Posttranslationale Modifikation des NirA Kernexportsignales
Posttranslational modification of NirA nuclear export signal
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Nitrate,
Nitrate signal,
Aspergillus,
Fungi,
Nuclear export
Projektziel: Das Projekt zielt darauf ab, unser Verständnis der molekularen Regulationsmechanismen für die Nitratverwertung zu verbessern. Nitrat wird in der Landwirtschaft umfassend als Dünger eingesetzt, was aber bekanntermassen mit Nitratbelastungen von Gewässern und Gesundheitsgefährdungen verbunden ist. Durch die ausreichende Ähnlichkeit zwischen Pilzen und Pflanzen auf dem Gebiet der Stickstoffverwertung hat das verbesserte Verständnis der Regulationsmechanismen in Pilzen hat auch das Potential die Nitratverwertung in Pflanzen besser zu verstehen und damit die Effizienz von landwirtschaftlichen Stickstoffdüngern zu erhöhen. Beschreibung: Der Bodenpilz Aspergillus nidulans hat sich mittlerweile als eines der am weitesten fortgeschrittenen Modellsysteme für die Untersuchung der Stickstoffverwertung in Eukaryonten etabliert und ausführliche Kenntnisse über die wichtigsten molekularen Regulatoren dieses Prozesses sind erarbeitet worden. In dem vorliegenden Projekt werden die zellulären Vorgänge untersucht werden, die notwendig sind, um dem Pilz die An- oder Abwesenheit von Nitrat in seiner Umwelt zu signalisieren und diese Information von der Zelloberfläche an den Zellkern weiterzuleiten. Ein wichtiger Teil dieses Signalweges führt über den geregelten Transport des Nitrat- Aktivators in und aus dem Zellkern, wobei die Anwesenheit von Nitrat zu einer Blockade des Kernexportes von NirA führt, dieser damit im Kern akkumuliert und jene Gene aktiviert, die für die Nitratverwertung notwendig sind. In den bisherigen Arbeiten haben wir eine ganz bestimmte Region innerhalb des Aktivators gefunden, die für das Ankoppeln des Transportkomplexes verantwortlich ist und jene Region, die als Kernexportsignal bezeichnet wird, sollte in diesem Projekt genau untersucht werden. Vor allem ist geplant, wie eine spezielle Modifikation einer Aminosäure innerhalb des Kernexportsignales, die das "Andocken" des Exportkomplexes ermöglicht, zustandekommt und wie sie anschliessend, wenn kein Nitrat mehr zur Verfügung steht, wieder entfernt wird. Ein Signalweg, der diese Modifikation erstellt bzw. entfernt, wird gemeinsam mit Mutanten, die Veränderungen in diesem Signal zeigen, untersucht werden. Zusammen sollten die einzelnen Projektteile den neu gefundenen Mechanismus der Nitrat Signalübertragung genau charakterisieren und durch die genetische Konservierung mancher dieser Prozesse zwischen Pilzen und Pflanzen auch als Leitlinie für Signalübertragungs Studien in Pflanzen dienen.
Projektziel: Das Projekt zielt darauf ab, unser Verständnis der molekularen Regulationsmechanismen für die Nitratverwertung zu verbessern. Nitrat wird in der Landwirtschaft umfassend als Dünger eingesetzt, was aber bekanntermassen mit Nitratbelastungen von Gewässern und Gesundheitsgefährdungen verbunden ist. Durch die ausreichende Ähnlichkeit zwischen Pilzen und Pflanzen auf dem Gebiet der Stickstoffverwertung hat das verbesserte Verständnis der Regulationsmechanismen in Pilzen hat auch das Potential die Nitratverwertung in Pflanzen besser zu verstehen und damit die Effizienz von landwirtschaftlichen Stickstoffdüngern zu erhöhen. Beschreibung: Der Bodenpilz Aspergillus nidulans hat sich mittlerweile als eines der am weitesten fortgeschrittenen Modellsysteme für die Untersuchung der Stickstoffverwertung in Eukaryonten etabliert und ausführliche Kenntnisse über die wichtigsten molekularen Regulatoren dieses Prozesses sind erarbeitet worden. In dem vorliegenden Projekt werden die zellulären Vorgänge untersucht werden, die notwendig sind, um dem Pilz die An- oder Abwesenheit von Nitrat in seiner Umwelt zu signalisieren und diese Information von der Zelloberfläche an den Zellkern weiterzuleiten. Ein wichtiger Teil dieses Signalweges führt über den geregelten Transport des Nitrat- Aktivators in und aus dem Zellkern, wobei die Anwesenheit von Nitrat zu einer Blockade des Kernexportes von NirA führt, dieser damit im Kern akkumuliert und jene Gene aktiviert, die für die Nitratverwertung notwendig sind. In den bisherigen Arbeiten haben wir eine ganz bestimmte Region innerhalb des Aktivators gefunden, die für das Ankoppeln des Transportkomplexes verantwortlich ist und jene Region, die als Kernexportsignal bezeichnet wird, sollte in diesem Projekt genau untersucht werden. Vor allem ist geplant, wie eine spezielle Modifikation einer Aminosäure innerhalb des Kernexportsignales, die das "Andocken" des Exportkomplexes ermöglicht, zustandekommt und wie sie anschliessend, wenn kein Nitrat mehr zur Verfügung steht, wieder entfernt wird. Ein Signalweg, der diese Modifikation erstellt bzw. entfernt, wird gemeinsam mit Mutanten, die Veränderungen in diesem Signal zeigen, untersucht werden. Zusammen sollten die einzelnen Projektteile den neu gefundenen Mechanismus der Nitrat Signalübertragung genau charakterisieren und durch die genetische Konservierung mancher dieser Prozesse zwischen Pilzen und Pflanzen auch als Leitlinie für Signalübertragungs Studien in Pflanzen dienen.
Research Output
- 314 Zitationen
- 8 Publikationen
-
2015
Titel Reversible Oxidation of a Conserved Methionine in the Nuclear Export Sequence Determines Subcellular Distribution and Activity of the Fungal Nitrate Regulator NirA DOI 10.1371/journal.pgen.1005297 Typ Journal Article Autor Gallmetzer A Journal PLOS Genetics Link Publikation -
2009
Titel Functional characterization of the Aspergillus nidulans methionine sulfoxide reductases (msrA and msrB) DOI 10.1016/j.fgb.2009.01.004 Typ Journal Article Autor Soriani F Journal Fungal Genetics and Biology Seiten 410-417 Link Publikation -
2015
Titel Interaction of Yna1 and Yna2 Is Required for Nuclear Accumulation and Transcriptional Activation of the Nitrate Assimilation Pathway in the Yeast Hansenula polymorpha DOI 10.1371/journal.pone.0135416 Typ Journal Article Autor Silvestrini L Journal PLOS ONE Link Publikation -
2010
Titel Transcriptome analysis of nitrate assimilation in Aspergillus nidulans reveals connections to nitric oxide metabolism DOI 10.1111/j.1365-2958.2010.07363.x Typ Journal Article Autor Schinko T Journal Molecular Microbiology Seiten 720-738 Link Publikation -
2010
Titel Dynamics of ammonia-oxidizing communities in barley-planted bulk soil and rhizosphere following nitrate and ammonium fertilizer amendment DOI 10.1111/j.1574-6941.2010.00970.x Typ Journal Article Autor Glaser K Journal FEMS Microbiology Ecology Seiten 575-591 Link Publikation -
2010
Titel Greenhouse gas fluxes respond to different N fertilizer types due to altered plant-soil-microbe interactions DOI 10.1007/s11104-010-0597-6 Typ Journal Article Autor Inselsbacher E Journal Plant and Soil Seiten 17-35 -
2010
Titel Distinct roles for Caf1, Ccr4, Edc3 and CutA in the co-ordination of transcript deadenylation, decapping and P-body formation in Aspergillus nidulans DOI 10.1111/j.1365-2958.2010.07118.x Typ Journal Article Autor Morozov I Journal Molecular Microbiology Seiten 503-516 Link Publikation -
2013
Titel Pseudo-constitutivity of nitrate-responsive genes in nitrate reductase mutants DOI 10.1016/j.fgb.2013.02.003 Typ Journal Article Autor Schinko T Journal Fungal Genetics and Biology Seiten 34-41 Link Publikation