Molekulare Grundlage der Flavanon 4-Reduktase-Aktivität
Molecular background of the flavanone 4-reductase activity
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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Dihydroflavonol 4-reductase,
Flavanone 4-reductase activity,
Substrate Specificity,
Flavanones
Die Dihydroflavonol 4-reduktase (DFR) ist ein Schlüsselenzym in der Flavonoid-Biosynthese und katalysiert die Bildung der Vorstufen für die Biosynthese der Anthocyan-Farbstoffe und der monomeren Flavan-3-ole, die die Grundbausteine der Tannine sind. Neben den Dihydroflavonolen, die die wichtigsten Substrate darstellen, können aber auch Flavanone umgesetzt werden. Letzteres wird als Flavanon-4-Reduktase (FNR) Aktivität bezeichnet. Die beiden Flavonoidklassen unterscheiden sich nur durch eine Hydroxylgruppe an der Position 3 des Heterozyklus. Im vorliegenden Projekt soll auf molekularer Ebene die Fähigkeit der DFR untersucht werden, auch Flavanone statt Dihydroflavonole als Substrate umzusetzen. Der überwiegende Teil der DFRs zeigt eine starke Präferenz gegenüber Dihydroflavonolen. Allerdings konnten wir weitere DFR-Typen identifizieren, die entweder nur Dihydroflavonole oder beide Substrate im gleichen Ausmaß akzeptieren. Im Projekt sollen die drei DFR-Typen mit unterschiedlicher Flavanon/Dihydroflavonol-Akzeptanz charakterisiert und weitere Vertreter der seltenen DFR-Typen in verschiedenen Pflanzen identifiziert werden. Ein SequenzvergleichderdreiTypen zeigte fünf signifikante Unterschiede in der Aminosäuresequenz rund um die mutmaßliche Substratbindungsstelle, die essentiell für die Koordination der Hydroxylgruppe in Position 3 und damit der Fähigkeit/Unfähigkeit Dihydroflavonole/Flavanone zu akzeptieren sein könnten. Im Projekt sollen kinetische Studien mit GST-Tag-gereinigten, rekombinanten DFRs aus verschiedenen Pflanzenarten und Dihydroflavonolen bzw. Flavanonen als Substrat durchgeführt werden. Die Ergebnisse sollen mit den Daten der Sequenzanalyse jener Aminosäurebereiche korreliert werden, die für die Flavanon/Dihydroflavonol-Akzeptanz verantwortlich sein dürften. In einem weiterenSchritt sollen auf Ebeneder Aminosäuresequenz Punktmutationen durchgeführt werden, um die Substrat-Akzeptanz entsprechend der Hypothesen zu verändern. Letztendlich sollen dadurch jene Aminosäuren in der Sequenz bestimmt werden, welche für die Akzeptanz von Dihydroflavonolen und/oder Flavanonen verantwortlich sind. Das genaue Verständnis des ersten Schritts in der Bildung der 3-Deoxyflavonoide kann einen wichtigen Beitrag zur Untersuchung der Biosynthese von 3-Deoxyanthocyanidin- Phytoalexinen und antimikrobiellen Inhaltsstoffen im Allgemeinen leisten, was zu einem besseren Verständnis von Wirt-Pathogen-Beziehungen führt.
Die Dihydroflavonol 4-Reduktase (DFR) ist ein Schlüsselenzym der Flavonoid-Biosynthese und katalysiert die Bildung der Flavan 3,4-diole. Neben den Dihydroflavonolen können auch Flavanone als Substrat dienen (Flavanon 4-Reduktase (FNR) Aktivität). Die Substratspezifität der DFR ist komplex und hat einen wesentlichen Einfluss auf das Flavonoid-Spektrum in Pflanzen. Das Projekt beschäftigte sich mit der DFR auf molekularer Ebene, insbesondere der verschiedenen Substratspezifitäten betreffend (i) der Dihydroflavonole/Flavanone, sowie (ii) des Hydroxylierungsmusters im B-Ring der Mais-DFRs A1 und A1*. In silico-Analysen der mutmaßlichen Substrat-Erkennungsregion der DFRs zusammen mit verschiedenen Kristallstrukturmodellen ermöglichten es uns, spezifische Aminosäuren zu definieren, welche für die Substratspezifität verantwortlich sein könnten. Wir klonierten mehrere DFRs von verschiedenen Pflanzen, exprimierten sie heterolog in E. coli und testeten die Substratspezifität in Enzymtests. Positions-spezifische Mutationen und chimäre DFRs wurden erzeugt, um die Möglichkeit einer Interkonversion zwischen den DFR-Typen zu beurteilen. Betreffend der Dihydroflavonol/Flavanon-Akzeptanz konnte bislang keine klare, wechselseitige Interkonversion zwischen den DFR-Typen erreicht werden. Allerdings konnten Tendenzen ausgemacht werden und damit das Verständnis bezüglich möglicher Interaktionen bei der mutmaßlichen Substratbindungsstelle erweitert werden. Kinetische Daten für die Mais A1 und A1* DFR zeigten eine konträre Substratspezifität betreffend des Hydroxylierungsmusters im B-Ring. Durch positions-spezifische Mutationen konnten wir Aminosäuren definieren, welche für die unterschiedliche Substratspezifität verantwortlich sind. Eine komplette Interkonversion zwischen den beiden DFRs konnte durch die Veränderung von nur 2-3 Aminosäuren erreicht werden. Weiters wurde eine spezifische, qualitative PCR-Methode entwickelt, um eine bestimmte gentechnisch veränderte orange Petunie nachzuweisen, welche die A1 DFR aus Mais enthält und aus einem wissenschaftlichen Züchtungsexperiment aus den 1980er Jahren stammt. Ergebnisse aus dem Projekt können das Verständnis der Interaktionen des Substrat/Protein-Komplexes von DFRs verbessen und eröffnen neue Möglichkeiten für Strategien, um Pflanzen mit verändertem Flavonoid-Spektrum herzustellen, was z.B. bezüglich Blütenfarben, Inhaltsstoffzusammensetzung von pflanzlichen Lebensmitteln und phytopathologischen Aspekten von Bedeutung sein kann.
- Technische Universität Wien - 100%
Research Output
- 81 Zitationen
- 22 Publikationen
- 1 Methoden & Materialien
- 1 Weitere Förderungen
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2020
Titel Event-specific qualitative polymerase chain reaction analysis for two T-DNA copies in genetically modified orange Petunia DOI 10.1007/s11240-020-01871-w Typ Journal Article Autor Haselmair-Gosch C Journal Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) Seiten 415-424 Link Publikation -
2019
Titel Re-investigating substrate specificity of dihydroflavonol 4-reductase with respect to the B-ring hydroxylation pattern of substrates DOI 10.17660/actahortic.2019.1242.130 Typ Journal Article Autor Halbwirth H Journal Acta Horticulturae Seiten 889-898 -
2018
Titel Additional file 8: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164932.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar ‘Harvest Orange’ shows a nonsense mutation in a flavonoid 3’-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.1186/s12870-018-1424-0 Typ Journal Article Autor Nitarska D Journal BMC Plant Biology Seiten 216 Link Publikation -
2018
Titel Great Cause—Small Effect: Undeclared Genetically Engineered Orange Petunias Harbor an Inefficient Dihydroflavonol 4-Reductase DOI 10.3389/fpls.2018.00149 Typ Journal Article Autor Haselmair-Gosch C Journal Frontiers in Plant Science Seiten 149 Link Publikation -
2017
Titel A wild ‘albino’ bilberry (Vaccinium myrtillus L.) from Slovenia shows three bottlenecks in the anthocyanin pathway and significant differences in the expression of several regulatory genes compared to the common blue berry type DOI 10.1371/journal.pone.0190246 Typ Journal Article Autor Zorenc Z Journal PLOS ONE Link Publikation -
2018
Titel Additional file 6: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164905.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 1: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164821 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 1: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164821.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 2: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164842 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 2: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164842.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 3: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164860 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 3: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164860.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 4: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164875 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 4: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164875.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 5: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164884 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 5: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164884.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 6: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164905 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 8: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164932 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 7: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164920.v1 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel Additional file 7: of The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.6084/m9.figshare.7164920 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation -
2018
Titel The rare orange-red colored Euphorbia pulcherrima cultivar 'Harvest Orange' shows a nonsense mutation in a flavonoid 3'-hydroxylase allele expressed in the bracts DOI 10.15488/4267 Typ Other Autor Nitarska D Link Publikation
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2020
Titel Event-specific qualitative PCR analysis method for detection of a specific gm orange petunia Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich
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2020
Titel SCIENTIFIC & TECHNOLOGICAL COOPERATION (WTZ Programme) Typ Travel/small personal Förderbeginn 2020