• Zum Inhalt springen (Accesskey 1)
  • Zur Suche springen (Accesskey 7)
FWF — Österreichischer Wissenschaftsfonds
  • Zur Übersichtsseite Entdecken

    • Forschungsradar
      • Historisches Forschungsradar 1974–1994
    • Entdeckungen
      • Emmanuelle Charpentier
      • Adrian Constantin
      • Monika Henzinger
      • Ferenc Krausz
      • Wolfgang Lutz
      • Walter Pohl
      • Christa Schleper
      • Elly Tanaka
      • Anton Zeilinger
    • Impact Stories
      • Verena Gassner
      • Wolfgang Lechner
      • Georg Winter
    • scilog-Magazin
    • Austrian Science Awards
      • FWF-Wittgenstein-Preise
      • FWF-ASTRA-Preise
      • FWF-START-Preise
      • Auszeichnungsfeier
    • excellent=austria
      • Clusters of Excellence
      • Emerging Fields
    • Im Fokus
      • 40 Jahre Erwin-Schrödinger-Programm
      • Quantum Austria
      • Spezialforschungsbereiche
    • Dialog und Diskussion
      • think.beyond Summit
      • Am Puls
      • Was die Welt zusammenhält
      • FWF Women’s Circle
      • Science Lectures
    • Wissenstransfer-Events
    • E-Book Library
  • Zur Übersichtsseite Fördern

    • Förderportfolio
      • excellent=austria
        • Clusters of Excellence
        • Emerging Fields
      • Projekte
        • Einzelprojekte
        • Einzelprojekte International
        • Klinische Forschung
        • 1000 Ideen
        • Entwicklung und Erschließung der Künste
        • FWF-Wittgenstein-Preis
      • Karrieren
        • ESPRIT
        • FWF-ASTRA-Preise
        • Erwin Schrödinger
        • doc.funds
        • doc.funds.connect
      • Kooperationen
        • Spezialforschungsgruppen
        • Spezialforschungsbereiche
        • Forschungsgruppen
        • International – Multilaterale Initiativen
        • #ConnectingMinds
      • Kommunikation
        • Top Citizen Science
        • Wissenschaftskommunikation
        • Buchpublikationen
        • Digitale Publikationen
        • Open-Access-Pauschale
      • Themenförderungen
        • AI Mission Austria
        • Belmont Forum
        • ERA-NET HERA
        • ERA-NET NORFACE
        • ERA-NET QuantERA
        • ERA-NET TRANSCAN
        • Ersatzmethoden für Tierversuche
        • Europäische Partnerschaft Biodiversa+
        • Europäische Partnerschaft BrainHealth
        • Europäische Partnerschaft ERA4Health
        • Europäische Partnerschaft ERDERA
        • Europäische Partnerschaft EUPAHW
        • Europäische Partnerschaft FutureFoodS
        • Europäische Partnerschaft OHAMR
        • Europäische Partnerschaft PerMed
        • Europäische Partnerschaft Water4All
        • Gottfried-und-Vera-Weiss-Preis
        • netidee SCIENCE
        • Projekte der Herzfelder-Stiftung
        • Quantum Austria
        • Rückenwind-Förderbonus
        • WE&ME Award
        • Zero Emissions Award
      • Länderkooperationen
        • Belgien/Flandern
        • Deutschland
        • Frankreich
        • Italien/Südtirol
        • Japan
        • Luxemburg
        • Polen
        • Schweiz
        • Slowenien
        • Taiwan
        • Tirol–Südtirol–Trentino
        • Tschechien
        • Ungarn
    • Schritt für Schritt
      • Förderung finden
      • Antrag einreichen
      • Internationales Peer-Review
      • Förderentscheidung
      • Projekt durchführen
      • Projekt beenden
      • Weitere Informationen
        • Integrität und Ethik
        • Inklusion
        • Antragstellung aus dem Ausland
        • Personalkosten
        • PROFI
        • Projektendberichte
        • Projektendberichtsumfrage
    • FAQ
      • Projektphase PROFI
      • Projektphase Ad personam
      • Auslaufende Programme
        • Elise Richter und Elise Richter PEEK
        • FWF-START-Preise
  • Zur Übersichtsseite Über uns

    • Leitbild
    • FWF-Film
    • Werte
    • Zahlen und Daten
    • Jahresbericht
    • Aufgaben und Aktivitäten
      • Forschungsförderung
        • Matching-Funds-Förderungen
      • Internationale Kooperationen
      • Studien und Publikationen
      • Chancengleichheit und Diversität
        • Ziele und Prinzipien
        • Maßnahmen
        • Bias-Sensibilisierung in der Begutachtung
        • Begriffe und Definitionen
        • Karriere in der Spitzenforschung
      • Open Science
        • Open-Access-Policy
          • Open-Access-Policy für begutachtete Publikationen
          • Open-Access-Policy für begutachtete Buchpublikationen
          • Open-Access-Policy für Forschungsdaten
        • Forschungsdatenmanagement
        • Citizen Science
        • Open-Science-Infrastrukturen
        • Open-Science-Förderung
      • Evaluierungen und Qualitätssicherung
      • Wissenschaftliche Integrität
      • Wissenschaftskommunikation
      • Philanthropie
      • Nachhaltigkeit
    • Geschichte
    • Gesetzliche Grundlagen
    • Organisation
      • Gremien
        • Präsidium
        • Aufsichtsrat
        • Delegiertenversammlung
        • Kuratorium
        • Jurys
      • Geschäftsstelle
    • Arbeiten im FWF
  • Zur Übersichtsseite Aktuelles

    • News
    • Presse
      • Logos
    • Eventkalender
      • Veranstaltung eintragen
      • FWF-Infoveranstaltungen
    • Jobbörse
      • Job eintragen
    • Newsletter
  • Entdecken, 
    worauf es
    ankommt.

    FWF-Newsletter Presse-Newsletter Kalender-Newsletter Job-Newsletter scilog-Newsletter

    SOCIAL MEDIA

    • LinkedIn, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
    • , externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
    • Facebook, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
    • Instagram, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
    • YouTube, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster

    SCILOG

    • Scilog — Das Wissenschaftsmagazin des Österreichischen Wissenschaftsfonds (FWF)
  • elane-Login, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
  • Scilog externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
  • en Switch to English

  

Seltene Ereignisse genauer vorhersagen

Predicting Rare Events More Accurately (PREMA)

Georg Lukas Heinze (ORCID: 0000-0003-1147-8491)
  • Grant-DOI 10.55776/I2276
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2015
  • Projektende 30.09.2020
  • Bewilligungssumme 202.491 €

Bilaterale Ausschreibung: Slowenien

Wissenschaftsdisziplinen

Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (50%); Biologie (50%)

Keywords

    Class Imbalance, Cross-Validation, Logistic Regression, Panalized Liklihood, Prognostic Model, Rare Events

Abstract Endbericht

Logistische Regression ist eine der in der medizinischen Forschung am häufigsten verwendeten statistischen Methoden zur Schätzung prognostischer Modelle, die den Zusammenhang zwischen einem binären Zielparameter (mit Kategorien Ereignis und kein Ereignis) und mehreren binären, kategoriellen oder kontinuierlichen erklärenden Variablen herstellen. Eine niedrige Prävalenz von Ereignissen, wie sie oft in klinischen oder epidemiologischen Studien, aber auch in empirischen Fragestellungen anderer Gebiete, vorkommt, führt zu Unterschätzung und Instabilität der Schätzer für die Ereigniswahrscheinlichkeit bei Subjekten mit Ereignis. Das liegt daran, dass die Analyse unverhältnismäßig stark von den Subjekten ohne Ereignis beeinflusst wird. Nähert sich die Anzahl der erklärenden Variablen an die Anzahl der Ereignisse an oder übersteigt diese, wird dieser Effekt sogar noch verstärkt. Für Analysen hochdimensionaler Variablenräume haben Pönalisierte-Likelihood-Methoden (PLM) an Bedeutung gewonnen. Diese reduzieren den mittleren quadratischen Vorhersagefehler indem sie die Schätzer für die Regressionskoeffizienten Richtung Null verzerren. Dennoch bleibt durch PLM das Problem der ungenauen Vorhersagen für Subjekte mit hoher Ereigniswahrscheinlichkeit bestehen. Das Hauptziel dieses Projektes ist es daher, PLM zu entwickeln, die sich besonders für die Analyse hochdimensionaler Variablenräume mit niedriger Ereignis-Prävalenz eignen. Dazu müssen neue Ansätze für die Schätzung der Regressionskoeffizienten, für die Wahl des involvierten Tuningkriteriums und für die abschließende Validierung der Modelle gefunden werden. Auf der Ebene der Modellschätzung sollen Gewichtungsmethoden, die die Anzahl der Ereignisse künstlich erhöhen, und vor allem verschiedene Typen von Likelihood-Pönalisierungen, etwa Kombinationen bekannter Pönalisierungen (Firth und LASSO oder Firth und ridge) oder Verallgemeinerungen der Firth-Pönalisierungen, untersucht werden. Weiters wird erwartet, dass die derzeit am häufigsten verwendeten Tuning-Kriterien zur Regulierung der Stärke der Pönalisierung, wie zum Beispiel Optimierung der kreuzvalidierten Devianz oder des Klassifizierungsfehlers, nicht für die Analyse seltener Ereignissen geeignet sind. Tuning-Kriterien, die Beobachtungen mit Ereignis stärker gewichten, sind eine vielversprechende Möglichkeit um akkuratere Schätzer für die Ereigniswahrscheinlichkeit zu erhalten. Auf ähnliche Weise sollen Maßzahlen für die Vorhersagegenauigkeit zur Modellvalidierung adaptiert werden, sodass sie größeren Wert auf die Vorhersagegenauigkeit bei Subjekten mit Ereignis legen. Die entwickelten Methoden sollen anhand von Beispielstudien und in umfassenden Simulationsstudien auf ihre Effizienz und praktische Anwendbarkeit hin untersucht werden. Ihre Implementierung in Softwarepakete wird den routinemäßigen Einsatz bei der Analyse hochdimensionaler Variablenräume mit niedriger Ereignis-Prävalenz ermöglichen, wie sie zum Beispiel häufig in epidemiologischen oder klinischen Fragestellungen vorkommen.

In diesem Projekt wurden neue statistische Verfahren zur Prognose seltener Ereignisse aufgrund von zum Prognosezeitpunkt verfügbarer Deskriptoren entwickelt. Diese Verfahren wurden im Hinblick auf ihre statistischen Eigenschaften untersucht und mit existierenden Methoden verglichen um Empfehlungen treffen zu können, wie effiziente statistische Analysen mit möglichst päzisen Vorhersagen erreicht werden kann. Der wesentlichste Beitrag des Projekts ist die Weiterentwicklung der logistischen Regressionsanalyse zu diesem Zweck. Mit den im Rahmen dieses Projektes entwickelten Verfahren FLIC und FLAC öffnen sich neue Wege zur präzisen Vorhersage von Wahrscheinlichkeiten seltener Ereignisse wie etwa Medikamentennebenwirkungen. Um die neuen Verfahren auch der internationalen Forschung zur Verfügung zu stellen, wurden entsprechende Computerprogramme entwickelt, die frei zugänglich sind.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Lara Lusa, University of Ljubljana - Slowenien
  • Robin Henderson, University of Newcastle upon Tyne - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 679 Zitationen
  • 29 Publikationen
  • 1 Policies
  • 2 Software
  • 1 Disseminationen
  • 5 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2021
    Titel To tune or not to tune, a case study of ridge logistic regression in small or sparse datasets
    DOI 10.48550/arxiv.2101.11230
    Typ Preprint
    Autor Šinkovec H
  • 2021
    Titel On resampling methods for model assessment in penalized and unpenalized logistic regression
    DOI 10.48550/arxiv.2101.07640
    Typ Preprint
    Autor Geroldinger A
  • 2021
    Titel Firth's logistic regression with rare events: accurate effect estimates AND predictions?
    DOI 10.48550/arxiv.2101.07620
    Typ Preprint
    Autor Puhr R
  • 2021
    Titel Solutions to problems of nonexistence of parameter estimates and sparse data bias in Poisson regression
    DOI 10.1177/09622802211065405
    Typ Journal Article
    Autor Joshi A
    Journal Statistical Methods in Medical Research
    Seiten 253-266
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The roles of predictors in cardiovascular risk models - a question of modeling culture?
    DOI 10.1186/s12874-021-01487-4
    Typ Journal Article
    Autor Wallisch C
    Journal BMC Medical Research Methodology
    Seiten 284
    Link Publikation
  • 2022
    Titel An investigation of penalization and data augmentation to improve convergence of generalized estimating equations for clustered binary outcomes
    DOI 10.1186/s12874-022-01641-6
    Typ Journal Article
    Autor Geroldinger A
    Journal BMC Medical Research Methodology
    Seiten 168
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Additional file 1 of An investigation of penalization and data augmentation to improve convergence of generalized estimating equations for clustered binary outcomes
    DOI 10.6084/m9.figshare.20046960.v1
    Typ Other
    Autor Blagus R
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Additional file 1 of An investigation of penalization and data augmentation to improve convergence of generalized estimating equations for clustered binary outcomes
    DOI 10.6084/m9.figshare.20046960
    Typ Other
    Autor Blagus R
    Link Publikation
  • 2019
    Titel "Bring More Data!" – A Good Advice? Removing Separation in Logistic Regression by Increasing Sample Size
    DOI 10.20944/preprints201910.0321.v1
    Typ Preprint
    Autor Šinkovec H
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Interrelations of Sphingolipid and Lysophosphatidate Signaling with Immune System in Ovarian Cancer
    DOI 10.1016/j.csbj.2019.04.004
    Typ Journal Article
    Autor Meshcheryakova A
    Journal Computational and Structural Biotechnology Journal
    Seiten 537-560
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Bring More Data!—A Good Advice? Removing Separation in Logistic Regression by Increasing Sample Size
    DOI 10.3390/ijerph16234658
    Typ Journal Article
    Autor Šinkovec H
    Journal International Journal of Environmental Research and Public Health
    Seiten 4658
    Link Publikation
  • 2021
    Titel To tune or not to tune, a case study of ridge logistic regression in small or sparse datasets
    DOI 10.1186/s12874-021-01374-y
    Typ Journal Article
    Autor Šinkovec H
    Journal BMC Medical Research Methodology
    Seiten 199
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 1 of To tune or not to tune, a case study of ridge logistic regression in small or sparse datasets
    DOI 10.6084/m9.figshare.16714206.v1
    Typ Other
    Autor Heinze G
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 1 of To tune or not to tune, a case study of ridge logistic regression in small or sparse datasets
    DOI 10.6084/m9.figshare.16714206
    Typ Other
    Autor Heinze G
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 2 of The roles of predictors in cardiovascular risk models - a question of modeling culture?
    DOI 10.6084/m9.figshare.17284181.v1
    Typ Other
    Autor Agibetov A
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 2 of The roles of predictors in cardiovascular risk models - a question of modeling culture?
    DOI 10.6084/m9.figshare.17284181
    Typ Other
    Autor Agibetov A
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 1 of The roles of predictors in cardiovascular risk models - a question of modeling culture?
    DOI 10.6084/m9.figshare.17284178.v1
    Typ Other
    Autor Agibetov A
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 3 of The roles of predictors in cardiovascular risk models - a question of modeling culture?
    DOI 10.6084/m9.figshare.17284184.v1
    Typ Other
    Autor Agibetov A
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 1 of The roles of predictors in cardiovascular risk models - a question of modeling culture?
    DOI 10.6084/m9.figshare.17284178
    Typ Other
    Autor Agibetov A
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Additional file 3 of The roles of predictors in cardiovascular risk models - a question of modeling culture?
    DOI 10.6084/m9.figshare.17284184
    Typ Other
    Autor Agibetov A
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Hotspots of vascular plant endemism in a global biodiversity hotspot in Southwest Asia suffer from significant conservation gaps
    DOI 10.1016/j.biocon.2019.07.005
    Typ Journal Article
    Autor Noroozi J
    Journal Biological Conservation
    Seiten 299-307
    Link Publikation
  • 2022
    Titel An Investigation of Penalization and Data Augmentation to Improve Convergence of Generalized Estimating Equations for Clustered Binary Outcomes
    DOI 10.21203/rs.3.rs-1369776/v1
    Typ Preprint
    Autor Geroldinger A
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Leave-one-out cross-validation, penalization, and differential bias of some prediction model performance measures—a simulation study
    DOI 10.1186/s41512-023-00146-0
    Typ Journal Article
    Autor Geroldinger A
    Journal Diagnostic and Prognostic Research
    Seiten 9
    Link Publikation
  • 2021
    Titel sj-docx-1-smm-10.1177_09622802211065405 - Supplemental material for Solutions to problems of nonexistence of parameter estimates and sparse data bias in Poisson regression
    DOI 10.25384/sage.17697919
    Typ Other
    Autor Geroldinger A
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Tuning in ridge logistic regression to solve separation
    DOI 10.48550/arxiv.2011.14865
    Typ Preprint
    Autor Šinkovec H
  • 2020
    Titel Selection of variables for multivariable models: Opportunities and limitations in quantifying model stability by resampling
    DOI 10.1002/sim.8779
    Typ Journal Article
    Autor Wallisch C
    Journal Statistics in Medicine
    Seiten 369-381
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Separation in Logistic Regression: Causes, Consequences, and Control
    DOI 10.1093/aje/kwx299
    Typ Journal Article
    Autor Mansournia M
    Journal American Journal of Epidemiology
    Seiten 864-870
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Firth's logistic regression with rare events: accurate effect estimates and predictions?
    DOI 10.1002/sim.7273
    Typ Journal Article
    Autor Puhr R
    Journal Statistics in Medicine
    Seiten 2302-2317
    Link Publikation
  • 2022
    Titel A comparison of full model specification and backward elimination of potential confounders when estimating marginal and conditional causal effects on binary outcomes from observational data
    DOI 10.1002/bimj.202100237
    Typ Journal Article
    Autor Luijken K
    Journal Biometrical Journal
    Seiten 2100237
    Link Publikation
Policies
  • 2020
    Titel Systematic Review of COVID-19 prediction models
    DOI 10.1136/bmj.m1328
    Typ Membership of a guideline committee
Software
  • 2020 Link
    Titel logistf: an R package for logistic regression with Firth's correction
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel flicflac SAS macro suite
    Link Link
Disseminationen
  • 2017
    Titel Keynote at Young Statisticians Meeting
    Typ A talk or presentation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2021
    Titel Guest Editor of Special Issue in the International Journal of Environmental Research and Public Health
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2019
    Titel Poster prize of the Austro-Swiss region of the International Biometric Society
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2019
    Titel Associate Editor of Statistics in Medicine
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Associate Editor of Diagnostic and Prognostic Research
    Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Keynote speaker at the BMS-ANed (Dutch Biometric Society) 2018 Spring Meeting
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)

Entdecken, 
worauf es
ankommt.

Newsletter

FWF-Newsletter Presse-Newsletter Kalender-Newsletter Job-Newsletter scilog-Newsletter

Kontakt

Österreichischer Wissenschaftsfonds FWF
Georg-Coch-Platz 2
(Eingang Wiesingerstraße 4)
1010 Wien

office(at)fwf.ac.at
+43 1 505 67 40

Allgemeines

  • Jobbörse
  • Arbeiten im FWF
  • Presse
  • Philanthropie
  • scilog
  • Geschäftsstelle
  • Social Media Directory
  • LinkedIn, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
  • , externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
  • Facebook, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
  • Instagram, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
  • YouTube, externe URL, öffnet sich in einem neuen Fenster
  • Cookies
  • Hinweisgeber:innensystem
  • Barrierefreiheitserklärung
  • Datenschutz
  • Impressum
  • IFG-Formular
  • Social Media Directory
  • © Österreichischer Wissenschaftsfonds FWF
© Österreichischer Wissenschaftsfonds FWF