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AID in der klonalen Evolution von CLL

Elucidating the contribution of AID to the clonal evolution of CLL

Roland Geisberger (ORCID: 0000-0002-0131-2191)
  • Grant-DOI 10.55776/P28201
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.01.2016
  • Projektende 31.12.2020
  • Bewilligungssumme 332.892 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (25%); Gesundheitswissenschaften (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)

Keywords

    Chronic Lymphocytic Leukemia (Cll), Mutations, Clonal Evolution, Genomic Stability, Activation induced deaminase (AID)

Abstract Endbericht

Die activation induced cytidine deaminase (AID) wird in Keimzentrums B Zellen exprimiert in denen es Klassenwechsel und und Affinitätsreifung der Antikörpergene katalysiert in dem es direkt die DNA deaminiert wodurch aus Cytosine Uracile entstehen. Da AID auch abseits der Antikörpergene die DNA deaminieren kann, können AID-induzierte DNA Schäden genomweit auftreten und somit zur Lymphomentstehung beitragen. Die chronisch lymphatischen Leukämie (CLL) ist eine sehr häufige monoklonale B Zellleukämie, in der die malignen B Zellen eines Patienten das gleiche Antikörpergen- rearrangement aufweisen. In unseren präliminären Daten konnten wir bisher zeigen, dass die Antikörpergene der CLL Zellen eine intraklonale Diversität aufweisen, was beweist, dass AID in der CLL aktiv ist. Parallel dazu konnten wir zeigen, dass in einem CLL Mausmodell AID wichtig ist für die Entwicklung einer aggressiveren Form der CLL. Aus diesen Daten schließen wir, dass AID in der klonalen Evolution der CLL beteiligt ist und eine weitere Analyse von AID in der CLL wäre wichtig um herauszufinden welche Genloci von AID mutiert werden, wie sich deren Mutation auf den Krankheitsverlauf auswirkt und ob eine gleichzeitige AID-Inhibierung bei Behandlung einen Therapieerfolg begünstigt.

Die wichtigsten Ergebnisse des Projekts lassen sich wie folgt zusammenfassen: Erstens konnten wir RNA-Editing als einen wichtigen Mechanismus in der chronischen lymphatischen Leukämie (CLL) identifizieren, der maßgeblich zur Diversifizierung des RNA-pools beiträgt. RNA-Editing (eine spezifische Veränderung einzelner Basen in RNA-Transkripten) führt zu vielen Veränderungen im CLL-Transkriptom und lässt die CLL in verschiedene Gruppen mit unterschiedlichen Krankheitsverläufen einteilen. Schließlich ist das RNA-Editing ein wichtiger Faktor, der die Therapieresistenz bestimmt, und wahrscheinlich könnten neuartige Medikamente, die das RNA-Editing hemmen, sehr vielversprechend sein, um CLL-Zellen anfällig für eine Reihe gängiger Medikamente zu machen, einschließlich Immun-Checkpoint-Therapien. Zweitens haben wir die Mutationslandschaft eines wichtigen Mausmodells für CLL aufgedeckt und die klonale Evolution der CLL bestimmt und dabei die Rolle von AID untersucht Diese Informationen sind sehr wichtig, um diese Maus als Modellsystem für CLL zu bewerten und die Ergebnisse von Forschungsstudien zu interpretieren, die an diesen Mäusen durchgeführt wurden. Schließlich führte das Projekt zu wichtigen Entdeckungen auf dem Gebiet der DNA-Doppelstrangbruch-Reparatur. Wir konnten zeigen, dass leukämische Zellen beschädigte DNA mit weniger Präzision und Genauigkeit reparieren als nicht-maligne Zellen. Parallel dazu konnten wir das Protein SAMHD1 als einen neuartigen Faktor bei der DNA-Endverknüpfung identifizieren. Dabei konnten wir zeigen, dass SAMHD1 durch die Regulierung des DNA-Vorläuferpools entscheidend die Insertion von weit entfernten DNA-Regionen in Reparaturstellen reguliert. Dieses Resultat zeigt einen wichtigen und neuen Mechanismus auf, der für die Diversifizierung von Genomen während der Krebsprogression ursächlich ist.

Forschungsstätte(n)
  • Paracelsus Med.-Priv.-Univ. Salzburg / SALK - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Daniel Hebenstreit, University of Warwick - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 387 Zitationen
  • 17 Publikationen
  • 4 Datasets & Models
Publikationen
  • 2021
    Titel Re-Sensitizing Tumor Cells to Cancer Drugs with Epigenetic Regulators.
    DOI 10.2174/1568009620666210108102723
    Typ Journal Article
    Autor Greil R
    Journal Current cancer drug targets
    Seiten 353-359
  • 2021
    Titel A POLE Splice Site Deletion Detected in a Patient with Biclonal CLL and Prostate Cancer: A Case Report
    DOI 10.3390/ijms22179410
    Typ Journal Article
    Autor Steiner M
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 9410
    Link Publikation
  • 2021
    Titel miRNA-Based Therapeutics in the Era of Immune-Checkpoint Inhibitors
    DOI 10.3390/ph14020089
    Typ Journal Article
    Autor Huemer F
    Journal Pharmaceuticals
    Seiten 89
    Link Publikation
  • 2021
    Titel SAMHD1 restrains aberrant nucleotide insertions at repair junctions generated by DNA end joining
    DOI 10.1093/nar/gkab051
    Typ Journal Article
    Autor Akimova E
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 2598-2608
    Link Publikation
  • 2021
    Titel AID Contributes to Accelerated Disease Progression in the TCL1 Mouse Transplant Model for CLL
    DOI 10.3390/cancers13112619
    Typ Journal Article
    Autor Schubert M
    Journal Cancers
    Seiten 2619
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Evidence for Non-Cancer-Specific T Cell Exhaustion in the Tcl1 Mouse Model for Chronic Lymphocytic Leukemia
    DOI 10.3390/ijms22136648
    Typ Journal Article
    Autor Parigger T
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 6648
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Oncogenic MTOR Signaling Axis Compensates BTK Inhibition in a Chronic Lymphocytic Leukemia Patient with Richter Transformation: A Case Report and Review of the Literature
    DOI 10.1159/000537791
    Typ Journal Article
    Autor Parigger T
    Journal Acta Haematologica
    Seiten 604-611
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Combined DNA Analysis from Stool and Blood Samples Improves Tumor Tracking and Assessment of Clonal Heterogeneity in Localized Rectal Cancer Patients
    DOI 10.1177/15330338241252706
    Typ Journal Article
    Autor Parigger T
    Journal Technology in Cancer Research & Treatment
    Seiten 15330338241252706
    Link Publikation
  • 2017
    Titel T cell exhaustion: from pathophysiological basics to tumor immunotherapy
    DOI 10.1186/s12964-016-0160-z
    Typ Journal Article
    Autor Catakovic K
    Journal Cell Communication and Signaling
    Seiten 1
    Link Publikation
  • 2020
    Titel RNA editing contributes to epitranscriptome diversity in chronic lymphocytic leukemia
    DOI 10.1038/s41375-020-0995-6
    Typ Journal Article
    Autor Gassner F
    Journal Leukemia
    Seiten 1053-1063
    Link Publikation
  • 2017
    Titel TIGIT expressing CD4+T cells represent a tumor-supportive T cell subset in chronic lymphocytic leukemia
    DOI 10.1080/2162402x.2017.1371399
    Typ Journal Article
    Autor Catakovic K
    Journal OncoImmunology
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Exome sequencing of the TCL1 mouse model for CLL reveals genetic heterogeneity and dynamics during disease development
    DOI 10.1038/s41375-018-0260-4
    Typ Journal Article
    Autor Zaborsky N
    Journal Leukemia
    Seiten 957-968
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Risks and chances of aberrant DNA repair in cancer
    DOI 10.18632/oncoscience.459
    Typ Journal Article
    Autor Schubert M
    Journal Oncoscience
    Seiten 256-257
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Imprecision and DNA Break Repair Biased Towards Incompatible End Joining in Leukemia
    DOI 10.1158/1541-7786.mcr-17-0373
    Typ Journal Article
    Autor Gassner F
    Journal Molecular Cancer Research
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Combination Strategies for Immune-Checkpoint Blockade and Response Prediction by Artificial Intelligence
    DOI 10.3390/ijms21082856
    Typ Journal Article
    Autor Huemer F
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 2856
    Link Publikation
  • 2020
    Titel RNA Editing Alters miRNA Function in Chronic Lymphocytic Leukemia
    DOI 10.3390/cancers12051159
    Typ Journal Article
    Autor Gassner F
    Journal Cancers
    Seiten 1159
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Investigating epigenetic effects of activation-induced deaminase in chronic lymphocytic leukemia
    DOI 10.1371/journal.pone.0208753
    Typ Journal Article
    Autor Schubert M
    Journal PLOS ONE
    Link Publikation
Datasets & Models
  • 2020 Link
    Titel RNA/DNA sequencing in CLL
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel microRNA sequencing in CLL
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2018 Link
    Titel Investigating epigenetic effects of activation-induced deaminase in chronic lymphocytic leukemia
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2021 Link
    Titel SAMHD1 restrains aberrant nucleotide insertions at repair junctions generated by DNA end joining
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link

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