FAME: Vollautomatische MRT-basierte Alterschätzung von Jugendlichen
FAME: Fully Automatic MRI-based Age Estimation of Adolescents
Wissenschaftsdisziplinen
Andere Humanmedizin, Gesundheitswissenschaften (30%); Informatik (70%)
Keywords
-
Automatic Forensic Age Estimation,
Magnetic Resonance Imaging,
Medical Computer Vision,
Machine Learning
Das Ziel des beantragten Projektes FAME ist die Erforschung neuer Methoden zur radiologischen Altersschätzung von Jugendlichen. Sowohl im klinischen Kontext, als auch vor allem für forensische Anwendungen, hier insbesondere für die Altersschätzung bei unbegleiteten jugendlichen Asylwerbern ohne Identifikationsdokumente, gibt es einen großen Bedarf für eine zeitgemäße radiologische Altersschätzungsmethode. Diese sollte ohne Strahlenbelastung auskommen, was bei den etablierten Methoden, welche auf Röntgenbildern oder Computertomografie aufbauen, unglücklicherweise der Fall ist. Da speziell in der forensischen Altersschätzung jugendlicher Asylwerber, welche als gesunde Patienten einzustufen sind, eine Untersuchung auf Basis ionisierender Röntgenstrahlung nur durch eine explizite Ausnahme in der Gesetzgebung erlaubt ist, stellt sich diese Forschung an Alternativen als hoch relevant dar, auch im Hinblick auf die laufend steigende Zahl an Asylwerbern, welche in den europäischen Staaten Zuflucht vor Verfolgung suchen. Die Magnetresonanztomografie (MRT) stellt in Hinsicht auf eine alternative Methode zur Röntgenstrahlung für die Altersschätzung eine hoch interessante Variante dar. Darüber hinaus verspricht MRT jedoch auch noch den Weg für genauere Altersschätzungen zu ebnen, da im Gegensatz zu zwei-dimensionalen Röntgenbildern in der Form von Projektionen, drei-dimensionale Information der Anatomie zur Verfügung steht. Im Zusammenspiel mit modernen Methoden der medizinischen Bildanalyse auf der Basis von Maschinellem Lernen, ist weiters eine verbesserte Wiederholbarkeit der Altersschätzung zu erwarten, da durch automatisierte Algorithmen die oft subjektiven Methoden der Radiologie, welche auf den Vergleich der untersuchten Patienten mit teilweise veralteten bild-basierten Atlanten, ersetzt werden können. Forschungsziel dieses inter-disziplinären Projektes am Ludwig Boltzmann Institut für Klinisch Forensische Bildgebung ist es, gemeinsam mit dem Institut für Maschinelles Sehen und Darstellen an der Technischen Universität Graz, eine multi-faktorielle Altersschätzungsmethode, welche auf MRT Daten der Hände, des Schlüsselbeins und der Weisheitszähne aufbaut, mittels Methoden der medizinischen Bildanalyse zu entwickeln. Diese neuartige, automatisierte Methode, welche einen Beitrag zur Forschung an Lokalisierung anatomischer Strukturen, Regression zur Altersbestimmung aus MR Daten, Interaktion zwischen Radiologen und Algorithmen zur Selektion alters-relevanter Merkmale und Fusion von Schätzungen aus den untersuchten komplementären anatomischen Strukturen leistet, ist für den späteren Einsatz bei jugendlichen, unbegleiteten Asylwerbern, die ohne anerkannte Dokumente nach Österreich kommen, gedacht, und soll im ersten Schritt technisch erforscht werden, als Vorbereitung auf eine Validierungsstudie, welche den Ersatz der etablierten Methodik durch einen neuen Gold Standard zum Ziel hat.
Im Rahmen des FWF Projektes FAME Fully Automatic MRI-based Age Estimation of Adolescents wurde am Ludwig Boltzmann Institut für Klinisch Forensische Bildgebung in Graz gemeinsam mit dem Institut für Maschinelles Sehen und Darstellen der Technischen Universität Graz eine Software entwickelt, welche es ermöglicht aus Aufnahmen der Magnetresonanztomographie (MRT) Bildgebung eine Schätzung des chronologischen Alters von Jugendlichen vollständig automatisiert durchzuführen. Die chronologische Altersschätzung von Jugendlichen hat in den letzten Jahren eine hohe Aufmerksamkeit durch die Migrationsbewegungen nach Europa erfahren. Eine der Herausforderungen im Rahmen dieser Migrationsbewegungen ist es, herauszufinden, ob Asylwerber, welche über keine gültigen Ausweisdokumente verfügen, minder- oder volljährig sind. Der Stand der Technik in Österreich, aber auch in anderen europäischen Ländern, besteht darin, die Knochen- und Zahnentwicklung mittels Röntgen- und Computertomographie (CT) Aufnahmen zu beurteilen, und damit ein sehr wahrscheinliches Mindestalter abzuschätzen. Im FWF Projekt FAME haben wir diese bestehende Methode insofern verbessert, als dass wir (1) durch den Einsatz der MRT Bildgebung keinerlei potentiell schädliche Röntgenstrahlung bei gesunden Probanden benötigen, (2) dreidimensionale Strukturen der betrachteten anatomischen Strukturen (Hand, Schlüsselbeine, Weisheitszähne) erfassen, und (3) eine objektivierte, reproduzierbare Altersschätzung durch den Einsatz einer Altersschätzungssoftware durchführen können. Die entwickelte Altersschätzungssoftware erforderte Grundlagenforschung in der medizinischen Bildanalyse. Im Rahmen des Projekts haben wir neue Methoden zur vollautomatischen Lokalisierung von anatomischen Strukturen aus MRT Bildern entwickelt. Darüberhinaus waren wir die erste Gruppe, welche eine Vorhersagesoftware zur multi- faktoriellen (Hand, Schlüsselbein, Weisheitszahn) chronologischen Altersschätzung in der Literatur vorgestellt haben. Unsere neuen Methoden nutzen aktuelle Ansätze des Maschinellen Lernens (Deep Learning) um diese Probleme der medizinischen Bildanalyse zu lösen. Dazu haben wir einen Datensatz aus MRT Bildern von 320 freiwilligen kaukasischen Probanden, welcher am Ludwig Boltzmann Institut für Klinisch Forensische Bildgebung aufgenommen wurde, zum Trainieren dieser Methoden herangezogen. Unsere entwickelte Methodik kann nun in einem nächsten Schritt auf größeren, heterogeneren Datensätzen validiert werden, um in der Praxis im Asylverfahren eingesetzt werden zu können. Dies erfordert einen Zusammenschluss im europäischen Kontext und müsste im Rahmen eines EU Horizon Projektes durchgeführt werden. Bei erfolgreicher Validierung unseres Ansatzes wäre es denkbar, den derzeitigen Stand der Technik durch eine Methode zu ersetzen, welche an gesunden Personen ohne den Einsatz ionisierender Röntgenstrahlung eingesetzt werden kann.
- Horst Bischof, Technische Universität Graz , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 2898 Zitationen
- 34 Publikationen
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2019
Titel Segmenting and tracking cell instances with cosine embeddings and recurrent hourglass networks DOI 10.1016/j.media.2019.06.015 Typ Journal Article Autor Payer C Journal Medical Image Analysis Seiten 106-119 Link Publikation -
2019
Titel Automated age estimation from MRI volumes of the hand DOI 10.1016/j.media.2019.101538 Typ Journal Article Autor Štern D Journal Medical Image Analysis Seiten 101538 Link Publikation -
2019
Titel Quantitative CT-derived vessel metrics in idiopathic pulmonary fibrosis: A structure–function study DOI 10.1111/resp.13485 Typ Journal Article Autor Jacob J Journal Respirology Seiten 445-452 Link Publikation -
2019
Titel Social Networks of Austrian Refugee-Migrants from the Anschluss in Australia – An Analysis of Meaning Structures DOI 10.1163/23519924-00501002 Typ Journal Article Autor Strobl P Journal Journal of Migration History Seiten 53-79 -
2019
Titel Octave equivalence perception is not linked to vocal mimicry: budgerigars fail standardized operant tests for octave equivalence DOI 10.1163/1568539x-00003538 Typ Journal Article Autor Wagner B Journal Behaviour Seiten 479-504 Link Publikation -
2019
Titel Integrating spatial configuration into heatmap regression based CNNs for landmark localization DOI 10.1016/j.media.2019.03.007 Typ Journal Article Autor Payer C Journal Medical Image Analysis Seiten 207-219 Link Publikation -
2016
Titel Argument from Personal Narrative DOI 10.11612/resphil.2016.93.3.5 Typ Journal Article Autor Dormandy K Journal Res Philosophica Seiten 601-620 Link Publikation -
2016
Titel Automatic Intervertebral Disc Localization and Segmentation in 3D MR Images Based on Regression Forests and Active Contours DOI 10.1007/978-3-319-41827-8_13 Typ Book Chapter Autor Urschler M Verlag Springer Nature Seiten 130-140 -
2016
Titel Gland segmentation in colon histology images: The glas challenge contest DOI 10.1016/j.media.2016.08.008 Typ Journal Article Autor Sirinukunwattana K Journal Medical Image Analysis Seiten 489-502 Link Publikation -
2016
Titel Automatic Localization of Locally Similar Structures Based on the Scale-Widening Random Regression Forest DOI 10.1109/isbi.2016.7493534 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Stern D Seiten 1422-1425 -
2016
Titel Impaired High-Density Lipoprotein Anti-Oxidative Function Is Associated With Outcome in Patients With Chronic Heart Failure DOI 10.1161/jaha.116.004169 Typ Journal Article Autor Schrutka L Journal Journal of the American Heart Association Link Publikation -
2016
Titel Evaluation and comparison of 3D intervertebral disc localization and segmentation methods for 3D T2 MR data: A grand challenge DOI 10.1016/j.media.2016.08.005 Typ Journal Article Autor Zheng G Journal Medical Image Analysis Seiten 327-344 -
2016
Titel Automated integer programming based separation of arteries and veins from thoracic CT images DOI 10.1016/j.media.2016.05.002 Typ Journal Article Autor Payer C Journal Medical Image Analysis Seiten 109-122 -
2018
Titel Introduction: Online Publics in Muslim Southeast Asia DOI 10.1163/22142312-12340090 Typ Journal Article Autor Slama M Journal Asiascape: Digital Asia Seiten 3-31 Link Publikation -
2018
Titel Reducing acquisition time for MRI-based forensic age estimation DOI 10.1038/s41598-018-20475-1 Typ Journal Article Autor Neumayer B Journal Scientific Reports Seiten 2063 Link Publikation -
2018
Titel Disagreement from the Religious Margins DOI 10.11612/resphil.1686 Typ Journal Article Autor Dormandy K Journal Res Philosophica Seiten 371-395 Link Publikation -
2018
Titel Automatic Age Estimation and Majority Age Classification From Multi-Factorial MRI Data DOI 10.1109/jbhi.2018.2869606 Typ Journal Article Autor Tern D Journal IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics Seiten 1392-1403 Link Publikation -
2016
Titel Applicability of Greulich–Pyle and Tanner–Whitehouse grading methods to MRI when assessing hand bone age in forensic age estimation: A pilot study DOI 10.1016/j.forsciint.2016.06.016 Typ Journal Article Autor Urschler M Journal Forensic Science International Seiten 281-288 -
2016
Titel Rebranding Islam. Piety, Prosperity, and a Self-Help Guru, written by James Bourk Hoesterey DOI 10.1163/22134379-17201010 Typ Journal Article Autor Slama M Journal Bijdragen tot de Taal-, Land- en Volkenkunde Seiten 127-130 Link Publikation -
2015
Titel Atherosclerosis Susceptibility in Mice Is Independent of the V1 Immunoglobulin Heavy Chain Gene DOI 10.1161/atvbaha.115.305990 Typ Journal Article Autor Centa M Journal Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology Seiten 25-36 Link Publikation -
2015
Titel S1P2/G12/13 Signaling Negatively Regulates Macrophage Activation and Indirectly Shapes the Atheroprotective B1-Cell Population DOI 10.1161/atvbaha.115.306066 Typ Journal Article Autor Grimm M Journal Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology Seiten 37-48 Link Publikation -
2017
Titel What ADAMTS13 does in the liver… DOI 10.1160/th16-11-0839 Typ Journal Article Autor Wojta J Journal Thrombosis and Haemostasis Seiten 06-06 -
2017
Titel Colistin dampens fibrinolysis and endothelial activation during endotoxaemia DOI 10.1160/th17-03-0196 Typ Journal Article Autor Schoergenhofer C Journal Thrombosis and Haemostasis Seiten 1714-1721 Link Publikation -
2017
Titel Integrating geometric configuration and appearance information into a unified framework for anatomical landmark localization DOI 10.1016/j.media.2017.09.003 Typ Journal Article Autor Urschler M Journal Medical Image Analysis Seiten 23-36 Link Publikation -
2017
Titel Forensic age estimation by morphometric analysis of the manubrium from 3D MR images DOI 10.1016/j.forsciint.2017.05.005 Typ Journal Article Autor Vera N Journal Forensic Science International Seiten 21-29 -
2017
Titel Segmentation and classification of colon glands with deep convolutional neural networks and total variation regularization DOI 10.7717/peerj.3874 Typ Journal Article Autor Kainz P Journal PeerJ Link Publikation -
2017
Titel Creative and Lucrative Da?wa: The Visual Culture of Instagram amongst Female Muslim Youth in Indonesia DOI 10.1163/22142312-12340085 Typ Journal Article Autor Nisa E Journal Asiascape: Digital Asia Seiten 1-32 Link Publikation -
2014
Titel Update on Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension DOI 10.1161/circulationaha.114.009309 Typ Journal Article Autor Lang I Journal Circulation Seiten 508-518 Link Publikation -
2014
Titel Association Between the Metabolic Syndrome, Its Individual Components, and Unprovoked Venous Thromboembolism DOI 10.1161/atvbaha.114.304085 Typ Journal Article Autor Ageno W Journal Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology Seiten 2478-2485 Link Publikation -
2014
Titel Coronary Neutrophil Extracellular Trap Burden and Deoxyribonuclease Activity in ST-Elevation Acute Coronary Syndrome Are Predictors of ST-Segment Resolution and Infarct Size DOI 10.1161/circresaha.116.304944 Typ Journal Article Autor Mangold A Journal Circulation Research Seiten 1182-1192 Link Publikation -
2014
Titel Coinhibitory Suppression of T Cell Activation by CD40 Protects Against Obesity and Adipose Tissue Inflammation in Mice DOI 10.1161/circulationaha.113.008055 Typ Journal Article Autor Wolf D Journal Circulation Seiten 2414-2425 Link Publikation -
2014
Titel Splenectomy Is Modifying the Vascular Remodeling of Thrombosis DOI 10.1161/jaha.113.000772 Typ Journal Article Autor Frey M Journal Journal of the American Heart Association Link Publikation -
2015
Titel Anatomical landmark detection in medical applications driven by synthetic data DOI 10.1109/iccvw.2015.21 Typ Conference Proceeding Abstract Autor Riegler G Seiten 85-89 -
2014
Titel Defective Angiogenesis Delays Thrombus Resolution DOI 10.1161/atvbaha.113.302991 Typ Journal Article Autor Alias S Journal Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology Seiten 810-819 Link Publikation