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3-D Zellträgergerüst mit Protein Nano-Ankern (3DS-PNA)

3-D Scaffolds carrying Protein NanoAnchors (3DS-PNA)

Thomas A. Klar (ORCID: 0000-0002-1339-5844)
  • Grant-DOI 10.55776/P26461
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.03.2014
  • Projektende 31.05.2018
  • Bewilligungssumme 344.129 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (20%); Medizinische Biotechnologie (20%); Nanotechnologie (60%)

Keywords

    Nanolithography, STED microscopy, Nano-Structuring, Microfluidics, Thrombocyte Activation, Cell Scaffolds

Abstract Endbericht

Der Schlüssel, um bei ex-vivo Experimenten an Zellen zu aussagekräftigen Ergebnissen, etwa zu deren Wachstum, zur Aktivierung, bis hin zur Differenzierung, zu gelangen, liegt in der Entwicklung möglichst definierter, aber dennoch naturnaher zellulärer Umgebungen. Insbesondere die dreidimensionale Strukturierung des Inneren von Mikrokanälen, um beispielsweise Blutgefäße zu simulieren, ist eine Herausforderung. Bisher eingesetzte Techniken, wie zum Beispiel die Dip-Pen Nano-Lithographie, die Nanoimprint-Lithographie oder die Elektronenstrahllithographie, sind allesamt auf eine zweidimensionale Strukturierung beschränkt. Bei hohen Aspektverhältnissen spricht man bestenfalls von "2,5 facher" Dimensionalität. Die einzige dreidimensionale Technik, die wohldefinierte und auch nicht-periodische Strukturen mit einer Auflösung im Mikrometerbereich erlaubt, ist die Zweiphotonenlithographie (two photon polymerization lithography, 2PPL). Diese ist gut geeignet, um Strukturen zur Anheftung von Zellen zu erzeugen. Allerdings können derzeit keine funktionalen Ankerpunkte im Nanometerbereich hergestellt werden. Nanoskopische Ankerpunkte wären aber interessant, um zum Beispiel feinste Störungen von Gefäßwänden zu simulieren oder als Präsentationspunkte für einzelne Proteine wie Antikörper oder Aktivierungsfaktoren zu dienen. In der Gruppe des Antragstellers T. Klar hat sich jüngst eine Erweiterung der 2PPL etabliert, die Stimulated Emission Depletion (STED) Lithographie, mit der nanoskopische Strukturgrößen in drei Dimensionen erreicht werden können. Die STED Lithographie ist verwandt mit der STED Mikroskopie, die vom Antragsteller mit entwickelt wurde und, die Auflösungen weit unterhalb des Abbe-Limits erlaubt. Es ist das Ziel dieses Projektes, mit STED-2PPL nanoskopische Andockstellen (NanoAnchors) für Antigene, Antikörper oder Aktivierungsfaktoren auf die mit klassischer 2PPL hergestellten mikroskopischen Gerüste (3D Scaffolds) "aufzusetzen". Als Demonstrationsbeispiel sollen derartige "3D Scaffolds carrying Protein NanoAnchors" (3DS-PNA) angewendet werden, um Fragen der Thrombozytenaktivierung nach Verletzungen der Blutgefäße, bei Präsentation bestimmter Proteine wie Aktivierungsfaktoren oder auch bei verschiedenen Flussparametern zu untersuchen. Das Projektkonsortium, bestehend aus dem Institut für Angewandte Physik der JKU Linz (eines von fünf Instituten weltweit, in dem derzeit die STED-Lithographie beherrscht wird) und der Blutzentrale Linz (forschendes Institut des Roten Kreuzes), deckt alle notwendigen Bereiche ab, um das Projekt erfolgreich durchzuführen. Weitere Synergien ergeben sich durch nationale und internationale Kooperationspartner, wie z. B. Prof. Stefan Hell, (MPI Göttingen, Deutschland), Dr. Lrnd Kelemen (Univ. Szeget, Ungarn), Prof. Peter Bettelheim (Krankenhaus der Elisabethinen, Linz) und Dr. Heinz Redl (Ludwig Boltzmann Institut für Traumatologie, Linz). Diese Gruppen könnten eine 3DS-PNA Plattform in ihrer jeweiligen biophysikalischen oder medizinischen Forschung sehr gewinnbringend einsetzen.

Der Schlüssel, um bei ex-vivo Experimenten an Zellen zu aussagekräftigen Ergebnissen, etwa zu deren Wachstum, zur Aktivierung, bis hin zur Differenzierung, zu gelangen, liegt in der Entwicklung möglichst definierter, aber dennoch naturnaher zellulärer Umgebungen. Insbesondere die dreidimensionale Strukturierung des Inneren von Mikrokanälen, um beispielsweise Blutgefäße zu simulieren, ist eine Herausforderung. In diesem Projekt ist es uns gelungen, derartige Strukturen in Flusszellen zu schreiben und an vordefinierten Punkten im dreidimensionalen Raum den von-Willebrand-Blutgerinnungsfaktor zu fixieren. Damit können nun realitätsnahe Studien zur Aktivierung von Blutplättchen und einer daraus resultierenden Bildung eines Blutgerinnsels in Abhängigkeit wichtiger Parameter studiert werden. Diese Parameter sind, unter anderen: die Dichte der von-Willebrand-Faktoren auf der Mikrometer Skala (Größe eines Blutplättchens), die Dichte auf der Skala weniger 10 Nanometer (Größe eines Adhäsionspunktes eines Blutplättchens), die Flussgeschwindigkeit etc. Technologisch wurde damit ein wesentlicher Fortschritt erzielt, da bisher eingesetzte Techniken zur Nanostrukturierung, wie zum Beispiel die Dip-Pen Nano-Lithographie, die Nanoimprint-Lithographie oder die Elektronenstrahllithographie, allesamt auf eine zweidimensionale Strukturierung beschränkt sind. Möglich wurde dies durch die Erweiterung der Zweiphotonenlithographie hin zur Stimulated Emission Depletion (STED) Lithographie, mit der nanoskopische Strukturgrößen in drei Dimensionen erreicht werden können. Die STED Lithographie ist verwandt mit der STED Mikroskopie, die von T. Klar mit entwickelt worden ist, und welche Auflösungen weit unterhalb des Abbe-Limits erlaubt. Neben der Realisierung der dreidimensionalen Strukturen war es ein weiteres Anliegen, diverse Methoden zu untersuchen, die eine möglichst gute Adhäsion von Proteinen, Antigenen, Antikörpern oder Aktivierungsfaktoren erlauben, im Idealfall durch die gezielte, nanolokalisierte Ausbildung von Kovalenten Bindungen. Dies wurde durch mehrere Strategien erreicht. Als weiteres Anwendungsbeispiel wurde ein dreidimensionaler Immunoassay gezeigt, in dem, unter anderem, die für den Cholesterolhaushalt wichtigen Partikel mit Lipoproteinen hoher Dichte untersucht werden können. Die Ergebnisse wurden in 4 wissenschaftlichen Publikationen in angesehenen Journalen veröffentlicht (eine weitere ist eingereicht, eine in Vorbereitung) und in mehr als 20 Vorträgen und Posterpräsentationen auf nationalen und internationalen Konferenzen vorgestellt.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 81%
  • Österreichisches Rotes Kreuz - 19%
Nationale Projektbeteiligte
  • Christian Gabriel, Österreichisches Rotes Kreuz , assoziierte:r Forschungspartner:in

Research Output

  • 189 Zitationen
  • 10 Publikationen
Publikationen
  • 2024
    Titel New buffer systems for photopainting of single biomolecules
    DOI 10.1039/d3lf00125c
    Typ Journal Article
    Autor Naderer C
    Journal RSC Applied Interfaces
    Seiten 110-121
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Multiphoton lithography with protein photoresists
    DOI 10.1016/j.mtbio.2024.100994
    Typ Journal Article
    Autor Sivun D
    Journal Materials Today Bio
    Seiten 100994
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Proteins on Supported Lipid Bilayers Diffusing around Proteins Fixed on Acrylate Anchors
    DOI 10.1021/acs.analchem.8b02588
    Typ Journal Article
    Autor Buchegger B
    Journal Analytical Chemistry
    Seiten 12372-12376
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Multiphoton-Polymerized 3D Protein Assay
    DOI 10.1021/acsami.7b13183
    Typ Journal Article
    Autor Wollhofen R
    Journal ACS Applied Materials & Interfaces
    Seiten 1474-1479
    Link Publikation
  • 2021
    Titel STED lithography in microfluidics for 3D thrombocyte aggregation testing
    DOI 10.1186/s12951-020-00762-8
    Typ Journal Article
    Autor Buchegger B
    Journal Journal of Nanobiotechnology
    Seiten 23
    Link Publikation
  • 2023
    Titel STED-Inspired Cationic Photoinhibition Lithography
    DOI 10.1021/acs.jpcc.3c04394
    Typ Journal Article
    Autor Islam S
    Journal The Journal of Physical Chemistry C
    Seiten 18736-18744
    Link Publikation
  • 2020
    Titel 3D multiphoton lithography using biocompatible polymers with specific mechanical properties
    DOI 10.1039/d0na00154f
    Typ Journal Article
    Autor Buchroithner B
    Journal Nanoscale Advances
    Seiten 2422-2428
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Functional photoresists for sub-diffraction stimulated emission depletion lithography
    DOI 10.1364/ome.7.002538
    Typ Journal Article
    Autor Wollhofen R
    Journal Optical Materials Express
    Seiten 2538
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Streptavidin functionalized polymer nanodots fabricated by visible light lithography
    DOI 10.1186/s12951-015-0084-6
    Typ Journal Article
    Autor Wolfesberger C
    Journal Journal of Nanobiotechnology
    Seiten 27
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Stimulated Emission Depletion Lithography with Mercapto-Functional Polymers
    DOI 10.1021/acsnano.5b05863
    Typ Journal Article
    Autor Buchegger B
    Journal ACS Nano
    Seiten 1954-1959
    Link Publikation

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