Macro nicht-kodierende RNS als epigenetische Regulatoren menschlicher Krankheiten
Macro non-coding RNAs as epigenetic regulators in human disease
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Mathematik (20%)
Keywords
-
Ribosome profiling,
Post-transcriptional regulation,
PAR-CLIP,
Regulatory motifs and structures,
Drosophila ovary,
RNAome
Die klassische Sichtweise des genetischen Informationsflusses, "Gen - mRNA - Protein" hat sich in letzter Zeit zu "Gen - RNA - Funktion" gewandelt. Neben mRNAs, welche als Vorlage für dieProduktion von Proteinen dienen, existierteine ständig steigende Zahl anRNAs, die bereits selbständige Genprodukte sind. Diese RNAs können unterschiedliche Aktivitäten aufweisen: Durch Interaktion mit anderen RNAs oder Proteinen können sie deren Aktivitäten oder Lokalisation innerhalb der Zelle beeinflussen. Ebensokönnen diese nicht-kodierenden RNAschemische Reaktionen katalysieren, Chromosomenabschnitte stilllegen oder DNA-Fragmente definieren,welche aus Chromosomen eliminiert werden. RNA Moleküle stehen daher im Zentrum von Netzwerken, welche die Genexpression regulieren. Störungen in diesen genetischen Kreisläufen können zu Fehlern in der Entwicklung oder zur Entstehung von Krankheiten führen. Es ist daher das längerfristigeZiel dieses RNA-REG SFBs das RNA-Regulon zu definieren und zum Verständnis beizutragen, wie RNA Moleküle den genetischen Informationsfluss steuern und dabei selbst reguliert werden. Das übergeordnete Leitmotiv dieses SFBs ist es, die Funktionen von regulatorischen RNAs aufzuklären und die zugrunde liegenden Wirkmechanismen zu verstehen. Die gewonnen Erkenntnisse sollen es ermöglichen, die diversen RNA-gesteuerten Prozesse in einem Netzwerk zu verknüpfen und daraus beobachtete Phänotypen und Krankheitsbilder abzuleiten. Der Zeitpunkt für diesen RNA-REG SFB istideal:Der technische Fortschritt auf dem Gebiet der Sequenzierung und bioinformatischen Datenanalyse ermöglicht erstmals einen unvoreingenommenen und spezifischen Zugang zu umfangreichen Genexpressionsanalysen, wodurchdas Konzept der Genregulation eine neue Komplexitätsebene erlangt.
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 31.01.2015)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2015 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 31.01.2015)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2015 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 31.01.2015)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2015 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 31.12.2012)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2015 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 31.01.2015)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2015 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2015 - 30.09.2019)
-
Konsortiumsmitglied (01.02.2011 - 30.09.2019)
- Medizinische Universität Wien
- Markus Landtaler, Helmholtz-Gemeinschaft Deutscher Forschungszentren - Deutschland
- Susanne Häussler, Helmholtz-Gemeinschaft Deutscher Forschungszentren - Deutschland
- Patrick Cramer, Max-Planck-Institut für Biophysikalische Chemie - Deutschland
- Knud H. Nierhaus, Max-Plank-Institut Berlin - Deutschland
- Rolf Backofen, Universität Freiburg - Deutschland
- P. F. Stadler*, Universität Leipzig - Deutschland
- Dusan Bartsch, Zentralinstitut für Seelische Gesundheit - Deutschland
- Jan Gorodkin, The Royal Veterinary and Agricultural University - Dänemark
- Eric Westhof, Université de Strasbourg - Frankreich
- Hanna Engelberg-Kulka, The Hebrew University of Jerusalem - Israel
- Claudio Gualerzi, Universita di Camerino - Italien
- Ronald Pearlman, York University - Kanada
- Artur Jarmolowski, Adam Mickiewicz University - Polen
- Mary E. Hatten, The Rockefeller University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Luiz Penalva, The University of Texas at San Antonio - Vereinigte Staaten von Amerika
- Jennifer Kugel, University of Colorado Boulder - Vereinigte Staaten von Amerika
- Prasanth Kannanganattu, University of Illinois at Urbana-Champaign - Vereinigte Staaten von Amerika
- Martin A. Gorovsky, University of Rochester - Vereinigte Staaten von Amerika
- John W. Brown, Scottish Crop Research Institute - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 23470 Zitationen
- 182 Publikationen
-
2020
Titel An internal deletion of ADAR rescued by MAVS deficiency leads to a minute phenotype DOI 10.1093/nar/gkaa025 Typ Journal Article Autor Bajad P Journal Nucleic Acids Research Seiten 3286-3303 Link Publikation -
2018
Titel In silico design of ligand triggered RNA switches DOI 10.1016/j.ymeth.2018.04.003 Typ Journal Article Autor Findeiß S Journal Methods Seiten 90-101 Link Publikation -
2018
Titel Efficient computation of co-transcriptional RNA-ligand interaction dynamics DOI 10.1016/j.ymeth.2018.04.036 Typ Journal Article Autor Wolfinger M Journal Methods Seiten 70-76 Link Publikation -
2018
Titel Live-cell imaging reveals the dynamics and function of single-telomere TERRA molecules in cancer cells DOI 10.1080/15476286.2018.1456300 Typ Journal Article Autor Avogaro L Journal RNA Biology Seiten 787-796 Link Publikation -
2018
Titel Primary transcriptome analysis reveals importance of IS elements for the shaping of the transcriptional landscape of Bordetella pertussis DOI 10.1080/15476286.2018.1462655 Typ Journal Article Autor Amman F Journal RNA Biology Seiten 967-975 Link Publikation -
2018
Titel Interaction of lipoprotein QseG with sensor kinase QseE in the periplasm controls the phosphorylation state of the two-component system QseE/QseF in Escherichia coli DOI 10.1371/journal.pgen.1007547 Typ Journal Article Autor Göpel Y Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2018
Titel Staufen2 deficiency leads to impaired response to novelty in mice DOI 10.1016/j.nlm.2018.02.027 Typ Journal Article Autor Popper B Journal Neurobiology of Learning and Memory Seiten 107-115 -
2016
Titel Differential transcriptional responses to Ebola and Marburg virus infection in bat and human cells DOI 10.1038/srep34589 Typ Journal Article Autor Hölzer M Journal Scientific Reports Seiten 34589 Link Publikation -
2016
Titel RNASeq Based Transcriptional Profiling of Pseudomonas aeruginosa PA14 after Short- and Long-Term Anoxic Cultivation in Synthetic Cystic Fibrosis Sputum Medium DOI 10.1371/journal.pone.0147811 Typ Journal Article Autor Tata M Journal PLOS ONE Link Publikation -
2016
Titel Transcriptome-wide effects of inverted SINEs on gene expression and their impact on RNA polymerase II activity DOI 10.1186/s13059-016-1083-0 Typ Journal Article Autor Tajaddod M Journal Genome Biology Seiten 220 Link Publikation -
2016
Titel The RNA ligase RtcB reverses MazF-induced ribosome heterogeneity in Escherichia coli DOI 10.1093/nar/gkw1018 Typ Journal Article Autor Temmel H Journal Nucleic Acids Research Seiten 4708-4721 Link Publikation -
2016
Titel Rapid and dynamic transcriptome regulation by RNA editing and RNA modifications DOI 10.1083/jcb.201511041 Typ Journal Article Autor Licht K Journal Journal of Cell Biology Seiten 15-22 Link Publikation -
2016
Titel Genetic and mechanistic diversity of piRNA 3'-end formation DOI 10.1038/nature20162 Typ Journal Article Autor Hayashi R Journal Nature Seiten 588-592 Link Publikation -
2015
Titel piRNA-guided slicing specifies transcripts for Zucchini-dependent, phased piRNA biogenesis DOI 10.1126/science.aaa1039 Typ Journal Article Autor Mohn F Journal Science Seiten 812-817 Link Publikation -
2015
Titel Forna (force-directed RNA): Simple and effective online RNA secondary structure diagrams DOI 10.1093/bioinformatics/btv372 Typ Journal Article Autor Kerpedjiev P Journal Bioinformatics Seiten 3377-3379 Link Publikation -
2020
Titel RNA polymerase II-binding aptamers in human ACRO1 satellites disrupt transcription in cis DOI 10.1080/21541264.2020.1790990 Typ Journal Article Autor Boots J Journal Transcription Seiten 217-229 Link Publikation -
2021
Titel Enhancing the Cell-Free Expression of Native Membrane Proteins by In Silico Optimization of the Coding Sequence—An Experimental Study of the Human Voltage-Dependent Anion Channel DOI 10.3390/membranes11100741 Typ Journal Article Autor Zayni S Journal Membranes Seiten 741 Link Publikation -
2014
Titel TSSAR: TSS annotation regime for dRNA-seq data DOI 10.1186/1471-2105-15-89 Typ Journal Article Autor Amman F Journal BMC Bioinformatics Seiten 89 Link Publikation -
2014
Titel Memory-efficient RNA energy landscape exploration DOI 10.1093/bioinformatics/btu337 Typ Journal Article Autor Mann M Journal Bioinformatics Seiten 2584-2591 Link Publikation -
2013
Titel Imprinted silencing is extended over broad chromosomal domains in mouse extra-embryonic lineages DOI 10.1016/j.ceb.2013.02.012 Typ Journal Article Autor Kulinski T Journal Current Opinion in Cell Biology Seiten 297-304 Link Publikation -
2013
Titel Spatio-temporal profiling of Filamin A RNA-editing reveals ADAR preferences and high editing levels outside neuronal tissues DOI 10.4161/rna.26216 Typ Journal Article Autor Stulic M Journal RNA Biology Seiten 1611-1617 Link Publikation -
2013
Titel Drosophila Gtsf1 is an essential component of the Piwi-mediated transcriptional silencing complex DOI 10.1101/gad.221150.113 Typ Journal Article Autor Dönertas D Journal Genes & Development Seiten 1693-1705 Link Publikation -
2012
Titel Asymmetric Segregation of the Double-Stranded RNA Binding Protein Staufen2 during Mammalian Neural Stem Cell Divisions Promotes Lineage Progression DOI 10.1016/j.stem.2012.06.006 Typ Journal Article Autor Kusek G Journal Cell Stem Cell Seiten 505-516 Link Publikation -
2012
Titel An Asymmetrically Localized Staufen2-Dependent RNA Complex Regulates Maintenance of Mammalian Neural Stem Cells DOI 10.1016/j.stem.2012.06.010 Typ Journal Article Autor Vessey J Journal Cell Stem Cell Seiten 517-528 Link Publikation -
2012
Titel Modelling Translation Initiation under the Influence of sRNA DOI 10.3390/ijms131216223 Typ Journal Article Autor Amman F Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 16223-16240 Link Publikation -
2012
Titel Involvement of a GHKL ATPase in RNA-Directed DNA Methylation in Arabidopsis thaliana DOI 10.1016/j.cub.2012.03.061 Typ Journal Article Autor Lorkovic Z Journal Current Biology Seiten 933-938 Link Publikation -
2012
Titel Transcript Diversification in the Nervous System: A to I RNA Editing in CNS Function and Disease Development DOI 10.3389/fnins.2012.00099 Typ Journal Article Autor Tariq A Journal Frontiers in Neuroscience Seiten 99 Link Publikation -
2012
Titel Alternative splicing in plants – coming of age DOI 10.1016/j.tplants.2012.06.001 Typ Journal Article Autor Syed N Journal Trends in Plant Science Seiten 616-623 Link Publikation -
2012
Titel Folding RNA/DNA hybrid duplexes DOI 10.1093/bioinformatics/bts466 Typ Journal Article Autor Lorenz R Journal Bioinformatics Seiten 2530-2531 -
2012
Titel Atypical DNA methylation of genes encoding cysteine-rich peptides in Arabidopsis thaliana DOI 10.1186/1471-2229-12-51 Typ Journal Article Autor You W Journal BMC Plant Biology Seiten 51 Link Publikation -
2012
Titel Selective translation during stress in Escherichia coli DOI 10.1016/j.tibs.2012.07.007 Typ Journal Article Autor Moll I Journal Trends in Biochemical Sciences Seiten 493-498 Link Publikation -
2015
Titel piRNA-guided slicing of transposon transcripts enforces their transcriptional silencing via specifying the nuclear piRNA repertoire DOI 10.1101/gad.267252.115 Typ Journal Article Autor Senti K Journal Genes & Development Seiten 1747-1762 Link Publikation -
2015
Titel A human haploid gene trap collection to study lncRNAs with unusual RNA biology DOI 10.1080/15476286.2015.1110676 Typ Journal Article Autor Kornienko A Journal RNA Biology Seiten 196-220 Link Publikation -
2014
Titel The multifunctional Staufen proteins: conserved roles from neurogenesis to synaptic plasticity DOI 10.1016/j.tins.2014.05.009 Typ Journal Article Autor Heraud-Farlow J Journal Trends in Neurosciences Seiten 470-479 Link Publikation -
2014
Titel The Rhino-Deadlock-Cutoff Complex Licenses Noncanonical Transcription of Dual-Strand piRNA Clusters in Drosophila DOI 10.1016/j.cell.2014.04.031 Typ Journal Article Autor Mohn F Journal Cell Seiten 1364-1379 Link Publikation -
2014
Titel Genome-scale functional characterization of Drosophila developmental enhancers in vivo DOI 10.1038/nature13395 Typ Journal Article Autor Kvon E Journal Nature Seiten 91-95 -
2014
Titel The HERMIT in the stream DOI 10.1145/2543728.2543736 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Farmer A Seiten 97-108 -
2014
Titel Impact of Hfq on the Bacillus subtilis Transcriptome DOI 10.1371/journal.pone.0098661 Typ Journal Article Autor Hämmerle H Journal PLoS ONE Link Publikation -
2014
Titel A bimodular nuclear localization signal assembled via an extended double-stranded RNA-binding domain acts as an RNA-sensing signal for transportin 1 DOI 10.1073/pnas.1323698111 Typ Journal Article Autor Barraud P Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2014
Titel Drosha protein levels are translationally regulated during Xenopus oocyte maturation DOI 10.1091/mbc.e13-07-0386 Typ Journal Article Autor Muggenhumer D Journal Molecular Biology of the Cell Seiten 2094-2104 Link Publikation -
2014
Titel The double-stranded transcriptome of Escherichia coli DOI 10.1073/pnas.1315974111 Typ Journal Article Autor Lybecker M Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 3134-3139 Link Publikation -
2014
Titel Dissection of thousands of cell type-specific enhancers identifies dinucleotide repeat motifs as general enhancer features DOI 10.1101/gr.169243.113 Typ Journal Article Autor Yáñez-Cuna J Journal Genome Research Seiten 1147-1156 Link Publikation -
2014
Titel Revisiting the coding potential of the E. coli genome through Hfq co-immunoprecipitation DOI 10.4161/rna.29299 Typ Journal Article Autor Bilusic I Journal RNA Biology Seiten 641-654 Link Publikation -
2014
Titel Regulation of Hfq by the RNA CrcZ in Pseudomonas aeruginosa Carbon Catabolite Repression DOI 10.1371/journal.pgen.1004440 Typ Journal Article Autor Sonnleitner E Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2014
Titel Transcriptional enhancers: from properties to genome-wide predictions DOI 10.1038/nrg3682 Typ Journal Article Autor Shlyueva D Journal Nature Reviews Genetics Seiten 272-286 -
2012
Titel Adenosine deaminases that act on RNA induce reproducible changes in abundance and sequence of embryonic miRNAs DOI 10.1101/gr.133025.111 Typ Journal Article Autor Vesely C Journal Genome Research Seiten 1468-1476 Link Publikation -
2012
Titel Transcriptional regulation of nitrate assimilation in Pseudomonas aeruginosa occurs via transcriptional antitermination within the nirBD–PA1779–cobA operon DOI 10.1099/mic.0.053850-0 Typ Journal Article Autor Romeo A Journal Microbiology Seiten 1543-1552 Link Publikation -
2012
Titel Mechanisms of long range silencing by imprinted macro non-coding RNAs DOI 10.1016/j.gde.2012.02.005 Typ Journal Article Autor Pauler F Journal Current Opinion in Genetics & Development Seiten 283-289 Link Publikation -
2012
Titel Airn Transcriptional Overlap, But Not Its lncRNA Products, Induces Imprinted Igf2r Silencing DOI 10.1126/science.1228110 Typ Journal Article Autor Latos P Journal Science Seiten 1469-1472 -
2012
Titel Use of Forward Genetic Screens to Identify Genes Required for RNA-Directed DNA Methylation in Arabidopsis thaliana DOI 10.1101/sqb.2012.77.015099 Typ Journal Article Autor Eun C Journal Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology Seiten 195-204 -
2012
Titel Transcriptome survey reveals increased complexity of the alternative splicing landscape in Arabidopsis DOI 10.1101/gr.134106.111 Typ Journal Article Autor Marquez Y Journal Genome Research Seiten 1184-1195 Link Publikation -
2012
Titel A zipcode unzipped DOI 10.1101/gad.184945.111 Typ Journal Article Autor Doyle M Journal Genes & Development Seiten 110-113 Link Publikation -
2012
Titel Sneaking around concatMap DOI 10.1145/2364527.2364559 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Siederdissen C Seiten 215-226 -
2012
Titel Transcriptional Silencing of Transposons by Piwi and Maelstrom and Its Impact on Chromatin State and Gene Expression DOI 10.1016/j.cell.2012.10.040 Typ Journal Article Autor Sienski G Journal Cell Seiten 964-980 Link Publikation -
2012
Titel RNA-interacting proteins act as site-specific repressors of ADAR2-mediated RNA editing and fluctuate upon neuronal stimulation DOI 10.1093/nar/gks1353 Typ Journal Article Autor Tariq A Journal Nucleic Acids Research Seiten 2581-2593 Link Publikation -
2012
Titel Small regulatory RNAs in Pseudomonas aeruginosa DOI 10.4161/rna.19231 Typ Journal Article Autor Sonnleitner E Journal RNA Biology Seiten 364-371 Link Publikation -
2012
Titel Macro lncRNAs DOI 10.4161/rna.19985 Typ Journal Article Autor Guenzl P Journal RNA Biology Seiten 731-741 -
2012
Titel RNA Folding Algorithms with G-Quadruplexes DOI 10.1007/978-3-642-31927-3_5 Typ Book Chapter Autor Lorenz R Verlag Springer Nature Seiten 49-60 -
2012
Titel Biased transcription and selective degradation of small RNAs shape the pattern of DNA elimination in Tetrahymena DOI 10.1101/gad.196493.112 Typ Journal Article Autor Schoeberl U Journal Genes & Development Seiten 1729-1742 Link Publikation -
2011
Titel Developmentally programmed, RNA-directed genome rearrangement in Tetrahymena DOI 10.1111/j.1440-169x.2011.01305.x Typ Journal Article Autor Mochizuki K Journal Development, Growth & Differentiation Seiten 108-119 Link Publikation -
2011
Titel Independent localization of MAP2, CaMKIIa and ß-actin RNAs in low copy numbers DOI 10.1038/embor.2011.149 Typ Journal Article Autor Mikl M Journal The EMBO Reports Seiten 1077-1084 Link Publikation -
2011
Titel Developmental control of imprinted expression by macro non-coding RNAs DOI 10.1016/j.semcdb.2011.02.018 Typ Journal Article Autor Santoro F Journal Seminars in Cell & Developmental Biology Seiten 328-335 -
2011
Titel Animal snoRNAs and scaRNAs with exceptional structures DOI 10.4161/rna.8.6.16603 Typ Journal Article Autor Marz M Journal RNA Biology Seiten 938-946 Link Publikation -
2014
Titel Functional repeat-derived RNAs often originate from retrotransposon-propagated ncRNAs DOI 10.1002/wrna.1243 Typ Journal Article Autor Matylla-Kulinska K Journal Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA Seiten 591-600 Link Publikation -
2014
Titel Genomic Imprinting in Mammals DOI 10.1101/cshperspect.a018382 Typ Journal Article Autor Barlow D Journal Cold Spring Harbor Perspectives in Biology Link Publikation -
2014
Titel ADAR2 induces reproducible changes in sequence and abundance of mature microRNAs in the mouse brain DOI 10.1093/nar/gku844 Typ Journal Article Autor Vesely C Journal Nucleic Acids Research Seiten 12155-12168 Link Publikation -
2014
Titel A Chloroplast Retrograde Signal Regulates Nuclear Alternative Splicing DOI 10.1126/science.1250322 Typ Journal Article Autor Petrillo E Journal Science Seiten 427-430 Link Publikation -
2014
Titel Development of Giant Bacteriophage ?KZ Is Independent of the Host Transcription Apparatus DOI 10.1128/jvi.01347-14 Typ Journal Article Autor Ceyssens P Journal Journal of Virology Seiten 10501-10510 Link Publikation -
2014
Titel The exon junction complex is required for definition and excision of neighboring introns in Drosophila DOI 10.1101/gad.245738.114 Typ Journal Article Autor Hayashi R Journal Genes & Development Seiten 1772-1785 Link Publikation -
2014
Titel Heterogeneity of the translational machinery: Variations on a common theme DOI 10.1016/j.biochi.2014.12.011 Typ Journal Article Autor Sauert M Journal Biochimie Seiten 39-47 Link Publikation -
2014
Titel Hormone-Responsive Enhancer-Activity Maps Reveal Predictive Motifs, Indirect Repression, and Targeting of Closed Chromatin DOI 10.1016/j.molcel.2014.02.026 Typ Journal Article Autor Shlyueva D Journal Molecular Cell Seiten 180-192 Link Publikation -
2014
Titel Enhancer–core-promoter specificity separates developmental and housekeeping gene regulation DOI 10.1038/nature13994 Typ Journal Article Autor Zabidi M Journal Nature Seiten 556-559 Link Publikation -
2014
Titel Quantitative genome-wide enhancer activity maps for five Drosophila species show functional enhancer conservation and turnover during cis-regulatory evolution DOI 10.1038/ng.3009 Typ Journal Article Autor Arnold C Journal Nature Genetics Seiten 685-692 Link Publikation -
2014
Titel Imaging of Endogenous Messenger RNA Splice Variants in Living Cells Reveals Nuclear Retention of Transcripts Inaccessible to Nonsense-Mediated Decay in Arabidopsis DOI 10.1105/tpc.113.118075 Typ Journal Article Autor Göhring J Journal The Plant Cell Seiten 754-764 Link Publikation -
2011
Titel Keeping the Soma Free of Transposons: Programmed DNA Elimination in Ciliates* DOI 10.1074/jbc.r111.276964 Typ Journal Article Autor Schoeberl U Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 37045-37052 Link Publikation -
2011
Titel Programmed DNA Elimination in Tetrahymena: A Small RNA-Mediated Genome Surveillance Mechanism DOI 10.1007/978-1-4614-0332-6_10 Typ Book Chapter Autor Kataoka K Verlag Springer Nature Seiten 156-173 Link Publikation -
2011
Titel Selective Translation of Leaderless mRNAs by Specialized Ribosomes Generated by MazF in Escherichia coli DOI 10.1016/j.cell.2011.07.047 Typ Journal Article Autor Vesper O Journal Cell Seiten 147-157 Link Publikation -
2011
Titel Genomic Imprinting: A Mammalian Epigenetic Discovery Model DOI 10.1146/annurev-genet-110410-132459 Typ Journal Article Autor Barlow D Journal Annual review of genetics Seiten 379-403 -
2011
Titel Finding aptamers and small ribozymes in unexpected places DOI 10.1002/wrna.105 Typ Journal Article Autor Matylla-Kulinska K Journal Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA Seiten 73-91 -
2011
Titel ViennaRNA Package 2.0 DOI 10.1186/1748-7188-6-26 Typ Journal Article Autor Lorenz R Journal Algorithms for Molecular Biology Seiten 26 Link Publikation -
2011
Titel Mechanisms of dendritic mRNA transport and its role in synaptic tagging DOI 10.1038/emboj.2011.278 Typ Journal Article Autor Doyle M Journal The EMBO Journal Seiten 3540-3552 Link Publikation -
2015
Titel Tristetraprolin Limits Inflammatory Cytokine Production in Tumor-Associated Macrophages in an mRNA Decay–Independent Manner DOI 10.1158/0008-5472.can-15-0205 Typ Journal Article Autor Kratochvill F Journal Cancer Research Seiten 3054-3064 Link Publikation -
2015
Titel Unmasking alternative splicing inside protein-coding exons defines exitrons and their role in proteome plasticity DOI 10.1101/gr.186585.114 Typ Journal Article Autor Marquez Y Journal Genome Research Seiten 995-1007 Link Publikation -
2015
Titel Targeted Gene Disruption by Ectopic Induction of DNA Elimination in Tetrahymena DOI 10.1534/genetics.115.178525 Typ Journal Article Autor Hayashi A Journal Genetics Seiten 55-64 Link Publikation -
2015
Titel Lost in Translation: Pitfalls in Deciphering Plant Alternative Splicing Transcripts DOI 10.1105/tpc.15.00572 Typ Journal Article Autor Brown J Journal The Plant Cell Seiten 2083-2087 Link Publikation -
2015
Titel A Tetrahymena Hsp90 co-chaperone promotes siRNA loading by ATP-dependent and ATP-independent mechanisms DOI 10.15252/embj.201490062 Typ Journal Article Autor Woehrer S Journal The EMBO Journal Seiten 559-577 Link Publikation -
2015
Titel Pitfalls of Mapping High-Throughput Sequencing Data to Repetitive Sequences: Piwi’s Genomic Targets Still Not Identified DOI 10.1016/j.devcel.2015.01.013 Typ Journal Article Autor Marinov G Journal Developmental Cell Seiten 765-771 Link Publikation -
2015
Titel The spliceosome-associated protein Nrl1 suppresses homologous recombination-dependent R-loop formation in fission yeast DOI 10.1093/nar/gkv1473 Typ Journal Article Autor Aronica L Journal Nucleic Acids Research Seiten 1703-1717 Link Publikation -
2015
Titel The dynamic epitranscriptome: A to I editing modulates genetic information DOI 10.1007/s00412-015-0526-9 Typ Journal Article Autor Tajaddod M Journal Chromosoma Seiten 51-63 Link Publikation -
2015
Titel Product Grammars for Alignment and Folding DOI 10.1109/tcbb.2014.2326155 Typ Journal Article Autor Siederdissen C Journal IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Seiten 507-519 Link Publikation -
2015
Titel SHAPE directed RNA folding DOI 10.1093/bioinformatics/btv523 Typ Journal Article Autor Lorenz R Journal Bioinformatics Seiten 145-147 Link Publikation -
2015
Titel Pseudoknots in RNA folding landscapes DOI 10.1093/bioinformatics/btv572 Typ Journal Article Autor Kucharík M Journal Bioinformatics Seiten 187-194 Link Publikation -
2015
Titel Processed Small RNAs in Archaea and BHB Elements DOI 10.18547/gcb.2015.vol1.iss1.e18 Typ Journal Article Autor Berkemer S Journal Genomics and Computational Biology Seiten 18 Link Publikation -
2015
Titel Silencio/CG9754 connects the Piwi–piRNA complex to the cellular heterochromatin machinery DOI 10.1101/gad.271908.115 Typ Journal Article Autor Sienski G Journal Genes & Development Seiten 2258-2271 Link Publikation -
2013
Titel Alterations of the Transcriptome of Sulfolobus acidocaldarius by Exoribonuclease aCPSF2 DOI 10.1371/journal.pone.0076569 Typ Journal Article Autor Märtens B Journal PLoS ONE Link Publikation -
2013
Titel Computational design of RNAs with complex energy landscapes DOI 10.1002/bip.22337 Typ Journal Article Autor Siederdissen C Journal Biopolymers Seiten 1124-1136 -
2013
Titel Transposon Domestication versus Mutualism in Ciliate Genome Rearrangements DOI 10.1371/journal.pgen.1003659 Typ Journal Article Autor Vogt A Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2013
Titel The Pseudomonas aeruginosa Catabolite Repression Control Protein Crc Is Devoid of RNA Binding Activity DOI 10.1371/journal.pone.0064609 Typ Journal Article Autor Milojevic T Journal PLoS ONE Link Publikation -
2013
Titel Predicting RNA Structure: Advances and Limitations DOI 10.1007/978-1-62703-667-2_1 Typ Book Chapter Autor Hofacker I Verlag Springer Nature Seiten 1-19 -
2013
Titel Imprinted Igf2r silencing depends on continuous Airn lncRNA expression and is not restricted to a developmental window DOI 10.1242/dev.088849 Typ Journal Article Autor Santoro F Journal Development Seiten 1184-1195 -
2013
Titel Interplay among RNA polymerases II, IV and V in RNA-directed DNA methylation at a low copy transgene locus in Arabidopsis thaliana DOI 10.1007/s11103-013-0041-4 Typ Journal Article Autor You W Journal Plant Molecular Biology Seiten 85-96 Link Publikation -
2013
Titel 2D Meets 4G: G-Quadruplexes in RNA Secondary Structure Prediction DOI 10.1109/tcbb.2013.7 Typ Journal Article Autor Lorenz R Journal IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics Seiten 832-844 -
2013
Titel False positive RNA binding activities after Ni-affinity purification from Escherichia coli DOI 10.4161/rna.25195 Typ Journal Article Autor Milojevic T Journal RNA Biology Seiten 1066-1069 Link Publikation -
2013
Titel Duplex formation between the sRNA DsrA and rpoS mRNA is not sufficient for efficient RpoS synthesis at low temperature DOI 10.4161/rna.27100 Typ Journal Article Autor Hämmerle H Journal RNA Biology Seiten 1834-1841 Link Publikation -
2013
Titel How to Multiply Dynamic Programming Algorithms DOI 10.1007/978-3-319-02624-4_8 Typ Book Chapter Autor Höner Zu Siederdissen C Verlag Springer Nature Seiten 82-93 -
2013
Titel Ribosome heterogeneity: another level of complexity in bacterial translation regulation DOI 10.1016/j.mib.2013.01.009 Typ Journal Article Autor Byrgazov K Journal Current Opinion in Microbiology Seiten 133-139 Link Publikation -
2013
Titel Loading and pre-loading processes generate a distinct siRNA population in Tetrahymena DOI 10.1016/j.bbrc.2013.05.133 Typ Journal Article Autor Mochizuki K Journal Biochemical and Biophysical Research Communications Seiten 497-502 Link Publikation -
2013
Titel A high-throughput screen to identify enhancers of ADAR-mediated RNA-editing DOI 10.4161/rna.23208 Typ Journal Article Autor Garncarz W Journal RNA Biology Seiten 192-204 Link Publikation -
2013
Titel A Domesticated PiggyBac Transposase Interacts with Heterochromatin and Catalyzes Reproducible DNA Elimination in Tetrahymena DOI 10.1371/journal.pgen.1004032 Typ Journal Article Autor Vogt A Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2013
Titel Genome-Wide Quantitative Enhancer Activity Maps Identified by STARR-seq DOI 10.1126/science.1232542 Typ Journal Article Autor Arnold C Journal Science Seiten 1074-1077 -
2013
Titel Epigenetics of Ciliates DOI 10.1101/cshperspect.a017764 Typ Journal Article Autor Chalker D Journal Cold Spring Harbor Perspectives in Biology Link Publikation -
2013
Titel Silencing by the imprinted Airn macro lncRNA DOI 10.4161/cc.23860 Typ Journal Article Autor Santoro F Journal Cell Cycle Seiten 711-712 Link Publikation -
2013
Titel Automated identification of RNA 3D modules with discriminative power in RNA structural alignments DOI 10.1093/nar/gkt795 Typ Journal Article Autor Theis C Journal Nucleic Acids Research Seiten 9999-10009 Link Publikation -
2013
Titel Bacterial helicases in post-transcriptional control DOI 10.1016/j.bbagrm.2012.12.005 Typ Journal Article Autor Kaberdin V Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms Seiten 878-883 -
2013
Titel Systematic analysis and evolution of 5S ribosomal DNA in metazoans DOI 10.1038/hdy.2013.63 Typ Journal Article Autor Vierna J Journal Heredity Seiten 410-421 Link Publikation -
2013
Titel Gene regulation by the act of long non-coding RNA transcription DOI 10.1186/1741-7007-11-59 Typ Journal Article Autor Kornienko A Journal BMC Biology Seiten 59 Link Publikation -
2013
Titel Interactome of Two Diverse RNA Granules Links mRNA Localization to Translational Repression in Neurons DOI 10.1016/j.celrep.2013.11.023 Typ Journal Article Autor Fritzsche R Journal Cell Reports Seiten 1749-1762 Link Publikation -
2013
Titel CMCompare webserver: comparing RNA families via covariance models DOI 10.1093/nar/gkt329 Typ Journal Article Autor Eggenhofer F Journal Nucleic Acids Research Link Publikation -
2013
Titel Complexity of the Alternative Splicing Landscape in Plants DOI 10.1105/tpc.113.117523 Typ Journal Article Autor Reddy A Journal The Plant Cell Seiten 3657-3683 Link Publikation -
2013
Titel Staufen2 Regulates Neuronal Target RNAs DOI 10.1016/j.celrep.2013.11.039 Typ Journal Article Autor Heraud-Farlow J Journal Cell Reports Seiten 1511-1518 Link Publikation -
2012
Titel A Downstream CpG Island Controls Transcript Initiation and Elongation and the Methylation State of the Imprinted Airn Macro ncRNA Promoter DOI 10.1371/journal.pgen.1002540 Typ Journal Article Autor Koerner M Journal PLoS Genetics Link Publikation -
2015
Titel Posttranscriptional regulation of cytokine expression DOI 10.1016/j.cyto.2015.11.007 Typ Journal Article Autor Kovarik P Journal Cytokine Seiten 21-26 -
2015
Titel Lamarckian Illusions DOI 10.1016/j.tree.2015.08.003 Typ Journal Article Autor Weiss A Journal Trends in Ecology & Evolution Seiten 566-568 Link Publikation -
2015
Titel Domain swapping between homologous bacterial small RNAs dissects processing and Hfq binding determinants and uncovers an aptamer for conditional RNase E cleavage DOI 10.1093/nar/gkv1161 Typ Journal Article Autor Göpel Y Journal Nucleic Acids Research Seiten 824-837 Link Publikation -
2015
Titel RNA 3D Modules in Genome-Wide Predictions of RNA 2D Structure DOI 10.1371/journal.pone.0139900 Typ Journal Article Autor Theis C Journal PLOS ONE Link Publikation -
2015
Titel Predicting RNA 3D structure using a coarse-grain helix-centered model DOI 10.1261/rna.047522.114 Typ Journal Article Autor Kerpedjiev P Journal RNA Seiten 1110-1121 Link Publikation -
2015
Titel Soups & SELEX for the origin of life DOI 10.1261/rna.050559.115 Typ Journal Article Autor Schroeder R Journal RNA Seiten 729-732 Link Publikation -
2015
Titel ViennaNGS: A toolbox for building efficient next- generation sequencing analysis pipelines DOI 10.12688/f1000research.6157.2 Typ Journal Article Autor Wolfinger M Journal F1000Research Seiten 50 Link Publikation -
2015
Titel AREsite2: an enhanced database for the comprehensive investigation of AU/GU/U-rich elements DOI 10.1093/nar/gkv1238 Typ Journal Article Autor Fallmann J Journal Nucleic Acids Research Link Publikation -
2016
Titel Genome-wide assessment of sequence-intrinsic enhancer responsiveness at single-base-pair resolution DOI 10.1038/nbt.3739 Typ Journal Article Autor Arnold C Journal Nature Biotechnology Seiten 136-144 Link Publikation -
2016
Titel Tristetraprolin binding site atlas in the macrophage transcriptome reveals a switch for inflammation resolution DOI 10.15252/msb.20156628 Typ Journal Article Autor Sedlyarov V Journal Molecular Systems Biology Link Publikation -
2016
Titel In vivo expression technology and 5? end mapping of the Borrelia burgdorferi transcriptome identify novel RNAs expressed during mammalian infection DOI 10.1093/nar/gkw1180 Typ Journal Article Autor Adams P Journal Nucleic Acids Research Seiten 775-792 Link Publikation -
2016
Titel Cross-regulation by CrcZ RNA controls anoxic biofilm formation in Pseudomonas aeruginosa DOI 10.1038/srep39621 Typ Journal Article Autor Pusic P Journal Scientific Reports Seiten 39621 Link Publikation -
2016
Titel Electron microscopy analysis of flash-annealed CuZr based bulk metallic glass DOI 10.1002/9783527808465.emc2016.6322 Typ Book Chapter Autor Müller C Verlag Wiley Seiten 754-755 Link Publikation -
2016
Titel Neuron type-specific miRNA represses two broadly expressed genes to modulate an avoidance behavior in C. elegans DOI 10.1101/gad.287904.116 Typ Journal Article Autor Drexel T Journal Genes & Development Seiten 2042-2047 Link Publikation -
2016
Titel Genome-Wide Ultrabithorax Binding Analysis Reveals Highly Targeted Genomic Loci at Developmental Regulators and a Potential Connection to Polycomb-Mediated Regulation DOI 10.1371/journal.pone.0161997 Typ Journal Article Autor Shlyueva D Journal PLOS ONE Link Publikation -
2016
Titel RNAlien – Unsupervised RNA family model construction DOI 10.1093/nar/gkw558 Typ Journal Article Autor Eggenhofer F Journal Nucleic Acids Research Seiten 8433-8441 Link Publikation -
2016
Titel sRNA-Mediated Control of Transcription Termination in E. coli DOI 10.1016/j.cell.2016.09.004 Typ Journal Article Autor Sedlyarova N Journal Cell Link Publikation -
2016
Titel Long non-coding RNAs display higher natural expression variation than protein-coding genes in healthy humans DOI 10.1186/s13059-016-0873-8 Typ Journal Article Autor Kornienko A Journal Genome Biology Seiten 14 Link Publikation -
2016
Titel Regulatory Enhancer–Core-Promoter Communication via Transcription Factors and Cofactors DOI 10.1016/j.tig.2016.10.003 Typ Journal Article Autor Zabidi M Journal Trends in Genetics Seiten 801-814 Link Publikation -
2017
Titel A framework for understanding the roles of miRNAs in animal development DOI 10.1242/dev.146613 Typ Journal Article Autor Alberti C Journal Development Seiten 2548-2559 Link Publikation -
2017
Titel NMR Structural Profiling of Transcriptional Intermediates Reveals Riboswitch Regulation by Metastable RNA Conformations DOI 10.1021/jacs.6b10429 Typ Journal Article Autor Helmling C Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 2647-2656 -
2017
Titel Temperature-dependent sRNA transcriptome of the Lyme disease spirochete DOI 10.1186/s12864-016-3398-3 Typ Journal Article Autor Popitsch N Journal BMC Genomics Seiten 28 Link Publikation -
2017
Titel RIsearch2: suffix array-based large-scale prediction of RNA–RNA interactions and siRNA off-targets DOI 10.1093/nar/gkw1325 Typ Journal Article Autor Alkan F Journal Nucleic Acids Research Link Publikation -
2017
Titel Combinatorial function of transcription factors and cofactors DOI 10.1016/j.gde.2016.12.007 Typ Journal Article Autor Reiter F Journal Current Opinion in Genetics & Development Seiten 73-81 -
2017
Titel RNA in Disease and development DOI 10.1080/15476286.2017.1316929 Typ Journal Article Autor Barta A Journal RNA Biology Seiten 457-459 Link Publikation -
2017
Titel RNAblueprint: flexible multiple target nucleic acid sequence design DOI 10.1093/bioinformatics/btx263 Typ Journal Article Autor Hammer S Journal Bioinformatics Seiten 2850-2858 Link Publikation -
2017
Titel Roles of Regulatory RNAs for Antibiotic Resistance in Bacteria and Their Potential Value as Novel Drug Targets DOI 10.3389/fmicb.2017.00803 Typ Journal Article Autor Dersch P Journal Frontiers in Microbiology Seiten 803 Link Publikation -
2017
Titel A to I editing in disease is not fake news DOI 10.1080/15476286.2017.1306173 Typ Journal Article Autor Bajad P Journal RNA Biology Seiten 1223-1231 Link Publikation -
2017
Titel Probing the canonicity of the Wnt/wingless signaling pathway DOI 10.1371/journal.pgen.1006700 Typ Journal Article Autor Franz A Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2017
Titel Accurate mapping of tRNA reads DOI 10.1093/bioinformatics/btx756 Typ Journal Article Autor Hoffmann A Journal Bioinformatics Seiten 1116-1124 Link Publikation -
2017
Titel SLAM-ITseq: Sequencing cell type-specific transcriptomes without cell sorting DOI 10.1101/235093 Typ Preprint Autor Matsushima W Seiten 235093 Link Publikation -
2017
Titel Small RNAs are trafficked from the epididymis to developing mammalian sperm DOI 10.1101/194522 Typ Preprint Autor Sharma U Seiten 194522 Link Publikation -
2017
Titel RNA structure prediction: from 2D to 3D. DOI 10.1042/etls20160027 Typ Journal Article Autor Thiel B Journal Emerging topics in life sciences Seiten 275-285 Link Publikation -
2017
Titel Structural insights into RapZ-mediated regulation of bacterial amino-sugar metabolism DOI 10.1093/nar/gkx732 Typ Journal Article Autor Gonzalez G Journal Nucleic Acids Research Seiten 10845-10860 Link Publikation -
2017
Titel A heterochromatin-dependent transcription machinery drives piRNA expression DOI 10.1038/nature23482 Typ Journal Article Autor Andersen P Journal Nature Seiten 54-59 Link Publikation -
2017
Titel Forebrain-specific, conditional silencing of Staufen2 alters synaptic plasticity, learning, and memory in rats DOI 10.1186/s13059-017-1350-8 Typ Journal Article Autor Berger S Journal Genome Biology Seiten 222 Link Publikation -
2017
Titel The Anaerobically Induced sRNA PaiI Affects Denitrification in Pseudomonas aeruginosa PA14 DOI 10.3389/fmicb.2017.02312 Typ Journal Article Autor Tata M Journal Frontiers in Microbiology Seiten 2312 Link Publikation -
2017
Titel Pumilio2-deficient mice show a predisposition for epilepsy DOI 10.1242/dmm.029678 Typ Journal Article Autor Follwaczny P Journal Disease Models & Mechanisms Seiten 1333-1342 Link Publikation -
2017
Titel HuR Small-Molecule Inhibitor Elicits Differential Effects in Adenomatosis Polyposis and Colorectal Carcinogenesis DOI 10.1158/0008-5472.can-15-1726 Typ Journal Article Autor Lang M Journal Cancer Research Seiten 2424-2438 Link Publikation -
2017
Titel The RNA-binding protein tristetraprolin schedules apoptosis of pathogen-engaged neutrophils during bacterial infection DOI 10.1172/jci80631 Typ Journal Article Autor Ebner F Journal Journal of Clinical Investigation Seiten 2051-2065 Link Publikation -
2018
Titel The cyclin-dependent kinase G group defines a thermo-sensitive alternative splicing circuit modulating the expression of Arabidopsis ATU2AF65A DOI 10.1111/tpj.13914 Typ Journal Article Autor Cavallari N Journal The Plant Journal Seiten 1010-1022 Link Publikation -
2018
Titel Nascent RNA signaling to yeast RNA Pol II during transcription elongation DOI 10.1371/journal.pone.0194438 Typ Journal Article Autor Klopf E Journal PLOS ONE Link Publikation -
2018
Titel Carbohydrate Utilization in Bacteria: Making the Most Out of Sugars with the Help of Small Regulatory RNAs DOI 10.1128/microbiolspec.rwr-0013-2017 Typ Journal Article Autor Durica-Mitic S Journal Microbiology Spectrum Link Publikation -
2018
Titel Advances in Light-Directed Synthesis of High-Density Microarrays and Extension to RNA and 2'F-ANA Chemistries DOI 10.1002/9783527812103.ch11 Typ Book Chapter Autor Lietard J Verlag Wiley Seiten 291-312 -
2018
Titel CMV: visualization for RNA and protein family models and their comparisons DOI 10.1093/bioinformatics/bty158 Typ Journal Article Autor Eggenhofer F Journal Bioinformatics Seiten 2676-2678 Link Publikation -
2018
Titel Cell-type specific sequencing of microRNAs from complex animal tissues DOI 10.1038/nmeth.4610 Typ Journal Article Autor Alberti C Journal Nature Methods Seiten 283-289 Link Publikation -
2018
Titel Assessing sufficiency and necessity of enhancer activities for gene expression and the mechanisms of transcription activation DOI 10.1101/gad.310367.117 Typ Journal Article Autor Catarino R Journal Genes & Development Seiten 202-223 Link Publikation -
2018
Titel Autoregulation of mazEF expression underlies growth heterogeneity in bacterial populations DOI 10.1093/nar/gky079 Typ Journal Article Autor Nikolic N Journal Nucleic Acids Research Link Publikation -
2018
Titel SLAM-seq defines direct gene-regulatory functions of the BRD4-MYC axis DOI 10.1126/science.aao2793 Typ Journal Article Autor Muhar M Journal Science Seiten 800-805 Link Publikation -
2018
Titel Positioning Europe for the EPITRANSCRIPTOMICS challenge DOI 10.1080/15476286.2018.1460996 Typ Journal Article Autor Jantsch M Journal RNA Biology Seiten 829-831 Link Publikation -
2017
Titel Interplay between the catabolite repression control protein Crc, Hfq and RNA in Hfq-dependent translational regulation in Pseudomonas aeruginosa DOI 10.1093/nar/gkx1245 Typ Journal Article Autor Sonnleitner E Journal Nucleic Acids Research Link Publikation -
2017
Titel The Other Face of an Editor: ADAR1 Functions in Editing-Independent Ways DOI 10.1002/bies.201700129 Typ Journal Article Autor Licht K Journal BioEssays Link Publikation -
2017
Titel Thiol-linked alkylation of RNA to assess expression dynamics DOI 10.1038/nmeth.4435 Typ Journal Article Autor Herzog V Journal Nature Methods Seiten 1198-1204 Link Publikation -
2017
Titel MazF activation promotes translational heterogeneity of the grcA mRNA in Escherichia coli populations DOI 10.7717/peerj.3830 Typ Journal Article Autor Nikolic N Journal PeerJ Link Publikation -
2019
Titel iRAPs curb antisense transcription in E. coli DOI 10.1093/nar/gkz791 Typ Journal Article Autor Magán A Journal Nucleic Acids Research Seiten 10894-10905 Link Publikation -
2018
Titel TERribly Difficult: Searching for Telomerase RNAs in Saccharomycetes DOI 10.3390/genes9080372 Typ Journal Article Autor Waldl M Journal Genes Seiten 372 Link Publikation -
2018
Titel Organ-wide profiling in mouse reveals high editing levels of Filamin B mRNA in the musculoskeletal system DOI 10.1080/15476286.2018.1480252 Typ Journal Article Autor Czermak P Journal RNA Biology Seiten 877-885 Link Publikation -
2017
Titel Novel small RNA spike-in oligonucleotides enable absolute normalization of small RNA-Seq data DOI 10.1038/s41598-017-06174-3 Typ Journal Article Autor Lutzmayer S Journal Scientific Reports Seiten 5913 Link Publikation -
2016
Titel The MazF-regulon: a toolbox for the post-transcriptional stress response in Escherichia coli DOI 10.1093/nar/gkw115 Typ Journal Article Autor Sauert M Journal Nucleic Acids Research Seiten 6660-6675 Link Publikation -
2016
Titel Insights into the Stress Response Triggered by Kasugamycin in Escherichia coli DOI 10.3390/antibiotics5020019 Typ Journal Article Autor Müller C Journal Antibiotics Seiten 19 Link Publikation -
2016
Titel RNA folding with hard and soft constraints DOI 10.1186/s13015-016-0070-z Typ Journal Article Autor Lorenz R Journal Algorithms for Molecular Biology Seiten 8 Link Publikation