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Phylogenie und Biodiversität von Trichoderma longibrachiatum

Phylogeny and biodiversity of Trichoderma longibrachiatum

Christian P. Kubicek (ORCID: )
  • Grant-DOI 10.55776/P19340
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.11.2006
  • Projektende 31.10.2011
  • Bewilligungssumme 281.295 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Trichoderma, Hypocrea, Genealogical Concordance Phylogenetic Sp, Biodiversity, Molecular Taxonomy

Abstract Endbericht

Trichoderma section Longibrachiatum (Hypocreales, Ascomycota) enthält Boden-bewohnende kosmopolitane Pilze, die häufig auf faulendem Holz zu finden sind. Einige ihrer Vertreter finden als industrielle Produzenten extrazellulärer Enzyme (e.g. Trichoderma reesei = H. jecorina) und Antibiotika (T. ghanense) Verwendung, während andere als biologische Pflanzenschutzmittel eingesetzt werden. In jüngerer Zeit häuften sich auch Berichte, daß der Typenstamm der Sektion - T. longibrachiatum - als opportunistischer Pathogen bei HIV-Patienten oder peritonaler Dialyse in Erscheinung tritt. Diese unterschiedlichen Beziehungen zur menschlichen Gesellschaft machen eine bessere Kenntnis der Biologie, Physiologie und Ökologie dieser Sektion von Trichoderma wünschenswert. Molekulare Taxonomie zeigte daß die Sektion monophyletisch ist, aber das dieser Sektion zugrundeliegende Spezieskonzept wurde bisher nicht kritisch hinterfragt. Im vorliegenden Projekt streben wir daher an (a) die phylogenetische Herkunft von Sektion Longibrachiatum zu ermitteln; (b) geeigente Markergene zu identifizieren, deren Verwendung eine statistisch gut unterstützte Phylogenie der Sektion liefern würden; (c) das "Genealogical Concordance Phylogenetic Species Concept" zu verwenden um Spezies innerhalb der Sektion zu identifizieren; und (d) die Anpassungsfähigkeit der Sektion an Umweltbedingungen (wie z.B C- und N- Verwertung; Einfluß von T, pH, humidity, Licht-Dunkelheit; und Beeinflussbarkeit durch Fungizide) kennzulernen. Dieser "integrative approach" sollte eine umfassende Kenntnis der Biologie und Biodiversität der Sektion Longibrachiatum vermitteln, welche als Basis für deren weitere Anwendung in der Biotechnologie als auch ihre Bekämpfung im klinischen Bereich dienen sollte.

Trichoderma section Longibrachiatum (Hypocreales, Ascomycota) enthält Boden-bewohnende kosmopolitane Pilze, die häufig auf faulendem Holz zu finden sind. Einige ihrer Vertreter finden als industrielle Produzenten extrazellulärer Enzyme (e.g. Trichoderma reesei = H. jecorina) und Antibiotika (T. ghanense) Verwendung, während andere als biologische Pflanzenschutzmittel eingesetzt werden. In jüngerer Zeit häuften sich auch Berichte, daß der Typenstamm der Sektion - T. longibrachiatum - als opportunistischer Pathogen bei HIV- Patienten oder peritonaler Dialyse in Erscheinung tritt. Diese unterschiedlichen Beziehungen zur menschlichen Gesellschaft machen eine bessere Kenntnis der Biologie, Physiologie und Ökologie dieser Sektion von Trichoderma wünschenswert. Molekulare Taxonomie zeigte daß die Sektion monophyletisch ist, aber das dieser Sektion zugrundeliegende Spezieskonzept wurde bisher nicht kritisch hinterfragt. Im vorliegenden Projekt streben wir daher an (a) die phylogenetische Herkunft von Sektion Longibrachiatum zu ermitteln; (b) geeigente Markergene zu identifizieren, deren Verwendung eine statistisch gut unterstützte Phylogenie der Sektion liefern würden; (c) das "Genealogical Concordance Phylogenetic Species Concept" zu verwenden um Spezies innerhalb der Sektion zu identifizieren; und (d) die Anpassungsfähigkeit der Sektion an Umweltbedingungen (wie z.B C- und N-Verwertung; Einfluß von T, pH, humidity, Licht-Dunkelheit; und Beeinflussbarkeit durch Fungizide) kennzulernen. Dieser "integrative approach" sollte eine umfassende Kenntnis der Biologie und Biodiversität der Sektion Longibrachiatum vermitteln, welche als Basis für deren weitere Anwendung in der Biotechnologie als auch ihre Bekämpfung im klinischen Bereich dienen sollte.

Forschungsstätte(n)
  • Technische Universität Wien - 100%

Research Output

  • 1934 Zitationen
  • 8 Publikationen
Publikationen
  • 2012
    Titel Molecular phylogeny and species delimitation in the section Longibrachiatum of Trichoderma
    DOI 10.1016/j.fgb.2012.02.004
    Typ Journal Article
    Autor Druzhinina I
    Journal Fungal Genetics and Biology
    Seiten 358-368
    Link Publikation
  • 2012
    Titel The Longibrachiatum Clade of Trichoderma: a revision with new species
    DOI 10.1007/s13225-012-0152-2
    Typ Journal Article
    Autor Samuels G
    Journal Fungal Diversity
    Seiten 77-108
    Link Publikation
  • 2012
    Titel Novel traits of Trichoderma predicted through the analysis of its secretome
    DOI 10.1111/j.1574-6968.2012.02665.x
    Typ Journal Article
    Autor Druzhinina I
    Journal FEMS Microbiology Letters
    Seiten 1-9
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Comparative genome sequence analysis underscores mycoparasitism as the ancestral life style of Trichoderma
    DOI 10.1186/gb-2011-12-4-r40
    Typ Journal Article
    Autor Kubicek C
    Journal Genome Biology
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Trichoderma: the genomics of opportunistic success
    DOI 10.1038/nrmicro2637
    Typ Journal Article
    Autor Druzhinina I
    Journal Nature Reviews Microbiology
    Seiten 749-759
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Evolution and Ecophysiology of the Industrial Producer Hypocrea jecorina (Anamorph Trichoderma reesei) and a New Sympatric Agamospecies Related to It
    DOI 10.1371/journal.pone.0009191
    Typ Journal Article
    Autor Druzhinina I
    Journal PLoS ONE
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Molecular identification of Trichoderma species associated with Pleurotus ostreatus and natural substrates of the oyster mushroom
    DOI 10.1111/j.1574-6968.2009.01765.x
    Typ Journal Article
    Autor Kredics L
    Journal FEMS Microbiology Letters
    Seiten 58-67
  • 2010
    Titel Clonal Species Trichoderma parareesei sp. nov. Likely Resembles the Ancestor of the Cellulase Producer Hypocrea jecorina/T. reesei
    DOI 10.1128/aem.01184-10
    Typ Journal Article
    Autor Atanasova L
    Journal Applied and Environmental Microbiology
    Seiten 7259-7267
    Link Publikation

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