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posttranslationale Regulierung des RNA-Silencing

Posttranslational regulation of RNA silencing

Yasin Dagdas (ORCID: 0000-0002-9502-355X)
  • Grant-DOI 10.55776/I6760
  • Förderprogramm Einzelprojekte International
  • Status laufend
  • Projektbeginn 01.01.2024
  • Projektende 30.06.2027
  • Bewilligungssumme 219.949 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (70%); Land- und Forstwirtschaft, Fischerei (30%)

Keywords

    RNA silencing, Autophagy, Ubiquitin, Proteasome, Argonaute, Arabidopsis

Abstract

RNA-Silencing ist bei allen Eukaryonten essentiell für die Entwicklung und spielt eine wichtige Rolle bei der Anpassung anUmweltbedingungen. Sie ist auch für die Kontrolle von Transposons entscheidend. Beim RNA-Silencing wird doppelsträngige RNA durch das RNase-III-Enzym Dicer in kleine RNA von 21 bis 24 Nukleotiden Länge zerlegt. Diese sRNA assoziieren mit Argonaute (AGO)-Proteinen und bilden so RNA-induzierte Silencing- Komplexe (RISCs). RISCs werden von der gebundenen sRNA so programmiert, dass sie auf der Grundlage von Sequenzkomplementarität spezifisch mit Transkripten interagieren, was zu deren Herunterregulierung führt. Trotz der offensichtlichen Bedeutung des RNA-Silencing in den meisten Eukaryonten wurde den molekularen Mechanismen, die den Umsatz von ARGONAUTE (AGO)-Proteinen (und RISC) regulieren, bisher nur wenig Aufmerksamkeit geschenkt. Obwohl in jüngster Zeit verschiedene Ubiquitin-E3-Ligasen identifiziert wurden, die in Drosophila, Säugetierzellen und Arabidopsis auf den selektiven Abbau von AGO- Proteinen abzielen, , sind ihre physiologischen Funktionen noch immer unbekannt. Speziell die Frage, wie biotische und abiotische Stressfaktoren die Homöostase von AGO-Proteinen oder RISC auf posttranslationaler Ebene beeinflussen, ist noch weitgehend ungeklärt. Ob RISCs umprogrammiert werden, um sich an veränderte Bedingungen anzupassen, und welche proteolytischen Mechanismen (26S-Proteasom versus Autophagie) die RISC- Homöostase steuern, bedarf weiterer Untersuchungen. Wir wollen , diese Fragestellung mit der Modellpflanze Arabidopsis thaliana (im Folgenden Arabidopsis genannt) lösen. Insgesamt sind unsere Studien zur posttranslationalen Kontrolle des AGO1-Proteins in Arabidopsis von grundlegender Bedeutung, da sie sich n auch auf andere Eukaryonten übertragen lassen. Die Erforschung des AGO1-Umsatzes wird auch als konzeptioneller Ansatz zum Verständnis kritischer Entscheidungsfindungen in proteolytischen Abläufen dienen.

Forschungsstätte(n)
  • Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg - 100%

Research Output

  • 8 Zitationen
  • 4 Publikationen
Publikationen
  • 2024
    Titel Metabolic enzymes moonlight as selective autophagy receptors to protect plants against viral-induced cellular damage
    DOI 10.1101/2024.05.06.590709
    Typ Preprint
    Autor Clavel M
    Seiten 2024.05.06.590709
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Cross-species interactome analysis uncovers a conserved selective autophagy mechanism for protein quality control in plants
    DOI 10.1101/2024.09.08.611708
    Typ Preprint
    Autor De Medina Hernández V
    Seiten 2024.09.08.611708
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Electrostatic changes enabled the diversification of an exocyst subunit via protein complex escape
    DOI 10.1038/s41477-025-02135-1
    Typ Journal Article
    Autor De La Concepcion J
    Journal Nature Plants
    Seiten 2350-2367
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Cross-species interactome analysis uncovers a conserved selective autophagy mechanism for protein quality control in plants
    DOI 10.1016/j.devcel.2025.11.001
    Typ Journal Article
    Autor Sánchez De Medina Hernández V
    Journal Developmental Cell
    Link Publikation

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