Selektiver Membrane-Transport mittels DNA Nanopores
Cargo-selective membrane transport with DNA nanopores
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (20%); Chemie (50%); Nanotechnologie (30%)
Keywords
-
Chemical Biology,
Nucleic Acids Chemistry,
Macromolecular Chemistry,
Protein Chemistry,
Bioaffinity,
Single Molecule Biophysics
Dieses Projekt befasst sich mit molekularen Transportprozesse, die in der Biologie und der Biotechnologie eine wichtige Rolle spielen. Die Transportprozess helfen Membranbarrieren zu überwinden und Biomoleküle in biologischen Zellen einzuschleusen oder Medikamente in der pharmazeutischen Industrie aufzureinigen. Der im Projekt untersuchte Transportprozess basisert auf kleinen Poren mit einer Breite von wenigen Nanometern. Die Bewegung von Molekülen durch diese kleine Öffnungen ist in mehrfacher Hinsicht einzigartig und unterscheidet sich von makroskopischen Systemen. (i) Eine Pore mit einer schmalen Öffnung kann eine Größenbegrenzung für Molekül auferlegen. (ii) Ein Biomoleküle innerhalb der Pore is räumlich beschränkt und ist vorübergehend festgehalten. (iii) Die keline Längenskala kann zu häufigen Wechselwirkungen zwischen dem Biomolekül und der Porenwand führen. Der Transporttyp in diesem Projekt ist zudem besonders, da die Poren interne Bindungswege aufweisen. Diese kleine Transportwege erkennen spezifisch die molekulare Fracht und ermöglichen, dass nur die Zielmoleküle auf der anderen Porenseite ankommen. Unser Projekt wird das Verständnis dieses Transportprozesses drastisch verbessern. Derzeit gibt es nur geringes Wissen darüber, wie die Porenabmessungen die Geschwindigkeit oder die Spezifität des Transportes beeinflussen. Um das Projektziel zu erreichen, werden Experimente und mathematische Simulationen kombiniert. Wir erwarten, dass unsere wissenschaftlichen Erkentnisse es erleichtern, für die Biotechnologie effektivere nanoporöse Reinigungs-Membranen oder Biosensoren zu entwicklen.
Dieses Projekt befasste sich mit molekularen Transportprozesse, die in der Biologie und der Biotechnologie eine wichtige Rolle spielen. Die Transportprozess helfen Membranbarrieren zu überwinden und Biomoleküle in biologischen Zellen einzuschleusen oder Medikamente in der pharmazeutischen Industrie aufzureinigen. Der im Projekt untersuchte Transportprozess basisert auf kleinen Poren mit einer Breite von wenigen Nanometern. Die Bewegung von Molekülen durch diese kleine Öffnungen ist in mehrfacher Hinsicht einzigartig und unterscheidet sich von makroskopischen Systemen. (i) Eine Pore mit einer schmalen Öffnung kann eine Größenbegrenzung für Molekül auferlegen. (ii) Ein Biomoleküle innerhalb der Pore is räumlich beschränkt und ist vorübergehend festgehalten. (iii) Die keline Längenskala kann zu häufigen Wechselwirkungen zwischen dem Biomolekül und der Porenwand führen. Der Transporttyp in diesem Projekt ist zudem besonders, da die Poren interne Affinitätsspuren aufweisen. Diese kleine Transportwege erkennen spezifisch die molekulare Fracht und ermöglichen, dass nur die Zielmoleküle auf der anderen Porenseite ankommen. Um das Verständnis dieser Transportprozesse drastisch zu verbessern, hat unser Projekt nanoskalare Poren mit einstellbarer Größe geschaffen und mit Affinitätsspuren ausgestattet. Auch der Transport wurde mittels Einzelmolekülanalyse verfolgt. Darüber hinaus wurde ein mathematisches Modell des Frachttransports entwickelt, um die experimentellen Ergebnisse zu verallgemeinern. Unsere neuen wissenschaftlichen Erkenntnisse werden beim rationalen Design von nanoporösen Reinigungsmembranen oder auf Nanoporen basierenden Geräten wie Biosensoren helfen.
- Universität Linz - 86%
- Technische Universität Wien - 14%
- Clemens Heitzinger, Technische Universität Wien , assoziierte:r Forschungspartner:in
Research Output
- 60 Zitationen
- 7 Publikationen
-
2025
Titel Molecular Interactions within Nanoconfinement of Model DNA Nanostructures Controlled by Compensatory Kinetics as Revealed by Single-Molecule Fluorescence Analysis DOI 10.1021/jacsau.5c00774 Typ Journal Article Autor Hagleitner-Ertug?Rul N Journal JACS Au Seiten 4427-4438 Link Publikation -
2023
Titel Facilated cargo DNA transport studied with AFM Typ PhD Thesis Autor Saanfor Hubert Suh -
2023
Titel Molecular Recognition in Confined Space Elucidated with DNA Nanopores and Single-Molecule Force Microscopy DOI 10.1021/acs.nanolett.3c00743 Typ Journal Article Autor Suh S Journal Nano Letters Seiten 4439-4447 Link Publikation -
2019
Titel Structural and Functional Stability of DNA Nanopores in Biological Media DOI 10.3390/nano9040490 Typ Journal Article Autor Burns J Journal Nanomaterials Seiten 490 Link Publikation -
2022
Titel Triggered Assembly of a DNA-Based Membrane Channel DOI 10.1021/jacs.1c06598 Typ Journal Article Autor Lanphere C Journal Journal of the American Chemical Society Seiten 4333-4344 Link Publikation -
2021
Titel Protein Transport through Nanopores Illuminated by Long-Time-Scale Simulations DOI 10.1021/acsnano.1c01078 Typ Journal Article Autor Mitscha-Baude G Journal ACS Nano Seiten 9900-9912 Link Publikation -
2018
Titel Tunable DNA Hybridization Enables Spatially and Temporally Controlled Surface-Anchoring of Biomolecular Cargo DOI 10.1021/acs.langmuir.8b01942 Typ Journal Article Autor Hager R Journal Langmuir Seiten 15021-15027 Link Publikation