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Regulation des Zytoskeletts durch lipid-aktivierte Kinasen

Lipid-activated kinases in cell shape and motility

Thomas Ashley Leonard (ORCID: 0000-0001-6853-666X)
  • Grant-DOI 10.55776/P28135
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.12.2015
  • Projektende 30.11.2020
  • Bewilligungssumme 434.228 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Cytoskeleton, Kinase, Lipid, Signaling, Autoinhibition, Membrane

Abstract Endbericht

Zellen müssen ihre Form ändern um zu wachsen, sich zu vermehren und zu teilen. Zusätzlich erfüllen viele Zellen sehr spezielle Funktionen: zytotoxische T-Lymphozyten müssen fähig sein Antigene zu erkennen und zytotoxische Enzyme in gezielter und kontrollierter Art und Weise freizusetzen; Fortsätze von Nervenzellen müssen sich auf ihren Bestimmungsort zubewegen können, und Zellen der Bauchspeicheldrüse müssen in der Lage sein Hormone in den Blutkreislauf zu sezernieren. Das Aktomyosin-Zytoskelett ermöglicht es Zellen, ihre Form als Reaktion auf äußere Signale zu ändern. Die Prozesse der Zellmigration und Zelladhesion, der Zellteilung, Chemotaxis und des Vesikeltransports beruhen auf der koordinierten Umgestaltung struktureller Bestandteile innerhalb der Zelle. Um diese Prozesse zu steuern, muss die Zelle fähig sein, extrazelluläre Reize wahrzunehmen, das Signal über die Plasmamembran zu übermitteln und die entsprechenden intrazellulären Antworten einzuleiten. Kinasen die durch Lipide und kleine GTPasen aktiviert werden, kontrollieren essentielle Aspekte der Aktin- und Myosinfunktion in eukaryontischen Zellen. Für pathophysiologische Prozesse wie die Metastasierung von Krebszellen und die Degeneration von Nervenzellen ist ein Zusammenhang mit einer Dysfunktion des Zytoskeletts beschrieben worden. Obwohl inzwischen viele Effektormoleküle identifiziert worden sind und in vielen Fällen außerdem die spezifische Aminosäure, die phosphoryliert wird bekannt ist, bleibt der Mechanismus durch den die Signale über die Membran übermittelt werden weitestgehend unverstanden. Der Mangel an Informationen auf struktureller Ebene über Volllängenkinasen hat bis heute ein komplettes Verständnis bezüglich der Regulation dieser Prozesse verhindert. Dieses Proposal strebt an, dieses Defizit durch die Anwendung biophysikalischer, biochemischer und zellbiologischer Methoden und das Studium der Rock und MRCK Familie der AGC-Kinasen zu beheben. Wir streben an, Antworten auf die folgenden Fragen zu geben: Was ist der oligomere Zustand der aktiven und inaktiven Kinasen in der Zelle? Welches sind die lipiden sekundären Botenstoffe und wie ist eine Membranbindung an die Aktivierung der Kinasen gekoppelt? Wir werden außerdem untersuchen wie diese Kinasen verschiedene membran-basierte Signale integrieren, um eine spezifische nachgeschaltete Antwort auszulösen. Wir hoffen damit die molekularen Details der Kommunikation zwischen Membran und Zytoskelett aufzuklären, ein Prozess der für alle eukaryontischen Zellen von entscheidender Bedeutung ist.

Organismen bestehen aus Millionen spezialisierter Zellen die wichtige, lebenserhaltende Aufgaben erfüllen und helfen auf verschiedenste Umwelteinflüsse zu reagieren. Für jede einzelne Zelle müssen Wachstum, Differenzierung, Stoffwechsel, Form und Fortbewegung reguliert werden, um sicherzustellen, dass alle Prozesse mit hoher Präzision zur richtigen Zeit und am richtigen Ort ablaufen. Kinasen sind Proteine, die Signale übertragen und damit an der Regulierung dieser wichtigen Prozesse beteiligt sind. Mit Hilfe ihrer Kinasedomäne katalysieren sie die Anheftung eines Phosphatmoleküls an ein anderes Protein, wodurch dessen Funktionsweise beeinflusst und verändert wird. Zellmembranen sind dabei wichtige Schnittstellen an denen zahlreiche Kinasen Phosphorylierungen ausüben und reguliert werden. Wir haben in unserer Forschungsarbeit einige essentielle Proteinkinasen und ihre Wirkungsweise und Regulierung an Zellmembranen untersucht. Wir können zeigen, dass die Proteinkinase ROCK, die an der Steuerung der Zellform und der Koordination der Fortbewegung beteiligt ist, über die räumliche Anordnung ihrer Kinasedomäne zum Substrat reguliert wird. Die Kinasedomäne in ROCK ist über eine Spiralkette mit den membranbindenden Domänen verbunden. Die Länge der Spiralkette diktiert dabei, wo die Kinasedomäne in der Zelle positioniert wird und agiert als ein molekulares Maßband. Dabei ist die Länge dieses Maßbandes im Laufe von Millionen von Jahren erhalten geblieben. Wir demonstrieren, dass eine Verkürzung der Spiralkette zum Abbruch der Weiterleitung der Signale in der Zelle führt, obwohl die enzymatische Aktivität von ROCK bestehen bleibt. Es handelt sich hierbei um einen völlig neuen Mechanismus der Regulierung von Kinasen durch eine spezifische räumliche Kontrolle. Akt ist eine weitere Proteinkinase, die unzählige wichtige Prozesse bezüglich Wachstum und Stoffwechsel der Zelle reguliert. Die Aktivierung von Akt wird durch die Kombination zweier Signale erreicht. Erstens bindet Akt an ein kleines Molekül in der Membran, PIP3, und zweitens wird Akt selbst durch zwei andere Proteinkinasen phosphoryliert. Eine wichtige Erkenntnis unserer Studie ist, dass Akt direkt durch die Bindung an PIP3 aktiviert wird, die Phosphorylierung allein jedoch nicht ausreichend ist, um Akt in den aktiven Zustand zu versetzen. Mit anderen Worten, die Aktivität von Akt ist örtlich beschränkt und zwar auf Membranen die PIP3 enthalten. Das hat weitreichende Auswirkungen auf die Kontrolle zellulärer Prozesse. Außerdem gibt unsere Arbeit Aufschluss darüber, wie seltene Mutationen in Krebs und Diabetes die krankhafte Aktivierung von Akt verursachen, die zu gesundheitsschädlichem Wachstum von Zellen und Gewebe führt. Proteinkinase D (PKD) kontrolliert die Sekretion zellulärer Produkte, ein grundlegender Prozess der von einem Zellkompartiment, dem sogenannten Trans-Golgi Netzwerk, gesteuert wird. Wir haben eine zuvor unbekannte Domäne in PKD identifiziert und strukturell charakterisiert. Diese neue, Ubiquitin-ähnliche Domäne (ULD), ist verantwortlich für die Dimerisierung von PKD, ein Vorgang bei dem sich zwei PKD Moleküle zu einer funktionalen Einheit zusammenschließen. Die Dimerisierung ist dabei wesentlich für den Aktivierungsprozess der Proteinkinase PKD. Zusammenfassend präsentiert unsere Forschungsarbeit bedeutende neue Erkenntnisse bezüglich der Regulierung einiger essentieller Signalmoleküle.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%

Research Output

  • 907 Zitationen
  • 24 Publikationen
  • 9 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2022
    Titel Structure and regulation of the myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase
    DOI 10.1101/2022.03.11.483953
    Typ Preprint
    Autor Truebestein L
    Seiten 2022.03.11.483953
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Structure and regulation of the myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase
    DOI 10.1016/j.str.2023.02.002
    Typ Journal Article
    Autor Truebestein L
    Journal Structure
    Link Publikation
  • 2021
    Titel In vitro reconstitution of Sgk3 activation by phosphatidylinositol-3-phosphate
    DOI 10.1101/2021.04.13.439688
    Typ Preprint
    Autor Pokorny D
    Seiten 2021.04.13.439688
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Structures of three MORN repeat proteins and a re-evaluation of the proposed lipid-binding properties of MORN repeats
    DOI 10.3204/pubdb-2020-05031
    Typ Other
    Autor Grishkovskaya I
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Structures of three MORN repeat proteins and a re-evaluation of the proposed lipid-binding properties of MORN repeats
    DOI 10.1371/journal.pone.0242677
    Typ Journal Article
    Autor Sajko S
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Mechanism of activation of an ancestral TEC kinase by PIP3
    DOI 10.1101/2025.05.22.653117
    Typ Preprint
    Autor Krötenheerdt E
    Seiten 2025.05.22.653117
    Link Publikation
  • 2021
    Titel In vitro reconstitution of Sgk3 activation by phosphatidylinositol 3-phosphate
    DOI 10.1016/j.jbc.2021.100919
    Typ Journal Article
    Autor Pokorny D
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 100919
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Structure of autoinhibited Akt1 reveals mechanism of PIP3-mediated activation
    DOI 10.1073/pnas.2101496118
    Typ Journal Article
    Autor Truebestein L
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Lipid-dependent Akt-ivity: where, when, and how
    DOI 10.1042/bst20190013
    Typ Journal Article
    Autor Siess K
    Journal Biochemical Society Transactions
    Link Publikation
  • 2019
    Titel A ubiquitin-like domain controls protein kinase D dimerization and activation by trans-autophosphorylation
    DOI 10.1074/jbc.ra119.008713
    Typ Journal Article
    Autor Elsner D
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 14422-14441
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Structures of three MORN repeat proteins and a re-evaluation of the proposed lipid-binding properties of MORN repeats
    DOI 10.1101/826180
    Typ Preprint
    Autor Sajko S
    Seiten 826180
    Link Publikation
  • 2018
    Titel A ubiquitin-like dimerization domain regulates protein kinase D activation by trans-autophosphorylation
    Typ PhD Thesis
    Autor Daniel Elsner
  • 2016
    Titel Made to measure – keeping Rho kinase at a distance
    DOI 10.1080/21541248.2016.1173770
    Typ Journal Article
    Autor Truebestein L
    Journal Small GTPases
    Seiten 82-92
    Link Publikation
  • 2016
    Titel Coiled-coils: The long and short of it
    DOI 10.1002/bies.201600062
    Typ Journal Article
    Autor Truebestein L
    Journal BioEssays
    Seiten 903-916
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Novel Features of DAG-Activated PKC Isozymes Reveal a Conserved 3-D Architecture
    DOI 10.1016/j.jmb.2015.11.001
    Typ Journal Article
    Autor Lucic I
    Journal Journal of Molecular Biology
    Seiten 121-141
  • 2017
    Titel Keeping it in the family: Structure and regulation of Src and Tec kinases
    Typ PhD Thesis
    Autor Freia Von Raußendorf
  • 2017
    Titel Role of membrane binding in the activation of Protein Kinase B (PKB/Akt) and Protein Kinase C (PKC)
    Typ PhD Thesis
    Autor Iva Lucic
  • 2018
    Titel Mutations in MAST1 Cause Mega-Corpus-Callosum Syndrome with Cerebellar Hypoplasia and Cortical Malformations
    DOI 10.1016/j.neuron.2018.10.044
    Typ Journal Article
    Autor Tripathy R
    Journal Neuron
    Link Publikation
  • 2020
    Titel It Takes Two to Tango: Activation of Protein Kinase D by Dimerization
    DOI 10.1002/bies.201900222
    Typ Journal Article
    Autor Reinhardt R
    Journal BioEssays
    Link Publikation
  • 2015
    Titel A molecular ruler regulates cytoskeletal remodelling by the Rho kinases
    DOI 10.1038/ncomms10029
    Typ Journal Article
    Autor Truebestein L
    Journal Nature Communications
    Seiten 10029
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Reply to Agarwal: Activity against nuclear substrates is not necessarily mediated by nuclear Akt
    DOI 10.1073/pnas.1808882115
    Typ Journal Article
    Autor Leonard T
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Conformational sampling of membranes by Akt controls its activation and inactivation
    DOI 10.1073/pnas.1716109115
    Typ Journal Article
    Autor Lucic I
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2017
    Titel PI(3,4,5)P3 Engagement Restricts Akt Activity to Cellular Membranes
    DOI 10.1016/j.molcel.2016.12.028
    Typ Journal Article
    Autor Ebner M
    Journal Molecular Cell
    Link Publikation
  • 2017
    Titel A switch in nucleotide affinity governs activation of the Src and Tec family kinases
    DOI 10.1038/s41598-017-17703-5
    Typ Journal Article
    Autor Von Raußendorf F
    Journal Scientific Reports
    Seiten 17405
    Link Publikation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2019
    Titel Invited speaker at FASEB conference on 'Protein Kinases and Protein Phosphorylation'
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel University of Vienna Doc PhD Award
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2018
    Titel Invited speaker at 'International Workshop on Biological Membranes', Helsinki, Finland
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2018
    Titel Invited speaker at FASEB meeting on 'Phospholipids: Dynamic Lipid Signaling in Health and Disease'
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2017
    Titel Speaker at FASEB conference on 'Protein Kinases and Protein Phoshorylation'
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2017
    Titel Invited short talk at Keystone Meeting on 'PI3K Pathways in Immunology, Growth Disorders and Cancer'
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2017
    Titel Invited speaker at 'Biomolecules and Nanostructures 6' conference, Podlesice, Poland
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2017
    Titel Vienna BioCenter PhD Thesis Award
    Typ Research prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2015
    Titel Speaker at FASEB conference on 'Protein Kinases and Protein Phosphorylation'
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2018
    Titel Bridging the Gap - Cytoskeleton Regulation by DMPK Kinases
    Typ Other
    Förderbeginn 2018

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