AID in der klonalen Evolution von CLL
Elucidating the contribution of AID to the clonal evolution of CLL
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (25%); Gesundheitswissenschaften (50%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)
Keywords
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Chronic Lymphocytic Leukemia (Cll),
Mutations,
Clonal Evolution,
Genomic Stability,
Activation induced deaminase (AID)
Die activation induced cytidine deaminase (AID) wird in Keimzentrums B Zellen exprimiert in denen es Klassenwechsel und und Affinitätsreifung der Antikörpergene katalysiert in dem es direkt die DNA deaminiert wodurch aus Cytosine Uracile entstehen. Da AID auch abseits der Antikörpergene die DNA deaminieren kann, können AID-induzierte DNA Schäden genomweit auftreten und somit zur Lymphomentstehung beitragen. Die chronisch lymphatischen Leukämie (CLL) ist eine sehr häufige monoklonale B Zellleukämie, in der die malignen B Zellen eines Patienten das gleiche Antikörpergen- rearrangement aufweisen. In unseren präliminären Daten konnten wir bisher zeigen, dass die Antikörpergene der CLL Zellen eine intraklonale Diversität aufweisen, was beweist, dass AID in der CLL aktiv ist. Parallel dazu konnten wir zeigen, dass in einem CLL Mausmodell AID wichtig ist für die Entwicklung einer aggressiveren Form der CLL. Aus diesen Daten schließen wir, dass AID in der klonalen Evolution der CLL beteiligt ist und eine weitere Analyse von AID in der CLL wäre wichtig um herauszufinden welche Genloci von AID mutiert werden, wie sich deren Mutation auf den Krankheitsverlauf auswirkt und ob eine gleichzeitige AID-Inhibierung bei Behandlung einen Therapieerfolg begünstigt.
Die wichtigsten Ergebnisse des Projekts lassen sich wie folgt zusammenfassen: Erstens konnten wir RNA-Editing als einen wichtigen Mechanismus in der chronischen lymphatischen Leukämie (CLL) identifizieren, der maßgeblich zur Diversifizierung des RNA-pools beiträgt. RNA-Editing (eine spezifische Veränderung einzelner Basen in RNA-Transkripten) führt zu vielen Veränderungen im CLL-Transkriptom und lässt die CLL in verschiedene Gruppen mit unterschiedlichen Krankheitsverläufen einteilen. Schließlich ist das RNA-Editing ein wichtiger Faktor, der die Therapieresistenz bestimmt, und wahrscheinlich könnten neuartige Medikamente, die das RNA-Editing hemmen, sehr vielversprechend sein, um CLL-Zellen anfällig für eine Reihe gängiger Medikamente zu machen, einschließlich Immun-Checkpoint-Therapien. Zweitens haben wir die Mutationslandschaft eines wichtigen Mausmodells für CLL aufgedeckt und die klonale Evolution der CLL bestimmt und dabei die Rolle von AID untersucht Diese Informationen sind sehr wichtig, um diese Maus als Modellsystem für CLL zu bewerten und die Ergebnisse von Forschungsstudien zu interpretieren, die an diesen Mäusen durchgeführt wurden. Schließlich führte das Projekt zu wichtigen Entdeckungen auf dem Gebiet der DNA-Doppelstrangbruch-Reparatur. Wir konnten zeigen, dass leukämische Zellen beschädigte DNA mit weniger Präzision und Genauigkeit reparieren als nicht-maligne Zellen. Parallel dazu konnten wir das Protein SAMHD1 als einen neuartigen Faktor bei der DNA-Endverknüpfung identifizieren. Dabei konnten wir zeigen, dass SAMHD1 durch die Regulierung des DNA-Vorläuferpools entscheidend die Insertion von weit entfernten DNA-Regionen in Reparaturstellen reguliert. Dieses Resultat zeigt einen wichtigen und neuen Mechanismus auf, der für die Diversifizierung von Genomen während der Krebsprogression ursächlich ist.
- Daniel Hebenstreit, University of Warwick - Vereinigtes Königreich
Research Output
- 385 Zitationen
- 16 Publikationen
- 4 Datasets & Models
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2024
Titel Combined DNA Analysis from Stool and Blood Samples Improves Tumor Tracking and Assessment of Clonal Heterogeneity in Localized Rectal Cancer Patients. DOI 10.1177/15330338241252706 Typ Journal Article Autor Gassner Fj Journal Technology in cancer research & treatment Seiten 15330338241252706 -
2021
Titel A POLE Splice Site Deletion Detected in a Patient with Biclonal CLL and Prostate Cancer: A Case Report DOI 10.3390/ijms22179410 Typ Journal Article Autor Steiner M Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 9410 Link Publikation -
2021
Titel miRNA-Based Therapeutics in the Era of Immune-Checkpoint Inhibitors DOI 10.3390/ph14020089 Typ Journal Article Autor Huemer F Journal Pharmaceuticals Seiten 89 Link Publikation -
2021
Titel SAMHD1 restrains aberrant nucleotide insertions at repair junctions generated by DNA end joining DOI 10.1093/nar/gkab051 Typ Journal Article Autor Akimova E Journal Nucleic Acids Research Seiten 2598-2608 Link Publikation -
2018
Titel Exome sequencing of the TCL1 mouse model for CLL reveals genetic heterogeneity and dynamics during disease development DOI 10.1038/s41375-018-0260-4 Typ Journal Article Autor Zaborsky N Journal Leukemia Seiten 957-968 Link Publikation -
2018
Titel Risks and chances of aberrant DNA repair in cancer DOI 10.18632/oncoscience.459 Typ Journal Article Autor Schubert M Journal Oncoscience Seiten 256-257 Link Publikation -
2021
Titel Re-Sensitizing Tumor Cells to Cancer Drugs with Epigenetic Regulators. DOI 10.2174/1568009620666210108102723 Typ Journal Article Autor Greil R Journal Current cancer drug targets Seiten 353-359 -
2021
Titel Evidence for Non-Cancer-Specific T Cell Exhaustion in the Tcl1 Mouse Model for Chronic Lymphocytic Leukemia DOI 10.3390/ijms22136648 Typ Journal Article Autor Parigger T Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 6648 Link Publikation -
2021
Titel AID Contributes to Accelerated Disease Progression in the TCL1 Mouse Transplant Model for CLL DOI 10.3390/cancers13112619 Typ Journal Article Autor Schubert M Journal Cancers Seiten 2619 Link Publikation -
2018
Titel Investigating epigenetic effects of activation-induced deaminase in chronic lymphocytic leukemia DOI 10.1371/journal.pone.0208753 Typ Journal Article Autor Schubert M Journal PLOS ONE Link Publikation -
2018
Titel Imprecision and DNA Break Repair Biased Towards Incompatible End Joining in Leukemia DOI 10.1158/1541-7786.mcr-17-0373 Typ Journal Article Autor Gassner F Journal Molecular Cancer Research Link Publikation -
2020
Titel Combination Strategies for Immune-Checkpoint Blockade and Response Prediction by Artificial Intelligence DOI 10.3390/ijms21082856 Typ Journal Article Autor Huemer F Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 2856 Link Publikation -
2020
Titel RNA Editing Alters miRNA Function in Chronic Lymphocytic Leukemia DOI 10.3390/cancers12051159 Typ Journal Article Autor Gassner F Journal Cancers Seiten 1159 Link Publikation -
2017
Titel TIGIT expressing CD4+T cells represent a tumor-supportive T cell subset in chronic lymphocytic leukemia DOI 10.1080/2162402x.2017.1371399 Typ Journal Article Autor Catakovic K Journal OncoImmunology Link Publikation -
2017
Titel T cell exhaustion: from pathophysiological basics to tumor immunotherapy DOI 10.1186/s12964-016-0160-z Typ Journal Article Autor Catakovic K Journal Cell Communication and Signaling Seiten 1 Link Publikation -
2020
Titel RNA editing contributes to epitranscriptome diversity in chronic lymphocytic leukemia DOI 10.1038/s41375-020-0995-6 Typ Journal Article Autor Gassner F Journal Leukemia Seiten 1053-1063 Link Publikation
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2021
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Titel SAMHD1 restrains aberrant nucleotide insertions at repair junctions generated by DNA end joining Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel microRNA sequencing in CLL Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
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Titel RNA/DNA sequencing in CLL Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2018
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Titel Investigating epigenetic effects of activation-induced deaminase in chronic lymphocytic leukemia Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link