seiten 5948
    Link Publikation
  • 2019
    Titel The Echinoderm Fauna of the Azores (NE Atlantic Ocean)
    DOI 10.11646/zootaxa.4639.1.1
    Typ Journal Article
    Autor Madeira P
    Journal Zootaxa
    Seiten 1-231
    Link Publikation
  • 2019
    Titel An annotated species list of regular echinoids from Sri Lanka with notes on some rarely seen temnopleurids
    DOI 10.11646/zootaxa.4571.1.3
    Typ Journal Article
    Autor Arachchige G
    Journal Zootaxa
    Seiten 35-57
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Phylogenomic analyses of echinoid diversification prompt a re-evaluation of their fossil record
    DOI 10.1101/2021.07.19.453013
    Typ Preprint
    Autor Koch N
    Seiten 2021.07.19.453013
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Phylogenomic analyses of echinoid diversification prompt a re-evaluation of their fossil record
    DOI 10.7554/elife.72460
    Typ Journal Article
    Autor Koch N
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Additional file 1: of Mind the gap! The mitochondrial control region and its power as a phylogenetic marker in echinoids
    DOI 10.6084/m9.figshare.6395117.v1
    Typ Other
    Autor Bronstein O
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Additional file 1: of Mind the gap! The mitochondrial control region and its power as a phylogenetic marker in echinoids
    DOI 10.6084/m9.figshare.6395117
    Typ Other
    Autor Bronstein O
    Link Publikation
  • 2018
    Titel The first mitochondrial genome of the model echinoid Lytechinus variegatus and insights into Odontophoran phylogenetics
    DOI 10.1016/j.ygeno.2018.04.008
    Typ Journal Article
    Autor Bronstein O
    Journal Genomics
    Seiten 710-718
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Implications of range overlap in the commercially important pan-tropical sea urchin genus Tripneustes (Echinoidea: Toxopneustidae)
    DOI 10.1007/s00227-019-3478-4
    Typ Journal Article
    Autor Bronstein O
    Journal Marine Biology
    Seiten 34
  • 2019
    Titel The first complete mitochondrial genome of the sand dollar Sinaechinocyamus mai (Echinoidea: Clypeasteroida)
    DOI 10.1016/j.ygeno.2019.10.007
    Typ Journal Article
    Autor Lin J
    Journal Genomics
    Seiten 1686-1693
    Link Publikation
  • 2019
    Titel The echinoid fauna from middle and southern Japan: a preliminary report
    DOI 10.11646/zoosymposia.15.1.14
    Typ Journal Article
    Autor Saitoh M
    Journal Zoosymposia
    Seiten 123-128
    Link Publikation
  • 2019
    Titel The Echinoderm Fauna of the Azores (NE Atlantic Ocean).
    DOI 10.11646/zootaxa.4639.1
    Typ Journal Article
    Autor Madeira P
    Journal Zootaxa
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Mind the gap! The mitochondrial control region and its power as a phylogenetic marker in echinoids
    DOI 10.1186/s12862-018-1198-x
    Typ Journal Article
    Autor Bronstein O
    Journal BMC Evolutionary Biology
    Seiten 80
    Link Publikation
Policies
  • 2010 Link
    Titel Contributions to the "World Register of Marine Species"
    DOI 10.14284/170
    Typ Influenced training of practitioners or researchers
    Link Link
Disseminationen
  • 0
    Titel Newspaper report "Der Stammbaum der Seeigel"
    Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview
  • 0 Link
    Titel Popular article "Stachelige Leckerbissen"
    Typ A magazine, newsletter or online publication
    Link Link
  • 0 Link
    Titel Radio interview "Der Seeigel - Das runde Stachel-Wunder"
    Typ A broadcast e.g. TV/radio/film/podcast (other than news/press)
    Link Link

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