Chemische Kommunikation in mykoparasitischen Interaktionen
CHEMICAL CROSS-TALK IN MYCOPARASITIC INTERACTIONS-ChemTalk
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (60%); Chemie (40%)
Keywords
-
Mass Spectrometry,
Metabolomics,
Chemical Cross-Talk,,
Secondary Metabolism,
Fungi,
Mycoparasitism
Schimmelpilze stellen eine reichhaltige Quelle an spezifischen Stoffwechselprodukten sogenannten Sekundärmetaboliten - dar, die einerseits als bioaktive Substanzen (zB. Antibiotika) Anwendung finden und andererseits auch für den Pilz selbst bei der Verteidigung und Kommunikation mit anderen Organismen bzw. als chemische Waffen nützlich sind. Dies trifft auch für mykoparasitische Pilze zu, die andere Pilze angreifen und parasitieren können und zu denen manche Arten der Gattung Trichoderma gehören. Die Bildung der meisten Sekundärmetaboliten erfordert die Anwesenheit spezifischer Reize, da die zugrundeliegenden Gene bei standardmäßiger Kultivierung im Labor nicht aktiv sind. Im vorliegenden Projekt sollen nun die Rolle von Sekundärmetaboliten bei der chemischen Kommunikation zwischen zwei Schimmelpilzen, dem Mykoparasiten Trichoderma atroviride und dem Pflanzenschädling Botrytis cinerea (Grauschimmel), im Detail untersucht und die aktivierenden Effekte dieser Interaktion auf die Bildung neuer Stoffwechselprodukte erforscht werden. Für diesen Zweck werden wir eine neuartige integrative Herangehensweise entwickeln, die aus einer Kombination modernster Methoden besteht und die gleichzeitige, detaillierte Untersuchung verschiedener zellulärer Ebenen ermöglicht. Das Zusammenführen von bildgebender Massenspektrometrie, hochauflösender Metabolomanalyse, Lebendzell-Mikroskopie und Analyse der Genexpression zu einem maßgeschneiderten Paket komplementärer Methoden wird zu neuen, noch nie dagewesenen Einblicken in die Rolle kleiner chemischer Moleküle während der komplexen mykoparasitischen Pilz-Pilz Interaktion und zur Entdeckung neuer pilzlicher Sekundärmetaboliten führen.
In diesem Forschungsprojekt wurde untersucht, wie der pflanzenfreundliche Pilz Trichoderma atroviride und der Pflanzenpathogen Botrytis cinerea (Grauschimmelkrankheit) durch den Austausch von chemischen Signalen miteinander interagieren. Bei diesen Signalen, den so genannten spezialisierten Metaboliten, handelt es sich um kleine Moleküle, die Pilze zur Kommunikation, zur Verteidigung oder zum Angriff auf andere einsetzen. Ziel war es, zu verstehen, wie diese chemischen Signale funktionieren, und neue zu entdecken, die für die Landwirtschaft oder die Medizin nützlich sein könnten. Pilze produzieren viele nützliche Verbindungen, wie z. B. Antibiotika, aber sie stellen diese Verbindungen nicht immer im Labor her. Um beide Pilze zur Produktion dieser verborgenen Chemikalien anzuregen, wurden sie zusammen kultiviert, um ihre natürliche Umgebung nachzuahmen, und es wurde getestet, wie bestimmte Chemikalien des einen Pilzes den anderen beeinflussen. Auf diese Weise wollten wir neue Verbindungen entdecken und verstehen, wie Pilze miteinander "kommunizieren". Wichtige Ergebnisse Wir konnten zeigen, dass die Menge und die Art der von T. atroviride produzierten Substanzen von den Lichtverhältnissen abhängen. Wenn der Pilz bei reduziertem Licht oder in Dunkelheit wuchs, erhöhte sich die Produktion bestimmter nützlicher Verbindungen, darunter 6-Pentyl--Pyron (6-PP), das antimykotische und das Pflanzenwachstum fördernde Eigenschaften besitzt. Das Team entdeckte außerdem das spezifische Gen (pks1), das für die 6-PP-Biosynthese verantwortlich ist. Wurde pks1 entfernt, stellte T. atroviride die Produktion von 6-PP ein und wurde weniger wirksam bei der Bekämpfung von B. cinerea. Es wurde gezeigt, dass der Schadpilz B. cinerea das von T. atroviride produzierte 6-PP abbauen und für seine eigene Energiegewinnung nutzen kann. Dies illustriert, dass Pilze nicht nur chemische Signale produzieren, sondern auch auf die Signale anderer Pilze reagieren und diese sogar verstoffwechseln können. Warum ist dies von Bedeutung? Diese Forschung hilft uns zu verstehen, wie Pilze in der Natur interagieren und konkurrieren. In Zukunft könnte dies zu einem besseren Pflanzenschutz führen, indem die pflanzenfördernde Wirkung von T. atroviride, einem natürlichen Mittel zur Bekämpfung von durch B. cinerea verursachten Pflanzenkrankheiten, gezielt verbessert wird. Der Einsatz solcher biologischen Pflanzenschutzmittel ist ein nachhaltiger Ansatz zur Bekämpfung von Pflanzenkrankheiten, ohne dass auf schädliche Chemikalien zurückgegriffen werden muss. Darüber hinaus könnten die erzielten Ergebnisse den Weg für die Suche nach neuen Chemikalien ebnen, die in der Landwirtschaft, Medizin oder Industrie eingesetzt werden können. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses Projekt unser Verständnis von Pilzinteraktionen verbessert und neue Möglichkeiten eröffnet hat, das Potential der Pilze zur Bewältigung von Herausforderungen in der Landwirtschaft und im Umweltschutz zu nutzen. Das interdisziplinäre Team hat herausgefunden, wie Pilze über sekundäre Stoffwechselprodukte kommunizieren, und die Tür zur Entdeckung neuer, nützlicher Verbindungen für eine Vielzahl von Anwendungen geöffnet.
- Universität für Bodenkultur Wien - 34%
- Universität Innsbruck - 32%
- Technische Universität Wien - 34%
- Martina Marchetti-Deschmann, Technische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Rainer Schuhmacher, Universität für Bodenkultur Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 170 Zitationen
- 36 Publikationen
- 2 Künstlerischer Output
- 6 Datasets & Models
- 7 Disseminationen
- 6 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 1 Weitere Förderungen
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2024
Titel The histone deacetylase Hda1 affects oxidative and osmotic stress response as well as mycoparasitic activity and secondary metabolite biosynthesis in Trichoderma atroviride DOI 10.1128/spectrum.03097-23 Typ Journal Article Autor Speckbacher V Journal Microbiology Spectrum Link Publikation -
2023
Titel Identification and evaluation of suitable reference genes for RT-qPCR analyses in Trichoderma atroviride under varying light conditions DOI 10.1186/s40694-023-00167-w Typ Journal Article Autor Flatschacher D Journal Fungal Biology and Biotechnology Seiten 20 Link Publikation -
2023
Titel MetInclude: A User-Configurable Method for Constructing Optimized Inclusion Lists for Untargeted LC-HRMS/MS Measurements Typ Conference Proceeding Abstract Autor Bueschl Konferenz Junganalytiker*innen Forum, Leoben, Austria -
2023
Titel The mycoparasitic behaviour of the fungus Trichoderma atroviride is shaped by a hidden chemical crosstalk Typ Conference Proceeding Abstract Autor Moreno-Ruiz D Konferenz FEMS 2023, Hamburg -
2023
Titel A hidden chemical cross-talk shapes the mycoparasitic behavior of Trichoderma atroviride Typ Conference Proceeding Abstract Autor Moreno-Ruiz D Konferenz Trichoderma & Clonostachys Workshop, 16th European Conference on Fungal Genetics (ECFG16; March 4 - 8, 2023), Innsbruck, Austria -
2023
Titel Comparative evaluation of the secondary metabolome of Trichoderma atroviride under three common light conditions Typ Conference Proceeding Abstract Autor Flatschacher D Konferenz 16th European Conference on Fungal Genetics, Innsbruck, Austria -
2023
Titel Towards identification of the genetic basis of 6-pentyl-alpha-pyrone biosyn-thesis in Trichoderma atroviride. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Eschlböck A Konferenz 16th European Conference on Fungal Genetics, Innsbruck, Austria -
2023
Titel Master thesis : Towards identification of the genetic basis of 6-pentyl-alpha-pyrone biosynthesis in Trichoderma atroviride Typ Other Autor Eschlböck A -
2025
Titel Simply cut out – Combining CRISPR/Cas9 RNPs and transiently selected telomere vectors for marker free-gene deletion in Trichoderma atroviride DOI 10.1101/2025.05.06.652419 Typ Preprint Autor Gründlinger M Seiten 2025.05.06.652419 Link Publikation -
2025
Titel Metabolite-mediated interactions of the mycoparasitic fungus Trichoderma atroviride with plant pathogenic and plant benefical microbes Typ Conference Proceeding Abstract Autor Flatschacher D Konferenz 17th European Conference on Fungal Genetics (ECFG17), Dublin, Ireland -
2025
Titel Insights into 6-Pentyl--Pyrone biosynthesis in Trichoderma atroviride Typ Conference Proceeding Abstract Autor Eschlböck A Konferenz 17th European Conference on Fungal Genetics (ECFG17), Dublin, Ireland -
2025
Titel Simply cut out – Combining CRISPR/Cas9 RNPs and transiently selected telomere vectors for marker free-gene deletion in Trichoderma atroviride DOI 10.3389/fgeed.2025.1623963 Typ Journal Article Autor Gründlinger M Journal Frontiers in Genome Editing Seiten 1623963 Link Publikation -
2024
Titel A hidden chemical crosstalk shapes the mycoparasitic behaviour of the fungus Trichoderma atroviride Typ Conference Proceeding Abstract Autor Moreno-Ruiz D Konferenz 12th International Mycological Congress (IMC12) -
2024
Titel Linking a polyketide synthase gene cluster to 6-pentyl-alpha-pyrone, a Trichoderma atroviride metabolite with diverse bioactivities Typ Conference Proceeding Abstract Autor Eschlböck A Konferenz 12th International Mycological Congress (IMC12), Maastricht, Netherlands -
2023
Titel Light-Induced Changes in Secondary Metabolite Production of Trichoderma atroviride DOI 10.3390/jof9080785 Typ Journal Article Autor Missbach K Journal Journal of Fungi Seiten 785 Link Publikation -
2021
Titel Stress-Activated Protein Kinase Signalling Regulates Mycoparasitic Hyphal-Hyphal Interactions in Trichoderma atroviride DOI 10.3390/jof7050365 Typ Journal Article Autor Moreno-Ruiz D Journal Journal of Fungi Seiten 365 Link Publikation -
2021
Titel Environmental and endogenous cues as well as strain- and developmental stage-specific responses affect biology and mycoparasitism of the biocontrol agent Trichoderma atroviride Typ Conference Proceeding Abstract Autor Moreno-Ruiz D Konferenz Second International Congress of Biological Control, Davos, Switzerland -
2021
Titel Microbial blind dates: MALDI MSI to capture fungal interactions occurring in a microassay Typ Conference Proceeding Abstract Autor Kirnbauer S Konferenz 69th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Philadelphia, USA -
2021
Titel Investigating the exometabolome of the mycoparasitic fungus Trichoderma atroviride under different light conditions using stable isoptope labeling Typ Conference Proceeding Abstract Autor Flatschacher D Konferenz Metabolomics 2021, online -
2021
Titel PhD thesis: Chemotropism in Trichoderma atroviride Typ Other Autor Moreno-Ruiz D -
2021
Titel Visualizing fungal secondary metabolites on an agar-based confrontation assay Typ Conference Proceeding Abstract Autor Kirnbauer Konferenz OurCon2021, Sheffield, UK -
2021
Titel MetInclude: An Efficient, User-Configurable Method to Selectively Generate Optimized Inclusion Lists for LC-HRMS/MS Typ Conference Proceeding Abstract Autor Bueschl Konferenz Metabolomics 2021 Online -
2020
Titel Influence of Different Light Regimes on the Mycoparasitic Activity and the Production of the Secondary Metabolite 6-Pentyl--Pyrone in Two Strains of <em>Trichoderma Atroviride</em> DOI 10.20944/preprints202009.0251.v1 Typ Preprint Autor Fuchs A -
2022
Titel FT-ICR Mass Spectrometry Imaging at Extreme Mass Resolving Power Using a Dynamically Harmonized ICR Cell with 1? or 2? Detection DOI 10.1021/acs.analchem.2c00754 Typ Journal Article Autor Tiquet M Journal Analytical Chemistry Seiten 9316-9326 Link Publikation -
2022
Titel FTICR Mass spectrometry imaging at extreme mass resolving power using a dynamically harmonized ICR cell with 1 or 2 detection DOI 10.26434/chemrxiv-2022-5w90f-v3 Typ Preprint Autor La Rocca R -
2022
Titel MetInclude Selects Better MS/MS Targets than DDA Typ Conference Proceeding Abstract Autor Bueschl Konferenz 9th PhD Conference Tulln (DocDay) 2022, Tulln, Austria -
2022
Titel MetInclude: A User-Configurable Method for Construction of Optimized Inclusion Lists for Untargeted LC-HRMS/MS Measurements (Poster) Typ Conference Proceeding Abstract Autor Bueschl Konferenz Metabolomics 2022, Valencia, Spain -
2022
Titel The mycoparasitic interaction of Trichoderma atroviride with prey fungi is governed by environmental and endogenous cues as well as developmental stage-specific responses Typ Conference Proceeding Abstract Autor Zeilinger S Konferenz VAAM Annual Conference 2022 -
2022
Titel Visualizing the interaction of Trichoderma atroviride and Botrytis cinerea with MALDI imaging Typ Conference Proceeding Abstract Autor Kirnbauer S Konferenz ISMC 2022, Maastricht, The Netherlands. -
2022
Titel Investigating the metabolome of Trichoderma atroviride and Botrytis ciner-ea under different light conditions using stable isotope labelling Typ Conference Proceeding Abstract Autor Kirnbauer S Konferenz ASAC JunganalytikerInnen Forum, Tulln, Austria -
2022
Titel Untargeted isotope-assisted metabolomics of the biocontrol fungus Trichoderma atroviride: how does light affect the formation of secondary metabo-lites? Typ Conference Proceeding Abstract Autor Flatschacher D Konferenz Metabolomics 2022, Valencia, Spain. -
2022
Titel qRAT: an R-based stand-alone application for relative expression analysis of RT-qPCR data DOI 10.1186/s12859-022-04823-7 Typ Journal Article Autor Flatschacher D Journal BMC Bioinformatics Seiten 286 Link Publikation -
2022
Titel FTICR Mass spectrometry imaging at extreme mass resolving power using 1 a dynamically harmonized ICR cell with 1? or 2? detection DOI 10.26434/chemrxiv-2022-5w90f-v2 Typ Preprint Autor Tiquet M Link Publikation -
2020
Titel The Lipoxygenase Lox1 Is Involved in Light- and Injury-Response, Conidiation, and Volatile Organic Compound Biosynthesis in the Mycoparasitic Fungus Trichoderma atroviride DOI 10.3389/fmicb.2020.02004 Typ Journal Article Autor Speckbacher V Journal Frontiers in Microbiology Seiten 2004 Link Publikation -
2020
Titel Chemotropism Assays for Plant Symbiosis and Mycoparasitism Related Compound Screening in Trichoderma atroviride DOI 10.3389/fmicb.2020.601251 Typ Journal Article Autor Moreno-Ruiz D Journal Frontiers in Microbiology Seiten 601251 Link Publikation -
2020
Titel Influence of Different Light Regimes on the Mycoparasitic Activity and 6-Pentyl-a-pyrone Biosynthesis in Two Strains of Trichoderma atroviride DOI 10.3390/pathogens9100860 Typ Journal Article Autor Moreno-Ruiz D Journal Pathogens Seiten 860 Link Publikation
-
2022
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Titel Additional file 3 of qRAT: an R-based stand-alone application for relative expression analysis of RT-qPCR data DOI 10.6084/m9.figshare.20342157 Typ Image Link Link -
2022
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Titel Additional file 4 of qRAT: an R-based stand-alone application for relative expression analysis of RT-qPCR data DOI 10.6084/m9.figshare.20342163 Typ Image Link Link
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2022
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Titel Additional file 2 of qRAT: an R-based stand-alone application for relative expression analysis of RT-qPCR data DOI 10.6084/m9.figshare.20342154 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Additional file 5 of qRAT: an R-based stand-alone application for relative expression analysis of RT-qPCR data DOI 10.6084/m9.figshare.20342166 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Additional file 1 of qRAT: an R-based stand-alone application for relative expression analysis of RT-qPCR data DOI 10.6084/m9.figshare.20342151 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2022
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Titel Additional file 6 of qRAT: an R-based stand-alone application for relative expression analysis of RT-qPCR data DOI 10.6084/m9.figshare.20342169 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Additional file 3 of Identification and evaluation of suitable reference genes for RT-qPCR analyses in Trichoderma atroviride under varying light conditions DOI 10.6084/m9.figshare.26620654 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Additional file 4 of Identification and evaluation of suitable reference genes for RT-qPCR analyses in Trichoderma atroviride under varying light conditions DOI 10.6084/m9.figshare.26620657 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2024
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Titel participation at outreach activity "Lange Nacht der Forschung" Typ Participation in an open day or visit at my research institution Link Link -
2024
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Titel Participation in outreach activity "Microbaplina" microbe zoo Typ Engagement focused website, blog or social media channel Link Link -
2023
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Titel interview for national newspaper "Die Presse am Sonntag" Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2023
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Titel interview for Podcast "IQ - Wissenschaft und Forschung, Bayern 2 " Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2023
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Titel participation in outreach activity "Tiroler Hochschultag" Typ Participation in an open day or visit at my research institution Link Link -
2023
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Titel Interview for national news, ORF Tirol Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview Link Link -
2023
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Titel interview for national newspaper Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link
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2024
Titel visiting scientist Tereza Jezkova from Faculty of Science, Charles University, Czech Republic Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel A hidden chemical crosstalk shapes the mycoparasitic behaviour of the fungus Trichoderma atroviride. Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel A hidden chemical cross-talk shapes the mycoparasitic behavior of Trichoderma atroviride Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel The mycoparasitic interaction of Trichoderma atroviride with prey fungi is governed by environmental and endogenous cues as well as developmental stage-specific responses Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2021
Titel Environmental and endogenous cues as well as strain- and developmental stage-specific responses affect biology and mycoparasitism of the biocontrol agent Trichoderma atroviride Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2020
Titel nominated as Associate Editor for the Journal "Frontiers in Fungal Biology" Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series Bekanntheitsgrad Continental/International
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2019
Titel CHEMICAL CROSS-TALK IN MYCOPARASITIC INTERACTIONS-ChemTalk Typ Other Förderbeginn 2019 Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)