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Untersuchung von proteinabbauenden Prozessen im ER von Pflanzen

Dissecting the glycan-dependent ERAD pathway in plants

Richard Strasser (ORCID: 0000-0001-8764-6530)
  • Grant-DOI 10.55776/P28218
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2015
  • Projektende 31.10.2019
  • Bewilligungssumme 351.435 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Secretory Pathway, Protein Degradation, Endoplasmic Reticulum, Protein Quality Control, Glycosylation, Arabidopsis thaliana

Abstract Endbericht

Glykosylierung zählt zu den häufigsten Formen der Proteinmodifizierung in allen Eukaryonten. Die proteingebundenen Zuckerketten beeinflussen zahlreiche biologische Prozesse und sind damit essenziell für die Entwicklung von Organismen wie auch für deren Anpassung an veränderte Umweltbedingungen. Die Übertragung dieser Zuckerketten (N-Glykane) erfolgt in einem bestimmten Bereich der Zelle, dem sogenannten endoplasmatischen Retikulum (ER). Im ER spielen die N- Glykane eine kritische Rolle bei der Faltung von Proteinen. Bei diesem lebenswichtigen zellulären Prozess kann es zur Bildung von unvollständig gefalteten oder fehlerhaften Proteinen kommen, die entfernt werden müssen, um das Gleichgewicht der Zelle zu erhalten. Zellen haben aus diesem Grund ein komplexes System der Qualitätskontrolle und einen spezifischen Proteinabbauprozess (ERAD- Prozess) entwickelt. Dieser selektive Prozess verhindert die Anhäufung von veränderten Proteinen sowie deren Transport an den Wirkort, wo sie die Zelle und den ganzen Organismus schädigen können. Für das Erkennen und Aussortieren falscher Glykoproteine ist beim ERAD-Prozess konkret die Herstellung einer bestimmten Zuckerstruktur an falsch gefalteten Glykoproteinen von entscheidender Bedeutung. Im Gegensatz zu anderen Organismen sind in Pflanzen diese Qualitätskontrolle und der spezifische Proteinabbauprozess kaum untersucht. Ziel dieses Projektes ist es, den Mechanismus für den selektiven Abbau von fehlgefalteten Glykoproteinen in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana zu erforschen. In Vorarbeiten wurden die beteiligten Proteine und die charakteristische Zuckerstruktur identifiziert. Um den Prozess zu verstehen, ist es nun notwendig, das genaue Zusammenspiel der einzelnen Faktoren mittels molekularbiologischer und biochemischer Methoden zu erkunden. Die Ergebnisse aus dem Projekt werden das Verständnis dieses essenziellen zellulären Systems wesentlich verbessern und können zu neuen Strategien führen, um Pflanzen resistenter gegen schädliche Umwelteinflüsse zu machen, welche die weltweite Pflanzenproduktion gefährden.

Die Anheftung von Zuckergruppen an Proteine führt zur Entstehung von Glykoproteinen und zählt zu den häufigsten Formen der Proteinmodifizierung in allen Eukaryonten. Die proteingebundenen Zuckergruppen beeinflussen zahlreiche biologische Prozesse und sind damit lebensnotwendig für die Entwicklung von Organismen wie auch für deren Anpassung an veränderte Umweltbedingungen. Die Übertragung der Zuckergruppen erfolgt in einem bestimmten Bereich der Zelle, dem sogenannten endoplasmatischen Retikulum. In diesem Organell spielen Zuckerstrukturen eine kritische Rolle bei der Faltung von Proteinen. Bei diesem lebenswichtigen Prozess kann es zur Bildung von unvollständig gefalteten oder schadhaften Proteinen kommen, die entfernt werden müssen, um das Gleichgewicht der Zelle zu erhalten und mögliche Schäden zu vermeiden. Zellen haben aus diesem Grund ein komplexes System der Qualitätskontrolle und einen gezielten Proteinabbauprozess entwickelt. Für das Erkennen und Aussortieren schadhafter Glykoproteine ist konkret die Erkennung einer bestimmten Zuckerstruktur an falsch gefalteten Glykoproteinen von entscheidender Bedeutung. In diesem Projekt wurden die Mechanismen für das Entstehen der bestimmten Zuckerstruktur und deren Rolle beim gezielten Abbau von fehlerhaften Glykoproteinen in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana mittels molekularbiologischer, biochemischer und zellbiologischer Methoden erforscht. Die gewonnenen Ergebnisse bestätigen, dass Pflanzen grundsätzlich einen ähnlichen Mechanismus wie Hefen oder der Mensch zum gezielten Abbau von fehlerhaften Glykoproteinen verwenden. Eine eingehende Untersuchung der Zuckerstrukturen mittels Massenspektrometrie zeigte jedoch klare Unterschiede, die auf ein verändertes Zusammenspiel der beteiligten Proteine hinweisen. Die Ergebnisse aus dem Projekt können verwendet werden, um Pflanzen resistenter gegen Stress und schädliche Umwelteinflüsse zu machen, welche die weltweite Pflanzenproduktion gefährden.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Chris Hawes, Oxford Brookes University - Vereinigtes Königreich

Research Output

  • 550 Zitationen
  • 13 Publikationen
Publikationen
  • 2019
    Titel A signal motif retains Arabidopsis ER-a-mannosidase I in the cis-Golgi and prevents enhanced glycoprotein ERAD
    DOI 10.1038/s41467-019-11686-9
    Typ Journal Article
    Autor Schoberer J
    Journal Nature Communications
    Seiten 3701
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Processing of the Terminal Alpha-1,2-Linked Mannose Residues From Oligomannosidic N-Glycans Is Critical for Proper Root Growth
    DOI 10.3389/fpls.2018.01807
    Typ Journal Article
    Autor Veit C
    Journal Frontiers in Plant Science
    Seiten 1807
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Arabidopsis thaliana FLA4 functions as a glycan-stabilized soluble factor via its carboxy-proximal Fasciclin 1 domain
    DOI 10.60692/d6wy3-c0r35
    Typ Other
    Autor Christiane Veit
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Arabidopsis thaliana FLA4 functions as a glycan-stabilized soluble factor via its carboxy-proximal Fasciclin 1 domain
    DOI 10.60692/c7qs3-rvp89
    Typ Other
    Autor Christiane Veit
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Arabidopsis thaliana FLA4 functions as a glycan-stabilized soluble factor via its carboxy-proximal Fasciclin 1 domain
    DOI 10.1111/tpj.13591
    Typ Journal Article
    Autor Xue H
    Journal The Plant Journal
    Seiten 613-630
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Plant glyco-biotechnology
    DOI 10.1016/j.semcdb.2017.07.005
    Typ Journal Article
    Autor Schoberer J
    Journal Seminars in Cell & Developmental Biology
    Seiten 133-141
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Momelotinib inhibits ACVR1/ALK2, decreases hepcidin production, and ameliorates anemia of chronic disease in rodents
    DOI 10.1182/blood-2016-09-740092
    Typ Journal Article
    Autor Asshoff M
    Journal Blood
    Seiten 1823-1830
    Link Publikation
  • 2017
    Titel Analysis of Protein Glycosylation in the ER
    DOI 10.1007/978-1-4939-7389-7_16
    Typ Book Chapter
    Autor Schoberer J
    Verlag Springer Nature
    Seiten 205-222
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Protein Quality Control in the Endoplasmic Reticulum of Plants
    DOI 10.1146/annurev-arplant-042817-040331
    Typ Journal Article
    Autor Strasser R
    Journal Annual Review of Plant Biology
    Seiten 1-26
    Link Publikation
  • 2018
    Titel The glycan-dependent ERAD machinery degrades topologically diverse misfolded proteins
    DOI 10.1111/tpj.13851
    Typ Journal Article
    Autor Shin Y
    Journal The Plant Journal
    Seiten 246-259
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Proper protein folding in the endoplasmic reticulum is required for attachment of a glycosylphosphatidylinositol anchor in plants
    DOI 10.1093/plphys/kiab181
    Typ Journal Article
    Autor Shin Y
    Journal Plant Physiology
    Seiten 1878-1892
    Link Publikation
  • 2019
    Titel The Golgi Localization of GnTI Requires a Polar Amino Acid Residue within Its Transmembrane Domain
    DOI 10.1104/pp.19.00310
    Typ Journal Article
    Autor Schoberer J
    Journal Plant Physiology
    Seiten 859-873
    Link Publikation
  • 2015
    Titel Platelet Fc?RIIA signaling: new clues for HIT
    DOI 10.1182/blood-2015-11-679860
    Typ Journal Article
    Autor Assinger A
    Journal Blood
    Seiten 2777-2778
    Link Publikation

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