Polyoxometallat-unterstützte Proteinkristallisation
Polyoxometalate facilitated protein crystallization
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (50%); Chemie (50%)
Keywords
-
Polyoxometalate,
Polyoxometalate Protein Interaction,
Protein Crystallization,
Crystallography,
Protein Screening Set,
Metal Clusters
Polyoxometallate (POMs) bilden eine große Stoffklasse polyatomischer (Übergangs)metall- Oxyanionen, die ein breites Anwendungsspektrum z.B. in der Katalyse, als Sensoren, in der Bio- und Nanotechnologie, in der Medizin und den Materialwissenschaften besitzen. Bislang gibt es nur sehr wenige Studien, die speziell die Wechselwirkung zwischen Proteinen und POMs hinsichtlich ihres Potentials zur Unterstützung der Proteinkristallisation untersuchen. Dieses beantragte Projekt wurde konzipiert, um zum grundlegenden molekularen Verständnis der Interaktion zwischen verschiedenen POM-Grundstrukturen und Proteinen beizutragen. Es sollen strukturell bereits bekannte POMs (Na6[V10O28] 18H2O, Na6[TeW 6O24] 22H2O, Na14[NaP5W 30O110] 31H2O und Na6[P2W 18O62] 18H2O) und neue POMs (Anderson-, Keggin- und Lindqvist-POMs) sowie Hydrid-POMs synthetisiert und mittels verschiedener spektroskopischer Techniken und der Röntgenstrukturanalyse charakterisiert werden. Ein Hauptziel ist es sowohl die Wasserlöslichkeit als auch die pH- Stabilität der POM-Verbindungen zu untersuchen. Die Strukturen neuer POM-Protein-Komplexe sollen röntgenographisch untersucht werden. Dazu werden die aufgereinigten Proteine biochemischen und molekularbiologischen Charakterisierungsmethoden und anschließend der Röntgenstrukturanalyse unterzogen. Die Zielproteine sind das Lysozym aus Hühnereiweiß, Proteinase K, humanes apo- Transferrin, humanes Serumalbumin, Myosin, Polyphenoloxidase, Hämocyanin und das Membranprotein Bacteriorhodopsin. Die Ergebnisse dieses Projektes werden zum grundlegenden Verständnis sowohl der physikalischen Eigenschaften von Polyoxometallaten als auch deren Wechselwirkungen mit Proteinen beitragen, an denen es aktuell in der Forschung fehlt. Dieses interdisziplinäre Projekt soll zur Etablierung eines kommerziellen POM-basierten Screening Kits führen, das die Kristallisation vieler Proteine vereinfachen soll. 1
Proteinkristallographie ist die am häufigsten verwendete Methode, um strukturelle Informationen über Zielproteine und Arzneimittel-Zielmolekül Wechselwirkungen zu erhalten. Diese strukturellen Informationen sind unverzichtbar für das Verständnis über den Großteil biologischer Prozesse. Das Erhalten von hochauflösenden Kristallen ist der wichtigste Schritt aber jedoch auch die Engstelle in der Röntgenstrukturanalyse, da dieser Prozess sehr zeit- und ressourcenaufwendig ist und ohne jegliche Garantie auf Erfolg. Das Verwenden von Additiven ist eine etablierte Methode, um die Kristallisation von Proteinen zu erleichtern oder gar zu ermöglichen, jedoch sind Additive nur begrenzt auf einige Proteine und unter bestimmten Bedingungen einsetzbar. Deshalb gibt es das Bestreben ein universelleres Additiv zu etablieren, welches ein breiteres Spektrum an Proteinen adressiert und in der Lage ist, noch strukturell unbekannte Proteine zu kristallisieren. Deshalb haben wir einige Verbindungen aus der Gruppe der Polyoxometallate (POMs) auf ihre Tauglichkeit, als Additive zu fungieren, untersucht. POMs sind Cluster von Übergangsmetall- (u.a. Molybdän, Wolfram) und Sauerstoffatomen, die eine beeindruckende Vielfalt an Größe und Struktur besitzen und zudem hervorragende Eigenschaften und Funktionen. Unsere bisherigen Untersuchungen zeigten, dass das Anderson-Evans Polyoxowolframat [TeW 6O24]6- (TEW) den geeignetsten POM-Archetyp für die Proteinkristallisation darstellt, da TEW die Kristallisationen zweier vorher unbekannter Proteine, die Polyphenoloxidase aus Champignons (abPPO4) und die Auronsynthase aus Coreopsis grandiflora (cgAUS1) ermöglichte und zur Kristallisation des Standardproteins Hühnereiweiß-Lysozym in einer neuen Kristallform und zu einer neuen Kristallpackung in der Kristallstruktur der Nukleotidbindedomäne von HSP70 führte. TEW ist ein mächtiges Kristallisationsadditiv, welches große Vorteile gegenüber üblichen, verwendeten Additiven mit sich bringt. Durch seine sechs-fach negative Ladung bindet TEW an positiv geladene Proteinstellen aber auch an polare und ungeladene Regionen. Auf diese Weise wirkt TEW wie ein anorganischer Kleber, da es überwiegend gleich(positiv)-geladene Proteinregionen miteinander verbindet und somit die Ausbildung des Kristallgitters erleichtert. Unter den meisten Kristallisationsbedingungen ist TEW stabil und leistet durch das Freisetzen einer großen Anzahl von Wassermolekülen während der Ausbildung von Kristallkontakten einen enormen entropischen Beitrag zur Kristallisationsenergie, was wiederum die Kristallisation energetisch begünstigt. Desweiteren liefert es wertvolle anomale Signale, die für das Phasing von Proteinen, die kein passendes Homolog für das Molecular Replacement Verfahren besitzen, notwendig sind. All diese Eigenschaften und Ergebnisse sorgen dafür, dass TEW erfolgreich auf dem Markt etabliert wurde, indem es nun als Teil eines Kristallisations-Screens (Jena Biosciences) für alle Kristallographen käuflich zugänglich ist.
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 2796 Zitationen
- 40 Publikationen
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2019
Titel Keggin-type polyoxotungstates as mushroom tyrosinase inhibitors - A speciation study DOI 10.1038/s41598-019-41261-7 Typ Journal Article Autor Breibeck J Journal Scientific Reports Seiten 5183 Link Publikation -
2019
Titel Inhibition of Na+/K+- and Ca2+-ATPase activities by phosphotetradecavanadate DOI 10.1016/j.jinorgbio.2019.110700 Typ Journal Article Autor Fraqueza G Journal Journal of Inorganic Biochemistry Seiten 110700 Link Publikation -
2019
Titel Synthesis, characterization, and POM-protein interactions of a Fe-substituted Krebs-type Sandwich-tungstoantimonate DOI 10.1007/s00706-019-2381-5 Typ Journal Article Autor Tanuhadi E Journal Monatshefte für Chemie - Chemical Monthly Seiten 871-875 Link Publikation -
2019
Titel Transition metal-substituted Keggin polyoxotungstates enabling covalent attachment to proteinase K upon co-crystallization DOI 10.1039/c9cc05818d Typ Journal Article Autor Breibeck J Journal Chemical Communications Seiten 11519-11522 Link Publikation -
2021
Titel Wells–Dawson phosphotungstates as mushroom tyrosinase inhibitors: a speciation study DOI 10.1038/s41598-021-96491-5 Typ Journal Article Autor Lampl R Journal Scientific Reports Seiten 19354 Link Publikation -
2021
Titel Speciation of Transition-Metal-Substituted Keggin-Type Silicotungstates Affected by the Co-crystallization Conditions with Proteinase K DOI 10.1021/acs.inorgchem.1c02005 Typ Journal Article Autor Breibeck J Journal Inorganic Chemistry Seiten 15096-15100 Link Publikation -
2020
Titel Synthesis, Characterization, and Phosphoesterase Activity of a Series of 4f- and 4d-Sandwich-Type Germanotungstates [(n-C4H9)4N] l/m H2[(M(H2O)3)(?-GeW10O35)2] (M = CeIII, NdIII, GdIII, ErIII, l = 7; ZrIV, m = 6) DOI 10.1021/acs.inorgchem.0c01852 Typ Journal Article Autor Tanuhadi E Journal Inorganic Chemistry Seiten 14078-14084 Link Publikation -
2020
Titel Polyoxometalates in solution: speciation under spotlight DOI 10.1039/d0cs00392a Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Chemical Society Reviews Seiten 7568-7601 Link Publikation -
2020
Titel The Aquaporin-3-Inhibiting Potential of Polyoxotungstates DOI 10.3390/ijms21072467 Typ Journal Article Autor Pimpão C Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 2467 Link Publikation -
2020
Titel Cation-Directed Synthetic Strategy Using 4f Tungstoantimonates as Nonlacunary Precursors for the Generation of 3d–4f Clusters DOI 10.1021/acs.inorgchem.0c00890 Typ Journal Article Autor Tanuhadi E Journal Inorganic Chemistry Seiten 8461-8467 Link Publikation -
2018
Titel Polyoxometalates: more than a phasing tool in protein crystallography DOI 10.1007/s40828-018-0064-1 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal ChemTexts Seiten 10 Link Publikation -
2018
Titel Successful amphiphiles as the key to crystallization of membrane proteins: Bridging theory and practice DOI 10.1016/j.bbagen.2018.11.004 Typ Journal Article Autor Breibeck J Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects Seiten 437-455 Link Publikation -
2018
Titel Synthesis of the first Zn 6 -hexagon sandwich-tungstoantimonate via rearrangement of a non-lacunary Krebs-type polyoxotungstate DOI 10.1039/c8dt02787k Typ Journal Article Autor Tanuhadi E Journal Dalton Transactions Seiten 15651-15655 Link Publikation -
2020
Titel Incorporation of CrIII into a Keggin Polyoxometalate as a Chemical Strategy to Stabilize a Labile {CrIIIO4} Tetrahedral Conformation and Promote Unattended Single-Ion Magnet Properties DOI 10.1021/jacs.9b12797 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 3336-3339 Link Publikation -
2020
Titel Binding of a Fatty Acid-Functionalized Anderson-Type Polyoxometalate to Human Serum Albumin DOI 10.1021/acs.inorgchem.9b03407 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Inorganic Chemistry Seiten 5243-5246 Link Publikation -
2020
Titel Aluminum-Substituted Keggin Germanotungstate [HAl(H2O)GeW11O39]4–: Synthesis, Characterization, and Antibacterial Activity DOI 10.1021/acs.inorgchem.0c03311 Typ Journal Article Autor Tanuhadi E Journal Inorganic Chemistry Seiten 28-31 Link Publikation -
2017
Titel The potential of hexatungstotellurate(VI) to induce a significant entropic gain during protein crystallization DOI 10.1107/s2052252517012349 Typ Journal Article Autor Molitor C Journal IUCrJ Seiten 734-740 Link Publikation -
2016
Titel [Ni(OH) 3 W 6 O 18 (OCH 2 ) 3 CCH 2 OH] 4- : the first tris-functionalized Anderson-type heteropolytungstate DOI 10.1039/c6cc04326g Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Chemical Communications Seiten 9263-9266 Link Publikation -
2016
Titel Synthesis and Characterization of the First Nickel(II)-Centered Single-Side Tris-Functionalized Anderson-Type Polyoxomolybdate DOI 10.1002/ejic.201601198 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal European Journal of Inorganic Chemistry Seiten 5507-5511 Link Publikation -
2021
Titel Interweaving Disciplines to Advance Chemistry: Applying Polyoxometalates in Biology DOI 10.1021/acs.inorgchem.1c00125 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Inorganic Chemistry Seiten 6109-6114 Link Publikation -
2019
Titel Tuning the interactions of decavanadate with thaumatin, lysozyme, proteinase K and human serum proteins by its coordination to a pentaaquacobalt( ii ) complex cation DOI 10.1039/c9nj02495f Typ Journal Article Autor Krivosudský L Journal New Journal of Chemistry Seiten 17863-17871 Link Publikation -
2019
Titel Serendipita Species Trigger Cultivar-Specific Responses to Fusarium Wilt in Tomato DOI 10.3390/agronomy9100595 Typ Journal Article Autor Sefloo N Journal Agronomy Seiten 595 Link Publikation -
2019
Titel Maternal Platelets—Friend or Foe of the Human Placenta? DOI 10.3390/ijms20225639 Typ Journal Article Autor Moser G Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 5639 Link Publikation -
2019
Titel Synthesis, crystal structure and characterization of two new Cr(III)-substituted polyoxotungstates: [Cr((OCH2)3CCH2OH)2W6O18]3- and [H3Cr2W10O38(H2O)2]7 - DOI 10.1016/j.poly.2019.04.057 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Polyhedron Seiten 202-208 Link Publikation -
2019
Titel Regioselective synthesis and characterization of monovanadium-substituted ß-octamolybdate [VMo7O26]5- DOI 10.1107/s205322961900620x Typ Journal Article Autor Krivosudský L Journal Acta Crystallographica Section C Seiten 872-876 Link Publikation -
2018
Titel Synthesis, structures and applications of electron-rich polyoxometalates DOI 10.1038/s41570-018-0112 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Nature Reviews Chemistry Seiten 0112 Link Publikation -
2018
Titel Iron(II) and copper(II) paratungstates B: a single-crystal X-ray diffraction study DOI 10.1107/s2053229618010021 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Acta Crystallographica Section C: Structural Chemistry Seiten 1252-1259 Link Publikation -
2018
Titel Synthesis and characterization of hybrid Anderson hexamolybdoaluminates(III) functionalized with indometacin or cinnamic acid DOI 10.1107/s2053229618012536 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Acta Crystallographica Section C: Structural Chemistry Seiten 1378-1383 Link Publikation -
2018
Titel Antibacterial Activity of Polyoxometalates Against Moraxella catarrhalis DOI 10.3389/fchem.2018.00336 Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Frontiers in Chemistry Seiten 336 Link Publikation -
2018
Titel The crystallization additive hexatungstotellurate promotes the crystallization of the HSP70 nucleotide binding domain into two different crystal forms DOI 10.1371/journal.pone.0199639 Typ Journal Article Autor Mac Sweeney A Journal PLOS ONE Link Publikation -
2018
Titel Polyoxometalates as Potential Next-Generation Metallodrugs in the Combat Against Cancer DOI 10.1002/anie.201803868 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Angewandte Chemie International Edition Seiten 2980-2999 Link Publikation -
2018
Titel Im Kampf gegen Krebs: Polyoxometallate als nächste Generation metallhaltiger Medikamente DOI 10.1002/ange.201803868 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Angewandte Chemie Seiten 3008-3029 Link Publikation -
2018
Titel The P-type ATPase inhibiting potential of polyoxotungstates† DOI 10.1039/c7mt00279c Typ Journal Article Autor Gumerova N Journal Metallomics Seiten 287-295 Link Publikation -
2018
Titel The antibacterial activity of polyoxometalates: structures, antibiotic effects and future perspectives DOI 10.1039/c7cc07549a Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Chemical Communications Seiten 1153-1169 Link Publikation -
2017
Titel Ten Good Reasons for the Use of the Tellurium-Centered Anderson–Evans Polyoxotungstate in Protein Crystallography DOI 10.1021/acs.accounts.7b00109 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Accounts of Chemical Research Seiten 1441-1448 Link Publikation -
2016
Titel Red cell distribution width and mortality in carotid atherosclerosis DOI 10.1111/eci.12584 Typ Journal Article Autor Wonnerth A Journal European Journal of Clinical Investigation Seiten 198-204 -
2015
Titel The use of polyoxometalates in protein crystallography – An attempt to widen a well-known bottleneck DOI 10.1016/j.ccr.2015.03.018 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Coordination Chemistry Reviews Seiten 22-38 Link Publikation -
2016
Titel In situ formation of the first proteinogenically functionalized [TeW 6 O 24 O 2 (Glu)] 7- structure reveals unprecedented chemical and geometrical features of the Anderson-type cluster DOI 10.1039/c6cc07004c Typ Journal Article Autor Molitor C Journal Chemical Communications Seiten 12286-12289 Link Publikation -
2015
Titel The Synthesis and Characterization of Aromatic Hybrid Anderson–Evans POMs and their Serum Albumin Interactions: The Shift from Polar to Hydrophobic Interactions DOI 10.1002/chem.201502458 Typ Journal Article Autor Al-Sayed E Journal Chemistry – A European Journal Seiten 17800-17807 Link Publikation -
2015
Titel Crystallization and preliminary crystallographic analysis of latent, active and recombinantly expressed aurone synthase, a polyphenol oxidase, from Coreopsis grandiflora DOI 10.1107/s2053230x15007542 Typ Journal Article Autor Molitor C Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications Seiten 746-751 Link Publikation