Phylogenie und Biodiversität von Trichoderma longibrachiatum
Phylogeny and biodiversity of Trichoderma longibrachiatum
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Trichoderma,
Hypocrea,
Genealogical Concordance Phylogenetic Sp,
Biodiversity,
Molecular Taxonomy
Trichoderma section Longibrachiatum (Hypocreales, Ascomycota) enthält Boden-bewohnende kosmopolitane Pilze, die häufig auf faulendem Holz zu finden sind. Einige ihrer Vertreter finden als industrielle Produzenten extrazellulärer Enzyme (e.g. Trichoderma reesei = H. jecorina) und Antibiotika (T. ghanense) Verwendung, während andere als biologische Pflanzenschutzmittel eingesetzt werden. In jüngerer Zeit häuften sich auch Berichte, daß der Typenstamm der Sektion - T. longibrachiatum - als opportunistischer Pathogen bei HIV-Patienten oder peritonaler Dialyse in Erscheinung tritt. Diese unterschiedlichen Beziehungen zur menschlichen Gesellschaft machen eine bessere Kenntnis der Biologie, Physiologie und Ökologie dieser Sektion von Trichoderma wünschenswert. Molekulare Taxonomie zeigte daß die Sektion monophyletisch ist, aber das dieser Sektion zugrundeliegende Spezieskonzept wurde bisher nicht kritisch hinterfragt. Im vorliegenden Projekt streben wir daher an (a) die phylogenetische Herkunft von Sektion Longibrachiatum zu ermitteln; (b) geeigente Markergene zu identifizieren, deren Verwendung eine statistisch gut unterstützte Phylogenie der Sektion liefern würden; (c) das "Genealogical Concordance Phylogenetic Species Concept" zu verwenden um Spezies innerhalb der Sektion zu identifizieren; und (d) die Anpassungsfähigkeit der Sektion an Umweltbedingungen (wie z.B C- und N- Verwertung; Einfluß von T, pH, humidity, Licht-Dunkelheit; und Beeinflussbarkeit durch Fungizide) kennzulernen. Dieser "integrative approach" sollte eine umfassende Kenntnis der Biologie und Biodiversität der Sektion Longibrachiatum vermitteln, welche als Basis für deren weitere Anwendung in der Biotechnologie als auch ihre Bekämpfung im klinischen Bereich dienen sollte.
Trichoderma section Longibrachiatum (Hypocreales, Ascomycota) enthält Boden-bewohnende kosmopolitane Pilze, die häufig auf faulendem Holz zu finden sind. Einige ihrer Vertreter finden als industrielle Produzenten extrazellulärer Enzyme (e.g. Trichoderma reesei = H. jecorina) und Antibiotika (T. ghanense) Verwendung, während andere als biologische Pflanzenschutzmittel eingesetzt werden. In jüngerer Zeit häuften sich auch Berichte, daß der Typenstamm der Sektion - T. longibrachiatum - als opportunistischer Pathogen bei HIV- Patienten oder peritonaler Dialyse in Erscheinung tritt. Diese unterschiedlichen Beziehungen zur menschlichen Gesellschaft machen eine bessere Kenntnis der Biologie, Physiologie und Ökologie dieser Sektion von Trichoderma wünschenswert. Molekulare Taxonomie zeigte daß die Sektion monophyletisch ist, aber das dieser Sektion zugrundeliegende Spezieskonzept wurde bisher nicht kritisch hinterfragt. Im vorliegenden Projekt streben wir daher an (a) die phylogenetische Herkunft von Sektion Longibrachiatum zu ermitteln; (b) geeigente Markergene zu identifizieren, deren Verwendung eine statistisch gut unterstützte Phylogenie der Sektion liefern würden; (c) das "Genealogical Concordance Phylogenetic Species Concept" zu verwenden um Spezies innerhalb der Sektion zu identifizieren; und (d) die Anpassungsfähigkeit der Sektion an Umweltbedingungen (wie z.B C- und N-Verwertung; Einfluß von T, pH, humidity, Licht-Dunkelheit; und Beeinflussbarkeit durch Fungizide) kennzulernen. Dieser "integrative approach" sollte eine umfassende Kenntnis der Biologie und Biodiversität der Sektion Longibrachiatum vermitteln, welche als Basis für deren weitere Anwendung in der Biotechnologie als auch ihre Bekämpfung im klinischen Bereich dienen sollte.
- Technische Universität Wien - 100%
Research Output
- 1934 Zitationen
- 8 Publikationen
-
2012
Titel Molecular phylogeny and species delimitation in the section Longibrachiatum of Trichoderma DOI 10.1016/j.fgb.2012.02.004 Typ Journal Article Autor Druzhinina I Journal Fungal Genetics and Biology Seiten 358-368 Link Publikation -
2012
Titel The Longibrachiatum Clade of Trichoderma: a revision with new species DOI 10.1007/s13225-012-0152-2 Typ Journal Article Autor Samuels G Journal Fungal Diversity Seiten 77-108 Link Publikation -
2012
Titel Novel traits of Trichoderma predicted through the analysis of its secretome DOI 10.1111/j.1574-6968.2012.02665.x Typ Journal Article Autor Druzhinina I Journal FEMS Microbiology Letters Seiten 1-9 Link Publikation -
2011
Titel Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma DOI 10.1186/gb-2011-12-4-r40 Typ Journal Article Autor Kubicek C Journal Genome Biology Link Publikation -
2011
Titel Trichoderma: the genomics of opportunistic success DOI 10.1038/nrmicro2637 Typ Journal Article Autor Druzhinina I Journal Nature Reviews Microbiology Seiten 749-759 Link Publikation -
2010
Titel Evolution and Ecophysiology of the Industrial Producer Hypocrea jecorina (Anamorph Trichoderma reesei) and a New Sympatric Agamospecies Related to It DOI 10.1371/journal.pone.0009191 Typ Journal Article Autor Druzhinina I Journal PLoS ONE Link Publikation -
2009
Titel Molecular identification of Trichoderma species associated with Pleurotus ostreatus and natural substrates of the oyster mushroom DOI 10.1111/j.1574-6968.2009.01765.x Typ Journal Article Autor Kredics L Journal FEMS Microbiology Letters Seiten 58-67 -
2010
Titel Clonal Species Trichoderma parareesei sp. nov. Likely Resembles the Ancestor of the Cellulase Producer Hypocrea jecorina/T. reesei DOI 10.1128/aem.01184-10 Typ Journal Article Autor Atanasova L Journal Applied and Environmental Microbiology Seiten 7259-7267 Link Publikation