Zirkulierende Tumor DNA bei Patienten mit Prostatakarzinom

Prostatakrebs ist weltweit ein häufiges Gesundheitsproblem unter Männern. Hochentwickelte Untersuchungstechniken des Erbguts haben unser Wissen über die genetischen Grundlagen des Prostatakarzinoms signifikant erweitert. Dennoch bleiben wichtige Fragen bezüglich der Früherkennung sowie der Charakterisierung des Tumorgenoms bei Patienten mit Metastasen oder wiederkehrender Erkrankung offen. Wir haben daher, basierend auf der Technik des whole genome sequencing von Plasma DNA, einen neuen Ansatz (Plasma- Seq) entwickelt, um das Erbgut von Patienten mit Krebs nicht-invasiv, also aus einer einzelnen Blutprobe, untersuchen zu können. Mit dieser Technik, die auch als liquid biopsy bezeichnet wird, ist es möglich, im Gegensatz zu Gewebeuntersuchungen, Proben in einem engen Zeitraum zu gewinnen und das Ansprechen auf eine bestimmte Therapie zu verfolgen. Im Verlauf können neue genetische Veränderungen auftreten, die einerseits für ein fehlendes Ansprechen und damit eine Progression der Erkrankung verantwortlich gemacht werden können, andererseits aber auch die Möglichkeit bieten, frühzeitig auf eine zielgerichtete, alternative Therapie zu wechseln. In Blutproben von Patienten mit Prostatakrebs konnten wir bereits erfolgreich genetische Veränderungen nachweisen, die mit einer fortgeschrittenen Erkrankung assoziiert sind. Wir konnten bereits zeigen, dass ein Nachweis möglich ist, auch wenn der Tumoranteil nur wenige Prozent der Plasma DNA beträgt. In diesem Projekt möchten wir den Hauptfokus auf den kastrationssensitiven Prostatakrebs (CRPC) richten. Dies ist ein sehr variables Krankheitsbild mit vielgestaltiger und belastender Symptomatik. Die bisherigen klinischen Parameter zur Abschätzung der Prognose zeigten bisher nur eine sehr begrenzte Wertigkeit, genetische Marker wurden bisher nur selten untersucht. Im Rahmen unserer Voruntersuchungen konnten wir bereits 189 Plasmaproben von 59 Patienten mit metastasiertem Prostatakarzinom isolieren. Diese Proben werden mit Hilfe von hochinnovativen Techniken, wie z.B. dem whole genome sequencing untersucht, um einen umfassenden Einblick in das Spektrum genetischer Veränderungen unter Therapie und die damit verbundene Tumorevolution erhalten zu können. Diese Ergebnisse sollen mit dem Erbgut der jeweiligen Prostatatumore verglichen werden, die aus vorherigen Operationen stammen.Diesesehr umfassenden Daten, die Ergebnissezu Kopienzahlveränderungen, Mutationen und der Genexpression liefern werden, erlauben eine Analyse von Signalwegen mit bisher ungekannter Auflösung, um bei Patienten die Wirksamkeit zielgerichteter Therapien zu erhöhen und die Belastung durch Nebenwirkungen nicht-effektiver Therapien zu minimieren.