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Posttranslationale Modifikationen von Proteinen des Gehirns

Posttranslational modifications of brain proteins

Friedrich Altmann (ORCID: 0000-0002-0112-7877)
  • Grant-DOI 10.55776/P22274
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2010
  • Projektende 30.09.2013
  • Bewilligungssumme 258.531 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (20%); Chemie (40%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (40%)

Keywords

    Glycoprotein, Brain, N-Glycan, O-Glycan, Neuronal Proteins, LC-MS

Abstract Endbericht

Gehirn und Nervengewebe enthalten eine besonders reichhaltige Auswahl ungewöhnlicher, protein-gebundener Glykane, deren funtionelle Rolle erst ungenügend beleuchtet wurde. Wir gehen von der Hypothese aus, dass eine bessere Kenntnis der Proteinglykosylierung im Gehirn und insbesondere die Beobachtung entwicklungs- bzw. krankheitsabhängiger Veränderungen derselben, zum Verständnis der Gehirnfunktion wesentlich beiträgt, Das vorliegende Projekte zielt auf die Messung der N- und O-Glykane von Mäusegehirn Glykoproteinen mittels einer neuartigen, isomer-spezifischen Technik ab, welche qualitative und quantitative Ergebnisse von minimalen Probenmengen ermöglicht. Es handelt sich dabei um die vor kurzem in unserer Gruppe entwickelte Methode, bei der eine "graphitic carbon" Säule zur Trennung der Glykane dient, welche dann massenspektroskopisch analysiert werden. Das Objekt der Untersuchungen werden die Proteine CD24 and L1 sein, die im Mäusegehirn für das Auswachsen von Neuriten wichtig sind. Prof. Melitta Schachner von der Universität Hamburg wird uns mit zu ausgewählten Zeitpunkten genommenen Proben versorgen. Neuere Ergebnisse dieser Gruppe zeigten, dass die Funktion dieser Proteine zu einem guten Teil auf Protein-Kohlenhydrat-Wechselwirkungen beruht. In einer ersten Phase sollen die Bedingungen für die instrumentelle Analytik der Glykane mittels LC-ESI-MS optimiert werden. Die zweite Phase befasst sich mit der eigentlichen Strukturanalysen der wichtigsen Glykane. Zusätzlich zu den übliche massenspektroskopischen Verfahren, wollen wir Referenzglykane mit bekannter Struktur einsetzen. Diese werden durch Verwendung spezifischer Glykosyltransferasen hergestellt, was sich bereits bei der Analyse biantennärer N-Glykane als sehr nützlich erwiesen hat. Es sollen somit die tatsächlichen Strukturen der vorkommenden N- und O-Glykane aufgeklärt werden und nicht nur ihre Zusammensetzung. In der letzten Phase schliesslich werden die so entwickelten Fähigkeiten auf die Proben aus Hamburg angewand, um allfällige Veränderungen während der Gehirnentwicklung messen zu können. Wahrscheinlich wird es mit der neuen Techniken auch möglich werden, die Liganden-Spezifität von L1 festzustellen.

Kürzlich wurden Hinweise für die Wichtigkeit bestimmter Zucker-Determinanten auf Glykoproteinen bei Gehirnentwicklung und Lernvorgängen in der Maus veröffentlicht. Dabei dürften Determinanten mit dem Zucker Fukose eine besondere Rolle spielen. Da die Aussagekraft klassischer Experimente mit Lektinen unzureichend ist, steigt das Bestreben nach instrumenteller Analytik, konkret nach der Kombination aus Flüssigchromatographie (LC) und Massenspektrometrie (MS), bei der die vom Protein getrennten Glykane zunächst nach ihrer Struktur aufgetrennt werden. Dann werden Masse und für die Strukturanalyse das Fragmentmuster bestimmt. Allerdings muss schon man im Falle eines einzigen Glykans im Mausgehirn, das aus 5 Hexosen, 4 Hexosaminen und einer Fukose besteht, bereits mit etwa 40 verschiedenen Isomeren rechnen, also Glykanen, welche die gleiche Masse, aber eine andere Struktur besitzen. Wir konnten im Rahmen des Projektes zeigen, dass ein vielversprechender Weg zur verlässlichen Strukturaufklärung über die chromatographische Trennung der Isomere geht. Dazu müssen Retentionszeiten und Fragmentmuster der möglichen Isomere ermitteln werden und das war ein Hauptgegenstand des Projektes. Mithilfe von 11 von uns gentechnisch erzeugten Glykosyltransferasen konnten wir bereits einen großen Teil der 40 möglichen Strukturen herstellen. Diese uns naheliegende Auswahl deckte aber noch nicht alle Peaks des Maushirns ab, was die Ungewöhnlichkeit der Maus-Strukturen unterstreicht. Da angesichts der Vielzahl möglicher Isomere die Zuordnung eines auftauchenden Peaks heikel ist, arbeiteten wir daran diese durch Einsatz interner Standards verlässlicher zu machen. Zwei Strategien zur Einführung von schweren Isotopen in die Glykan-Standards wurden entwickelt. Der Einbau von Zuckern in Glykane erfolgt über aktivierte Vorstufen. Für die hier wichtigen Zucker gab es aber keine Isotopen-markierten Präparate zu kaufen, sodass wir die 13C-markierte, aktivierte Galaktose erst erzeugen mussten, wiederum mit gentechnisch hergestellten Enzymen. Damit gelang es, die weltweit ersten isotopen-markierten Standards für die Glykan-Analyse mit LC-MS herzustellen. Diese sind Voraussetzung für jede weitere sinnvolle Arbeit auf diesem Gebiet.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 99%
  • Medizinische Universität Wien - 1%
Nationale Projektbeteiligte
  • Gert Lubec, Medizinische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Internationale Projektbeteiligte
  • Melitta Schachner Camartin, Universität Hamburg - Deutschland

Research Output

  • 318 Zitationen
  • 7 Publikationen
Publikationen
  • 2016
    Titel Distinguishing N -acetylneuraminic acid linkage isomers on glycopeptides by ion mobility-mass spectrometry
    DOI 10.1039/c6cc01114d
    Typ Journal Article
    Autor Hinneburg H
    Journal Chemical Communications
    Seiten 4381-4384
    Link Publikation
  • 2019
    Titel N-glycans of the microalga Chlorella vulgaris are of the oligomannosidic type but highly methylated
    DOI 10.1038/s41598-018-36884-1
    Typ Journal Article
    Autor Mócsai R
    Journal Scientific Reports
    Seiten 331
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Bisecting Lewis X in Hybrid-Type N-Glycans of Human Brain Revealed by Deep Structural Glycomics
    DOI 10.1021/acs.analchem.1c03793
    Typ Journal Article
    Autor Helm J
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 15175-15182
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Time grid-based isomer specific N-glycan analysis and detection of bi-secting Lewis X in human brain
    DOI 10.1101/2021.04.14.439640
    Typ Preprint
    Autor Helm J
    Seiten 2021.04.14.439640
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Determination of true ratios of different N-glycan structures in electrospray ionization mass spectrometry
    DOI 10.1007/s00216-017-0235-8
    Typ Journal Article
    Autor Grünwald-Gruber C
    Journal Analytical and Bioanalytical Chemistry
    Seiten 2519-2530
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Processing of complex N-glycans in IgG Fc-region is affected by core fucosylation
    DOI 10.1080/19420862.2015.1053683
    Typ Journal Article
    Autor Castilho A
    Journal mAbs
    Seiten 863-870
    Link Publikation
  • 2011
    Titel Isomeric analysis of oligomannosidic N-glycans and their dolichol-linked precursors
    DOI 10.1093/glycob/cwr138
    Typ Journal Article
    Autor Pabst M
    Journal Glycobiology
    Seiten 389-399
    Link Publikation

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