Multimodale Bildgebung des Hirnstamms mittels MRT
Structural and functional mapping of the brainstem with MRI
Wissenschaftsdisziplinen
Klinische Medizin (70%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (10%); Medizintechnik (20%)
Keywords
-
Magnetic Resonance Imaging (MRI),
Ultra-high field,
Deep Brain Stimulation (DBS),
Functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI),
Quantitative Susceptibility Mapping (QSM),
Brainstem
Der Hirnstamm nimmt eine wichtige Rolle im zentralen Nervensystem ein, unter anderem überträgt er Signale von Groß- und Kleinhirn in den Rest des Körpers. Seine Integrität ist von besonderer Bedeutung für Motorfunktion, Lebensqualität und Lebenserwartung bei altersbedingten Erkrankungen, wie der Parkinson-Krankheit. Sie ist eine neurodegenerative Erkrankung, die Mittelhirn- und Hirnstammstrukturen betrifft und zu Muskelsteifheit, Muskelzittern, Sprech- und Gehschwierigkeiten führt. Bei manchen Patienten lassen sich die Symptome Medikamentös lindern, viele leiden jedoch letztendlich unter einem allgemeinen Rückgang der motorischen Funktionen. Die Tiefenhirnstimulation stellt eine wirksame Behandlungsoption für viele Parkinson-Patienten dar, bei denen Medikamente keine Wirkung zeigen. Ein implantierter Hirnschrittmacher stimuliert bestimmte tiefliegende Bereiche des Gehirns oder Hirnstamms und kann somit motorische Ausfälle vermeiden. Gegenwärtig werden die Stimulationselektroden auf der Grundlage von Atlanten platziert, die mit Magnetresonanztomographiebildern (MRT) des Patienten verknüpft werden. Diese Vorgehensweise ist jedoch durch die geringe Anzahl der in Atlanten dargestellten Nuclei des Hirnstamms limitiert und ist außerdem aufgrund der anatomischen Variabilität zwischen den Patienten unzuverlässig. Die Tiefenhirnstimulation könnte stark verbessert werden, indem bei jedem Patienten die tiefliegenden Stimulationsorte individuell identifiziert werden. Auf konventionellen MRT-Bildern sind diese aufgrund ihrer geringen Größe und des begrenzten Kontrastes nur schwer zu erkennen, sie sind auf MRT-Bildern der kürzlich entwickelten Methode quantitative Suszeptibilitätsabbildung (QSM) jedoch gut erkennbar. Außerdem können sie auch mittels "funktioneller" MRT (fMRT) sichtbar gemacht werden, da fMRT die aktiven Gehirnareale bei Durchführung einer Aufgabe zeigt. Diese beiden Methoden, QSM und fMRT, können derzeit nicht zur Planung der Tiefenhirnstimulation verwendet werden, da sie zwei lange Messungen umfassen, bei denen die Patienten äußerst still liegen müssen, was ein besonderes Problem für viele Parkinson-Patienten darstellt. In diesem Projekt wird die Entwicklung einer neuen schnellen MRT-Methode vorgeschlagen, die hochauflösende QSM- und fMRT-Bilder aus derselben Messung generiert. Dieses Projekt wird an einem Gerät der der neuesten Generation von Ultrahochfeld (7 T) MRT-Scannern durchgeführt, wodurch höhere Bildauflösungen erzielt werden können. Neben der Realisierung dieses kombinierten strukturellen und funktionellen Scans wird das Projekt i) Methoden entwickeln, um jegliche Verzerrungen aus den fMRT-Daten zu entfernen, die sonst die genaue Lokalisation der Hirnstammstrukturen erschweren würden ii) durch Atmung und Herzpuls bedingte Signalfluktuationen in den fMRT-Daten identifizieren und entfernen, da diese sonst die neuronale Aktivierung überschatten und iii) ein bewegungskorrigiertes QSM-Bild mit erhöhter Auflösung erzeugen. In Kombination mit geeigneten fMRT-Aufgaben wird diese Sequenz zur simultanen funktionellen und strukturellen Identifizierung von Zielen im Hirnstamm (mit dem Akronym "FAST- STEM") in der Lage sein, mehrere Mittelhirn- und Hirnstammziele zur Tiefenhirnstimulation in einer für Parkinson-Patienten tolerierbaren Untersuchungszeit zu identifizieren. Schließlich wird diese neue Vorgehensweise zur Abbildung des Hirnstamms auf einen klinischen 3 T MRT-Scanner übertragen, um sicherzustellen, dass Patienten in zukünftigen Studien davon profitieren können. Letztendlich wird erwartet, dass diese Methode der Hirnstammbildgebung neue, effektive Ziele für die Tiefenhirnstimulation identifizieren und präzise lokalisieren kann, was zu einer Linderung der schwächenden Symptome und eine Verbesserung der Lebensqualität der Patienten mit Parkinson-Krankheit zur Folge führt.
Die Parkinson-Krankheit (PD) ist eine neurodegenerative Erkrankung, die durch das Absterben von Neuronen, welche den Neurotransmitter Dopamin produzieren und freisetzen, gekennzeichnet ist. Dies geschieht in einer Vielzahl von Strukturen des Mittelhirns und des Hirnstamms und führt bei den Patienten zu Zittern, Haltungsinstabilität, Steifheit und schließlich zu einem allgemeinen Rückgang der motorischen Funktionen. Die tiefe Hirnstimulation (DBS) ist in vielen Fällen eine wirksame Behandlungsoption für Patienten, die nicht gut auf eine medikamentöse Behandlung ansprechen. Ein chirurgisch implantierter "Hirnschrittmacher" stimuliert Neuronen in bestimmten Regionen der grauen Substanz und des Hirnstamms und verringert so die auftretenden motorischen Einschränkungen. Ziel dieses Projekts war es, MRT-Methoden zu entwickeln, die bei der Identifizierung neuer Bereiche für die Anwendung von DBS im Tiefenhirn und im Hirnstamm helfen. Mithilfe der MRT können eine Vielzahl verschiedener Bilder erzeugt werden, die bestimmte Aspekte der Struktur oder Funktion des Gehirns widerspiegeln. Zum Beispiel können die tief liegenden Regionen der grauen Substanz, die für die DBS von Interesse sind, gut auf quantitativen Suszeptibilitätsabbildungen (QSM), welche sehr eisenreiche Bereiche des Gehirns zeigen, dargestellt werden. Dieselben Bereiche können auch bei der funktionellen Magnetresonanztomographie (fMRT) "aufleuchten", wenn sie durch eine relevante Aufgabe aktiviert werden. Sowohl QSM als auch fMRI profitieren von der Verwendung von MRT-Scannern mit ultrahohem Magnetfeld, wie z. B. dem 7-Tesla-System im Hochfeld-MR-Zentrum in Wien. Die Bildgebung bei 7T ermöglicht die Visualisierung kleiner Zielbereiche in der grauen Substanz mit hoher Empfindlichkeit und ausgezeichneter Auflösung, allerdings bringt die Verwendung eines ultrahohen Feldes auch eine Reihe von Herausforderungen mit sich. Die Forscher, die an diesem Projekt beteiligt waren, entwickelten zunächst eine Methode die es ermöglicht sowohl QSMs als auch fMRI aus denselben 7T Daten zu erzeugen, sowie neue Ansätze zur Korrektur von Verzerrungen und physiologischem Rauschen, die für die Verwendung der Ergebnisse in der Neurochirurgie unerlässlich sind. Anschließend wendeten sie diese Methoden auf eine schnelle Bildgebungsmethode namens 3D EPI und auf eine noch schnellere, bewegungsrobuste Bildgebung unter Verwendung von 2D EPI und einer "Super-Resolution"-Rekonstruktion an, die es ermöglicht, hochauflösende Bilder aus mehreren Sätzen niedrig aufgelöster Bilder zu erzeugen, die in verschiedenen Ebenen aufgenommen wurden. Schließlich konnte das Problem der Bildgebung gelöst werden, dass durch das Vorhandensein von Fett im Kopf und Hals entsteht; ihr Simultaneous, MUltiple Resonance Frequency (SMURF)-Ansatz für die Fett-Wasser-Bildgebung ermöglicht die gleichzeitige Erzeugung getrennter Bilder von Fett und Wasser. Ein Ansatz, der mit dem internationalen Young Investigator Award der International Society of Magnetic Resonance in Medicine ausgezeichnet wurde. Die in diesem Projekt entwickelten Methoden wurden an mehr als die Hälfte der etwa 100 Ultrahochfeld-MRT-Standorte in der ganzen Welt verteilt und von MRT-Anbietern in ihre Forschungspakete aufgenommen. Diese Innovationen haben das quantitative Suszeptibilitäts-Mapping und die funktionelle Magnetresonanztomographie im Unterhirn und im Hirnstamm zur Identifizierung von Zielen für die tiefe Hirnstimulation verbessert.
- Markus Barth, University of Queensland Australia - Australien
Research Output
- 241 Zitationen
- 23 Publikationen
- 1 Policies
- 2 Methoden & Materialien
- 1 Disseminationen
- 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
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2024
Titel Magnetic resonance elastography resolving all gross anatomical segments of the kidney during controlled hydration. DOI 10.3389/fphys.2024.1327407 Typ Journal Article Autor Darwish O Journal Frontiers in physiology Seiten 1327407 -
2024
Titel Three-dimensional EPI with shot-selective CAIPIRIHANA for rapid high-resolution quantitative susceptibility mapping at 3T. DOI 10.1002/mrm.30101 Typ Journal Article Autor Jin J Journal Magnetic resonance in medicine Seiten 997-1010 -
2024
Titel Recommended implementation of quantitative susceptibility mapping for clinical research in the brain: A consensus of the ISMRM electro-magnetic tissue properties study group. DOI 10.1002/mrm.30006 Typ Journal Article Autor Bilgic B Journal Magnetic resonance in medicine Seiten 1834-1862 -
2023
Titel Magnetic susceptibility changes in the brainstem reflect REM sleep without atonia severity in isolated REM sleep behavior disorder. DOI 10.1038/s41531-023-00557-2 Typ Journal Article Autor Nepozitek J Journal NPJ Parkinson's disease Seiten 112 -
2023
Titel Super-resolution QSM in little or no additional time for imaging (NATIve) using 2D EPI imaging in 3 orthogonal planes. DOI 10.1016/j.neuroimage.2023.120419 Typ Journal Article Autor Bachrata B Journal NeuroImage Seiten 120419 -
2019
Titel Improving sensitivity, specificity, and reproducibility of individual brainstem activation DOI 10.1007/s00429-019-01936-3 Typ Journal Article Autor Matt E Journal Brain Structure and Function Seiten 2823-2838 Link Publikation -
2021
Titel Improved susceptibility weighted imaging at ultra-high field using bipolar multi-echo acquisition and optimized image processing: CLEAR-SWI DOI 10.1016/j.neuroimage.2021.118175 Typ Journal Article Autor Eckstein K Journal NeuroImage Seiten 118175 Link Publikation -
2021
Titel Feasibility of Hepatic Fat Quantification Using Proton Density Fat Fraction by Multi-Echo Chemical-Shift-Encoded MRI at 7T DOI 10.3389/fphy.2021.665562 Typ Journal Article Autor Korínek R Journal Frontiers in Physics Seiten 665562 Link Publikation -
2019
Titel Developments in ultra-high field functional magnetic resonance imaging and quantitative susceptibility mapping for clinical applications Typ Postdoctoral Thesis Autor Simon Robinson -
2023
Titel Improved dynamic distortion correction for fMRI using single-echo EPI and a readout-reversed first image (REFILL). DOI 10.1002/hbm.26440 Typ Journal Article Autor Bachrata B Journal Human brain mapping Seiten 5095-5112 -
2022
Titel Phase-based masking for quantitative susceptibility mapping of the human brain at 9.4T DOI 10.1002/mrm.29368 Typ Journal Article Autor Hagberg G Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 2267-2276 Link Publikation -
2021
Titel QSMxT: Robust masking and artifact reduction for quantitative susceptibility mapping DOI 10.1002/mrm.29048 Typ Journal Article Autor Stewart A Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 1289-1300 Link Publikation -
2021
Titel Improved methods for ultra-high field magnetic susceptibility imaging Typ PhD Thesis Autor Korbinian Eckstein Link Publikation -
2020
Titel Phase unwrapping with a rapid opensource minimum spanning tree algorithm (ROMEO) DOI 10.1002/mrm.28563 Typ Journal Article Autor Dymerska B Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 2294-2308 Link Publikation -
2020
Titel Reinforcement and Punishment Shape the Learning Dynamics in fMRI Neurofeedback DOI 10.3389/fnhum.2020.00304 Typ Journal Article Autor Klöbl M Journal Frontiers in Human Neuroscience Seiten 304 Link Publikation -
2019
Titel The Impact of Echo Time Shifts and Temporal Signal Fluctuations on BOLD Sensitivity in Presurgical Planning at 7 T DOI 10.1097/rli.0000000000000546 Typ Journal Article Autor Dymerska B Journal Investigative Radiology Link Publikation -
2019
Titel Intra-session and inter-subject variability of 3D-FID-MRSI using single-echo volumetric EPI navigators at 3T DOI 10.1002/mrm.28076 Typ Journal Article Autor Moser P Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 1920-1929 Link Publikation -
2022
Titel Simultaneous, separate water and fat imaging with magnetic resonance imaging using selective excitation and CAIPIRINHA Typ PhD Thesis Autor Beata Bachrata Link Publikation -
2022
Titel Unsupervised physiological noise correction of functional magnetic resonance imaging data using phase and magnitude information (PREPAIR) DOI 10.1002/hbm.26152 Typ Journal Article Autor Bancelin D Journal Human Brain Mapping Seiten 1209-1226 Link Publikation -
2022
Titel NeXtQSM—A complete deep learning pipeline for data-consistent Quantitative Susceptibility Mapping trained with hybrid data DOI 10.1016/j.media.2022.102700 Typ Journal Article Autor Cognolato F Journal Medical Image Analysis Seiten 102700 Link Publikation -
2020
Titel Phase Unwrapping with a Rapid Opensource Minimum Spanning TreE AlgOrithm (ROMEO) DOI 10.1101/2020.07.24.214551 Typ Preprint Autor Dymerska B Seiten 2020.07.24.214551 Link Publikation -
2021
Titel Quantitative susceptibility mapping of the head-and-neck using SMURF fat-water imaging with chemical shift and relaxation rate corrections DOI 10.1002/mrm.29069 Typ Journal Article Autor Bachrata B Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 1461-1479 Link Publikation -
2020
Titel Simultaneous Multiple Resonance Frequency imaging (SMURF): Fat-water imaging using multi-band principles DOI 10.1002/mrm.28519 Typ Journal Article Autor Bachrata B Journal Magnetic Resonance in Medicine Seiten 1379-1396 Link Publikation
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2024
Link
Titel Adoption in Consensus Practice DOI 10.1002/mrm.30006 Typ Contribution to new or improved professional practice Link Link
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2023
Link
Titel CLEAR-SWI DOI 10.1016/j.neuroimage.2021.118175 Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link -
2020
Link
Titel Phase unwrapping method DOI 10.1002/mrm.28563 Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link
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2021
Titel 2021 ISMRM Young Investigator Award Typ Research prize DOI 10.1002/mrm.29069 Bekanntheitsgrad Continental/International