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SYNMOD_Biosafety and biosecurity, public perception

SYNMOD_Biosafety and biosecurity, public perception

Markus Schmidt (ORCID: 0000-0002-9788-4791)
  • Grant-DOI 10.55776/I490
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2010
  • Projektende 31.12.2013
  • Bewilligungssumme 356.286 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Andere Technische Wissenschaften (10%); Industrielle Biotechnologie (90%)

Keywords

    Synthetic biology, Novel antibiotics, Biosafety, Ethics, Genomic chassis, Protein modules

Abstract Endbericht

In Synmod ist die Anwendung der Prinzipien der synthetischen Biologie für das Design und die Produktion von neuen Antibiotikamolekülen geplant. Zunächst werden Peptid-Module in evolutionär entstandenen Antibiotika definiert, um sie anschließend für neue Wirkungsfunktionen zu rekombinieren. Die Module stammen aus der Gruppe der Lantibiotics, d.h. aus post-translational modifizierten Peptidantibiotika. Im nächsten Schritt konstruieren wir ein kontextunabhängiges post-translational System, welches eine Feinabstimmung des Modifikationsstoffwechsels ermöglichen soll. Dies soll durch die modulare Organisation des Stoffwechselweges bei gleichzeitiger genauer Charakterisierung der Expressionselemente erreicht werden. Der neu entworfene Stoffwechsel wird anschließend in ein neues Produktionschassis implementiert, d.h. in ein komplexitätsreduziertes Gram-positives Staphylococcus carnosus Bakterium (2.56 Mb Genom). Der resultierende Bakterienstamm wird dazu verwendet, eine Reihe von neuen Lantibiotika zu produzieren. Durch konsequente Anwendung des Prinzips der Modularität und der Kontextunabhängigkeit auf verschiedenen Ebenen des Ingenieursprozesses, versuchen wir eine neues Antibiotikaproduktionssystem zu entwickeln, welches ungewöhnlich robust und zielgenau ist. Anhand einer konkreten Anwendung der synthetischen Biologie, wollen wir weiters auch deren konkrete gesellschaftliche Auswirkungen anhand von ethischen und Sicherheits-Fragen analysieren. Auf Basis dieser Analysen wollen wir mit einer breiteren Öffentlichkeit in Kontakt treten um einen konstruktiven Dialog zu den Auswirkungen dieser neuen Biotechnologie zu ermöglichen.

Bis zur Entdeckung von Antibiotika waren Infektionskrankheiten eine permanente Bedrohung der Gesundheit und des Lebens. Kaum eine andere wissenschaftlich/medizinische Entdeckung hatte je so einen großen Einfluss auf das Wohlbefinden und die Sicherheit der gesamten Bevölkerung. Schnell fanden Antibiotika Anwendung, wurden von Ärzten gerne verschrieben und von den Patienten auch eingenommen, allerdings manchmal vor Ende der Therapie abgesetzt. In diesen Fällen kam es teilweise zur Entwicklung von Krankheitserregern die eine gewisse Resistenz bzw. Toleranz gegenüber den Wirkstoffen entwickelten. Mit anderen Worten die Wirkstoffe erzielten nicht mehr ihre heilende Wirkung. Lange Zeit half man sich gegen solche resistenten Keime, indem immer neue Antibiotika, die man nach und nach in der Natur fand, zum Einsatz kamen. Seit einigen Jahren jedoch werden immer seltener neue Wirkstoffe auf den Markt gebracht, nicht zuletzt weil keine neuen Substanzen in der Natur gefunden werden und weil sich die Pharmaindustrie keinen großen Gewinn erwartet. Im internationalen Forschungsprojekt SYNMOD wurde ein neuer Weg zur Herstellung neuer Antibiotika beschritten. Das Ziel von SYNMOD war aus einer speziellen Klasse von Antibiotika (Lantibiotika) biochemische Module zu extrahieren und diese neu zu kombinieren. Die so hergestellten synthetischen Antibiotika wurden in weiterer Folge auf ihre Wirksamkeit gegen Krankheitserreger getestet. Im Rahmen dieses Projekts war die Aufgabe des österreichischen Teilprojekts in erster Linie die Untersuchung der Schnittstelle zwischen Wissenschaft und Öffentlichkeit. Wir widmeten uns dabei verschiedenen Themen, z.B. welche ethische Fragen aufgeworfen werden, ob neue Sicherheitsprobleme zu berücksichtigen sind, welche Bedeutung der Lebensbegriff allgemein auf die Debatte um die synthetischen Biologie hat, oder in welcher Art und Weise die Ziele des Projekts und deren gesellschaftlichen Implikationen am besten dargestellt werden könnten. Unsere Ergebnisse zeigen dass die synthetische Biologie im Zusammenhang mit medizinischen Anwendungen wie etwa Antibiotika generell als ethisch unproblematisch eingeschätzt wird. Einzig die übermäßige Verwendung von Antibiotika in der industriellen Tierhaltung wird als problematisch betrachtet. Eine Modularisierung und damit Vereinfachung der Herstellung biologischer Systeme bringt, gleichsam als Nebeneffekt, eine Ausweitung des Personenkreises mit sich die diese Technologie verwenden können. Sogenannte Bio-hacker wurden in Medien und vereinzelt von Wissenschaftlern als Sicherheitsgefahr bezeichnet. Unsere Analyse widerspricht dieser Angst weitgehend, handelt es sich bei den Bio-hackern doch um semi-professionelle Enthusiasten die in erster Linie an der Demokratisierung der Produktionsprozesse interessiert sind, und auch dann innovativ tätig werden, wenn großer kein finanzieller Gewinn zu erwarten ist.

Forschungsstätte(n)
  • Biofaction KG - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Friedrich Götz, Eberhard-Karls-Universität Tübingen - Deutschland
  • Ralf Wagner, Universität Regensburg - Deutschland
  • Oscar P. Kuipers, University of Groningen - Niederlande
  • Sven Panke, Eidgenössische Technische Hochschule Zürich - Schweiz
  • Nicolas Szita, University College London - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 325 Zitationen
  • 18 Publikationen
Publikationen
  • 2015
    Titel What is Life—in Everyday Understanding? A Focus Group Study on Lay Perspectives on the Term Life
    DOI 10.1162/artl_a_00181
    Typ Journal Article
    Autor Kerbe W
    Journal Artificial Life
    Seiten 119-133
  • 2012
    Titel Synthetic constructs in/for the environment: Managing the interplay between natural and engineered Biology
    DOI 10.1016/j.febslet.2012.02.022
    Typ Journal Article
    Autor Schmidt M
    Journal FEBS Letters
    Seiten 2199-2206
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Engineering Life? Synthetische Biologie und die Technisierung des Lebendigen.
    Typ Journal Article
    Autor Kerbe W
    Journal Soziale Technik
  • 2012
    Titel Regulatory Frameworks for Synthetic Biology
    DOI 10.1002/9783527659296.ch5
    Typ Book Chapter
    Autor Pei L
    Verlag Wiley
    Seiten 157-226
  • 2015
    Titel Splicing Boundaries: The Experiences of Bioart Exhibition Visitors
    DOI 10.1162/leon_a_00701
    Typ Journal Article
    Autor Kerbe W
    Journal Leonardo
    Seiten 128-136
    Link Publikation
  • 2014
    Titel European do-it-yourself (DIY) biology: Beyond the hope, hype and horror
    DOI 10.1002/bies.201300149
    Typ Journal Article
    Autor Seyfried G
    Journal BioEssays
    Seiten 548-551
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Synthetic Toxicology: Where Engineering Meets Biology and Toxicology
    DOI 10.1093/toxsci/kfq339
    Typ Journal Article
    Autor Schmidt M
    Journal Toxicological Sciences
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Biosafety Considerations of Synthetic Biology in the International Genetically Engineered Machine (iGEM) Competition
    DOI 10.1525/bio.2013.63.1.7
    Typ Journal Article
    Autor Guan Z
    Journal BioScience
    Seiten 25-34
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Splicing boundaries: The experiences of bioart exhibition.
    Typ Journal Article
    Autor Kerbe W
  • 2013
    Titel Synthetic Biology Approaches to Combat Antibiotic Resistant Bacteria.
    Typ Conference Proceeding Abstract
    Autor Pei L
    Konferenz Microbial pathogens and strategies for combating them: science, technology and education (A. Méndez-Vilas, Ed.)
  • 2013
    Titel The Bio:Fiction film festival: Sensing how a debate about synthetic biology might evolve
    DOI 10.1177/0963662513503772
    Typ Journal Article
    Autor Schmidt M
    Journal Public Understanding of Science
    Seiten 619-635
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Synthetic Biology
    DOI 10.1002/9783527659296
    Typ Book
    Verlag Wiley
  • 2012
    Titel Perspektiven der Kommunikation für die Synthetische Biologie.
    Typ Book Chapter
    Autor Torgersen H
  • 2011
    Titel Synthetic biology in the view of European public funding organisations
    DOI 10.1177/0963662510393624
    Typ Journal Article
    Autor Pei L
    Journal Public Understanding of Science
    Seiten 149-162
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Darstellungen der Synthetischen Biologie.
    Typ Book Chapter
    Autor Cserer A
  • 2011
    Titel Synthetic biology: planning for a secure future.
    Typ Journal Article
    Autor Hauser J
    Journal American Institute for the Biological Sciences
  • 2013
    Titel Frames and comparators: How might a debate on synthetic biology evolve?
    DOI 10.1016/j.futures.2013.02.002
    Typ Journal Article
    Autor Torgersen H
    Journal Futures
    Seiten 44-54
    Link Publikation
  • 0
    Titel Gallery Guide for the SYNTH-ETHIC exhibition in the Museum of Natural History in Vienna, May 14 - June 28, 2011.
    Typ Other
    Autor Hauser J

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