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Posttranslationale Modifikation des NirA Kernexportsignales

Posttranslational modification of NirA nuclear export signal

Joseph Strauss (ORCID: 0000-0003-0474-6267)
  • Grant-DOI 10.55776/P20630
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.04.2008
  • Projektende 30.09.2011
  • Bewilligungssumme 348.548 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Nitrate, Nitrate signal, Aspergillus, Fungi, Nuclear export

Abstract Endbericht

Projektziel: Das Projekt zielt darauf ab, unser Verständnis der molekularen Regulationsmechanismen für die Nitratverwertung zu verbessern. Nitrat wird in der Landwirtschaft umfassend als Dünger eingesetzt, was aber bekanntermassen mit Nitratbelastungen von Gewässern und Gesundheitsgefährdungen verbunden ist. Durch die ausreichende Ähnlichkeit zwischen Pilzen und Pflanzen auf dem Gebiet der Stickstoffverwertung hat das verbesserte Verständnis der Regulationsmechanismen in Pilzen hat auch das Potential die Nitratverwertung in Pflanzen besser zu verstehen und damit die Effizienz von landwirtschaftlichen Stickstoffdüngern zu erhöhen. Beschreibung: Der Bodenpilz Aspergillus nidulans hat sich mittlerweile als eines der am weitesten fortgeschrittenen Modellsysteme für die Untersuchung der Stickstoffverwertung in Eukaryonten etabliert und ausführliche Kenntnisse über die wichtigsten molekularen Regulatoren dieses Prozesses sind erarbeitet worden. In dem vorliegenden Projekt werden die zellulären Vorgänge untersucht werden, die notwendig sind, um dem Pilz die An- oder Abwesenheit von Nitrat in seiner Umwelt zu signalisieren und diese Information von der Zelloberfläche an den Zellkern weiterzuleiten. Ein wichtiger Teil dieses Signalweges führt über den geregelten Transport des Nitrat- Aktivators in und aus dem Zellkern, wobei die Anwesenheit von Nitrat zu einer Blockade des Kernexportes von NirA führt, dieser damit im Kern akkumuliert und jene Gene aktiviert, die für die Nitratverwertung notwendig sind. In den bisherigen Arbeiten haben wir eine ganz bestimmte Region innerhalb des Aktivators gefunden, die für das Ankoppeln des Transportkomplexes verantwortlich ist und jene Region, die als Kernexportsignal bezeichnet wird, sollte in diesem Projekt genau untersucht werden. Vor allem ist geplant, wie eine spezielle Modifikation einer Aminosäure innerhalb des Kernexportsignales, die das "Andocken" des Exportkomplexes ermöglicht, zustandekommt und wie sie anschliessend, wenn kein Nitrat mehr zur Verfügung steht, wieder entfernt wird. Ein Signalweg, der diese Modifikation erstellt bzw. entfernt, wird gemeinsam mit Mutanten, die Veränderungen in diesem Signal zeigen, untersucht werden. Zusammen sollten die einzelnen Projektteile den neu gefundenen Mechanismus der Nitrat Signalübertragung genau charakterisieren und durch die genetische Konservierung mancher dieser Prozesse zwischen Pilzen und Pflanzen auch als Leitlinie für Signalübertragungs Studien in Pflanzen dienen.

Projektziel: Das Projekt zielt darauf ab, unser Verständnis der molekularen Regulationsmechanismen für die Nitratverwertung zu verbessern. Nitrat wird in der Landwirtschaft umfassend als Dünger eingesetzt, was aber bekanntermassen mit Nitratbelastungen von Gewässern und Gesundheitsgefährdungen verbunden ist. Durch die ausreichende Ähnlichkeit zwischen Pilzen und Pflanzen auf dem Gebiet der Stickstoffverwertung hat das verbesserte Verständnis der Regulationsmechanismen in Pilzen hat auch das Potential die Nitratverwertung in Pflanzen besser zu verstehen und damit die Effizienz von landwirtschaftlichen Stickstoffdüngern zu erhöhen. Beschreibung: Der Bodenpilz Aspergillus nidulans hat sich mittlerweile als eines der am weitesten fortgeschrittenen Modellsysteme für die Untersuchung der Stickstoffverwertung in Eukaryonten etabliert und ausführliche Kenntnisse über die wichtigsten molekularen Regulatoren dieses Prozesses sind erarbeitet worden. In dem vorliegenden Projekt werden die zellulären Vorgänge untersucht werden, die notwendig sind, um dem Pilz die An- oder Abwesenheit von Nitrat in seiner Umwelt zu signalisieren und diese Information von der Zelloberfläche an den Zellkern weiterzuleiten. Ein wichtiger Teil dieses Signalweges führt über den geregelten Transport des Nitrat- Aktivators in und aus dem Zellkern, wobei die Anwesenheit von Nitrat zu einer Blockade des Kernexportes von NirA führt, dieser damit im Kern akkumuliert und jene Gene aktiviert, die für die Nitratverwertung notwendig sind. In den bisherigen Arbeiten haben wir eine ganz bestimmte Region innerhalb des Aktivators gefunden, die für das Ankoppeln des Transportkomplexes verantwortlich ist und jene Region, die als Kernexportsignal bezeichnet wird, sollte in diesem Projekt genau untersucht werden. Vor allem ist geplant, wie eine spezielle Modifikation einer Aminosäure innerhalb des Kernexportsignales, die das "Andocken" des Exportkomplexes ermöglicht, zustandekommt und wie sie anschliessend, wenn kein Nitrat mehr zur Verfügung steht, wieder entfernt wird. Ein Signalweg, der diese Modifikation erstellt bzw. entfernt, wird gemeinsam mit Mutanten, die Veränderungen in diesem Signal zeigen, untersucht werden. Zusammen sollten die einzelnen Projektteile den neu gefundenen Mechanismus der Nitrat Signalübertragung genau charakterisieren und durch die genetische Konservierung mancher dieser Prozesse zwischen Pilzen und Pflanzen auch als Leitlinie für Signalübertragungs Studien in Pflanzen dienen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 28%
  • Austrian Institute of Technology - AIT - 72%

Research Output

  • 314 Zitationen
  • 8 Publikationen
Publikationen
  • 2015
    Titel Reversible Oxidation of a Conserved Methionine in the Nuclear Export Sequence Determines Subcellular Distribution and Activity of the Fungal Nitrate Regulator NirA
    DOI 10.1371/journal.pgen.1005297
    Typ Journal Article
    Autor Gallmetzer A
    Journal PLOS Genetics
    Link Publikation
  • 2009
    Titel Functional characterization of the Aspergillus nidulans methionine sulfoxide reductases (msrA and msrB)
    DOI 10.1016/j.fgb.2009.01.004
    Typ Journal Article
    Autor Soriani F
    Journal Fungal Genetics and Biology
    Seiten 410-417
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Interaction of Yna1 and Yna2 Is Required for Nuclear Accumulation and Transcriptional Activation of the Nitrate Assimilation Pathway in the Yeast Hansenula polymorpha
    DOI 10.1371/journal.pone.0135416
    Typ Journal Article
    Autor Silvestrini L
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Transcriptome analysis of nitrate assimilation in Aspergillus nidulans reveals connections to nitric oxide metabolism
    DOI 10.1111/j.1365-2958.2010.07363.x
    Typ Journal Article
    Autor Schinko T
    Journal Molecular Microbiology
    Seiten 720-738
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Dynamics of ammonia-oxidizing communities in barley-planted bulk soil and rhizosphere following nitrate and ammonium fertilizer amendment
    DOI 10.1111/j.1574-6941.2010.00970.x
    Typ Journal Article
    Autor Glaser K
    Journal FEMS Microbiology Ecology
    Seiten 575-591
    Link Publikation
  • 2010
    Titel Greenhouse gas fluxes respond to different N fertilizer types due to altered plant-soil-microbe interactions
    DOI 10.1007/s11104-010-0597-6
    Typ Journal Article
    Autor Inselsbacher E
    Journal Plant and Soil
    Seiten 17-35
  • 2010
    Titel Distinct roles for Caf1, Ccr4, Edc3 and CutA in the co-ordination of transcript deadenylation, decapping and P-body formation in Aspergillus nidulans
    DOI 10.1111/j.1365-2958.2010.07118.x
    Typ Journal Article
    Autor Morozov I
    Journal Molecular Microbiology
    Seiten 503-516
    Link Publikation
  • 2013
    Titel Pseudo-constitutivity of nitrate-responsive genes in nitrate reductase mutants
    DOI 10.1016/j.fgb.2013.02.003
    Typ Journal Article
    Autor Schinko T
    Journal Fungal Genetics and Biology
    Seiten 34-41
    Link Publikation

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