Neue chemoenzymatische Route von Säuren zu Nitrilen
A new chemoenzymatic route from carboxylic acids to nitriles
Bilaterale Ausschreibung: Tschechien
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (30%); Chemie (10%); Industrielle Biotechnologie (60%)
Keywords
-
Chemoenzymatic cascade,
Carboxylate reductase (CAR),
Aldoxime dehydratase,
Nitrile synthesis,
Aldoxime Synthesis
Nitrile sind vielseitige chemische Verbindungen. Citronellylnitril, zum Beispiel, verströmt einen zitronenartigen Duft und wird häufig in Haushaltsreinigern eingesetzt. Der typische Weg um Nitrile herzustellen besteht aus der chemischen Reaktion bestimmter Moleküle mit Zyanid. Zyanid ist aber hochgiftig. Agatha Christie lässt ihre fiktiven Mörder gerne zu Zyanid greifen: Ein wenig unscheinbares, weißes Pulver in ein Glas Sekt, und schon nimmt Blausäure den Opfern die Luft zum Atmen. Die Verwendung von Zyanid wird überflüssig, wenn man Nitrile mit Hilfe von Enzymen herstellt. Diese Biokatalysatoren sind ungiftig und arbeiten bei ökologisch vertretbaren, milden Bedingungen. Das Ziel des vorliegenden Projektes ist es, gleich zwei Enzyme (Carboxylatreduktasen und Aldoximdehydratasen) und eine einfache chemische Reaktion zu einer Kaskade zu verbinden: Aus Säure wird Aldehyd, daraus ein Oxim, das wiederum in das Zielprodukt das Nitril umgewandelt wird. Carboxylatreduktase-Enzyme können aus einer Säure selektiv den Aldehyd machen, sie brauchen aber biologische Cofaktoren als Energielieferanten. Letztere kann man nicht einfach zu einer Reaktion zugeben, da sie viel zu teuer wären. Wenn wir die Reaktion aber in einem Mikroorganismus ablaufen lassen, so ist dieses Problem gelöst, da die Zellen die nötigen Cofaktoren ganz einfach aus Zucker und Sauerstoff bilden. Das Produkt dieser ersten enzymatischen Stufe der Aldehyd ist sehr reaktiv und wird sogleich über chemische Kondensation mit Hydroxylamin als Oxim abgefangen. Das Oxim wiederum wird von einer Aldoximdehydratase als Substrat erkannt. Dieses Enzym ist erstaunlicherweise in der Lage, das Nitril unter Wasserabspaltung in wässriger Lösung freizusetzen! Dies ist eine ausgesprochen milde Alternative zur klassisch chemischen Wasserabspaltung. Wir haben uns zum Ziel gesetzt, das Bakterium Escherichia coli dazu zu bringen, die oben dargelegte Kaskadenreaktion zu Nitrilen zu katalysieren. Unsere Methode wird nicht nur für die Herstellung duftender Nitrile, sondern auch für die Synthese pharmazeutischer Wirkstoffe einsetzbar sein. Als besonders wichtiges Projektergebnis erwarten wir ein deutlich besseres Verständnis des Zusammenspiels von Enzymen und Chemikalien im lebenden Mikrooganismus. Dieses Wissen wird uns nicht nur helfen, Schwachstellen in unserer Kaskade zu identifizieren und zu beheben, sondern auch, andere Kaskaden mit Aldehyden als Zwischenprodukt zu verbessern. Aus Genom- Sequenzierungsprojekten wissen wir, dass Gene von hunderten bakteriellen und pilzlichen Aldoximdehydratasen in Datenbanken schlummern. Erst eine Handvoll dieser Enzyme wurde bis jetzt untersucht und eines unserer Ziele ist es, herausragende neue Aldoximdehydratasen zu finden. Daher erwarten wir als weiteres Resultat unserer Arbeit tiefgreifendes Wissen über die, bis dato, ziemlich unerforschte Enzymklasse der Aldoximdehydratasen und neue Varianten dieser hochinteressanten Biokatalysatoren.
Wenn der Haushaltsreiniger einen zitronenartigen Duft verströmt, dann kann das an einem Nitril namens Citronellylnitril liegen. Auch bei der Herstellung von pharmazeutischen Wirkstoffen, Sekundenklebern oder chemikalienresistenten Handschuhen kommen diese vielseitigen chemischen Nitril-Gruppen zum Einsatz. Für das bisher gängige Herstellungsverfahren benötigte es eine chemische Reaktion bestimmter Moleküle mit hochgiftigem Zyanid. Um das Zyanid zu ersetzen, greifen wir auf Enzyme zurück und verbinden drei einzelne Reaktionen zu einer Kaskade. Ausgangsstoff sind Carbonsäuren, etwa Fettsäuren aus Ölen oder Lignin, das als Reststoff in der Holzverarbeitung anfällt. Im ersten Schritt wird die Carbonsäure durch Zugabe von Zucker, Sauerstoff und dem in lebenden Bakterienzellen enthaltenen Enzym Carbonsäurereduktase zu einem Aldehyd gewandelt. Dieses Aldehyd ist allerdings hoch reaktiv und dadurch instabil, in vielen Fällen noch dazu flüchtig. Um diesen Stoff abzufangen, lässt man das Aldehyd mit Hydroxylamin reagieren, wodurch es zu stabilem Oxim umgesetzt wird. Oxim ist eine gewässerte Form des Nitrils, weswegen im letzten Schritt das Enzym Aldoxim Dehydratase zum Einsatz kommt. Auch dieses befindet sich in Bakterienzellen und sorgt dafür, dass dem Oxim das Wasser entzogen wird. Ist dies geschehen, hat die Kaskade ihr Ziel erreicht und das gewünschte Nitril ist hergestellt. Für kleine Mengen ist diese Methode bereits gut einsetzbar. Das wäre etwa bei sehr potenten Duftstoffen der Fall, von denen nur wenig benötigt wird, um einen Effekt zu erzielen. Für die Herstellung größerer Nitrilmengen ist noch Optimierungsarbeit notwendig, um den biokatalytischen Prozess zu vertretbaren Kosten nutzen zu können. Aktuell kommen im ersten Prozessschritt stark verdünnte Lösungen zum Einsatz und es benötigt einen großen Reaktor, um Großmengen zu produzieren. Das ist allerdings teuer, daher sollte noch daran geforscht werden, den ersten Schritt effizienter zu gestalten. Die Dehydrierung des Oxims alleine ist hingegen ausgesprochen effizient und bereits heute technisch reif für die Produktion. Im Zuge unserer Forschung haben wir sehr viel Neues über die beteiligten Enzyme gelernt und ihre Vorlieben, sowie verschiedenste Szenarien durchgespielt, wie die Kaskade möglichst effizient zu nutzen wäre.
- Florian Rudroff, Technische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
- Harald Gröger, Universität Bielefeld - Deutschland
- Miroslav Patek, Czech Academy of Sciences - Tschechien
Research Output
- 143 Zitationen
- 19 Publikationen
- 5 Datasets & Models
- 6 Disseminationen
- 11 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2025
Titel NADH Driven Enzymatic Carboxylic Acid Reduction DOI 10.1002/cctc.202401994 Typ Journal Article Autor Ling J Journal ChemCatChem Link Publikation -
2024
Titel In-vitro studies of bacterial and fungal carboxylic acid reductases expressed in K. phaffii Typ Other Autor Goj -
2024
Titel Characterization of a new carboxylic acid reductase from Clostridium bornimense and the dependency of CARs on cofactors NADH and NADPH Typ Other Autor Breuer -
2024
Titel Aldehyde Reductase Activity of Carboxylic Acid Reductases DOI 10.1002/cbic.202400121 Typ Journal Article Autor Winkler M Journal ChemBioChem Link Publikation -
2024
Titel Cell-free reduction of carboxylic acids with secreted carboxylic acid reductase DOI 10.1016/j.jbiotec.2024.01.008 Typ Journal Article Autor Goj D Journal Journal of Biotechnology Seiten 44-50 Link Publikation -
2024
Titel Aldoxime dehydratases: production, immobilization and use in multistep processes Typ Other Autor Ludmila Martínková Link Publikation -
2024
Titel Aldoxime dehydratases: production, immobilization, and use in multistep processes DOI 10.1007/s00253-024-13272-6 Typ Journal Article Autor Martínková L Journal Applied Microbiology and Biotechnology Seiten 518 Link Publikation -
2024
Titel Immobilization of aldoxime dehydratases on metal affinity resins and use of the immobilized catalysts for the synthesis of nitriles important in fragrance industry DOI 10.1016/j.jbiotec.2024.02.005 Typ Journal Article Autor Krístková B Journal Journal of Biotechnology Seiten 12-19 -
2023
Titel Bio-Based Valorization of Lignin-Derived Phenolic Compounds: A Review DOI 10.3390/biom13050717 Typ Journal Article Autor Martínková L Journal Biomolecules Seiten 717 Link Publikation -
2022
Titel Chemoenzymatic one-pot reaction from carboxylic acid to nitrile via oxime DOI 10.1039/d1cy01694f Typ Journal Article Autor Horvat M Journal Catalysis Science & Technology Seiten 62-66 Link Publikation -
2022
Titel Metabolism of Aldoximes and Nitriles in Plant-Associated Bacteria and Its Potential in Plant-Bacteria Interactions DOI 10.3390/microorganisms10030549 Typ Journal Article Autor Rädisch R Journal Microorganisms Seiten 549 Link Publikation -
2022
Titel Biocatalytic Carboxylate Reduction – Recent Advances and New Enzymes DOI 10.1002/cctc.202200441 Typ Journal Article Autor Winkler M Journal ChemCatChem Link Publikation -
2022
Titel Organic Acid to Nitrile: A Chemoenzymatic Three-Step Route DOI 10.1002/adsc.202201053 Typ Journal Article Autor Winkler M Journal Advanced Synthesis & Catalysis Seiten 37-42 Link Publikation -
2022
Titel Scanning aldoxime dehydratase sequence space and characterization of a new aldoxime dehydratase from Fusarium vanettenii DOI 10.1016/j.enzmictec.2022.110187 Typ Journal Article Autor Krístková B Journal Enzyme and Microbial Technology Seiten 110187 -
2022
Titel Identification and characterization of microbial carboxylic acid reductases (CARs) for application in biocatalysis Typ PhD Thesis Autor Masethabela Maria Maphatsoe -
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Titel The fragrance of hay by aldoxime dehydratases Typ Other Autor Reinert -
2021
Titel Characterization and immobilization of Pycnoporus cinnabarinus carboxylic acid reductase, PcCAR2 DOI 10.1016/j.jbiotec.2021.12.010 Typ Journal Article Autor Maphatsoe M Journal Journal of Biotechnology Seiten 47-54 Link Publikation -
2021
Titel Comparison of K. phaffii and E. coli as whole cell catalysts for the reduction of carboxylic acids Typ Other Autor Ebner Link Publikation -
2021
Titel Chemoenzymatic cascade from carboxylic acids to nitriles Typ Other Autor Weilch Link Publikation
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2024
Link
Titel Data Hannah Breuer Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Data Victoria Weilch Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
Link
Titel Data Melissa Horvat Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Data Dominic Goj Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2023
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Titel RetroBioCat Database Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2023
Titel European Researchers Night Typ Participation in an open day or visit at my research institution -
2022
Titel Lange Nacht der Forschung Typ Participation in an open day or visit at my research institution -
2024
Titel Lange Nacht der Forschung 2024 Typ Participation in an open day or visit at my research institution -
2024
Titel Press release Typ A press release, press conference or response to a media enquiry/interview -
2022
Titel Article for Specialty Chemicals Magazine Typ A magazine, newsletter or online publication -
2024
Link
Titel Article in Magazine Typ A magazine, newsletter or online publication Link Link
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2025
Titel Federico Acciaretti Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel 4th International Symposium on Microbial Lipids Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel Kanokkan Sriwaiyaphram Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International -
2024
Titel Pietro Caramia Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International -
2023
Titel JBiotech Special Issue Typ Appointed as the editor/advisor to a journal or book series Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel New trends in organic synthesis Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad National (any country) -
2022
Titel Biocat 2022 Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel Summer School Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2022
Titel Student Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International -
2021
Titel CCBIO Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2021
Titel CZ Visiting Typ Attracted visiting staff or user to your research group Bekanntheitsgrad Continental/International