Die Rolle der DNA-Replikation in B Zell Genominstabilität
The role of DNA replication in B cell genome instability
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (75%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (25%)
Keywords
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B cells,
DNA replication,
Chromosomal Translocations,
Activation Induced Deaminase (Aid),
Genome Instability
Antikörper bilden die Grundlage für alle langanhaltende Serumimmunität. Erfolgreiche Immunantworten auf Pathogene, wie Viren und Bakterien, beinhalten fast immer auch die Erzeugung von hochaffinen Antikörpern welche die Pathogene binden und neutralisieren. Der Prozess durch den ein umfangreiches Repertoire von Antikörpern erzeugt wird als Antikörper-Diversifizierung bezeichnet und steht im Mittelpunkt der vorgeschlagenen Forschung. Antikörper Diversifizierung ist ein einzigartiges genomisches Phänomen das ausschließlich an den Immunglobulin (Ig) Loci in B- Lymphozyten auftritt. Der Hauptregler für dieses Phänomen ist das Enzym Activation Induced Deaminase (AID), das Mutationen an bestimmten Stellen innerhalb der Ig-Loci einführt. Dieser essentielle immunologische Prozess ist von Kollateralschäden im Genom begleitet da AID ein nicht- spezifisches Enzym ist das nicht-Ig Gene mutieren kann. Dies kann zu Genominstabilität führen die sich durch das Auftreten von schädlichen chromosomalen Translokationen auszeichnen die zu B-Zell- Krebserkrankungen, wie beispielsweise Burkitt-Lymphoma führen können. Daher ist es von großer klinischer und biologischer Bedeutung zu verstehen wie AID-Aktivität und die damit verbundenen genomischen Prozesse zu solchen Malignitäten führen. In diesem Zusammenhang haben wir vor kurzem die DNA-Replikation als einen wichtigen Akteur bei der Antikörper Diversifizierung identifiziert und vorläufige Ergebnisse zeigen deutlich eine Rolle für die DNA-Replikation in AID- vermittelten Translokationen. Auf dieser Basis stellen wir die Hypothese auf, dass die DNA- Replikation eine wichtige Rolle bei der B-Zell-Tumorgenese hat. Die vorgeschlagene Forschung zielt darauf ab, dieses wie folgt zu ermitteln: Ziel 1: Aufklärung der DNA-Replikation Landschaft in B Zellen, die Antikörper-Diversifikation durchlaufen: Hier werden wir eine genomweite Karte erhalten die zeigt wo die DNA-Replikation in B-Zellen, die AID exprimieren und Antikörper Diversifizierung durchführen, initiiert wird und bestimmen wie deren Häufigkeit und Verteilung von dem Verlust der Replikationsfaktoren beeinflusst wird. Dies wird zu vorher identifizierten Stellen von AID-Aktivität im Genom verglichen um festzustellen ob Replikationsinitiationsstellen mit AID-Aktivität korrelieren. Ziel 2: Feststellen ob die DNA-Replikation benötigt wird für AID vermittelte Translokationen: In diesem Ziel werden wir feststellen, ob der Verlust von Replikationsfaktoren die Frequenz und Verteilung der AID-vermittelten Translokationen in B-Zellen verändert. In Kombination mit Daten von Ziel 1 wird uns das ermöglichen festzustellen ob Translokationen an Stellen von AID-Aktivität und/oder DNA-Replikationsinitiation auftreten. Zusammenfassend erwarten wir dass diese Studien neue Erkenntnisse über die Rolle der DNA- Replikation in der Genese der AID-vermittelte Genominstabilität liefern, von der wir annehmen dass sie wichtige Auswirkungen auf die B-Zell-Lymphomaforschung sowie auf dem Gebiet der Genomintegrität im Allgemeinen hat.
- Davide F. Robbiani, Universita della Svizzera italiana - Schweiz
Research Output
- 161 Zitationen
- 10 Publikationen
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2023
Titel RIF1 regulates early replication timing in murine B cells DOI 10.1038/s41467-023-43778-y Typ Journal Article Autor Malzl D Journal Nature Communications Seiten 8049 Link Publikation -
2024
Titel Specific origin selection and excess functional MCM2-7 loading in ORC-deficient cells DOI 10.1101/2024.10.30.621095 Typ Preprint Autor Shibata Y Seiten 2024.10.30.621095 Link Publikation -
2023
Titel RIF1 regulates replication origin activity and early replication timing in B cells DOI 10.1101/2023.03.31.535086 Typ Preprint Autor Malzl D Seiten 2023.03.31.535086 Link Publikation -
2021
Titel DNA replication timing directly regulates the frequency of oncogenic chromosomal translocations DOI 10.1101/2021.05.29.446276 Typ Preprint Autor Peycheva M Seiten 2021.05.29.446276 -
2025
Titel Regulation of somatic hypermutation by higher-order chromatin structure DOI 10.1016/j.molcel.2025.06.003 Typ Journal Article Autor Schoeberl U Journal Molecular Cell Link Publikation -
2025
Titel Specific origin selection and excess functional MCM2–7 loading in ORC-deficient cells DOI 10.1093/nar/gkaf518 Typ Journal Article Autor Shibata Y Journal Nucleic Acids Research Link Publikation -
2022
Titel DNA replication timing directly regulates the frequency of oncogenic chromosomal translocations DOI 10.1126/science.abj5502 Typ Journal Article Autor Peycheva M Journal Science Link Publikation -
2022
Titel A de novo transcription-dependent TAD boundary underpins critical multiway interactions during antibody class switch recombination DOI 10.1101/2022.04.26.489407 Typ Preprint Autor Costea J Seiten 2022.04.26.489407 Link Publikation -
2017
Titel R Loops in the Regulation of Antibody Gene Diversification DOI 10.3390/genes8060154 Typ Journal Article Autor Pavri R Journal Genes Seiten 154 Link Publikation -
2020
Titel Spt5-mediated enhancer transcription directly couples enhancer activation with physical promoter interaction DOI 10.1038/s41588-020-0605-6 Typ Journal Article Autor Fitz J Journal Nature Genetics Seiten 505-515