Funktion von translationalen Initiationsfaktoren aus Archaea

Im letzten Jahrzehnt wurde die Forschung an Organismen der Domäne der Archaea in vielen Bereichen intensiviert. Das Hauptziel dieses Projektes ist es, neue Erkenntnisse im Bereich der Initiation der Translation von Archaea zu gewinnen. Dafür werden die Funktionen von 2 Initiationsfaktoren aus dem Modellorganismus Sulfolobus solfataricus untersucht. Mit Hilfe einer Methode zur Bestimmung dynamischer Interaktionen zwischen Faktoren und Ribosomen werde ich die Funktion der Initiationsfaktoren aIF1 und a/eIF2 näher charakterisieren. Unsere derzeitigen Studien zeigen, dass aIF1 an die kleine ribosomale Untereinheit bindet und dadurch die Bindung von a/eIF2.GTP.Met-tRNAi an das Ribosom verstärkt. Jedoch ist der Grund für diese Stimulation nicht bekannt. Durch die Kartierung der Dynamik des Prozesses der Bindung der beiden Faktoren ans Ribosom soll geklärt werden, ob diese Stimulation durch direkten Kontakt der beiden Faktoren oder durch Konformationsänderungen des Ribosoms hervorgerufen wird. Parallel zu diese Experimenten werden die Gruppen von Prof. Gualerzi und Prof. Londei die Position von bakteriellen bzw. von 2 weiteren Faktoren aus Archaea am Ribosom kartieren. Dies sollte es uns ermöglichen, die Daten von Initiationsfaktoren aus Bakterien und Archaea zu vergleichen um evolutionäre Aspekte der Initiation der Translation besser zu verstehen.