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Struktur-Funktionsanalyse des spät-endosomalen LAMTOR Komplexes

Structure-Function analysis of the late endosomal LAMTOR complex

Lukas A. Huber (ORCID: 0000-0003-1116-2120)
  • Grant-DOI 10.55776/P26682
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2014
  • Projektende 31.12.2018
  • Bewilligungssumme 410.760 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (20%)

Keywords

    Signal transduction, Proliferation, Scaffolds, Protein complexes, Late endosomes

Abstract

So genannte Scaffold (Gerüst) Proteine organisieren intrazelluläre Signaltransduktions-Komplexe in Raum und Zeit und steuern dadurch alle essentiellen Vorgänge von Zellen, wie Zellteilung, Wachstum, Differenzierung, Zelltod und Zellmigration. In vorangegangenen Arbeiten konnten wir zeigen, dass die Mitogen-aktivierte Protein Kinase (MAPK) durch die Scaffold Proteine MP1 und p14 an der limitierenden Membran einer ganz bestimmten Organelle aufgehängt ist, dem späten Endosom (1). Dabei bilden p14 und MP1 einen sehr stabilen heterodimeren Komplex und MP1 bindet direkt an die Kinasen MEK1 und ERK1/2. Verankert an der Membran wird der Komplex durch ein weiteres Protein, p18 (2,3). Dieser p18/p14/MP1 (LAMTOR) Komplex steuert auch die Rekrutierung von mTORC an diese Organelle. Weitere Mitglieder des Komplexes, HBXIP/C7orf59, wurden kürzlich identifiziert (4) und Aktivität als Guanin Nukleotid Austauschfaktor für die RagA+B GTP bindenden Proteine nachgewiesen, um dadurch die Menge der vorhandenen intrazellulären Aminosäuren zu messen (5) und Zellwachstum zu steuern. Wir konnten durch konditionelle Gendeletion von p14 im Mausmodell zeigen, dass der p14/Mp1 Teil des Komplexes endosomalen Transport und Zellwachstum kontrolliert (6). Weiters konnten wir erstmals eine neue Immun-Defizienz in Kindern entdecken, die durch eine genetische Mutation in p14 schwere Schädigungen des Lysosoms hervorruft (7). Auch der p18-mTORC teil des Komplexes wurde Schädigungen am Lysosom zugeordnet (8). Damit reguliert dieser Komplexnicht nur MAPKundmTORC1Signalweiterleitung sondern auch endosomale/lysosomale Biogenes und Integrität. Welche grundlegend neuen Aspekte werden in diesem Projekt untersucht? Dieses Projekt wird eine detaillierte atomare Aufklärung der Proteinkristallstrukturen des gesamten LAMTOR Komplexes liefern. Diese Information wird dazu dienen funktionelle Experimente zu planen, um die einzelnen Komponenten auf ihre biologische Funktion in der Signalweiterleitung und Signaldifferenzierung besser verstehen zu können. Unsere Arbeitshypothese beinhaltet, dass der LAMTOR Komplex so ähnlich am, der späten Endosom assembliert wie ein anderer multifunktionaler Protein Komplex, der sogenannte TRAPP Komplex (trafficking protein particle). Die entscheidenden Fragen, die in diesem Projekt beantwortet werden sollen, lauten: (1.) In welcher Zusammensetzung und Stöchiometrie assemblieren die LAMTOR Komponenten? (2.) Gibt da ein generelles Ordnungsprinzip, dass auch in anderen Komplexen in Zellen gefunden werden kann? (3.) Wie reguliert der LAMTOR Komplex die endosomale/lysosomale Biogenese? Um diese Fragen zu beantworten planen wir, (1.) die Kristallstruktur des gesamten aus allen Untereinheiten bestehenden Komplexes aufzuklären und (2.) diese Informationen mit bereits gelösten Strukturen zu vergleichen (z.B. TRAPP Komplex, aber auch andere); (3.) erste Hinweise weiter zu untersuchen, dass so genannte SNARE Bindungsdomänen darin enthalten sein könnten, was die gestörte Organellenbiogenese erklären könnte. Zusammenfassend, werden die vorgeschlagenen Studien maßgeblich dazu beitragen könnten, die Rolle des LAMTOR Komplexes in der Koordination und Weiterleitung verschiedener intrazellulärer Signalkaskaden und die Biogenese intrazellulärer Organellen besser zu verstehen.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Innsbruck - 100%

Research Output

  • 1030 Zitationen
  • 10 Publikationen
Publikationen
  • 2020
    Titel G3BP1 tethers the TSC complex to lysosomes and suppresses mTORC1 in the absence of stress granules
    DOI 10.1101/2020.04.16.044081
    Typ Preprint
    Autor Prentzell M
    Seiten 2020.04.16.044081
    Link Publikation
  • 2017
    Titel LAMTOR/Ragulator is a negative regulator of Arl8b- and BORC-dependent late endosomal positioning
    DOI 10.1083/jcb.201703061
    Typ Journal Article
    Autor Filipek P
    Journal Journal of Cell Biology
    Seiten 4199-4215
    Link Publikation
  • 2019
    Titel LAMTOR/Ragulator regulates lipid metabolism in macrophages and foam cell differentiation
    DOI 10.1002/1873-3468.13579
    Typ Journal Article
    Autor Lamberti G
    Journal FEBS Letters
    Seiten 31-42
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Biogenesis of lysosome-related organelles complex-1 (BORC) regulates late endosomal/lysosomal size through PIKfyve-dependent phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate
    DOI 10.1111/tra.12679
    Typ Journal Article
    Autor Yordanov T
    Journal Traffic
    Seiten 674-696
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Lysosomal signaling in control of degradation pathways
    DOI 10.1016/j.ceb.2016.01.006
    Typ Journal Article
    Autor Huber L
    Journal Current Opinion in Cell Biology
    Seiten 8-14
    Link Publikation
  • 2015
    Titel SLC38A9 is a component of the lysosomal amino acid sensing machinery that controls mTORC1
    DOI 10.1038/nature14107
    Typ Journal Article
    Autor Rebsamen M
    Journal Nature
    Seiten 477-481
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Homeostatic feedback between lysosomal mTORC1 and mTORC2-AKT signaling controls nutrient uptake in brown adipose tissue
    DOI 10.1101/2022.05.17.492242
    Typ Preprint
    Autor Liebscher G
    Seiten 2022.05.17.492242
  • 2014
    Titel LAMTOR2 regulates dendritic cell homeostasis through FLT3-dependent mTOR signalling
    DOI 10.1038/ncomms6138
    Typ Journal Article
    Autor Scheffler J
    Journal Nature Communications
    Seiten 5138
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Crystal structure of the human lysosomal mTORC1 scaffold complex and its impact on signaling
    DOI 10.1126/science.aao1583
    Typ Journal Article
    Autor De Araujo M
    Journal Science
    Seiten 377-381
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Spatio-Temporal Parameters of Endosomal Signaling in Cancer: Implications for New Treatment Options
    DOI 10.1002/jcb.25418
    Typ Journal Article
    Autor Stasyk T
    Journal Journal of Cellular Biochemistry
    Seiten 836-843
    Link Publikation

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