Wissenschaftsdisziplinen
Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (20%); Gesundheitswissenschaften (80%)
Keywords
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Rhinovirus,
Cryo-Electron Microscopy,
RNA release,
Membrane,
Uncoating,
Receptor
Virale Infektionen beginnen mit der spezifischen Bindung des Pathogens an Wirtszellrezeptoren. Daraufhin entlässt das Virus sein Genom ins Zytoplasma. Dies geschieht entweder direkt von der Plasmamembran aus oder nach Eintritt in Endosomen, in das endoplasmatische Retikulum oder in den Golgi auf einer Reihe von möglichen Wegen. Im Falle von lipid-umhüllten Viren ist der Prozess des Eindringens und des Transportes des Genoms ins Zytosol relativ gut bekannt. Jedoch im Fall von nackten Viren gibt es viele offene Fragen: Auf welchen Wegen dringen die Viren in die Zelle ein? Welche Rezeptoren sind daran beteiligt? Wie und wo verlässt das Genom das Virus und dringt daraufhin ins Zytoplasma ein? Ist dieser Prozess gerichtet (d.h. mit welchem Ende verlässt die Nukleinsäure zuerst das virale Kapsid)? Welche Kraft treibt diesen Prozess und wie schnell ist er? Welche Rolle spielen die Rezeptoren in der Freisetzung des Genoms und in dessen Eindringen in die Zelle? Dringt die Nukleinsäure durch eine Pore ein oder wird die endosomale Membrane einfach zerrissen? Wir schlagen vor, diese Fragen unter Verwendung von Rhinoviren des Menschen, den Erregern des Schnupfens als Modellsystem zu untersuchen. Diese kleinen, ikosahedrischen, nackten Viren zirkulieren in Form von mehr als 100 verschiedenen Genotypen in der Population, was zu immer wiederkehrenden Infektionen Anlass gibt. Obwohl strukturell als auch funktionell nahe verwandt, binden Rhinoviren an verschiedene Rezeptoren. Diese leiten sie in unterschiedliche Internalisierungswege und bewirken, dass das Genom von verschiedenen Kompartimenten aus ins Zytoplasma gelangt. Ein besseres Verständnis dieser frühen Prozesse der viralen Infektion könnte den Weg für neue Strategien der Intervention bereiten.
Schnupfenviren sind in der Regel relativ harmlos, können aber in Kombination mit Asthma, chronischer obstruktiver Lungenerkrankung oder zystischer Fibrose sehr gefährlich werden. Außerdem ist ihr ökonomischer Schaden durch Krankenstände und (meist unwirksame Medikamente) enorm. Der erste Schritt zur Infektion ist die Anheftung des Virus an einen Rezeptor in der Zellmembran und die Aufnahme in Endosomen. In diesen Membran-umgebenen Zellorganellen kommt es zu einer Strukturänderung und der Abgabe des RNA Genoms, das durch die endosomale Membran ins Zytoplasma transportiert wird, wo die Replikation stattfindet. Wir untersuchten diese ersten Schritte der Infektion mit strukturbiologischen Methoden. Dazu etablierten wir zunächst ein in vitro System das es erlaubte den RNA Transport vom Virusinneren ins Innere eines Liposoms zu demonstrieren. Daraufhin konnten wir die 3-dimensionale (3D) Struktur jener subviralen Partikel aufklären, die den Übergang zwischen nativem Virus und dem leeren Kapsid darstellen. Unter anderem konnten wir zeigen, dass sich die Faltung des RNA Genoms bei der Vorbereitung zum Verlassen des Virions stark verändert. Diese Konformationsänderungen erscheinen daher zur Feinabstimmung ihres Austritts aus dem Virion notwendig. Des Weiteren konnten wir die 3D Struktur von Membran-gebundenen Viren auflösen; sie erklärt, wie die instabile RNA vom Inneren des Virions ins Zytoplasma gelangt wo sie vervielfältigt wird, ohne jemals den aggressiven Enzymen im Lumen des späten Endosomes ausgesetzt zu sein. Unsere Arbeit umreißt die Dynamik der Strukturänderung vom Virion zum subviralen Partikel und von diesem schließlich zum leeren Kapsid und erklärt wie diese frühen Ereignisse zur Infektion führen.
Research Output
- 521 Zitationen
- 13 Publikationen
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2012
Titel Productive Entry Pathways of Human Rhinoviruses DOI 10.1155/2012/826301 Typ Journal Article Autor Fuchs R Journal Advances in Virology Seiten 826301 Link Publikation -
2012
Titel Insights into Minor Group Rhinovirus Uncoating: The X-ray Structure of the HRV2 Empty Capsid DOI 10.1371/journal.ppat.1002473 Typ Journal Article Autor Garriga D Journal PLoS Pathogens Link Publikation -
2012
Titel Characterization of rhinovirus subviral A particles via capillary electrophoresis, electron microscopy and gas-phase electrophoretic mobility molecular analysis: Part I DOI 10.1002/elps.201100647 Typ Journal Article Autor Weiss V Journal ELECTROPHORESIS Seiten 1833-1841 -
2013
Titel Human Rhinovirus Subviral A Particle Binds to Lipid Membranes over a Twofold Axis of Icosahedral Symmetry DOI 10.1128/jvi.02055-13 Typ Journal Article Autor Kumar M Journal Journal of Virology Seiten 11309-11312 Link Publikation -
2011
Titel Liposomal Nanocontainers as Models for Viral Infection: Monitoring Viral Genomic RNA Transfer through Lipid Membranes DOI 10.1128/jvi.00329-11 Typ Journal Article Autor Bilek G Journal Journal of Virology Seiten 8368-8375 Link Publikation -
2011
Titel Recent developments in capillary and chip electrophoresis of bioparticles: Viruses, organelles, and cells DOI 10.1002/elps.201100048 Typ Journal Article Autor Subirats X Journal ELECTROPHORESIS Seiten 1579-1590 -
2013
Titel Viral Uncoating Is Directional: Exit of the Genomic RNA in a Common Cold Virus Starts with the Poly-(A) Tail at the 3'-End DOI 10.1371/journal.ppat.1003270 Typ Journal Article Autor Harutyunyan S Journal PLoS Pathogens Link Publikation -
2013
Titel Uncoating of common cold virus is preceded by RNA switching as determined by X-ray and cryo-EM analyses of the subviral A-particle DOI 10.1073/pnas.1312128110 Typ Journal Article Autor Pickl-Herk A Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 20063-20068 Link Publikation -
2010
Titel Liposomal Leakage Induced by Virus-Derived Peptides, Viral Proteins, and Entire Virions: Rapid Analysis by Chip Electrophoresis DOI 10.1021/ac101435v Typ Journal Article Autor Weiss V Journal Analytical Chemistry Seiten 8146-8152 -
2014
Titel IgGs are made for walking on bacterial and viral surfaces DOI 10.1038/ncomms5394 Typ Journal Article Autor Preiner J Journal Nature Communications Seiten 4394 Link Publikation -
2015
Titel Analysis of a Common Cold Virus and Its Subviral Particles by Gas-Phase Electrophoretic Mobility Molecular Analysis and Native Mass Spectrometry DOI 10.1021/acs.analchem.5b01450 Typ Journal Article Autor Weiss V Journal Analytical Chemistry Seiten 8709-8717 Link Publikation -
2014
Titel The Rhinovirus Subviral A-Particle Exposes 3'-Terminal Sequences of Its Genomic RNA DOI 10.1128/jvi.00539-14 Typ Journal Article Autor Harutyunyan S Journal Journal of Virology Seiten 6307-6317 Link Publikation -
2013
Titel Characterization of rhinovirus subviral A particles via capillary electrophoresis, electron microscopy and gas phase electrophoretic mobility molecular analysis: Part II DOI 10.1002/elps.201200686 Typ Journal Article Autor Subirats X Journal ELECTROPHORESIS Seiten 1600-1609