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3D funktionelle Charakterisierung von Lufträumen in Blättern

Functional characterisation of plant leaf airspaces in 3D

Guillaume Théroux-Rancourt (ORCID: 0000-0002-2591-0524)
  • Grant-DOI 10.55776/M2245
  • Förderprogramm Lise Meitner
  • Status beendet
  • Projektbeginn 15.01.2018
  • Projektende 14.02.2020
  • Bewilligungssumme 162.180 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Plant anatomy, Plant evolution, CO2 diffusion, Leaf intercellular airspace, High resolution computed tomography, Finite element method

Abstract Endbericht

Pflanzenblätter sind Schlüsselkomponenten im globalen Kohlenstoff- und Wasserkreislauf, da praktisch die gesamte terrestrische Kohlenstoffaufnahme aus der Atmosphäre und ~ 70% aller terrestrischen Verdunstung über diese verläuft. Die Erforschung der Kohlenstoff- und Wasserflüsse über Blätter hat sich bislang darauf fokussiert, wie die Poren an der Oberfläche des Blattes (Spaltöffnungen) und die Mesophyllzellen, in denen Photosynthese stattfindet, auf die Umwelt reagieren. Die vielen Interzellularen (Lufträume) zwischen den Spaltöffnungen und den Mesophyllzellen wurden dabei meist übersehen, da diese luftgefüllten Hohlräume in den Blättern von den bisher am häufigsten untersuchten Pflanzen kaum die Diffusion von Kohlstoffdioxide (CO2) begrenzen. Bei bestimmten Blatttypen könnten diese Interzellularen allerdings die Bewegung von CO2 limitieren. Blätter der Bedecktsamer (Angiospermen), die am stärksten diversifizierte und evolutionär jüngste Pflanzengruppe, zeigen eine verbesserte Kontrolle der Spaltöffnungen und Wassertransporteigenschaften im Vergleich zu ihren Vorfahren, beispielsweise den Farnen und Gymnospermen. Im Vergleich dazu ist wenig über die Vielfalt des Interzellularsystems bekannt und ob Angiospermen auch hier ähnlich wie beim Wassertransport ein effizienteres System entwickelt haben. Mit dem Projekt 3D funktionelle Charakterisierung von Lufträumen in Blättern soll diese Frage beantwortet werden. Die Darstellung des dreidimensionalen Aufbaus von Blättern mittels hochauflösender Röntgencomputertomografie ermöglicht es, Volumen und Verteilung der Interzellularen zu analysieren. In Kombination mit einer Analyse von Photosynthese und Transpiration soll die dreidimensionale Darstellung des Blattes die Bedeutung der Interzellularen als wesentliche funktionelle Parameter für Kohlenstoff- und Wassertransportprozesse sowie die Koordination der Interzellularen mit anderen Blatteigenschaften aufklären. Die funktionelle Charakterisierung erfolgt mittels Finite-Elemente-Analyse, die v.a. für technische Modelle verwendet wird, aber auch pflanzenphysiologische Prozesse in einem dreidimensionalen Blatt simulieren kann. Das Modell soll anschließend verwendet werden, um ein Big Leaf Modell zu entwickeln (eine Vegetationsschicht wird hier als ein einziges großes Blatt gesehen). Solche Modelle ermöglichen es, die Rolle der Interzellularen im Kohlenstoff- und Wasserhaushalt zu quantifizieren. Diese Modelle werden auch dazu dienen anhand der Eigenschaften fossiler Blätter das frühere Klima zu rekonstruieren und auch die Reaktion auf das zukünftige Klima vorherzusagen.

Pflanzenblätter sind Schlüsselkomponenten im globalen Kohlenstoff- und Wasserkreislauf, da praktisch die gesamte terrestrische Kohlenstoffaufnahme aus der Atmosphäre und ~ 70% aller terrestrischen Verdunstung über diese verläuft. Die Erforschung der Kohlenstoff- und Wasserflüsse über Blätter hat sich bislang darauf fokussiert, wie die Poren an der Oberfläche des Blattes (Spaltöffnungen) und die Mesophyllzellen, in denen Photosynthese stattfindet, auf die Umwelt reagieren. Die vielen Interzellularen (Lufträume) zwischen den Spaltöffnungen und den Mesophyllzellen wurden dabei meist übersehen, da diese luftgefüllten Hohlräume in den Blättern von den bisher am häufigsten untersuchten Pflanzen kaum die Diffusion von Kohlstoffdioxid (CO2) begrenzen. Bei bestimmten Blatttypen könnten diese Interzellularen die Bewegung von CO2 allerdings limitieren. Blätter der Bedecktsamer (Angiospermen), die am stärksten diversifizierte und evolutionär jüngste Pflanzengruppe, zeigen eine verbesserte Kontrolle der Spaltöffnungen und Wassertransporteigenschaften im Vergleich zu ihren Vorfahren, beispielsweise den Farnen und Gymnospermen. Im Vergleich dazu ist wenig über die Vielfalt des Interzellularsystems bekannt und ob Angiospermen auch hier, ähnlich wie beim Wassertransport, ein effizienteres System entwickelt haben. Das Projekt "3D funktionelle Charakterisierung von Lufträumen in Blättern" hat diese Fragen beantwortet und gezeigt, dass Angiospermen, dank kleinerer photosynthetisierender Zellen, die verfügbare Oberfläche für die Diffusion von CO2 vergrößern und somit das anschließende Erreichen der photosynthetisierenden Chloroplasten erleichtern. Angiospermen können die höhere Anzahl an Poren an der Blattoberfläche, durch welche mehr CO2 für Photosynthese bereitgestellt wird, voll ausnutzen, da sie einerseits mehr Zelloberfläche haben durch die CO2 diffundieren kann und andererseits, einen Luftraum der den CO2 Transport zu den Zellen erleichtert. Diese Umstrukturierung der gesamten Blattanatomie ermöglichte es Angiospermen, trotz sinkender CO2-Konzentrationen seit dem Ende der Kreidezeit, die Mehrheit der Biome der Welt zu dominieren. Die Darstellung des dreidimensionalen Aufbaus von Blättern mittels hochauflösender Röntgencomputertomografie ermöglicht es, Volumen und Verteilung der Interzellularen zu analysieren. In Kombination mit einer Analyse von Photosynthese und Transpiration hat die dreidimensionale Darstellung des Blattes die Bedeutung der Interzellularen als wesentliche funktionelle Parameter für Kohlenstoff- und Wassertransportprozesse, sowie die Koordination der Interzellularen mit anderen Blatteigenschaften aufgeklärt. Dieses neue Wissen über den Aufbau und die Funktion von Blättern, ist der Schlüssel, um vollständig zu verstehen, wie sich Blätter in der Vergangenheit als Reaktion auf sich ändernde Umweltbedingungen entwickelt und angepasst sowie Kohlenstoffaufnahme und Wasserverlust optimiert haben. Dies bildet die Basis um Reaktionen auf zukünftige klimatische Veränderungen vorherzusagen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Stefano Manzoni, University of Stockholm - Schweden

Research Output

  • 389 Zitationen
  • 19 Publikationen
  • 7 Datasets & Models
  • 1 Software
  • 1 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2021
    Titel The three-dimensional construction of leaves is coordinated with water use efficiency in conifers
    DOI 10.1111/nph.17772
    Typ Journal Article
    Autor Trueba S
    Journal New Phytologist
    Seiten 851-861
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.1098/rspb.2020.3145
    Typ Journal Article
    Autor Théroux-Rancourt G
    Journal Proceedings of the Royal Society B
    Seiten 20203145
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The 3D construction of leaves is coordinated with water use efficiency in conifers
    DOI 10.1101/2021.04.23.441113
    Typ Preprint
    Autor Trueba S
    Seiten 2021.04.23.441113
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Desiccation of the leaf mesophyll and its implications for CO2 diffusion and light processing
    DOI 10.1111/pce.14287
    Typ Journal Article
    Autor Momayyezi M
    Journal Plant, Cell & Environment
    Seiten 1362-1381
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Structural organization of the spongy mesophyll
    DOI 10.1111/nph.17971
    Typ Journal Article
    Autor Borsuk A
    Journal New Phytologist
    Seiten 946-960
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.1101/2020.01.16.904458
    Typ Preprint
    Autor Théroux-Rancourt G
    Seiten 2020.01.16.904458
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Supplementary Information from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.6084/m9.figshare.13889506.v1
    Typ Other
    Autor Roddy A
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Supplementary Information from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.6084/m9.figshare.13889506
    Typ Other
    Autor Roddy A
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Analyzing anatomy over three dimensions unpacks the differences in mesophyll diffusive area between sun and shade Vitis vinifera leaves.
    DOI 10.1093/aobpla/plad001
    Typ Journal Article
    Autor Herrera Jc
    Journal AoB PLANTS
  • 2023
    Titel An unsupervised, shape-based 3d cell instance segmentation method for plant tissues
    DOI 10.3217/978-3-85125-954-4-08
    Typ Other
    Autor Palmrich
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Redundant 1-cells in Multi-labeled 2-Gmap Irregular Pyramids
    DOI 10.3217/978-3-85125-954-4-01
    Typ Other
    Autor Banaeyan
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Towards Uncertainty Detection in Automated Leaf Tissue Segmentation
    DOI 10.3217/978-3-85125-954-4-07
    Typ Other
    Autor Grexova
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Digitally Deconstructing Leaves in 3D Using X-ray Microcomputed Tomography and Machine Learning
    DOI 10.1101/814954
    Typ Preprint
    Autor Théroux-Rancourt G
    Seiten 814954
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Localized growth and remodelling drives spongy mesophyll morphogenesis
    DOI 10.1098/rsif.2022.0602
    Typ Journal Article
    Autor Treado J
    Journal Journal of the Royal Society Interface
    Seiten 20220602
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Emergent honeycomb topology of the leaf spongy mesophyll
    DOI 10.1101/852459
    Typ Preprint
    Autor Borsuk A
    Seiten 852459
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Shape matters: the pitfalls of analyzing mesophyll anatomy
    DOI 10.1111/nph.16360
    Typ Journal Article
    Autor Théroux-Rancourt G
    Journal New Phytologist
    Seiten 2239-2242
    Link Publikation
  • 2020
    Titel The Scaling of Genome Size and Cell Size Limits Maximum Rates of Photosynthesis with Implications for Ecological Strategies
    DOI 10.1086/706186
    Typ Journal Article
    Autor Roddy A
    Journal International Journal of Plant Sciences
    Seiten 75-87
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Assessing adaptive and plastic responses in growth and functional traits in a 10-year-old common garden experiment with pedunculate oak (Quercus robur L.) suggests that directional selection can drive climatic adaptation
    DOI 10.1111/eva.13034
    Typ Journal Article
    Autor George J
    Journal Evolutionary Applications
    Seiten 2422-2438
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Digitally deconstructing leaves in 3D using X-ray microcomputed tomography and machine learning
    DOI 10.1002/aps3.11380
    Typ Journal Article
    Autor Théroux-Rancourt G
    Journal Applications in Plant Sciences
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2021 Link
    Titel R script used to generate the theoretical conductance values based on cell size and leaf porosity. from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.6084/m9.figshare.13889500
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel R script used to generate the theoretical conductance values based on cell size and leaf porosity. from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.6084/m9.figshare.13889500.v1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel R script used to generate the theoretical conductance values based on cell size and leaf porosity. from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.6084/m9.figshare.13889500.v2
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Supplementary Tables from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.6084/m9.figshare.13889503
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel Supplementary Tables from Maximum CO2 diffusion inside leaves is limited by the scaling of cell size and genome size
    DOI 10.6084/m9.figshare.13889503.v1
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Image Dataset for 'Digitally deconstructingleaves in 3D using X-ray microcomputed tomography and machine learning'
    DOI 10.5281/zenodo.3694972
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Image Dataset for 'Digitally deconstructingleaves in 3D using X-ray microcomputed tomography and machine learning'
    DOI 10.5281/zenodo.3694973
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Software
  • 2019 Link
    Titel Software for the automated segmentation of microCT scans of plant leaves
    Link Link
Disseminationen
  • 2020
    Titel Publication in an industry magazine
    Typ A magazine, newsletter or online publication
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel Plant anatomy symposium in Moscow
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2020
    Titel Water's gateway to heaven: 3D imaging and modeling of transient stomatal responses in plant leaves under dynamic environments
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2020
    Geldgeber Vienna Science and Technology Fund

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