3D funktionelle Charakterisierung von Lufträumen in Blättern
Functional characterisation of plant leaf airspaces in 3D
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Plant anatomy,
Plant evolution,
CO2 diffusion,
Leaf intercellular airspace,
High resolution computed tomography,
Finite element method
Pflanzenblätter sind Schlüsselkomponenten im globalen Kohlenstoff- und Wasserkreislauf, da praktisch die gesamte terrestrische Kohlenstoffaufnahme aus der Atmosphäre und ~ 70% aller terrestrischen Verdunstung über diese verläuft. Die Erforschung der Kohlenstoff- und Wasserflüsse über Blätter hat sich bislang darauf fokussiert, wie die Poren an der Oberfläche des Blattes (Spaltöffnungen) und die Mesophyllzellen, in denen Photosynthese stattfindet, auf die Umwelt reagieren. Die vielen Interzellularen (Lufträume) zwischen den Spaltöffnungen und den Mesophyllzellen wurden dabei meist übersehen, da diese luftgefüllten Hohlräume in den Blättern von den bisher am häufigsten untersuchten Pflanzen kaum die Diffusion von Kohlstoffdioxide (CO2) begrenzen. Bei bestimmten Blatttypen könnten diese Interzellularen allerdings die Bewegung von CO2 limitieren. Blätter der Bedecktsamer (Angiospermen), die am stärksten diversifizierte und evolutionär jüngste Pflanzengruppe, zeigen eine verbesserte Kontrolle der Spaltöffnungen und Wassertransporteigenschaften im Vergleich zu ihren Vorfahren, beispielsweise den Farnen und Gymnospermen. Im Vergleich dazu ist wenig über die Vielfalt des Interzellularsystems bekannt und ob Angiospermen auch hier ähnlich wie beim Wassertransport ein effizienteres System entwickelt haben. Mit dem Projekt 3D funktionelle Charakterisierung von Lufträumen in Blättern soll diese Frage beantwortet werden. Die Darstellung des dreidimensionalen Aufbaus von Blättern mittels hochauflösender Röntgencomputertomografie ermöglicht es, Volumen und Verteilung der Interzellularen zu analysieren. In Kombination mit einer Analyse von Photosynthese und Transpiration soll die dreidimensionale Darstellung des Blattes die Bedeutung der Interzellularen als wesentliche funktionelle Parameter für Kohlenstoff- und Wassertransportprozesse sowie die Koordination der Interzellularen mit anderen Blatteigenschaften aufklären. Die funktionelle Charakterisierung erfolgt mittels Finite-Elemente-Analyse, die v.a. für technische Modelle verwendet wird, aber auch pflanzenphysiologische Prozesse in einem dreidimensionalen Blatt simulieren kann. Das Modell soll anschließend verwendet werden, um ein Big Leaf Modell zu entwickeln (eine Vegetationsschicht wird hier als ein einziges großes Blatt gesehen). Solche Modelle ermöglichen es, die Rolle der Interzellularen im Kohlenstoff- und Wasserhaushalt zu quantifizieren. Diese Modelle werden auch dazu dienen anhand der Eigenschaften fossiler Blätter das frühere Klima zu rekonstruieren und auch die Reaktion auf das zukünftige Klima vorherzusagen.
Pflanzenblätter sind Schlüsselkomponenten im globalen Kohlenstoff- und Wasserkreislauf, da praktisch die gesamte terrestrische Kohlenstoffaufnahme aus der Atmosphäre und ~ 70% aller terrestrischen Verdunstung über diese verläuft. Die Erforschung der Kohlenstoff- und Wasserflüsse über Blätter hat sich bislang darauf fokussiert, wie die Poren an der Oberfläche des Blattes (Spaltöffnungen) und die Mesophyllzellen, in denen Photosynthese stattfindet, auf die Umwelt reagieren. Die vielen Interzellularen (Lufträume) zwischen den Spaltöffnungen und den Mesophyllzellen wurden dabei meist übersehen, da diese luftgefüllten Hohlräume in den Blättern von den bisher am häufigsten untersuchten Pflanzen kaum die Diffusion von Kohlstoffdioxid (CO2) begrenzen. Bei bestimmten Blatttypen könnten diese Interzellularen die Bewegung von CO2 allerdings limitieren. Blätter der Bedecktsamer (Angiospermen), die am stärksten diversifizierte und evolutionär jüngste Pflanzengruppe, zeigen eine verbesserte Kontrolle der Spaltöffnungen und Wassertransporteigenschaften im Vergleich zu ihren Vorfahren, beispielsweise den Farnen und Gymnospermen. Im Vergleich dazu ist wenig über die Vielfalt des Interzellularsystems bekannt und ob Angiospermen auch hier, ähnlich wie beim Wassertransport, ein effizienteres System entwickelt haben. Das Projekt "3D funktionelle Charakterisierung von Lufträumen in Blättern" hat diese Fragen beantwortet und gezeigt, dass Angiospermen, dank kleinerer photosynthetisierender Zellen, die verfügbare Oberfläche für die Diffusion von CO2 vergrößern und somit das anschließende Erreichen der photosynthetisierenden Chloroplasten erleichtern. Angiospermen können die höhere Anzahl an Poren an der Blattoberfläche, durch welche mehr CO2 für Photosynthese bereitgestellt wird, voll ausnutzen, da sie einerseits mehr Zelloberfläche haben durch die CO2 diffundieren kann und andererseits, einen Luftraum der den CO2 Transport zu den Zellen erleichtert. Diese Umstrukturierung der gesamten Blattanatomie ermöglichte es Angiospermen, trotz sinkender CO2-Konzentrationen seit dem Ende der Kreidezeit, die Mehrheit der Biome der Welt zu dominieren. Die Darstellung des dreidimensionalen Aufbaus von Blättern mittels hochauflösender Röntgencomputertomografie ermöglicht es, Volumen und Verteilung der Interzellularen zu analysieren. In Kombination mit einer Analyse von Photosynthese und Transpiration hat die dreidimensionale Darstellung des Blattes die Bedeutung der Interzellularen als wesentliche funktionelle Parameter für Kohlenstoff- und Wassertransportprozesse, sowie die Koordination der Interzellularen mit anderen Blatteigenschaften aufgeklärt. Dieses neue Wissen über den Aufbau und die Funktion von Blättern, ist der Schlüssel, um vollständig zu verstehen, wie sich Blätter in der Vergangenheit als Reaktion auf sich ändernde Umweltbedingungen entwickelt und angepasst sowie Kohlenstoffaufnahme und Wasserverlust optimiert haben. Dies bildet die Basis um Reaktionen auf zukünftige klimatische Veränderungen vorherzusagen.
- Stefano Manzoni, University of Stockholm - Schweden
Research Output
- 389 Zitationen
- 19 Publikationen
- 7 Datasets & Models
- 1 Software
- 1 Disseminationen
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 1 Weitere Förderungen
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2021
Titel The three-dimensional construction of leaves is coordinated with water use efficiency in conifers DOI 10.1111/nph.17772 Typ Journal Article Autor Trueba S Journal New Phytologist Seiten 851-861 Link Publikation -
2021
Titel Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.1098/rspb.2020.3145 Typ Journal Article Autor Théroux-Rancourt G Journal Proceedings of the Royal Society B Seiten 20203145 Link Publikation -
2021
Titel The 3D construction of leaves is coordinated with water use efficiency in conifers DOI 10.1101/2021.04.23.441113 Typ Preprint Autor Trueba S Seiten 2021.04.23.441113 Link Publikation -
2022
Titel Desiccation of the leaf mesophyll and its implications for CO2 diffusion and light processing DOI 10.1111/pce.14287 Typ Journal Article Autor Momayyezi M Journal Plant, Cell & Environment Seiten 1362-1381 Link Publikation -
2022
Titel Structural organization of the spongy mesophyll DOI 10.1111/nph.17971 Typ Journal Article Autor Borsuk A Journal New Phytologist Seiten 946-960 Link Publikation -
2020
Titel Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.1101/2020.01.16.904458 Typ Preprint Autor Théroux-Rancourt G Seiten 2020.01.16.904458 Link Publikation -
2021
Titel Supplementary Information from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.6084/m9.figshare.13889506.v1 Typ Other Autor Roddy A Link Publikation -
2021
Titel Supplementary Information from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.6084/m9.figshare.13889506 Typ Other Autor Roddy A Link Publikation -
2023
Titel Analyzing anatomy over three dimensions unpacks the differences in mesophyll diffusive area between sun and shade Vitis vinifera leaves. DOI 10.1093/aobpla/plad001 Typ Journal Article Autor Herrera Jc Journal AoB PLANTS -
2023
Titel An unsupervised, shape-based 3d cell instance segmentation method for plant tissues DOI 10.3217/978-3-85125-954-4-08 Typ Other Autor Palmrich Link Publikation -
2023
Titel Redundant 1-cells in Multi-labeled 2-Gmap Irregular Pyramids DOI 10.3217/978-3-85125-954-4-01 Typ Other Autor Banaeyan Link Publikation -
2023
Titel Towards Uncertainty Detection in Automated Leaf Tissue Segmentation DOI 10.3217/978-3-85125-954-4-07 Typ Other Autor Grexova Link Publikation -
2019
Titel Digitally Deconstructing Leaves in 3D Using X-ray Microcomputed Tomography and Machine Learning DOI 10.1101/814954 Typ Preprint Autor Théroux-Rancourt G Seiten 814954 Link Publikation -
2022
Titel Localized growth and remodelling drives spongy mesophyll morphogenesis DOI 10.1098/rsif.2022.0602 Typ Journal Article Autor Treado J Journal Journal of the Royal Society Interface Seiten 20220602 Link Publikation -
2019
Titel Emergent honeycomb topology of the leaf spongy mesophyll DOI 10.1101/852459 Typ Preprint Autor Borsuk A Seiten 852459 Link Publikation -
2019
Titel Shape matters: the pitfalls of analyzing mesophyll anatomy DOI 10.1111/nph.16360 Typ Journal Article Autor Théroux-Rancourt G Journal New Phytologist Seiten 2239-2242 Link Publikation -
2020
Titel The Scaling of Genome Size and Cell Size Limits Maximum Rates of Photosynthesis with Implications for Ecological Strategies DOI 10.1086/706186 Typ Journal Article Autor Roddy A Journal International Journal of Plant Sciences Seiten 75-87 Link Publikation -
2020
Titel Assessing adaptive and plastic responses in growth and functional traits in a 10-year-old common garden experiment with pedunculate oak (Quercus robur L.) suggests that directional selection can drive climatic adaptation DOI 10.1111/eva.13034 Typ Journal Article Autor George J Journal Evolutionary Applications Seiten 2422-2438 Link Publikation -
2020
Titel Digitally deconstructing leaves in 3D using X-ray microcomputed tomography and machine learning DOI 10.1002/aps3.11380 Typ Journal Article Autor Théroux-Rancourt G Journal Applications in Plant Sciences Link Publikation
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2021
Link
Titel R script used to generate the theoretical conductance values based on cell size and leaf porosity. from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.6084/m9.figshare.13889500 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel R script used to generate the theoretical conductance values based on cell size and leaf porosity. from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.6084/m9.figshare.13889500.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel R script used to generate the theoretical conductance values based on cell size and leaf porosity. from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.6084/m9.figshare.13889500.v2 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel Supplementary Tables from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.6084/m9.figshare.13889503 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2021
Link
Titel Supplementary Tables from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size DOI 10.6084/m9.figshare.13889503.v1 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel Image Dataset for 'Digitally deconstructingleaves in 3D using X-ray microcomputed tomography and machine learning' DOI 10.5281/zenodo.3694972 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel Image Dataset for 'Digitally deconstructingleaves in 3D using X-ray microcomputed tomography and machine learning' DOI 10.5281/zenodo.3694973 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2020
Titel Publication in an industry magazine Typ A magazine, newsletter or online publication
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2019
Titel Plant anatomy symposium in Moscow Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International
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2020
Titel Water's gateway to heaven: 3D imaging and modeling of transient stomatal responses in plant leaves under dynamic environments Typ Research grant (including intramural programme) Förderbeginn 2020 Geldgeber Vienna Science and Technology Fund