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Licht-vermittelte Kontrolle der TRPC3 Funktion

Illuminating the TRPC3 signaling machinery

Klaus Groschner (ORCID: 0000-0002-8659-377X)
  • Grant-DOI 10.55776/P33263
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2020
  • Projektende 31.08.2024
  • Bewilligungssumme 391.381 €
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (60%); Informatik (20%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (20%)

Keywords

    Lipid Mediators, Photopharmacology, TRPC3, Diacylglycerol, Transient Receptor Potential Channels

Abstract Endbericht

Ionenkanäle der TRPC Familie sind Eiweißmoleküle (Proteine) die in der Zellmembran von fast allen menschlichen Zellen vorkommen und Angriffspunkte für die medikamentöse (pharmakologische) Behandlung von verschiedensten Erkrankungen darstellen. Die Bezeichnung TRPC leitet sich von der Funktion dieser Moleküle in den Insekten ab in denen sie erstmals entdeckt wurden. Ein Defekt in der TRPC Funktion führt in der Fruchtfliege zur Erblindung durch zeitliche Verkürzung der Reaktion von Sehzellen (Lichtrezeptoren), was als sogenanntes transientes Rezeptorpotential (TRP) erkennbar wird. Störungen der Funktion von klassischen (classical) TRP Molekülen (TRPC) werden bei Menschen insbesondere für Erkrankungen des Nervensystems (Neurodegeneration), desHerzkreislaufsystems(Herzmuskelschwäche, Herzrhythmusstörungen) sowie der Niere (Niereninsuffizienz), aber auch für Tumorerkrankungen verantwortlich gemacht. Dementsprechend erscheint die Entwicklung von Wirkstoffen mit spezifischem Angriffspunkt an TRPC Kanalproteinen sehr attraktiv für die Entwicklung neuer, verbesserter Therapien gegen diese Erkrankungen. Die zentrale Hürde auf dem Weg dieser Entwicklung ist die weite Verbreitung von ähnlichen TRPC Kanälen im menschlichen Körper wodurch eine besonders hohe Spezifität des therapeutischen Eingriffes nötig wird. Darüber hinaus ist noch weitgehend unklar, ob und wie sich bestimmte TRPC Kanäle in verschiedenen Organen des menschlichen Körpers in ihrer Funktion unterscheiden. Ein hervorstechendes Merkmal des TRPC3 Proteins, eines wichtigen Vertreters dieser Ionenkanalfamile, ist die Fähigkeit, seine Umgebung in der Zellmembran hinsichtlich ihrer Fett(Lipid)-Zusammensetzung zu erkennen. Spezielle Membranlipide werden innerhalb des TRPC3 Moleküls an noch nicht klar identifizierte Stellen gebunden und bestimmen so seine Funktion. Seit kurzem ist man in der Lage, die Wirkung solcher regulatorischen Lipide oder aber auch synthetischer Wirkstoffe, die an TRPC3 Kanäle binden, gezielt und effektiv durch Licht zu kontrollieren. Dabei kann der aktive Zustand von Lipiden und auch von synthetischen Wirkstoffen durch Licht bestimmter Wellenlängen ein- und ausgeschaltet werden. Die Licht-vermittelte Kontrolle der TRPC3 Funktion ist damit ohne direkten Kontakt und mit sehr hoher zeitlicher und räumlicher Präzision möglich. Diese Methode einer lichtvermittelten Kontrolle von Proteinen und damit von Organfunktionen wird als Photopharmakologie bezeichnet. Im vorliegenden Projekt sollen einerseits die genauen molekularen Mechanismen der Beeinflussung von TRPC3 durch Lipide und synthetische Wirkstoffe geklärt und andererseits Möglichkeiten einer völlig neuen und hochspezifischen Kontrolle dieser Moleküle in erkrankten menschlichen Geweben durch Photopharmakologie entwickelt werden.

Das Projekt P 33263-B wurde konzipiert, um unser Wissen über ein Ca2+-permeables Kanalprotein mit der Bezeichnung TRPC3 (transient receptor potential channel canonical 3) zu erweitern. Dieser Kationenkanal ist für die Erzeugung von Ca2+-Signalen in einer Vielzahl menschlicher Gewebe beteiligt und damit für deren Funktion von zentraler Bedeutung. TRPC3 wurde als potenzielles Ziel für die Therapie neurologischer Erkrankungen wie Epilepsie, kognitiver Dysfunktion und Neurodegeneration vorgeschlagen. Auch im Hinblick auf kardiovaskuläre Erkrankungen, insbesondere Bluthochdruck, kardiale Remodellierung und Herzrhythmusstörungen erscheint TRPC3 als attraktive therapeutische Zielstruktur. TRPC3 wird auch als ein mögliches Ziel für die Behandlung von Diabetes mellitus und bestimmten Krebsarten ansehen. Trotz der überwältigenden Beweise für eine Rolle von TRPC3 in der menschlichen Physiopathologie wurde bisher enttäuschend wenig Fortschritt bei der Entwicklung klinischer Anwendungen erzielt. Dieses Dilemma ist zum Teil auf das noch immer fehlende Wissen über die zelluläre Kontrolle durch spezifische regulatorische Strukturen innerhalb des TRPC3-Proteins zurückzuführen. Unsere Arbeitshypothese für das Projekt P 33263-B basierte auf einem Konzept, in dem der TRPC3 Kanal durch verschiedene Lipidmoleküle, die an regulatorische Stellen im Kanal binden, kontrolliert wird. Das übergreifende Ziel unseres Projekts war es unser Verständnis über die Struktur-Funktions-Beziehungen dieser Lipidregulation von TRPC3 zu verbessern. Um dieses Ziel zu erreichen, verwendeten wir eine interdisziplinäre Strategie, die einen effizienten Zyklus aus Hypothesenbildung und Hypothesenprüfung umfasste. Dabei werden zuerst mögliche regulatorische Strukturen und kritische Aminosäuren innerhalb des Kanals durch computergestützte Modellierung identifiziert. Die Relevanz dieser Strukturen wurde dann durch Mutagenese und funktionelle Aufzeichnungen getestet und die funktionellen Phänotypen der Kanalmutationen nachfolgend rigoros auf Übereinstimmung mit unserem Modell geprüft. Unsere experimentelle Strategie umfasste auch eine Technologie zur hochpräzisen Analyse von Lipid-Protein Interaktionen. Aktive Lipidmoleküle wurden dabei mit hoher zeitlicher und räumlicher Präzision durch Lipid-Photopharmakologie generiert. Dadurch konnten TRPC3-Kanäle genau definierten Veränderungen der regulatorischen Lipide ausgesetzt werden. Insgesamt hat unsere Arbeit wichtige neue Einblicke in die zelluläre Regulierung von TRPC3 erbracht. Auf der Grundlage unserer Ergebnisse schlagen wir nun vor, dass TRPC3 mehrere regulatorische Lipidmoleküle innerhalb des Kanalkomplexes binden kann. Wir haben jene Mechanismen identifiziert, durch die Diacylglycerin, Phosphatidy-linositol-bisphosphat und Cholesterin die zelluläre Aktivität der TRPC3-Kanäle steuern. Unsere Arbeiten zeigen, dass diese Lipide unterschiedliche Bindungsstellen in TRPC3 besetzen. Darüber hinaus haben wir Befunde für eine allosterische Kommunikation zwischen den unterschiedlichen sensorischen Lipidbindungsstellen erhalten. Wir schlagen ein Konzept vor, bei dem die komplexe Lipidsensorik von TRPC3 in zentraler Weise daran beteiligt ist die Kanalaktivität an den metabolischen und funktionellen Zustand eines Gewebes anzupassen. Unsere Ergebnisse ebnen damit den Weg zu einem besseren Verständnis der zellulären Rolle und Regulierung von TRPC3, und werden voraussichtlich die Entwicklung therapeutischer Maßnahmen mit TRPC3 als Zielmolekül vorantreiben.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 32%
  • Medizinische Universität Graz - 53%
  • Universität Graz - 15%
Nationale Projektbeteiligte
  • Thomas Stockner, Medizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
  • Toma Glasnov, Universität Graz , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Dirk Trauner, University of Pennsylvania - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 84 Zitationen
  • 22 Publikationen
  • 2 Datasets & Models
  • 4 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2022
    Titel Exploring TRPC3 Interaction with Cholesterol through Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulations
    DOI 10.3390/biom12070890
    Typ Journal Article
    Autor Clarke A
    Journal Biomolecules
    Seiten 890
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Two-Dimensional Interfacial Exchange Diffusion Has the Potential to Augment Spatiotemporal Precision of Ca Signaling
    DOI 10.14288/1.0406619
    Typ Other
    Autor Fameli N
    Link Publikation
  • 2021
    Titel 2D interfacial exchange-diffusion has the potential to augment spatiotemporal precision of Ca2+ signalling
    DOI 10.22541/au.163578735.52407243/v1
    Typ Preprint
    Autor Breemen C
    Link Publikation
  • 2021
    Titel TRPC3, an underestimated, universal pacemaker channel?
    DOI 10.1016/j.ceca.2021.102484
    Typ Journal Article
    Autor Tiapko O
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102484
  • 2024
    Titel TRPC1: The housekeeper of the hippocampus
    DOI 10.1016/j.ceca.2024.102933
    Typ Journal Article
    Autor Skerjanz J
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102933
    Link Publikation
  • 2024
    Titel LIPID COORDINATION IN TRPC CHANNELS AND THE COMMUNICATION BETWEEN TRP COMPLEXES AND MEMBRANE LIPIDS
    Typ PhD Thesis
    Autor Hazel Erkan-Candag
  • 2024
    Titel Unravelling the interaction of TRPC3 with its lipid environment through a coarse-grained molecular dynamics approach
    Typ PhD Thesis
    Autor Amy Clarke
  • 2023
    Titel Nanojunctions: Specificity of Ca2+ signalling requires nano-scale architecture of intracellular membrane contact sites
    DOI 10.1101/2023.02.17.528983
    Typ Preprint
    Autor Fameli N
    Seiten 2023.02.17.528983
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Nanojunctions: Specificity of Ca2+ signaling requires nano-scale architecture of intracellular membrane contact sites
    DOI 10.1016/j.ceca.2023.102837
    Typ Journal Article
    Autor Fameli N
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102837
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Calcium transport and sensing in TRPC channels – New insights into a complex feedback regulation
    DOI 10.1016/j.ceca.2023.102816
    Typ Journal Article
    Autor Baron J
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102816
  • 2022
    Titel TRPC3 governs the spatiotemporal organization of cellular Ca2+ signatures by functional coupling to IP3 receptors
    DOI 10.1016/j.ceca.2022.102670
    Typ Journal Article
    Autor Curcic S
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102670
  • 2024
    Titel PIP2 modulates TRPC3 activity via TRP helix and S4-S5 linker
    DOI 10.1038/s41467-024-49396-6
    Typ Journal Article
    Autor Clarke A
    Journal Nature Communications
    Seiten 5220
    Link Publikation
  • 2024
    Titel De novo variants in GABRA4 are associated with a neurological phenotype including developmental delay, behavioral abnormalities and epilepsy
    DOI 10.1038/s41431-024-01600-3
    Typ Journal Article
    Autor Sajan S
    Journal European Journal of Human Genetics
    Seiten 912-919
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Bidirectional Allosteric Coupling between PIP2 Binding and the Pore of the Oncochannel TRPV6
    DOI 10.3390/ijms25010618
    Typ Journal Article
    Autor Humer C
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 618
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Probing binding and occlusion of substrate in the human creatine transporter-1 by computation and mutagenesis
    DOI 10.1002/pro.4842
    Typ Journal Article
    Autor Clarke A
    Journal Protein Science
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Coordinating the regulatory dance: how PIP2 modulates TRPC3 activity via TRP helix and S4-S5 linker
    DOI 10.21203/rs.3.rs-3552323/v1
    Typ Preprint
    Autor Clarke A
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Arriving at the next level of complexity in IP3R and SOCE signaling
    DOI 10.1016/j.ceca.2023.102796
    Typ Journal Article
    Autor Groschner K
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102796
  • 2022
    Titel Two-Dimensional Interfacial Exchange Diffusion Has the Potential to Augment Spatiotemporal Precision of Ca2+ Signaling
    DOI 10.3390/ijms23020850
    Typ Journal Article
    Autor Van Breemen C
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 850
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Characterization of DAG Binding to TRPC Channels by Target-Dependent cis–trans Isomerization of OptoDArG
    DOI 10.3390/biom12060799
    Typ Journal Article
    Autor Erkan-Candag H
    Journal Biomolecules
    Seiten 799
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Diacylglycerols interact with the L2 lipidation site in TRPC3 to induce a sensitized channel state
    DOI 10.15252/embr.202154276
    Typ Journal Article
    Autor Erkan-Candag H
    Journal The EMBO Reports
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Light-Mediated Control over TRPC3-Mediated NFAT Signaling
    DOI 10.3390/cells9030556
    Typ Journal Article
    Autor Graziani A
    Journal Cells
    Seiten 556
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Mechanisms and significance of Ca2+ entry through TRPC channels
    DOI 10.1016/j.cophys.2020.06.005
    Typ Journal Article
    Autor Bacsa B
    Journal Current Opinion in Physiology
    Seiten 25-33
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2025 Link
    Titel Data set for "Diacylglycerols interact with the L2 lipidation site in TRPC3 to induce a sensitized channel state
    DOI 10.5281/zenodo.14761493
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel PIP2 modulates TRPC3 activity via TRP helix and S4-S5 linker
    DOI 10.5281/zenodo.11259097
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2023
    Titel Abstract selected for additional oral presentation at the ECS Meeting 2024 (Cambridge, GB)
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Invitation as a speaker at the Cellular and Organellar Ca2+ Signaling Conference 2023 (Haifa, Israel)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Invited as a speaker at the 2023 GRC on Organellar Channels and Transporters (Barcelona, Spain)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2022
    Titel Invited as speaker at the Ca2+ Signaling GRC 2022 (Ventura, USA)
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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