Alkylglycerol Monooxygenase: Klonierung und Biochemie
Alkylglycerol monooxygenase: Cloning and biochemistry
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (50%)
Keywords
-
Tetrahydrobiopterin,
Phenylalanine Hydroxylase,
Alkylglycerol Monooxygenase,
Ether Lipid
Im menschlichen Körper kommt eine Vielzahl verschiedener Fettstoffe vor, die den Baustein Glycerin als Grundstruktur enthalten. Die Glycerinderivate, bei denen langkettige Kohlenstoffreste mit Esterbindungen gebunden sind, wurden bereits eingehend und gut untersucht. Jene mit einer Etherbindung sind weniger gut untersucht, und über ihren Stoffwechsel ist wenig bekannt. Sie kommen im Säugetierkörper in vielen Geweben vor und spielen wichtige Rollen z.B. in der Entwicklung des Gehirns, in der Reifung von Samenzellen und zum Schutz des Auges vor Kataraktbildung. Alkylglycerol Monooxygenase (Glyceryl Ether Monooxygenase, E.C. 1.14.16.5) ist das einzige bekannte Enzyme, das die Etherbindung zwischen dem Alkylrest und dem Glycerin spalten kann. Alkylglycerol Monooxygenase bildet damit einen entscheidenden Schritt im Abbau der Etherlipide. Die Sequenz dieses Enzyms ist noch nicht bekannt, und deshalb ist eine Erforschung der Biochemie und der physiologischen Rolle dieses Schrittes des Etherlipidabbaus derzeit nicht möglich. Ziel des vorliegenden Projektes ist es nun, der Alkylglycerol Monooxygenase eine Sequenz zuzuordnen, und damit eine Erforschung der Biochemie dieses Enzyms mit den Methoden des Standes der Technik zu ermöglichen. Dazu haben wir im vorangegangenen Projekt 19764 entscheidende Vorarbeiten geleistet. Wir haben Techniken entwickelt, dieses instabile Enzym mit hoher Empfindlichkeit nachzuweisen, und aus Zellmaterial effektiv zu extrahieren. Um die Sequenz zuzuordnen, planen wir, eine Suche mit funktionelle Expression in Xenopus laevis Oocyten durchzuführen. Mit dieser Technik sind auch schon anderen Enzymen, deren Reinigung nicht möglich war, Sequenzen zugeordnet worden. Wir konnten den entscheidenden Schritt dieser Technik bereits erfolgreich durchführen und zeigen, dass nach Injektion von Boten Ribonucleinsäure aus Rattenleber Xenopus Oocyten eine Tetrahydrobiopterin-abhängige Alkylglycerol Monooxygenase Aktivität exprimieren. Mit Standardmethoden werden wir davon ausgehend die Boten Ribonucleinsäure fraktionieren, und die Sequenz zuordnen können. Nach der Zuordnung der Sequenz planen wir, die Biochemie des Enzyms näher zu studieren. Wir wollen feststellen, welche Aminosäurereste für die Aktivität und welche für die Bindung des Cofaktors Tetrahydrobiopterin wichtig sind. Dazu planen wir, das Enzym rekombinant herzustellen und zu reinigen, und einzelne Aminosäurereste gezielt auszutauschen. Weiters wollen wir Bindungspartner des Enzyms finden. Dazu wollen wir zwei Methoden einsetzen, das Split Ubiquitinsystem der Hefe, und Affinitäts-chromatographische Reinigung von Proteinkomplexen aus transifizierten Säugetierzellen.
Das Ziel dieses Projekts war es, einem wichtigen Enzym des menschlichen Fettstoffwechsels, der Alkylglycerol monooxygenase, einen Ort in im Genom zuzuordnen und damit dessen Bauplan zu finden. Die Stoffwechselreaktion, die Alkylglycerol monooxygenase ausführt, war schon seit 1964 bekannt. Nicht gewusst hat man allerdings bisher, welches Gen in unserem Genom für diese Reaktion verantwortlich ist. Für den Menschen kennt man noch etwa hundert weitere Enzyme ohne zugeordnete Sequenz oder Geninformation. Für die meisten bekannten Stoffwechselenzyme wurde die entsprechende Sequenz durch Untersuchung des in reiner Form gewonnenen Enzyms entschlüsselt. Das war im Fall der Alkylglycerol monooxygenase jedoch nicht möglich. Dieses Enzym ist in der zellulären Membran verankert und sehr empfindlich. Jeder Versuch es aus der Membran herauszulösen um es in reiner Form zu gewinnen führt umgehend zum Verlust der Fähigkeit, die enzymatische Reaktion auszuführen. Um dieses Problem zu lösen, wählten wir einen neuartigen Ansatz. Da durch die intensiven Forschungen am menschlichen Genom praktisch alle Baupläne für Proteine des Menschen bekannt sind, musste in den Tausenden Genen/Bauplänen mit unbekannter Rolle auch der für die Alkylglycerol monooxygenase vorhanden sein. Zusätzlich nützten wir das umfangreiche Wissen über Motive im Bauplan der Proteine, die auf eine bestimmte Funktion schließen lassen. Eines dieser mehr als 10 000 Motive, das sogenannte Fettsäure-Hydroxylase Motiv, charakterisiert Proteine die Fette in einer Art spalten, die uns an die Alkylglycerol monooxygenase Reaktion erinnerte. Das menschliche Genom enthält mehrere Baupläne unbekannter Funktion die das Fettsäure Hydroxylase Motiv enthalten. Eine Prüfung dieser Baupläne durch deren Einbringen in kultivierte Zellen ergab dann dass tatsächlich ein Protein mit bislang unbekannter Funktion, das Transmembran-Protein 195 genannt worden war, für die Alkylglycerol monooxygenase Aktivität verantwortlich ist. Dieser wissenschaftliche Durchbruch erschloss die Alkylglycerol monooxygenase für die moderne wissenschaftliche Forschung. Es ist nun möglich, die Aktivität des Enzyms in kultivierten Zellen und in Modellorganismen zu verändern und zu beobachten, welche Folgen das für den Organismus oder die Zelle hat. Außerdem ist es nun möglich, in Datenbanken nach Krankheitsassoziationen der Alkylglycerol monooxygenase im Menschen zu suchen.
Research Output
- 470 Zitationen
- 17 Publikationen
-
2015
Titel The Physarum polycephalum Genome Reveals Extensive Use of Prokaryotic Two-Component and Metazoan-Type Tyrosine Kinase Signaling DOI 10.1093/gbe/evv237 Typ Journal Article Autor Schaap P Journal Genome Biology and Evolution Seiten 109-125 Link Publikation -
2015
Titel Expression of full-length human alkylglycerol monooxygenase and fragments in Escherichia coli. Typ Journal Article Autor Golderer G Et Al -
2015
Titel Tetrahydrobiopterin and alkylglycerol monooxygenase substantially alter the murine macrophage lipidome DOI 10.1073/pnas.1414887112 Typ Journal Article Autor Watschinger K Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 2431-2436 Link Publikation -
2013
Titel Expression of full-length human alkylglycerol monooxygenase and fragments in Escherichia coli DOI 10.1515/pterid-2013-0014 Typ Journal Article Autor Mayer M Journal Pteridines Seiten 111-115 Link Publikation -
2012
Titel Studying fatty aldehyde metabolism in living cells with pyrene-labeled compounds DOI 10.1194/jlr.d025650 Typ Journal Article Autor Keller M Journal Journal of Lipid Research Seiten 1410-1416 Link Publikation -
2012
Titel Orphan enzymes in ether lipid metabolism DOI 10.1016/j.biochi.2012.06.027 Typ Journal Article Autor Watschinger K Journal Biochimie Seiten 59-65 Link Publikation -
2012
Titel Catalytic residues and a predicted structure of tetrahydrobiopterin-dependent alkylglycerol mono-oxygenase DOI 10.1042/bj20111509 Typ Journal Article Autor Watschinger K Journal Biochemical Journal Seiten 279-286 Link Publikation -
2014
Titel A gatekeeper helix determines the substrate specificity of Sjögren–Larsson Syndrome enzyme fatty aldehyde dehydrogenase DOI 10.1038/ncomms5439 Typ Journal Article Autor Keller M Journal Nature Communications Seiten 4439 Link Publikation -
2015
Titel Cuticle Integrity and Biogenic Amine Synthesis in Caenorhabditis elegans Require the Cofactor Tetrahydrobiopterin (BH4) DOI 10.1534/genetics.114.174110 Typ Journal Article Autor Loer C Journal Genetics Seiten 237-253 Link Publikation -
2011
Titel Fatty Alcohols Accumulate in Cultured Fibroblasts of Sjögren Larsson Syndrome Patients DOI 10.1096/fasebj.25.1_supplement.715.8 Typ Journal Article Autor Keller M Journal The FASEB Journal Seiten 715.8-715.8 -
2011
Titel Tetrahydrobiopterin-dependent Alkylglycerol Monooxygenase: From Gene Identification to Novel Insights into Etherlipid Degradation DOI 10.1096/fasebj.25.1_supplement.913.8 Typ Journal Article Autor Watschinger K Journal The FASEB Journal Seiten 913.8-913.8 -
2010
Titel Identification of the gene encoding alkylglycerol monooxygenase defines a third class of tetrahydrobiopterin-dependent enzymes DOI 10.1073/pnas.1002404107 Typ Journal Article Autor Watschinger K Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Seiten 13672-13677 Link Publikation -
2013
Titel Fatty aldehyde dehydrogenase, the enzyme downstream of tetrahydrobiopterin-dependent alkylglycerol monooxygenase DOI 10.1515/pterid-2013-0004 Typ Journal Article Autor Keller M Journal Pteridines Seiten 105-109 Link Publikation -
2013
Titel Three classes of tetrahydrobiopterin-dependent enzymes DOI 10.1515/pterid-2013-0003 Typ Journal Article Autor Werner E Journal Pteridines Seiten 7-11 Link Publikation -
2013
Titel First insights into structure-function relationships of alkylglycerol monooxygenase DOI 10.1515/pterid-2013-0007 Typ Journal Article Autor Watschinger K Journal Pteridines Seiten 99-103 Link Publikation -
2013
Titel The role of coproporphyrinogen III oxidase and ferrochelatase genes in heme biosynthesis and regulation in Aspergillus niger DOI 10.1007/s00253-013-5274-2 Typ Journal Article Autor Franken A Journal Applied Microbiology and Biotechnology Seiten 9773-9785 Link Publikation -
2013
Titel Alkylglycerol monooxygenase DOI 10.1002/iub.1143 Typ Journal Article Autor Watschinger K Journal IUBMB Life Seiten 366-372 Link Publikation