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Multimodale Bildgebung des Hirnstamms mittels MRT

Structural and functional mapping of the brainstem with MRI

Simon Daniel Robinson (ORCID: 0000-0001-7463-5162)
  • Grant-DOI 10.55776/P31452
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2018
  • Projektende 30.06.2024
  • Bewilligungssumme 384.554 €

Wissenschaftsdisziplinen

Klinische Medizin (70%); Medizinisch-theoretische Wissenschaften, Pharmazie (10%); Medizintechnik (20%)

Keywords

    Magnetic Resonance Imaging (MRI), Ultra-high field, Deep Brain Stimulation (DBS), Functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI), Quantitative Susceptibility Mapping (QSM), Brainstem

Abstract Endbericht

Der Hirnstamm nimmt eine wichtige Rolle im zentralen Nervensystem ein, unter anderem überträgt er Signale von Groß- und Kleinhirn in den Rest des Körpers. Seine Integrität ist von besonderer Bedeutung für Motorfunktion, Lebensqualität und Lebenserwartung bei altersbedingten Erkrankungen, wie der Parkinson-Krankheit. Sie ist eine neurodegenerative Erkrankung, die Mittelhirn- und Hirnstammstrukturen betrifft und zu Muskelsteifheit, Muskelzittern, Sprech- und Gehschwierigkeiten führt. Bei manchen Patienten lassen sich die Symptome Medikamentös lindern, viele leiden jedoch letztendlich unter einem allgemeinen Rückgang der motorischen Funktionen. Die Tiefenhirnstimulation stellt eine wirksame Behandlungsoption für viele Parkinson-Patienten dar, bei denen Medikamente keine Wirkung zeigen. Ein implantierter Hirnschrittmacher stimuliert bestimmte tiefliegende Bereiche des Gehirns oder Hirnstamms und kann somit motorische Ausfälle vermeiden. Gegenwärtig werden die Stimulationselektroden auf der Grundlage von Atlanten platziert, die mit Magnetresonanztomographiebildern (MRT) des Patienten verknüpft werden. Diese Vorgehensweise ist jedoch durch die geringe Anzahl der in Atlanten dargestellten Nuclei des Hirnstamms limitiert und ist außerdem aufgrund der anatomischen Variabilität zwischen den Patienten unzuverlässig. Die Tiefenhirnstimulation könnte stark verbessert werden, indem bei jedem Patienten die tiefliegenden Stimulationsorte individuell identifiziert werden. Auf konventionellen MRT-Bildern sind diese aufgrund ihrer geringen Größe und des begrenzten Kontrastes nur schwer zu erkennen, sie sind auf MRT-Bildern der kürzlich entwickelten Methode quantitative Suszeptibilitätsabbildung (QSM) jedoch gut erkennbar. Außerdem können sie auch mittels "funktioneller" MRT (fMRT) sichtbar gemacht werden, da fMRT die aktiven Gehirnareale bei Durchführung einer Aufgabe zeigt. Diese beiden Methoden, QSM und fMRT, können derzeit nicht zur Planung der Tiefenhirnstimulation verwendet werden, da sie zwei lange Messungen umfassen, bei denen die Patienten äußerst still liegen müssen, was ein besonderes Problem für viele Parkinson-Patienten darstellt. In diesem Projekt wird die Entwicklung einer neuen schnellen MRT-Methode vorgeschlagen, die hochauflösende QSM- und fMRT-Bilder aus derselben Messung generiert. Dieses Projekt wird an einem Gerät der der neuesten Generation von Ultrahochfeld (7 T) MRT-Scannern durchgeführt, wodurch höhere Bildauflösungen erzielt werden können. Neben der Realisierung dieses kombinierten strukturellen und funktionellen Scans wird das Projekt i) Methoden entwickeln, um jegliche Verzerrungen aus den fMRT-Daten zu entfernen, die sonst die genaue Lokalisation der Hirnstammstrukturen erschweren würden ii) durch Atmung und Herzpuls bedingte Signalfluktuationen in den fMRT-Daten identifizieren und entfernen, da diese sonst die neuronale Aktivierung überschatten und iii) ein bewegungskorrigiertes QSM-Bild mit erhöhter Auflösung erzeugen. In Kombination mit geeigneten fMRT-Aufgaben wird diese Sequenz zur simultanen funktionellen und strukturellen Identifizierung von Zielen im Hirnstamm (mit dem Akronym "FAST- STEM") in der Lage sein, mehrere Mittelhirn- und Hirnstammziele zur Tiefenhirnstimulation in einer für Parkinson-Patienten tolerierbaren Untersuchungszeit zu identifizieren. Schließlich wird diese neue Vorgehensweise zur Abbildung des Hirnstamms auf einen klinischen 3 T MRT-Scanner übertragen, um sicherzustellen, dass Patienten in zukünftigen Studien davon profitieren können. Letztendlich wird erwartet, dass diese Methode der Hirnstammbildgebung neue, effektive Ziele für die Tiefenhirnstimulation identifizieren und präzise lokalisieren kann, was zu einer Linderung der schwächenden Symptome und eine Verbesserung der Lebensqualität der Patienten mit Parkinson-Krankheit zur Folge führt.

Die Parkinson-Krankheit (PD) ist eine neurodegenerative Erkrankung, die durch das Absterben von Neuronen, welche den Neurotransmitter Dopamin produzieren und freisetzen, gekennzeichnet ist. Dies geschieht in einer Vielzahl von Strukturen des Mittelhirns und des Hirnstamms und führt bei den Patienten zu Zittern, Haltungsinstabilität, Steifheit und schließlich zu einem allgemeinen Rückgang der motorischen Funktionen. Die tiefe Hirnstimulation (DBS) ist in vielen Fällen eine wirksame Behandlungsoption für Patienten, die nicht gut auf eine medikamentöse Behandlung ansprechen. Ein chirurgisch implantierter "Hirnschrittmacher" stimuliert Neuronen in bestimmten Regionen der grauen Substanz und des Hirnstamms und verringert so die auftretenden motorischen Einschränkungen. Ziel dieses Projekts war es, MRT-Methoden zu entwickeln, die bei der Identifizierung neuer Bereiche für die Anwendung von DBS im Tiefenhirn und im Hirnstamm helfen. Mithilfe der MRT können eine Vielzahl verschiedener Bilder erzeugt werden, die bestimmte Aspekte der Struktur oder Funktion des Gehirns widerspiegeln. Zum Beispiel können die tief liegenden Regionen der grauen Substanz, die für die DBS von Interesse sind, gut auf quantitativen Suszeptibilitätsabbildungen (QSM), welche sehr eisenreiche Bereiche des Gehirns zeigen, dargestellt werden. Dieselben Bereiche können auch bei der funktionellen Magnetresonanztomographie (fMRT) "aufleuchten", wenn sie durch eine relevante Aufgabe aktiviert werden. Sowohl QSM als auch fMRI profitieren von der Verwendung von MRT-Scannern mit ultrahohem Magnetfeld, wie z. B. dem 7-Tesla-System im Hochfeld-MR-Zentrum in Wien. Die Bildgebung bei 7T ermöglicht die Visualisierung kleiner Zielbereiche in der grauen Substanz mit hoher Empfindlichkeit und ausgezeichneter Auflösung, allerdings bringt die Verwendung eines ultrahohen Feldes auch eine Reihe von Herausforderungen mit sich. Die Forscher, die an diesem Projekt beteiligt waren, entwickelten zunächst eine Methode die es ermöglicht sowohl QSMs als auch fMRI aus denselben 7T Daten zu erzeugen, sowie neue Ansätze zur Korrektur von Verzerrungen und physiologischem Rauschen, die für die Verwendung der Ergebnisse in der Neurochirurgie unerlässlich sind. Anschließend wendeten sie diese Methoden auf eine schnelle Bildgebungsmethode namens 3D EPI und auf eine noch schnellere, bewegungsrobuste Bildgebung unter Verwendung von 2D EPI und einer "Super-Resolution"-Rekonstruktion an, die es ermöglicht, hochauflösende Bilder aus mehreren Sätzen niedrig aufgelöster Bilder zu erzeugen, die in verschiedenen Ebenen aufgenommen wurden. Schließlich konnte das Problem der Bildgebung gelöst werden, dass durch das Vorhandensein von Fett im Kopf und Hals entsteht; ihr Simultaneous, MUltiple Resonance Frequency (SMURF)-Ansatz für die Fett-Wasser-Bildgebung ermöglicht die gleichzeitige Erzeugung getrennter Bilder von Fett und Wasser. Ein Ansatz, der mit dem internationalen Young Investigator Award der International Society of Magnetic Resonance in Medicine ausgezeichnet wurde. Die in diesem Projekt entwickelten Methoden wurden an mehr als die Hälfte der etwa 100 Ultrahochfeld-MRT-Standorte in der ganzen Welt verteilt und von MRT-Anbietern in ihre Forschungspakete aufgenommen. Diese Innovationen haben das quantitative Suszeptibilitäts-Mapping und die funktionelle Magnetresonanztomographie im Unterhirn und im Hirnstamm zur Identifizierung von Zielen für die tiefe Hirnstimulation verbessert.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Markus Barth, University of Queensland Australia - Australien

Research Output

  • 241 Zitationen
  • 23 Publikationen
  • 1 Policies
  • 2 Methoden & Materialien
  • 1 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2024
    Titel Magnetic resonance elastography resolving all gross anatomical segments of the kidney during controlled hydration.
    DOI 10.3389/fphys.2024.1327407
    Typ Journal Article
    Autor Darwish O
    Journal Frontiers in physiology
    Seiten 1327407
  • 2024
    Titel Three-dimensional EPI with shot-selective CAIPIRIHANA for rapid high-resolution quantitative susceptibility mapping at 3T.
    DOI 10.1002/mrm.30101
    Typ Journal Article
    Autor Jin J
    Journal Magnetic resonance in medicine
    Seiten 997-1010
  • 2024
    Titel Recommended implementation of quantitative susceptibility mapping for clinical research in the brain: A consensus of the ISMRM electro-magnetic tissue properties study group.
    DOI 10.1002/mrm.30006
    Typ Journal Article
    Autor Bilgic B
    Journal Magnetic resonance in medicine
    Seiten 1834-1862
  • 2023
    Titel Magnetic susceptibility changes in the brainstem reflect REM sleep without atonia severity in isolated REM sleep behavior disorder.
    DOI 10.1038/s41531-023-00557-2
    Typ Journal Article
    Autor Nepozitek J
    Journal NPJ Parkinson's disease
    Seiten 112
  • 2023
    Titel Super-resolution QSM in little or no additional time for imaging (NATIve) using 2D EPI imaging in 3 orthogonal planes.
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2023.120419
    Typ Journal Article
    Autor Bachrata B
    Journal NeuroImage
    Seiten 120419
  • 2019
    Titel Improving sensitivity, specificity, and reproducibility of individual brainstem activation
    DOI 10.1007/s00429-019-01936-3
    Typ Journal Article
    Autor Matt E
    Journal Brain Structure and Function
    Seiten 2823-2838
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Improved susceptibility weighted imaging at ultra-high field using bipolar multi-echo acquisition and optimized image processing: CLEAR-SWI
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2021.118175
    Typ Journal Article
    Autor Eckstein K
    Journal NeuroImage
    Seiten 118175
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Feasibility of Hepatic Fat Quantification Using Proton Density Fat Fraction by Multi-Echo Chemical-Shift-Encoded MRI at 7T
    DOI 10.3389/fphy.2021.665562
    Typ Journal Article
    Autor Korínek R
    Journal Frontiers in Physics
    Seiten 665562
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Developments in ultra-high field functional magnetic resonance imaging and quantitative susceptibility mapping for clinical applications
    Typ Postdoctoral Thesis
    Autor Simon Robinson
  • 2023
    Titel Improved dynamic distortion correction for fMRI using single-echo EPI and a readout-reversed first image (REFILL).
    DOI 10.1002/hbm.26440
    Typ Journal Article
    Autor Bachrata B
    Journal Human brain mapping
    Seiten 5095-5112
  • 2022
    Titel Phase-based masking for quantitative susceptibility mapping of the human brain at 9.4T
    DOI 10.1002/mrm.29368
    Typ Journal Article
    Autor Hagberg G
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 2267-2276
    Link Publikation
  • 2021
    Titel QSMxT: Robust masking and artifact reduction for quantitative susceptibility mapping
    DOI 10.1002/mrm.29048
    Typ Journal Article
    Autor Stewart A
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 1289-1300
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Improved methods for ultra-high field magnetic susceptibility imaging
    Typ PhD Thesis
    Autor Korbinian Eckstein
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Phase unwrapping with a rapid opensource minimum spanning tree algorithm (ROMEO)
    DOI 10.1002/mrm.28563
    Typ Journal Article
    Autor Dymerska B
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 2294-2308
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Reinforcement and Punishment Shape the Learning Dynamics in fMRI Neurofeedback
    DOI 10.3389/fnhum.2020.00304
    Typ Journal Article
    Autor Klöbl M
    Journal Frontiers in Human Neuroscience
    Seiten 304
    Link Publikation
  • 2019
    Titel The Impact of Echo Time Shifts and Temporal Signal Fluctuations on BOLD Sensitivity in Presurgical Planning at 7 T
    DOI 10.1097/rli.0000000000000546
    Typ Journal Article
    Autor Dymerska B
    Journal Investigative Radiology
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Intra-session and inter-subject variability of 3D-FID-MRSI using single-echo volumetric EPI navigators at 3T
    DOI 10.1002/mrm.28076
    Typ Journal Article
    Autor Moser P
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 1920-1929
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Simultaneous, separate water and fat imaging with magnetic resonance imaging using selective excitation and CAIPIRINHA
    Typ PhD Thesis
    Autor Beata Bachrata
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Unsupervised physiological noise correction of functional magnetic resonance imaging data using phase and magnitude information (PREPAIR)
    DOI 10.1002/hbm.26152
    Typ Journal Article
    Autor Bancelin D
    Journal Human Brain Mapping
    Seiten 1209-1226
    Link Publikation
  • 2022
    Titel NeXtQSM—A complete deep learning pipeline for data-consistent Quantitative Susceptibility Mapping trained with hybrid data
    DOI 10.1016/j.media.2022.102700
    Typ Journal Article
    Autor Cognolato F
    Journal Medical Image Analysis
    Seiten 102700
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Phase Unwrapping with a Rapid Opensource Minimum Spanning TreE AlgOrithm (ROMEO)
    DOI 10.1101/2020.07.24.214551
    Typ Preprint
    Autor Dymerska B
    Seiten 2020.07.24.214551
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Quantitative susceptibility mapping of the head-and-neck using SMURF fat-water imaging with chemical shift and relaxation rate corrections
    DOI 10.1002/mrm.29069
    Typ Journal Article
    Autor Bachrata B
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 1461-1479
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Simultaneous Multiple Resonance Frequency imaging (SMURF): Fat-water imaging using multi-band principles
    DOI 10.1002/mrm.28519
    Typ Journal Article
    Autor Bachrata B
    Journal Magnetic Resonance in Medicine
    Seiten 1379-1396
    Link Publikation
Policies
  • 2024 Link
    Titel Adoption in Consensus Practice
    DOI 10.1002/mrm.30006
    Typ Contribution to new or improved professional practice
    Link Link
Methoden & Materialien
  • 2023 Link
    Titel CLEAR-SWI
    DOI 10.1016/j.neuroimage.2021.118175
    Typ Improvements to research infrastructure
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2020 Link
    Titel Phase unwrapping method
    DOI 10.1002/mrm.28563
    Typ Improvements to research infrastructure
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Disseminationen
  • 2021 Link
    Titel Q&A Interview in Society Magazine
    Typ A magazine, newsletter or online publication
    Link Link
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2021
    Titel 2021 ISMRM Young Investigator Award
    Typ Research prize
    DOI 10.1002/mrm.29069
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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