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Ubiquitin E3 Ligasen und Zellpolarität in Arabidopsis

Ubiquitin E3 Ligases and Cell Polarity in Arabidopsis

Christian Luschnig (ORCID: 0000-0003-2099-9280)
  • Grant-DOI 10.55776/P31493
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2018
  • Projektende 30.11.2023
  • Bewilligungssumme 374.572 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    PIN Proteins, E3 Ubiquitin Ligase, Auxin, Arabidopsis, Protein Ubiquitylation, Polar Protein Sorting

Abstract Endbericht

Im Allgemeinen zeichnen sich höhere Pflanzen durch gerichtetes Wachstum aus, wobei die Sprossachse nach oben ausgerichtet ist, wohingegen Wurzeln in den Boden wachsen. Die Etablierung dieser Hauptwachstumsachsen erfolgt bereits in sehr frühen Stadien der Pflanzenentwicklung und wird über den gesamten Lebenszyklus beibehalten. Gerichtetes Wachstum von pflanzlichen Organen ist unter vielfältiger Kontrolle und reagiert auf Entwicklungs- und Umweltsignale, was eine flexible Anpassung der Pflanzenentwicklung in Abhängigkeit von Umweltfaktoren erlaubt. Vor einigen Jahrzehnten wurde der Pflanzenwachstumsregulator Auxin als Schlüsselregulator des gerichteten Wachstums identifiziert. Dieses kleine Molekül wird in zellteilungsaktivem Gewebe produziert, von wo es aktiv durch den gesamten Pflanzenkörper transportiert wird und dadurch eine Vielzahl von Entwicklungsprozessen beeinflusst. Der Transport des Wachstumsregulators über zelluläre Plasmamembrangrenzen hinweg wird durch eine pflanzenspezifische Familie von Membranproteinen kontrolliert, die die Freisetzung von Auxin aus dem Zellinneren in seine Umgebung vermittelt, von wo es von benachbarten Zellen wiederum aufgenommen wird. Diese PIN- FORMED-(PIN)-Proteine zeigen oftmals eine asymmetrische Verteilung in der Plasmamembran, begrenzt auf mehr oder weniger große Abschnitte. Weiters konnte gezeigt werden, dass diese Polarität in der PIN-Verteilung die Richtung des Auxintransportes definiert. So führt eine Anreicherung von PIN Protein an immer der gleichen Seite von benachbarten Zellen dazu, dass der Auxintransport in diesem Zellverband genau in diese eine Richtung erfolgt. Zudem ist die Lokalisierung von PIN Proteinen nicht statisch, sondern variiert im Zuge der Pflanzenentwicklung, was wiederum Anpassungen in der Pflanzenentwicklung ermöglicht. Die Mechanismen der Sortierung und Verteilung von PIN-Proteinen sind Gegenstand intensiver Forschung und sollen auch in diesem Projekt behandelt werden. Mein Labor identifizierte eine kleine Gruppe von Proteinen, sogenannte Ubiquitin-Ligasen, in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana, die die reversible Bindung des kleinen Proteins Ubiquitin an Zielproteine katalysieren. Das Anhängen eines oder mehrerer Ubiquitineinheiten beeinflusst Funktion, Stabilität und intrazelluläre Verteilung von Proteinen, mit weitreichenden Auswirkungen auf unterschiedlichste zelluläre Prozesse. Im Fall der oben genannten Arabidopsis Ubiquitin-Ligasen führt deren Ausfall zu einer drastischen Änderung in der Lokalisierung eines PIN-Proteins von der oberen zur unteren Seite von Wurzelzellen. Diese Aberration wiederumbewirkt schwerwiegendeDefekte imAuxintransport undin der Wurzelentwicklung, wasdieWichtigkeit einer korrekten PIN-Positionierung für die Pflanzenentwicklung unterstreicht. In diesem Projekt sollen molekularen Mechanismen charakterisiert werden, die den Effekten dieser Ubiquitin-Ligasen auf Zellpolarität zugrunde liegen. Insbesondere sollen Zielproteine der Ubiquitin-Ligasen und deren Funktion bei der Kontrolle der PIN Verteilung identifiziert werden. In weiteren genetischen und zellbiologischen Ansätzen soll die Funktion der Ubiquitin-Ligasen in bereits etablierte Signal- und Proteinsortierungsnetzwerke integriert werden, was zu einem besseren Verständnis dieser bisher unbekannten Mechanismen der Polaritätskontrolle in höheren Pflanzen beitragen sollte.

PR-Zusammenfassung FWF 31493 Pflanzen als Primärressource aller lebenden Materie sind permanent Umweltsignalen und -reizen ausgesetzt, die die Entwicklung von Pflanzen und damit deren Vitalität nachhaltig beeinflussen. Pflanzen haben dazu eine Vielzahl von Mechanismen etabliert, die es ermöglichen, die Pflanzenentwicklung auch an extreme Bedingungen anzupassen und zu optimieren. Die adaptiven Wachstumsprozesse von Pflanzen werden oftmals durch hormonelle Signale gesteuert, wobei Auxin eines der vielseitigsten dieser Pflanzenhormone repräsentiert. Der Schlüssel zur Aktivität von Auxin in Adaptationsprozessen ist ein streng regulierter, gerichteter Transport durch den gesamten Pflanzenkörper. Die Ausrichtung des Auxintransports wird durch die asymmetrische, polare Verteilung der pflanzenspezifischen PIN-Proteine definiert, die Auxin aus dem Inneren einer Zelle in den extrazellulären Raum transportieren, von wo es von benachbarten Zellen wieder aufgenommen wird. Dieser stark polarisierte zelluläre Auxin-Export definiert dadurch Richtung und Amplitude des Hormontransports in Pflanzengeweben und ganzen Organen. Veränderungen in der Verteilung von PIN-Proteinen beeinflussen somit die Ausrichtung des Auxintransports und eine Vielzahl von Entwicklungsprozessen, die durch Auxin gesteuert werden. In diesem Projekt charakterisierten wir eine bisher unbekannte Familie pflanzlicher Proteine, welche die zelluläre Verteilung der PIN-Verteilung reguliert. Konkret führt ein Verlust der Funktionalität der sogenannten WAV3-Proteine zu einem Switch in der Polarität ausgewählter PIN-Proteine, die sich dann nicht mehr an der oberen/apikalen Seite der Zellen ansammeln, sondern stattdessen an der unteren/basalen Seite dieser Zellen zu finden sind. Als Konsequenz dieser dramatisch veränderten Polarität wird der gerichtete Auxintransport -und somit pflanzliche Adaptationsprozesse- nachhaltig gestört. Proteine vom WAV3-Typ weisen selbst eine polare Lokalisierung an der basalen Zelldomäne auf. Diese lokalisierte Verteilung wiederum scheint für die korrekte Sortierung der PIN-Proteine, die sich in der apikalen Zelldomäne ansammeln sollen, von entscheidender Bedeutung zu sein. Darüber hinaus konnten wir in diesem Projekt einige grundlegende Mechanismen identifizieren, durch die WAV3-Proteine die Sortierung von PIN-Proteinen beeinflussen. Erstaunlicherweise zeigt auch die Verteilung der WAV3-Proteine selbst eine gewisse Dynamik, die wiederum die dynamische Umverteilung von PIN-Proteinen in adaptiven Wachstumsreaktionen beeinflusst. Die Aufklärung der Mechanismen, durch die diese Dynamik in der WAV3-Proteinlokalisierung die Verteilung von PIN-Proteinen steuert, ist Gegenstand eines weiteren derzeit laufenden, vom FWF geförderten Projekts. Diese aktuellen Arbeiten sollen zu einem besseren Verständnis jener Mechanismen beitragen, mit denen Pflanzen ihr Wachstum an geänderte Umweltbedingungen anpassen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität für Bodenkultur Wien - 100%

Research Output

  • 391 Zitationen
  • 9 Publikationen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2021
    Titel Auxin and Root Gravitropism: Addressing Basic Cellular Processes by Exploiting a Defined Growth Response
    DOI 10.3390/ijms22052749
    Typ Journal Article
    Autor Konstantinova N
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 2749
    Link Publikation
  • 2022
    Titel WAVY GROWTH Arabidopsis E3 ubiquitin ligases affect apical PIN sorting decisions
    DOI 10.1038/s41467-022-32888-8
    Typ Journal Article
    Autor Konstantinova N
    Journal Nature Communications
    Seiten 5147
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Endosomally Localized RGLG-Type E3 RING-Finger Ligases Modulate Sorting of Ubiquitylation-Mimic PIN2
    DOI 10.3390/ijms23126767
    Typ Journal Article
    Autor Retzer K
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 6767
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Modulation of abscisic acid signaling via endosomal TOL proteins
    DOI 10.1111/nph.19904
    Typ Journal Article
    Autor Moulinier-Anzola J
    Journal New Phytologist
    Seiten 1065-1081
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Auxin signalling in growth: Schrödinger’s cat out of the bag
    DOI 10.1016/j.pbi.2019.10.003
    Typ Journal Article
    Autor Gallei M
    Journal Current Opinion in Plant Biology
    Seiten 43-49
  • 2019
    Titel Brassinosteroid signaling delimits root gravitropism via sorting of the Arabidopsis PIN2 auxin transporter
    DOI 10.1038/s41467-019-13543-1
    Typ Journal Article
    Autor Retzer K
    Journal Nature Communications
    Seiten 5516
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Pho-view of Auxin: Reversible Protein Phosphorylation in Auxin Biosynthesis, Transport and Signaling
    DOI 10.1016/j.molp.2020.11.004
    Typ Journal Article
    Autor Tan S
    Journal Molecular Plant
    Seiten 151-165
    Link Publikation
  • 2020
    Titel TOLs Function as Ubiquitin Receptors in the Early Steps of the ESCRT Pathway in Higher Plants
    DOI 10.1016/j.molp.2020.02.012
    Typ Journal Article
    Autor Moulinier-Anzola J
    Journal Molecular Plant
    Seiten 717-731
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Plants on (brassino)steroids
    DOI 10.1038/s41477-021-00918-w
    Typ Journal Article
    Autor Korbei B
    Journal Nature Plants
    Seiten 548-549
Weitere Förderungen
  • 2024
    Titel PIN polarity control by Arabidopsis WAV3-type proteins
    Typ Research grant (including intramural programme)
    DOI 10.55776/pat8419423
    Förderbeginn 2024
    Geldgeber University of Natural Resources and Life Sciences

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