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Detection of gene expression in autotrophic picoplankton

Detection of gene expression in autotrophic picoplankton

Albin Alfreider (ORCID: 0000-0002-7644-7154)
  • Grant-DOI 10.55776/J1470
  • Förderprogramm Erwin Schrödinger
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.08.1997
  • Projektende 31.10.1998
  • Bewilligungssumme 27.252 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Abstract

Da ein Großteil der Mikroorganismen in aquatischen Systemen aufgrund der schlechten Kultivierbarkeit nicht mit klassisch-physiologischen Tests untersucht werden kann, besteht unter Biologen ein sehr großes Interesse, geeignete Methoden zur Analyse spezifischer mikrobieller Stoffwechselleistungen zu entwickeln. Erste sehr vielversprechende Ergebnisse bieten molekularbiologische Techniken, wobei die Expressionsmuster ausgewählter Enzyme durch die Analyse von mRNA-Genen mit hoher Sensitivität untersucht werden konnten. Das geplante Forschungsvorhaben soll am Labor von Prof. John Paul am marinbiologischen Institut in St. Petersburg, Florida durchgeführt werden. Diese Forschungsstätte hat vor allem auf dem Gebiet der mRNA-Analyse planktischer Mikroorganismen Pionierarbeit geleistet. Dadurch bietet sich mir die Möglichkeit an einem führenden Institut auf dem Gebiet der molekularen Ökologie mitarbeiten zu können und neue wissenschaftliche Techniken zu erlernen. Konkret soll mit spezifischen, mRNA gerichteten Oligonukleotidsonden die Genexpression der Ribulosebisphosphat-Carboxylase/Oxygenase (RubisCO; katalysiert den ersten Schritt bei der CO 2 Fixierung in Primärproduzenten) des autotrophen Picoplankton detektiert werden. Die methodische Entwicklungsarbeit beinhaltet vor allem das Austesten unterschiedlicher Markierungssubstanzen für die Gensonden und die Adaptation der mikroskopischen Analyse in Verbindung mit einem automatischen Bildanalysesystem. Inhaltliches Ziel ist es ein universell auf aquatische Mikroorganismen anwendbares Verfahren zu etablieren, welches die Detektion von spezifischen Stoffwechselleistungen in Einzelzellen erlaubt.

Forschungsstätte(n)
  • University of California at St. Petersburg - 100%
  • Universität Innsbruck - 10%

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