Intranukleare Mechanismen der Stressregulation in Hefe
Nuclear control of stress signaling in yeast
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Nuclear Export,
Transcription,
Stress,
Nutrient Signaling,
Saccharomyces cerevisiae,
Chromatin Recruitment
Veränderte Umweltbedingungen erfordern konstantes Anpassen verschiedenster zellulärer Prozesse. Diese reichen von enzymatischen Aktivitäten, über Expression von Genen bis hin zur Kontrolle von grundlegenden Ereignissen wie der Zellteilung. Diese Vorgänge hängen auch teilweise von einander ab. In der Hefe Saccharomyces cerevisiae werden viele Gene (bis zu 10% aller Gene) in der allgemeinen transkriptionellen Stressreaktion eingeschaltet. Der Transkriptionsfaktor Msn2 fungiert als genereller Aktivator für viele dieser Gene. Msn2 vereint nicht nur unterschiedliche Arten von Stress, sondern auch mehrere Signalwege wie zum Beispiel Protein Kinase A, Target of Rapamycin (TOR) und den Hyperosmolarity Response (HOG). Die Frage, wie diese verschiedenen Mechanismen die Aktivität eines Transkriptionsfaktors steuern können wurde von einigen Labors in der Vergangenheit unersucht. Eine erstaunliche Bandbreite von Regulationsmechanismen kam bei diesen Untersuchungen zu Tage. Der zentrale stressabhängige Mechanismus, der die Aktivität von Msn2 reguliert wurde jedoch noch nicht entdeckt. In der hier projektierten Arbeit wird eine funktionelle Analyse der konservierten Domänen von Msn2 vorgeschlagen. Zwei Beobachtungen sind grundlegend für die geplante Arbeit. Die erste Beobachtung ist die Trennbarkeit von nuklearer Lokalisierung und regulierter Bindung an DNA. Die Regulation von Transkriptionsfaktoren im Kern ist ein verbreitetes Phänomen, das neben der Regulation durch Transport zwischen Kern und Zytoplasma existiert. Im Fall von Msn2 gibt es eine enge Verbindung zwischen Aktivierung und der regulierten Bindung an DNA. Im speziellen planen wir die Suche nach neuen Komponenten jenes Mechanismus, der nach Stress zur schnellen nuklearen Konzentration und anschließendem Binden von Msn2 an DNA führt. Wir vermuten, dass eine Erforschung des zugrunde liegenden Mechanismus neue Einsichten für das Verständnis der stressregulierten Transkription liefern wird. Wir vermuten, dass Proteine, die mit dieser Region interagieren auch eine Rolle in der generellen Stressantwort haben. Die zweite Beobachtung basiert auf Sequenzvergleichen zwischen Msn2 und verwandten Proteinen aus anderen Pilzen. Dieser Vergleich lieferte eine kurze konservierte Domäne im N-Terminus aller Msn2-artigen Proteine. Dieser Bereich ist auch für Stress, PKA und TOR regulierten nuklearen Export notwendig. Die phylogenetische (C.glabrata, K.lactis aber nicht C.albicans) und auch von uns gezeigte funktionelle Konservierung dieser N-terminalen Domäne wird von uns verwendet werden um die strukturelle und funktionelle Analyse der Stressregulation voranzutreiben.
Umweltbedingungen erzeugen Stress und erfordern dadurch konstantes Anpassen verschiedenster zellulärer Prozesse. Diese reichen von enzymatischen Aktivitäten, über Expression von Genen bis hin zur Kontrolle von grundlegenden Ereignissen wie der Zellteilung. Alle Organismen können die jeweils ausgelesene genomische Information schnell verändern und so optimal an die Umwelt angepasst bleiben. Am Modellsystem Hefe und an Candida glabrata untersuchen wir die Mechanismen wie Gene durch Stress reguliert werden. In der Hefe Saccharomyces cerevisiae werden in der Reaktion auf Stress viele Gene (bis zu 10% aller Gene) gemeinsam eingeschaltet. Das Projekt zielte auf die weitere Aufklärung der Signalwege über die Stresssignale den Zellkern erreichen. Stressresponse muss reguliert sein. Wir fanden, dass die starke Transkription von Stressgenen selbst Stress darstellt. DNA-Bereiche, die Stressgene enthalten werden nach deren Induktion durch sogenannte Chromatin-Remodeller wieder in geordnetes Chromatin zurückgeführt. Wir konnten auch zeigen, dass die toxische Wirkung von Arsen teilweise auf dem Hervorrufen eines besonders starke Stressresponses beruht. Ein wichtiges Resultat der Arbeit ist die Beobachtung, dass Proteinphosphatase 2A einen entscheidender genereller Regulator für Stressignale darstellt. Weiters wurden die Erkenntnisse auf eine der Bäckerhefe verwandte humanpathogene Hefe (Candida glabrata) angewandt und lieferten Einsichten wie diese auf Umwelteinflüsse reagiert.
- Universität Wien - 100%
Research Output
- 707 Zitationen
- 12 Publikationen
-
2016
Titel INO80 represses osmostress induced gene expression by resetting promoter proximal nucleosomes DOI 10.1093/nar/gkw1292 Typ Journal Article Autor Klopf E Journal Nucleic Acids Research Seiten 3752-3766 Link Publikation -
2011
Titel Pun1p is a metal ion-inducible, calcineurin/Crz1p-regulated plasma membrane protein required for cell wall integrity DOI 10.1016/j.bbamem.2011.01.002 Typ Journal Article Autor Hosiner D Journal Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes Seiten 1108-1119 Link Publikation -
2009
Titel Autophagy supports Candida glabrata survival during phagocytosis DOI 10.1111/j.1462-5822.2009.01391.x Typ Journal Article Autor Roetzer A Journal Cellular Microbiology Seiten 199-216 Link Publikation -
2009
Titel Cooperation between the INO80 Complex and Histone Chaperones Determines Adaptation of Stress Gene Transcription in the Yeast Saccharomyces cerevisiae DOI 10.1128/mcb.01858-08 Typ Journal Article Autor Klopf E Journal Molecular and Cellular Biology Seiten 4994-5007 Link Publikation -
2009
Titel The mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, Afo1p, determines cellular longevity through mitochondrial back-signaling via TOR1 DOI 10.18632/aging.100065 Typ Journal Article Autor Heeren G Journal Aging Seiten 622-636 Link Publikation -
2013
Titel Yeast Protein Phosphatase 2A-Cdc55 Regulates the Transcriptional Response to Hyperosmolarity Stress by Regulating Msn2 and Msn4 Chromatin Recruitment DOI 10.1128/mcb.00834-12 Typ Journal Article Autor Reiter W Journal Molecular and Cellular Biology Seiten 1057-1072 Link Publikation -
2011
Titel Interplay of Dynamic Transcription and Chromatin Remodeling: Lessons from Yeast DOI 10.3390/ijms12084758 Typ Journal Article Autor Niederacher G Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 4758-4769 Link Publikation -
2010
Titel From Saccharomyces cerevisiae to Candida glabrata in a few easy steps: important adaptations for an opportunistic pathogen DOI 10.1111/j.1574-6968.2010.02102.x Typ Journal Article Autor Roetzer A Journal FEMS Microbiology Letters Seiten 1-9 Link Publikation -
2010
Titel Regulation of Candida glabrata oxidative stress resistance is adapted to host environment DOI 10.1016/j.febslet.2010.12.006 Typ Journal Article Autor Roetzer A Journal FEBS Letters Seiten 319-327 Link Publikation -
2008
Titel Candida glabrata environmental stress response involves Saccharomyces cerevisiae Msn2/4 orthologous transcription factors DOI 10.1111/j.1365-2958.2008.06301.x Typ Journal Article Autor Roetzer A Journal Molecular Microbiology Seiten 603-620 Link Publikation -
2008
Titel Arsenic Toxicity to Saccharomyces cerevisiae Is a Consequence of Inhibition of the TORC1 Kinase Combined with a Chronic Stress Response DOI 10.1091/mbc.e08-04-0438 Typ Journal Article Autor Hosiner D Journal Molecular Biology of the Cell Seiten 1048-1057 Link Publikation -
2010
Titel Chemogenomic and transcriptome analysis identifies mode of action of the chemosensitizing agent CTBT (7-chlorotetrazolo[5,1-c]benzo[1,2,4]triazine) DOI 10.1186/1471-2164-11-153 Typ Journal Article Autor Batova M Journal BMC Genomics Seiten 153 Link Publikation