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Molekulare Evolution der Epidermis in Amnioten

Molecular evolution of the epidermis in amniotes

Leopold Eckhart (ORCID: 0000-0002-5645-2036)
  • Grant-DOI 10.55776/P23801
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2011
  • Projektende 31.12.2015
  • Bewilligungssumme 184.768 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (90%); Klinische Medizin (10%)

Keywords

    Evolution, Skin Barrier, Epidermis, Genomics, Skin, Reptiles

Abstract Endbericht

Die Epidermis (Oberhaut) der Säugetiere, Reptilien und Vögel, also der Amnioten, bildet eine lebenswichtige Barriere zur Umwelt und ist auch für die Ausbildung von Hautanhangsgebilden wie Haaren und Federn zuständig. In der Evolution der Amnioten passte sich die Epidermis an viele unterschiedliche Umweltbedingungen und Lebensstile an. Trotzdem blieben einige Strukturprinzipien wie das Vorhandensein einer oberflächlichen Schicht aus verhornten Zellen erhalten. Die Bildung und Funktion der Epidermis wird von bestimmten Genen kontrolliert, die bisher nur unvollständig charakterisiert sind. Die Verfügbarkeit von Genomsequenzen eines breiten Spektrums von Amnioten erlaubt es erstmals, die genetische Basis für die Evolution der Epidermis zu bestimmen. Das erste Ziel dieser Studie ist die Entwicklung eines Szenarios für den evolutionären Ursprung und die Adaption aller Gene, die hauptsächlich oder ausschließlich in der Epidermis aktiv sind. Zu diesem Zweck werden die Genomsequenzen von Amnioten auf das Vorhandensein und die Sequenzähnlichkeit von Genen untersucht, die homolog zu humanen Genen mit epidermis-spezifischer Funktion sind. Das zweite Ziel ist die detailierte Aufklärung der Evolution und der funktionellen Diversifizierung dreier ausgewählter Gene, nämlich (1) Loricrin, dem Hauptbestandteil der Proteinhülle verhornter Hautzellen, (2) Filaggrin, dem wichtigsten Filament aggregierenden Protein der Oberhaut, und (3) einem neuen Hautprotein der Reptilien, das einen extrem hohen Gehalt der Aminosäure Cystein aufweist. Neben phylogenetischen Analysen werden Genexpressionsstudien und funktionelle Studien durchgeführt. Die Ergebnisse dieser Studie werden zu einem besseren Verständnis der epidermalen Barrierefunktion in Reptilien, Vögeln und Säugetieren führen und zur Klärung der Rolle von Genen beitragen, die im Menschen mit Hautkrankheiten assoziert sind.

Die Haut der Säugetiere, Reptilien und Vögel ist lebenswichtiges Schutzorgan, das im Lauf der Evolution eine Anpassung an viele unterschiedliche Umweltbedingungen und Lebensstile ermöglicht hat. Im hier zusammengefassten Projekt wurden Einsichten in die Evolution von Genen gewonnen, die für die Barriereeigenschaften der menschlichen Haut verantwortlich sind. Zusätzlich konnten wichtige Bestandteile von Reptilienschuppen und Federn identifiziert werden. Schließlich wurde ein neues Szenario für die Evolution der Haut in frühen landlebenden, reptilienartigen Tieren und für die evolutionäre Diversifizierung der Haut in den verschiedenen Gruppen der Amnioten entworfen. Die gewonnenen Erkenntnisse sind nicht nur für die Evolutionsgeschichte interessant, sondern auch für die systembiologische Charakterisierung der humanen Haut.Ausgangspunkt dieses Projekts waren Gene, die für eine gesunde Haut im Menschen notwendig sind und deren Mutationen mit atopischer Dermatitis, Psoriasis und anderen Krankheiten assoziiert sind. In den letzten Jahren publizierte Genomsequenzen zahlreicher Säugetier-, Reptilien- und Vogelarten wurden verwendet, um zu bestimmen, ob ähnliche Gene wie beim Menschen auch in anderen Spezies vorhanden sind. Tatsächlich konnten zum Beispiel Varianten des Gens für das Hautprotein Loricrin in Vögeln und Reptilien gefunden werden, was auf eine Entstehung dieses Gens in einem gemeinsamen Vorfahren der Amnioten (Säugetiere, Reptilien und Vögel) vor mehr als 300 Millionen Jahren hindeutet. Ähnliche Ergebnisse wurden für die Gruppe der filaggrinartigen Gene erzielt. Während der Ursprung dieser Gene in der frühen Evolution der Amnioten auf eine zentrale Rolle in der Haut dieser Landwirbeltieren schliessen läßt, sind Äquivalente anderer humaner Hautgene spezifisch für Säugetiere.Ein überraschendes Ergebnis dieser Studie war die Entdeckung einer großen Zahl neuer Proteinbestandteile der Haut von Reptilien, darunter auch Komponenten des Schildkrötenpanzers. Weiters wurde ein neues cysteinreiches Protein beschrieben, welches für die Bildung der mechanisch stabilen Struktur der Federn mitverantwortlich ist. Die Ergebnisse dieser Arbeit lieferten die Grundlage für ein Folgeprojekt zur Evolution von Kornifizierungsproteinen, das bereits gestartet wurde.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Lorenzo Alibardi, University of Bologna - Italien

Research Output

  • 605 Zitationen
  • 23 Publikationen
Publikationen
  • 2021
    Titel The Trichohyalin-Like Protein Scaffoldin Is Expressed in the Multilayered Periderm during Development of Avian Beak and Egg Tooth
    DOI 10.3390/genes12020248
    Typ Journal Article
    Autor Mlitz V
    Journal Genes
    Seiten 248
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Gene duplications and gene loss in the epidermal differentiation complex during the evolutionary land-to-water transition of cetaceans
    DOI 10.1038/s41598-021-91863-3
    Typ Journal Article
    Autor Holthaus K
    Journal Scientific Reports
    Seiten 12334
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Comparative Analysis of Epidermal Differentiation Genes of Crocodilians Suggests New Models for the Evolutionary Origin of Avian Feather Proteins
    DOI 10.1093/gbe/evy035
    Typ Journal Article
    Autor Holthaus K
    Journal Genome Biology and Evolution
    Seiten 701-711
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Differential Evolution of the Epidermal Keratin Cytoskeleton in Terrestrial and Aquatic Mammals
    DOI 10.1093/molbev/msy214
    Typ Journal Article
    Autor Ehrlich F
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 328-340
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Phylogenetic profiling and gene expression studies implicate a primary role of PSORS1C2 in terminal differentiation of keratinocytes
    DOI 10.1111/exd.13272
    Typ Journal Article
    Autor Zadeh S
    Journal Experimental Dermatology
    Seiten 352-358
  • 2015
    Titel Gene loss in keratinization programs accompanies adaptation of cetacean skin to aquatic lifestyle
    DOI 10.1111/exd.12756
    Typ Journal Article
    Autor Oh J
    Journal Experimental Dermatology
    Seiten 572-573
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Immunolocalization of Scaffoldin, a Trichohyalin-Like Protein, in the Epidermis of the Chicken Embryo
    DOI 10.1002/ar.23039
    Typ Journal Article
    Autor Alibardi L
    Journal The Anatomical Record
    Seiten 479-487
  • 2014
    Titel Evolutionary Origin and Diversification of Epidermal Barrier Proteins in Amniotes
    DOI 10.1093/molbev/msu251
    Typ Journal Article
    Autor Strasser B
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 3194-3205
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Identification and comparative analysis of the epidermal differentiation complex in snakes
    DOI 10.1038/srep45338
    Typ Journal Article
    Autor Holthaus K
    Journal Scientific Reports
    Seiten 45338
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Localisation of keratin K78 in the basal layer and first suprabasal layers of stratified epithelia completes expression catalogue of type II keratins and provides new insights into sequential keratin expression
    DOI 10.1007/s00441-015-2278-5
    Typ Journal Article
    Autor Langbein L
    Journal Cell and Tissue Research
    Seiten 735-750
  • 2015
    Titel Comparative Genomics Identifies Epidermal Proteins Associated with the Evolution of the Turtle Shell
    DOI 10.1093/molbev/msv265
    Typ Journal Article
    Autor Holthaus K
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 726-737
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Epidermal cornification is preceded by the expression of a keratinocyte-specific set of pyroptosis-related genes
    DOI 10.1038/s41598-017-17782-4
    Typ Journal Article
    Autor Lachner J
    Journal Scientific Reports
    Seiten 17446
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Filaggrin has evolved from an “S100 fused-type protein” (SFTP) gene present in a common ancestor of amphibians and mammals
    DOI 10.1111/exd.13317
    Typ Journal Article
    Autor Mlitz V
    Journal Experimental Dermatology
    Seiten 955-957
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Immunolocalization and phylogenetic profiling of the feather protein with the highest cysteine content
    DOI 10.1007/s00709-019-01381-3
    Typ Journal Article
    Autor Lachner J
    Journal Protoplasma
    Seiten 1257-1265
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Comparative genomics suggests loss of keratin K24 in three evolutionary lineages of mammals
    DOI 10.1038/s41598-019-47422-y
    Typ Journal Article
    Autor Ehrlich F
    Journal Scientific Reports
    Seiten 10924
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Skin Game: Study Peels Back Details on Mammalian Keratin Genes and Adaptation to Living on Land or in Water
    DOI 10.1093/molbev/msy238
    Typ Journal Article
    Autor Caspermeyer J
    Journal Molecular Biology and Evolution
    Seiten 434-434
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Comparative genomics reveals conservation of filaggrin and loss of caspase-14 in dolphins
    DOI 10.1111/exd.12681
    Typ Journal Article
    Autor Strasser B
    Journal Experimental Dermatology
    Seiten 365-369
    Link Publikation
  • 2014
    Titel Trichohyalin-Like Proteins Have Evolutionarily Conserved Roles in the Morphogenesis of Skin Appendages
    DOI 10.1038/jid.2014.204
    Typ Journal Article
    Autor Mlitz V
    Journal Journal of Investigative Dermatology
    Seiten 2685-2692
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Molecular and Comparative Genomics Analysis of Proteins and Peptides Involved in Epidermal Differentiation of Reptiles and Birds (Sauropsida)
    DOI 10.6092/unibo/amsdottorato/8042
    Typ Other
    Autor Holthaus K
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Convergent evolution of cysteine-rich proteins in feathers and hair
    DOI 10.1186/s12862-015-0360-y
    Typ Journal Article
    Autor Strasser B
    Journal BMC Evolutionary Biology
    Seiten 82
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Immunolocalization of loricrin in the maturing a-layer of normal and regenerating epidermis of the lizard Anolis carolinensis
    DOI 10.1002/jez.b.22610
    Typ Journal Article
    Autor Alibardi L
    Journal Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution
    Seiten 159-167
  • 2021
    Titel Immunolocalization of epidermal differentiation complex proteins reveals distinct molecular compositions of cells that control structure and mechanical properties of avian skin appendages
    DOI 10.1002/jmor.21357
    Typ Journal Article
    Autor Alibardi L
    Journal Journal of Morphology
    Seiten 917-933
  • 2016
    Titel Immunolocalization of a Histidine-Rich Epidermal Differentiation Protein in the Chicken Supports the Hypothesis of an Evolutionary Developmental Link between the Embryonic Subperiderm and Feather Barbs and Barbules
    DOI 10.1371/journal.pone.0167789
    Typ Journal Article
    Autor Alibardi L
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation

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