Selektion in Drosophila melanogaster Populationen
Local selective sweeps in Drosophila melanogaster
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Hitchhiking mapping,
Local selective sweeps Local adaptation,
Genome scans,
Drosophila,
Local adaptation
Das vorgeschlagene Projekt baut auf einem Vorprojekt auf. Bisher wurden 30 Mikrosatelliten Loci beschrieben, die mit einem "selective sweep" während der Habitatexpansion von D. melanogaster in Verbindung gebracht werden können. Das Ziel dieses Projekts ist es die identifizierten Kandidatenloci näher zu beschreiben. Dabei werde Mikrosatelliten Polymorphismen, DNA Sequenzpolymorphismen und Expressionsmuster von benachbarten Genen bestimmt.
Das Projekt zielte auf ein besseres Verständnis der Anpassungsprozesse von Drosophila Populationen bei ihrer Habitatexpansion ab. Dafür wurden neue statistische Methoden entwickelt, die es gestatten neue, vorteilhafte Mutation zu identifizieren. Während eine Methode ein verbesserter `single locus` Test ist, wurden im zweiten Test mehrere, gekoppelte Loci gemeinsam analysiert. Um diese neuen Teststatistiken zu validieren, wurden sie auf die kürzlich entdeckte DDT Resistenzmutation angewendet. Die Analysen zeigten, dass es möglich ist vorteilhafte Mutationen mit der lnRH Teststatistik zu identifizieren. Allerdings sind Mutationen, die nicht erst kürzlich entstanden sind, viel schwerer zu identifizieren. Schließlich hat sich das Projekt noch der Fragestellung der demographischen Vergangenheit von Drosophila gewidmet. Dabei ging es vornehmlich darum zu verstehen, wie die Demographie das Variabilitätsmuster beieinflußt hat.
Research Output
- 45 Zitationen
- 1 Publikationen
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2019
Titel Polymerase d deficiency causes syndromic immunodeficiency with replicative stress DOI 10.1172/jci128903 Typ Journal Article Autor Conde C Journal Journal of Clinical Investigation Seiten 4194-4206 Link Publikation