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IMPACT

IMPACT

Gaia Novarino (ORCID: 0000-0002-7673-7178)
  • Grant-DOI 10.55776/I4205
  • Förderprogramm International - Multilaterale Initiativen
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2019
  • Projektende 31.03.2023
  • Bewilligungssumme 357.037 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Cross-Omics, Micro-Electrode Arrays, Chromatinopathies, Converging Pathways, Ineurons, Brain Organoids

Abstract Endbericht

Neurologische Entwicklungsstörungen (NES) sind eine große Gruppe seltener Erkrankungen, welche durch Mutationen in einer hohen Anzahl von verschiedenen Genen verursacht werden können. Aus diesem Grund kommen einzelne Mutationen nur selten vor, was das Studium und die Therapie von NES deutlich erschwert. Die am häufigsten mutierten Gene im Falle von NES spielen überwiegend eine Rolle in molekularen Prozessen in den Synapsen von Nervenzellen oder in der Regulation der DNA-Transkription durch Modulation der Chromatinstruktur (epigenetische Veränderungen der DNA). Im Rahmen dieses Projektes untersuchen wir fünf verschiedene NES: Kabuki, Kleefstra, Gabriele-de-Vries und Gelsmoortel-Van der Aa Syndrom sowie eine Form von syndromischer Autismus Spektrum Störung. Diese werden durch Mutationen in den Genen KMT2D, EHMT1, YY1, ADNP und CHD8 verursacht und ähnliche klinische Merkmale. Die Besonderheit unserer Studie liegt darin, dass alle diese Gene ähnliche Funktionen in der epigenetischen Regulation der Transkription von Genen erfüllen und auch mit gemeinsamen molekularen Partnern interagieren. Unsere Hypothese ist daher, dass Mutationen in diesen Genen zu einzigartigen als auch gemeinsamen Effekten auf Ebene der Transkription oder Translation von Genen führen. Ziel des Kooperationsprojekts IMPACT ist es daher gemeinsame molekulare und zelluläre Signaturen dieser sogenannten genetischen Chromatinopathien aufzudecken. Solche konvergierenden Krankheitsmechanismen bieten ein attraktives Ziel für die Entwicklung von wissensbasierten therapeutischen Ansätzen für eine Vielzahl verwandter, seltener Neuroentwicklungsstörungen.

Autismus-Spektrum-Störungen (ASDs) sind eine Gruppe heterogener Erkrankungen, die sich durch Schwierigkeiten bei der Herstellung sozialer Kontakte und das Auftreten repetitiver Verhaltensweisen auszeichnen. Gene, die für Chromatin-Remodeler kodieren, sind bei ASD-Patienten häufig mutiert, und darunter ist das Chromodomän-Helicase-DNA-Bindungsprotein 8 (CHD8) eines der am häufigsten mutierten und am stärksten durchschlagenden Gene. In dieser Studie haben wir zerebrale Organoid-Modelle (miniaturisierte, gehirnähnliche Strukturen, die aus menschlichen Stammzellen gezüchtet werden) und Einzelzell-RNA-Sequenzierung eingesetzt, um die Auswirkungen der CHD8-Haploinsuffizienz (nur eine funktionelle Kopie des Gens vorhanden) auf die Entwicklung der menschlichen Hirnrinde zu untersuchen. Die Ergebnisse zeigten Störungen in der Differenzierung erregender und hemmender Neuronen, was zu veränderten zeitlichen Dynamiken während der Hirnentwicklung führte. Die Analyse identifizierte spezifische Gene und Signalwege, die von CHD8-Mutationen betroffen sind, insbesondere im Zusammenhang mit der Regulation des Zellzyklus, der RNA-Spleißung und der Neurogenese. Unsere Forschung hat Licht auf die zellulären und molekularen Mechanismen geworfen, die ASD und CHD8-bezogene Phänotypen zugrunde liegen, und wertvolle Erkenntnisse über die neuroentwicklungsbezogenen Aspekte dieser Störungen geliefert.

Forschungsstätte(n)
  • Institute of Science and Technology Austria - ISTA - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Frank Kooy, Universiteit Antwerpen - Belgien
  • Giacomo Cavalli, Centre National de la Recherche Scientifique Montpellier - Frankreich
  • Giuseppe Testa, European Institute of Oncology - Italien
  • James Ellis, University of Toronto - Kanada
  • Hans Van Bokhoven, Radboud University - Niederlande

Research Output

  • 69 Zitationen
  • 4 Publikationen
Publikationen
  • 2022
    Titel CHD8 haploinsufficiency links autism to transient alterations in excitatory and inhibitory trajectories
    DOI 10.1016/j.celrep.2022.110615
    Typ Journal Article
    Autor Villa C
    Journal Cell Reports
    Seiten 110615
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Transcriptional consequences of mutations in genes associated with Autism Spectrum Disorder
    DOI 10.15479/at:ista:12094
    Typ Other
    Autor Dotter C
    Link Publikation
  • 2020
    Titel CHD8 haploinsufficiency alters the developmental trajectories of human excitatory and inhibitory neurons linking autism phenotypes with transient cellular defects
    DOI 10.1101/2020.11.26.399469
    Typ Preprint
    Autor Villa C
    Seiten 2020.11.26.399469
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Transcriptional consequences of mutations in genes associated with Autism Spectrum Disorder
    Typ PhD Thesis
    Autor Christoph Dotter

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