Strukturelle Charakterisierung von Typ 3-Kupferproteinen
Structural studies of type 3 copper proteins
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (75%); Chemie (25%)
Keywords
-
Type 3 Copper Center,
Activation Of Enzymes,
Polyphenol Oxidases,
Reaction Mechnaism,
X-ray structure analysis,
Food Industry
Polyphenoloxidasen sind allgegenwärtig in vielen Organismen, wie Bakterien, Pilzen Pflanzen und auch Menschen vorhanden. Die Funktion dieser Proteine (Tyrosinase, Catecholoxidase und Aureusidinsynthase) besteht in der Oxidation von phenolischen Substraten. Die Enzyme beinhalten ein Typ III Kupferzentrum. Polyphenoloxidasen werden in vivo in ihrer latenten Form hergestellt und weiter in eine aktive Form prozessiert. Tyrosinase katalysiert zwei Reaktionen (Hydroxilierung und Oxidation) im Rahmen der Bildung von braunen Pigmenten (z.B. Melanine). Aureusidinsynthase katalysiert eine Hydroxilierung und Oxidation von o- diphenolischen Chalkonen zu den zugehörigen Auronen. Diese Aurone sind verantwortlich für die gelbe Blütenfärbung in Asteraceae. Das Projekt soll einen fundamentalen Beitrag zum molekularen Verständnis der Funktion der Polyphenoloxidasen leisten. Die Ziele des Antrages sind die Kristallstrukturen von mehreren unterschiedlichen Polyphenoloxidasen- Isoformen (hier Tyrosinase aus Champignons und Aureusidinsynthase aus Mädchenauge) in ihren latenten und ihren proteolytisch aktivierten Formen zu untersuchen. Zur Untersuchung der Struktur und des Aktivierungsprozesses von Polyphenoloxidasen wird eine Kombination von Proteinisolierung, biochemischer Charakterisierung, molekularbiologischen Methoden und der Röntgenstrukturanalyse eingesetzt. Rekombinant hergestellte Tyrosinase und Aureusidinsynthase soll hohe Konzentrationen an reinem Protein liefern. Gegenwärtig sind fünf Gensequenzen (PPO 1 - 5) der Tyrosinase aus Champignons bekannt. Nur die aktive Form (bestehend aus den Aminosäureresten 2-392 von insgesamt 576) von PPO3 ist derzeit kristallographisch bekannt. Demzufolge gibt es keine ausreichende Charakterisierung von PPO 1, 2, 4 und 5 in der aktiven Form und von allen latenten Formen der PPO 1 bis 5. Die Sequenzanalyse der fünf PPOs aus Champignons zeigt große Unterschiede was Sequenzlänge und Glykolysierung betrifft. Insbesondere zeigt PPO4 ein um 35 Aminosäuren längeres C-Ende. Diese 35 Aminosäuren sind sehr hydrophob. PPO4 gilt unser größtes Interesse. Eine röntgenographische Charakterisierung der Ausreusidinsynthase liegt bis heute nicht vor. Neben dem Aktivierungsprozess sollen Aureusdinsynthasekristalle mit unterschiedlichen Substraten co-kristallisiert werden, um die hohe Substratspezifität des Enzyms zu studieren und zu verstehen, wie Selektivität in enzymatischen Reaktionen realisiert wird. Zudem erwarten wir über dieses Projekt Reaktionsmechanismen für Polyphenoloxidasen favorisieren oder ausschließen zu können.
Polyphenoloxidasen (PPOs) sind eine Gruppe von Typ 3-Kupfer Metalloenzymen zu denen Tyosinasen (Tyrs), Catecholoxidasen (COs) und Auronsynthase (AUS) gehören. Tyrs katalysieren die ortho-Hydroxylierung von Monophenolen (Monophenolase Aktivität) und die da- rauffolgende Oxidation der entstehenden ortho-Diphenole zu ortho-Chinone (Diphenolase Aktivität), wohingegen COs nur die letztere Reaktion katalysieren können. Die ortho-Chinone sind hochreaktiv Ausgangsverbindungen für die Biosynthese von Melanin. AUS katalysiert die Synthese von Auronen ausgehend von Chalkonen und ist somit an der Gelbfärbung von einigen Zierpflanzen beteiligt. Unsere Forschungsziele waren die Produktion der Pilztyrosi- nase aus Agaricus bisporus (abPPO4) und der Auronsynthase aus Coreopsis grandiflora (cgAUS1) in möglichst hoher Ausbeute und deren biochemische und strukturelle Charakterisierung, um Erkenntnisse über den katalytischen Mechanismus von PPOs zu erhalten. Wir haben effiziente Extraktions- und Reinigungsprotokolle für die Isolierung beider Enzyme aus ihrer jeweiligen natürlichen Quellen entwickelt. Später haben wir Protokolle für die hocheffiziente Expression und Aufreinigung der Enzyme in rekombinanter Form erstellt, die ausreichende Mengen an Enzym für weitere Charakterisierungen lieferten. Beide Enzyme wurden sowohl in ihrer latenten als auch aktiven Form biochemisch charakterisiert und die Ergebnisse lieferten die exakte Schnittstelle an der Domäne, die das aktive Zentrum abdeckt. Die kinetische Charakterisierung der Substratspezifität von cgAUS ergab, dass sich cgAUS in mehrerer Hinsicht von anderen Enzymklassen unterscheidet und deswegen wurde cgAUS letztendlich als Auronsynthase klassifiziert, was diese zu einer neuen, speziellen Untergruppe der PPOs macht. Interessanterweise, war cgAUS, von der man glaubte sie besäße ähnlich wie COs keine Hydroxylase-Aktivität, da sie keine typischen Substrate der Tyrosinase (z.B. Tyrosin) umsetzen kann, aktiv auf das natürliche Monphenol-Substrat Isoliquiritigenin. Kristallisationsexperimente lieferten die Kristallstruktur einer latenten pflanzlichen PPO (cgAUS1) und führten zur ersten Veröffentlichung eines heterogenen Kristalls, der die aktive als auch latente Form einer Pilztyrosinase (abPPO4) in einer einzigen Kristallstruktur enthält. Die Analyse ergab, dass alle strukturell bekannten PPOs sehr ähnliche aktive Zentren besitzen, weshalb es schwierig ist, strukturelle Merkmale für die Substratspezifizität zu bestimmen. Jedoch zeigten Molecular Dynamics Studien mit verschiedenen Substraten an cgAUS, dass Aminosäuren, die am Eingang zum aktiven Zentrum liegen, eine entscheidende Rolle bei der Substratspezifizität spielen, da sie abhängig von der Struktur des Substrats dessen Position innerhalb des aktiven Zentrums entweder stabilisieren oder destabilisieren. Wir haben einen neuen Mechanismus für die katalytische Reaktion von PPOs vorgeschlagen, der sich auf diese Substrat-stabilisierenden/destabilisierenden Reste konzentriert.
- Universität Wien - 3%
- Universität Wien - 97%
- Kristina Djinovic-Carugo, Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 1540 Zitationen
- 35 Publikationen
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2016
Titel Aurone synthase is a catechol oxidase with hydroxylase activity and provides insights into the mechanism of plant polyphenol oxidases DOI 10.1073/pnas.1523575113 Typ Journal Article Autor Molitor C Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2016
Titel In situ formation of the first proteinogenically functionalized [TeW 6 O 24 O 2 (Glu)] 7- structure reveals unprecedented chemical and geometrical features of the Anderson-type cluster DOI 10.1039/c6cc07004c Typ Journal Article Autor Molitor C Journal Chemical Communications Seiten 12286-12289 Link Publikation -
2015
Titel The Structure of a Plant Tyrosinase from Walnut Leaves Reveals the Importance of “Substrate-Guiding Residues” for Enzymatic Specificity DOI 10.1002/anie.201506994 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Angewandte Chemie International Edition Seiten 14677-14680 Link Publikation -
2015
Titel Crystallization and preliminary crystallographic analysis of latent, active and recombinantly expressed aurone synthase, a polyphenol oxidase, from Coreopsis grandiflora DOI 10.1107/s2053230x15007542 Typ Journal Article Autor Molitor C Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications Seiten 746-751 Link Publikation -
2015
Titel Fungal Tyrosinases: Why Mushrooms Turn Brown DOI 10.1016/b978-0-12-409547-2.11521-5 Typ Book Chapter Autor Pretzler M Verlag Elsevier -
2017
Titel The potential of hexatungstotellurate(VI) to induce a significant entropic gain during protein crystallization DOI 10.1107/s2052252517012349 Typ Journal Article Autor Molitor C Journal IUCrJ Seiten 734-740 Link Publikation -
2017
Titel Heterologous expression and characterization of functional mushroom tyrosinase (AbPPO4) DOI 10.1038/s41598-017-01813-1 Typ Journal Article Autor Pretzler M Journal Scientific Reports Seiten 1810 Link Publikation -
2017
Titel In crystallo activity tests with latent apple tyrosinase and two mutants reveal the importance of the mutated sites for polyphenol oxidase activity DOI 10.1107/s2053230x17010822 Typ Journal Article Autor Kampatsikas I Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications Seiten 491-499 Link Publikation -
2017
Titel Purification and Characterization of Latent Polyphenol Oxidase from Apricot (Prunus armeniaca L.) DOI 10.1021/acs.jafc.7b03210 Typ Journal Article Autor Derardja A Journal Journal of Agricultural and Food Chemistry Seiten 8203-8212 Link Publikation -
2017
Titel Three recombinantly expressed apple tyrosinases suggest the amino acids responsible for mono- versus diphenolase activity in plant polyphenol oxidases DOI 10.1038/s41598-017-08097-5 Typ Journal Article Autor Kampatsikas I Journal Scientific Reports Seiten 8860 Link Publikation -
2017
Titel Ten Good Reasons for the Use of the Tellurium-Centered Anderson–Evans Polyoxotungstate in Protein Crystallography DOI 10.1021/acs.accounts.7b00109 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Accounts of Chemical Research Seiten 1441-1448 Link Publikation -
2017
Titel Purification and Characterization of Latent Polyphenol Oxidase from Apricot (Prunus armeniaca L.) DOI 10.60692/q9e97-3y004 Typ Other Autor Ala Eddine Derardja Link Publikation -
2017
Titel Purification and Characterization of Latent Polyphenol Oxidase from Apricot (Prunus armeniaca L.) DOI 10.60692/37w64-w1x08 Typ Other Autor Ala Eddine Derardja Link Publikation -
2016
Titel Inside back cover DOI 10.1039/c6cc90463g Typ Journal Article Journal Chemical Communications -
2016
Titel In situ formation of the first proteinogenically functionalized [TeW 6 O 24 O 2 (Glu)] 7- structure reveals unprecedented chemical and geometrical features of the Anderson-type cluster DOI 10.3204/pubdb-2016-03725 Typ Other Autor Bijelic A Link Publikation -
2018
Titel What causes the different functionality in type-III-copper enzymes? A state of the art perspective DOI 10.1016/j.ica.2017.04.041 Typ Journal Article Autor Pretzler M Journal Inorganica Chimica Acta Seiten 25-31 Link Publikation -
2018
Titel Polymerizing Like Mussels Do: Toward Synthetic Mussel Foot Proteins and Resistant Glues DOI 10.1002/anie.201809587 Typ Journal Article Autor Horsch J Journal Angewandte Chemie International Edition Seiten 15728-15732 Link Publikation -
2018
Titel Polymerizing Like Mussels Do: Toward Synthetic Mussel Foot Proteins and Resistant Glues DOI 10.1002/ange.201809587 Typ Journal Article Autor Horsch J Journal Angewandte Chemie Seiten 15954-15958 Link Publikation -
2020
Titel Die Erzeugung von Tyrosinaseaktivität in einer Catecholoxidase erlaubt die Identifizierung der für die C-H-Aktivierung in Typ-III-Kupferenzymen verantwortlichen Aminosäurereste DOI 10.1002/ange.202008859 Typ Journal Article Autor Kampatsikas I Journal Angewandte Chemie Seiten 21126-21131 Link Publikation -
2020
Titel Identification of Amino Acid Residues Responsible for C-H Activation in Type-III Copper Enzymes by Generating Tyrosinase Activity in a Catechol Oxidase DOI 10.1002/anie.202008859 Typ Journal Article Autor Kampatsikas I Journal Angewandte Chemie International Edition Seiten 20940-20945 Link Publikation -
2020
Titel Polyphenol oxidases exhibit promiscuous proteolytic activity DOI 10.1038/s42004-020-0305-2 Typ Journal Article Autor Biundo A Journal Communications Chemistry Seiten 62 Link Publikation -
2019
Titel Keggin-type polyoxotungstates as mushroom tyrosinase inhibitors - A speciation study DOI 10.1038/s41598-019-41261-7 Typ Journal Article Autor Breibeck J Journal Scientific Reports Seiten 5183 Link Publikation -
2019
Titel Variational approaches to quantum impurities: from the Fröhlich polaron to the angulon DOI 10.1080/00268976.2019.1567852 Typ Journal Article Autor Li X Journal Molecular Physics Seiten 1981-1988 Link Publikation -
2019
Titel Inhibition of apricot polyphenol oxidase by combinations of plant proteases and ascorbic acid DOI 10.1016/j.fochx.2019.100053 Typ Journal Article Autor Derardja A Journal Food Chemistry: X Seiten 100053 Link Publikation -
2014
Titel Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of polyphenol oxidase from Juglans regia (jrPPO1) DOI 10.1107/s2053230x1400884x Typ Journal Article Autor Zekiri F Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications Seiten 832-834 Link Publikation -
2014
Titel High level protein-purification allows the unambiguous polypeptide determination of latent isoform PPO4 of mushroom tyrosinase DOI 10.1016/j.phytochem.2013.12.016 Typ Journal Article Autor Mauracher S Journal Phytochemistry Seiten 14-25 Link Publikation -
2014
Titel Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of latent isoform PPO4 mushroom (Agaricus bisporus) tyrosinase DOI 10.1107/s2053230x14000582 Typ Journal Article Autor Mauracher S Journal Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications Seiten 263-266 Link Publikation -
2014
Titel Purification and characterization of tyrosinase from walnut leaves (Juglans regia) DOI 10.1016/j.phytochem.2014.02.010 Typ Journal Article Autor Zekiri F Journal Phytochemistry Seiten 5-15 Link Publikation -
2014
Titel Chapter One Type-3 Copper Proteins Recent Advances on Polyphenol Oxidases DOI 10.1016/bs.apcsb.2014.07.001 Typ Book Chapter Autor Kaintz C Verlag Elsevier Seiten 1-35 -
2014
Titel Latent and active abPPO4 mushroom tyrosinase cocrystallized with hexatungstotellurate(VI) in a single crystal DOI 10.1107/s1399004714013777 Typ Journal Article Autor Mauracher S Journal Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography Seiten 2301-2315 Link Publikation -
2014
Titel Cloning and functional expression in E. coli of a polyphenol oxidase transcript from Coreopsis grandiflora involved in aurone formation DOI 10.1016/j.febslet.2014.07.034 Typ Journal Article Autor Kaintz C Journal FEBS Letters Seiten 3417-3426 Link Publikation -
2015
Titel Kristallstruktur einer pflanzlichen Tyrosinase aus Walnussblättern: die Bedeutung “substratlenkender Aminosäurereste” für die Enzymspezifität DOI 10.1002/ange.201506994 Typ Journal Article Autor Bijelic A Journal Angewandte Chemie Seiten 14889-14893 Link Publikation -
2015
Titel Latent and active aurone synthase from petals of C. grandiflora: a polyphenol oxidase with unique characteristics DOI 10.1007/s00425-015-2261-0 Typ Journal Article Autor Molitor C Journal Planta Seiten 519-537 Link Publikation -
2015
Titel Site-directed mutagenesis around the CuA site of a polyphenol oxidase from Coreopsis grandiflora (cgAUS1) DOI 10.1016/j.febslet.2015.02.009 Typ Journal Article Autor Kaintz C Journal FEBS Letters Seiten 789-797 Link Publikation -
2020
Titel Similar but Still Different: Which Amino Acid Residues Are Responsible for Varying Activities in Type-III Copper Enzymes? DOI 10.1002/cbic.202000647 Typ Journal Article Autor Kampatsikas I Journal ChemBioChem Seiten 1161-1175 Link Publikation