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Simulation elektronen-induzierter Zellschädigungen

Modeling of electron induced damage in biological tissue

Michael Probst (ORCID: 0000-0003-3112-5597)
  • Grant-DOI 10.55776/P30355
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2017
  • Projektende 30.06.2021
  • Bewilligungssumme 401.303 €

Wissenschaftsdisziplinen

Physik, Astronomie (100%)

Keywords

    Computational Modelling, Low-Energy Electrons, Biomolecular Systems, Radiosensitizers, Multi-Method Approach, (micro-)solvation

Abstract Endbericht

Im Rahmen des Projektes Simulation Elektronen-induzierter Gewebsschädigungen untersuchen wir die Auswirkungen von langsamen Elektronen auf biologische Systeme mittels Simulationen. Experimente haben in der Vergangenheit gezeigt, dass niederenergetische Elektronen durch hochenergetische Strahlung wie z.B. Höhenstrahlung oder Röntgenstrahlung im Rahmen einer Strahlentherapie im menschlichen Körper freigesetzt werden. Die Resultate dieser Experimente haben dargelegt, dass diese Elektronen die DNS schädigen können. Diese Schäden können in einigen Fällen fehlerhaft repariert werden und in weiterer Folge zu Mutationen oder auch zum Absterben der Zelle führen. Letzteres wird auch in der Strahlentherapie ausgenützt um Krebszellen zu zerstören. Jedoch wird auch das gesunde, umliegende Gewebe um den Tumor durch die Strahlung in Mitleidenschaft gezogen. Aber nicht nur die DNS kann Schäden erleiden, sondern auch chemotherapeutische Arzneimittel, welche manchmal in Kombination mit Strahlentherapie verabreicht werden, können verändert werden. Das kann sowohl negative (Schädigung gesunden Gewebes) als auch positive (effizientere Zerstörung von Krebszellen) Auswirkungen haben. Um ein besseres Verständnis und ein gezielteres Verabreichen von chemotherapeutischen Arzneien im Zusammenhang mit begleitender Strahlentherapie zu erreichen, müssen die grundlegenden Phänomene in der Zelle verstanden sein. Auf Grundlage sehr genauer quantenchemischer Methoden soll eine Datenbank erstellt werden, welche es erlaubt DNS Fragmente in deren natürlicher Umgebung, also gelöst in Wasser zusammen mit anderen Biomolekülen und Radikalen, zu beschreiben. Diese sehr genauen Methoden können aber nur bei kleinen Systemen angewandt werden. Kombiniert mit weit weniger zeitintensiven Methoden, die nicht so exakt sind, soll ein Simulationsverfahren erstellt werden, mit dem große Systeme und deren Verhalten unter Einfluss von langsamen Elektronen beschrieben und untersucht werden können. Auf lange Frist gesehen sollen die Resultate aus diesem Projekt die Grundlagen für intelligentes Arzneimitteldesign und koordinierte strahlen-chemotherapeutische Behandlung schaffen.

In dem Projekt 'Modellierung elektronen-induzierter Schäden in biologischem Gewebe' konnte die Grundlage für einen Multiskalenansatz zur quantitativen Beschreibung der Auswirkungen von niederenergetischen Elektronen auf in der klinischen Radiochemotherapie verwendeten Substanzen eingebettet in biomolekularen Umgebungen geschaffen werden. Experimente haben gezeigt, dass niederenergetische Elektronen in unserem Körper durch hochenergetische Strahlung wie kosmische Strahlung oder bei der Strahlentherapie entstehen. Die Ergebnisse haben gezeigt, dass diese Elektronen Schäden an der DNA verursachen können, die in einigen Fällen zu einer fehlerhaften Reparatur und in der Folge zu Mutation von Zellen oder sogar zum Zelltod führen können. Diese Phänomene werden in der Strahlentherapie ausgenutzt. Aber auch das gesunde Gewebe, das den Tumor umgibt, wird durch die Bestrahlung in Mitleidenschaft gezogen. Nicht nur die DNA kann geschädigt werden, sondern auch chemotherapeutische Medikamente, die manchmal in Kombination mit der Strahlentherapie eingesetzt werden. Die Veränderung dieser Medikamente kann sich entweder positiv (effizientere Zerstörung von Krebszellen) oder negativ (Schädigung von gesundem Gewebe) auswirken. Für ein besseres Verständnis und eine gezielte Verabreichung von Chemotherapeutika müssen die grundlegenden Mechanismen innerhalb der Zelle verstanden werden. Um die Grundlage für dieses Ziel zu schaffen, wurden in diesem Projekt die Genauigkeit der Resultate quantenchemischer Berechnungen analysiert und bewertet. Es wurden Diagnostiken entwickelt, mit diesen die Präzision der Simulationen abgeschätzt werden können. Des Weiteren wurde die Wechselwirkung von Elektronen mit verschiedenen Radiosensitzern wie Cisplatin aber auch mit DNS-Sequenzen untersucht. Diese Ergebnisse zeigten den Einfluss der biomolekularen Umgebung wie Ionen oder wässrige Lösung auf molekulare Prozesse.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Innsbruck - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Henning Zettergren, University of Stockholm - Schweden
  • Michael Gatchell, University of Stockholm - Schweden
  • Kersti Hermansson, Uppsala Universitet - Schweden
  • Peter Papp, Comenius University Bratislava - Slowakei
  • Stefan Matjecik, Comenius University Bratislava - Slowakei

Research Output

  • 244 Zitationen
  • 17 Publikationen
Publikationen
  • 2018
    Titel Cold physics and chemistry: Collisions, ionization and reactions inside helium nanodroplets close to zero K
    DOI 10.1016/j.physrep.2018.05.001
    Typ Journal Article
    Autor Mauracher A
    Journal Physics Reports
    Seiten 1-90
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Total and partial electron impact ionization cross sections of fusion-relevant diatomic molecules
    DOI 10.1063/1.5063767
    Typ Journal Article
    Autor Huber S
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 024306
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Mixed cationic clusters of nitrogen and hydrogen
    DOI 10.48550/arxiv.1912.00754
    Typ Preprint
    Autor Martini P
  • 2019
    Titel Protonated Clusters of Neon and Krypton
    DOI 10.48550/arxiv.1912.01344
    Typ Preprint
    Autor Gatchell M
  • 2020
    Titel Mixed cationic clusters of nitrogen and hydrogen
    DOI 10.1063/1.5140850
    Typ Journal Article
    Autor Martini P
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 014303
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Hydrogenated gold clusters from helium nanodroplets: displacement of H2 by H2O
    DOI 10.1140/epjd/e2020-10080-1
    Typ Journal Article
    Autor Lundberg L
    Journal The European Physical Journal D
    Seiten 102
    Link Publikation
  • 2020
    Titel On the impact of multi-reference character of small transition metal compounds on their bond dissociation energies
    DOI 10.1063/1.5143495
    Typ Journal Article
    Autor Süß D
    Journal The Journal of Chemical Physics
    Seiten 114104
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Dissociative electron attachment to fluorinated nitrobenzenes
    DOI 10.1016/j.ijms.2021.116731
    Typ Journal Article
    Autor Mauracher A
    Journal International Journal of Mass Spectrometry
    Seiten 116731
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Electron impact ionisation cross sections of fluoro-substituted nucleosides
    DOI 10.1140/epjd/e2019-90708-9
    Typ Journal Article
    Autor Huber S
    Journal The European Physical Journal D
    Seiten 137
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Comparative study of electronic-structure methods for platinum-containing molecules: bond lengths and bond dissociation energies
    DOI 10.1140/epjd/e2019-90691-1
    Typ Journal Article
    Autor Süß D
    Journal The European Physical Journal D
    Seiten 135
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Hydrogenated Gold Clusters from Helium Nanodroplets: Cluster Ionization and Affinities for Protons and Hydrogen Molecules
    DOI 10.1007/s13361-019-02235-1
    Typ Journal Article
    Autor Lundberg L
    Journal Journal of The American Society for Mass Spectrometry
    Seiten 1906-1913
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Dependence of Electronic Properties of DNA Single Strands on Size and Environment
    DOI 10.1021/acsomega.9b00819
    Typ Journal Article
    Autor Mauracher A
    Journal ACS Omega
    Seiten 10791-10798
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Dissociative electron attachment to 2-chlorotoluene: Unusual temperature effects for the formation of Cl-
    DOI 10.1016/j.cplett.2019.06.057
    Typ Journal Article
    Autor Mahmoodi-Darian M
    Journal Chemical Physics Letters
    Seiten 527-530
  • 2019
    Titel Protonated Clusters of Neon and Krypton
    DOI 10.1007/s13361-019-02329-w
    Typ Journal Article
    Autor Gatchell M
    Journal Journal of The American Society for Mass Spectrometry
    Seiten 2632-2636
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Combinations of density functionals for accurate molecular properties of Be/W/H compounds
    DOI 10.1016/j.nme.2021.101026
    Typ Journal Article
    Autor Chen L
    Journal Nuclear Materials and Energy
    Seiten 101026
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Solvation of ions in helium
    DOI 10.1080/0144235x.2020.1794585
    Typ Journal Article
    Autor González-Lezana T
    Journal International Reviews in Physical Chemistry
    Seiten 465-516
    Link Publikation
  • 2018
    Titel Electron impact ionisation cross sections of cis- and trans-diamminedichloridoplatinum(II) and its hydrolysis products
    DOI 10.1080/00268976.2018.1509148
    Typ Journal Article
    Autor Huber S
    Journal Molecular Physics
    Seiten 2233-2240
    Link Publikation

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