Funktionelle Prinzipien der Legumain-Macrocypin Interaktion
Functional principles of legumain inhibition by macrocypin
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (50%); Chemie (30%); Informatik (20%)
Keywords
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Reactive Center Loop,
Activity Regulation,
Inhibitor,
Cysteine Protease,
Crystal Structure
Das Leben fordert von uns täglich Entscheidungen, die oftmals nicht rückgängig gemacht werden können. Auch auf der für uns unsichtbaren mikroskopischen Ebene des Lebens müssen Entscheidungen getroffen werden, die weitreichende Konsequenzen nach sich ziehen. Auf zellulärer Ebene sind Enzyme zentrale Wegweiser für die biologische Signalverarbeitung. Enzyme sind regulatorische Moleküle, die eine entscheidende Funktion in allen biologischen Prozessen in allen lebenden Organismen haben. Innerhalb der enormen Palette an Enzyme repräsentieren die Proteasen eine besonders wichtige Subspezies. Proteasen funktionieren als molekulare Scheren, die ein Zielprotein an einer spezifischen Stelle schneiden und so eine wichtige Rolle als Schaltstellen in der biologischen Signalverarbeitung spielen. Um sicher zu stellen, dass das richtige Signal zur richtigen Zeit weitergegeben wird, muss dieser Prozess streng reguliert und kontrolliert werden. Falsche Signale können sich in schweren Krankheiten wie Krebs und Alzheimer manifestieren. Ein Paradebeispiel für eine Protease mit besonders wichtiger Funktion fürs Immunsystem ist das Legumain. Legumain spaltet fremde Proteine, z.B. von einem bakteriellen Erreger, in einer bestimmten Art und Weise, so dass sie von unserem Immunsystem als fremd erkannt werden können. Idealerweise bewirkt das, dass eine Immunreaktion ausgelöst wird, um uns vor fremden Gefahren zu schützen. Andererseits ist es allerdings auch so, dass ein Zuwenig oder Zuviel an Legumain mit schwerwiegenden Erkrankungen wie Multiple Sklerose und Krebs assoziiert ist. Daher ist es wichtig, Legumain in seiner Aktivität streng zu regulieren/kontrollieren um pathologische Fehlfunktionen zu verhindern. Die Natur hat sich eine Reihe verschiedener Strategien überlegt, um das zu ermöglichen. Eine effiziente Strategie ist die Entwicklung von Molekülen, die spezifisch ans Legumain binden und so verhindern, dass es andere Proteine schneiden kann. Für Legumain sind von diesen regulatorischen Molekülen, sogenannten Inhibitoren, bis heute nur zwei Arten bekannt. Eine davon sind die Macrocypine aus dem Parasol. Macrocypine sind besonders interessant für uns, da sie sehr resistent gegen äußere Einflüsse wie extreme Säurestärke oder hohe Temperaturen sind. Diese speziellen Eigenschaften machen sie zu einem attraktiven Ausgangspunkt für biotechnologische Anwendungen wie z.B. die Entwicklung bioaktiver Moleküle. Innerhalb des Projekts Funktionelle Prinzipien der Legumain-Macrocypin Interaktion untersuchen wir, wie Macrocypine auf atomarer Ebene ans Legumain binden und welche mechanistischen Konsequenzen diese Bindung hat. Um diese Fragen zu untersuchen, kombinieren wir eine breite Palette an biochemischen, biophysikalischen und strukturbiologischen Methoden um ein detailliertes Verständnis für diese Wechselwirkung zu erhalten. Die Ergebnisse dieser Studie werden es uns ermöglichen, neue legumain-reaktive Substanzen zu entwickeln, die auch in der medizinischen und biotechnologischen Forschung Anwendung finden werden.
Enzyme sind wichtige Moleküle, die entscheidende Funktionen in allen lebenden Organismen erfüllen. Proteasen sind eine spezielle Art von Enzymen, die als Signalmoleküle wirken, indem sie andere Proteine zerschneiden. Die Signalübertragung muss auf verschiedenen Ebenen reguliert werden, um sicherzustellen, dass die richtige Reaktion zur richtigen Zeit stattfindet. Falsche Signale können zu schweren Erkrankungen wie Krebs oder neurodegenerativen Krankheiten führen. Ein Beispiel für eine Protease, die besonders wichtig für unser Immunsystem ist, ist Legumain. Legumain spaltet fremde Proteine auf eine Weise, dass sie von unserem Immunsystem erkannt werden können. Infolgedessen wird eine Immunreaktion ausgelöst, um uns vor fremden Gefahren wie Bakterien zu schützen. Allerdings wurden zu hohe Mengen an Legumain oder eine falsche Lokalisation mit Störungen wie Brustkrebs und der Alzheimer-Krankheit in Verbindung gebracht. Es ist klar, dass die Aktivität von Legumain sorgfältig reguliert werden muss, um pathologische Störungen zu verhindern. Die Natur hat verschiedene Möglichkeiten entwickelt, um die Funktion von Legumain zu kontrollieren, und eine effektive Methode besteht darin, spezifische Proteine namens "Inhibitoren" einzusetzen. Diese Inhibitoren binden an Legumain und verhindern, dass es andere Proteine zerschneidet. Eine interessante Gruppe von Inhibitoren stammt aus dem Parasolpilz und wird als "Macrocypine" bezeichnet. Sie sind auch unter extremen Bedingungen stabil, was sie zu attraktiven Ausgangspunkten für biotechnologische Anwendungen macht. Das Forschungsprojekt "Funktionelle Prinzipien der Legumain-Macrocypin Interaktion" konzentrierte sich darauf zu untersuchen, wie Macrocypine auf molekularer Ebene mit Legumain interagieren. Im Rahmen dieses Projekts haben wir erfolgreich die dreidimensionale Struktur von Legumain im Komplex mit verschiedenen Macrocypinen bestimmt, wodurch wir einen detaillierten Plan ihrer Interaktion erhalten haben. Die Ergebnisse enthüllten den genauen Mechanismus, durch den Macrocypine an Legumain binden und sie von Substraten (Proteinen, die typischerweise von Enzymen gespalten werden) in wirksame Inhibitoren umwandeln. Bemerkenswerterweise bilden einige Macrocypine kovalente Wechselwirkungen mit Legumain, eine starke und stabile Art von Bindung, die ihre hemmende Aktivität weiter verstärkt. Darüber hinaus fanden wir heraus, dass bestimmte Isoformen von Macrocypinen andere Cysteinproteasen hemmen, was darauf hindeutet, dass sie möglicherweise bisher unbekannte Breitspektrum-Inhibitoren sind. Zusammenfassend haben unsere Studien das Potenzial von Macrocypinen als neues Gerüst für die Arzneimittelentwicklung aufgedeckt und bieten die Grundlage für das Design von spezifischen Legumain-Inhibitoren.
- Universität Salzburg - 100%
Research Output
- 61 Zitationen
- 10 Publikationen
- 2 Datasets & Models
- 3 Wissenschaftliche Auszeichnungen
- 3 Weitere Förderungen
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2022
Titel Legumain Activity Is Controlled by Extended Active Site Residues and Substrate Conformation DOI 10.3390/ijms232012548 Typ Journal Article Autor Elamin T Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 12548 Link Publikation -
2022
Titel Structural and functional studies of legumain–mycocypin complexes revealed a competitive, exosite-regulated mode of interaction DOI 10.1016/j.jbc.2022.102502 Typ Journal Article Autor Elamin T Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 102502 Link Publikation -
2021
Titel The Peptide Ligase Activity of Human Legumain Depends on Fold Stabilization and Balanced Substrate Affinities DOI 10.1021/acscatal.1c02057 Typ Journal Article Autor Dall E Journal ACS Catalysis Seiten 11885-11896 Link Publikation -
2020
Titel Structural and functional studies of Arabidopsis thaliana legumain beta reveal isoform specific mechanisms of activation and substrate recognition DOI 10.1074/jbc.ra120.014478 Typ Journal Article Autor Dall E Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 13047-13064 Link Publikation -
2023
Titel Phytocystatin 6 is a context-dependent, tight-binding inhibitor of Arabidopsis thaliana legumain isoform ß DOI 10.1101/2023.05.22.541692 Typ Preprint Autor Santos N Seiten 2023.05.22.541692 Link Publikation -
2023
Titel Arabidopsis thaliana Phytocystatin 6 Forms Functional Oligomer and Amyloid Fibril States DOI 10.1021/acs.biochem.3c00530 Typ Journal Article Autor Santos N Journal Biochemistry Seiten 3420-3429 Link Publikation -
2022
Titel Production of Functional Plant Legumain Proteases Using the Leishmania tarentolae Expression System DOI 10.1007/978-1-0716-2079-3_4 Typ Book Chapter Autor Dall E Verlag Springer Nature Seiten 35-51 -
2023
Titel Legumain Functions as a Transient TrkB Sheddase DOI 10.3390/ijms24065394 Typ Journal Article Autor Holzner C Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 5394 Link Publikation -
2023
Titel Arabidopsis thaliana phytocystatin 6 forms functional oligomer and amyloid fibril states DOI 10.1101/2023.09.25.559285 Typ Preprint Autor Santos N Seiten 2023.09.25.559285 Link Publikation -
2023
Titel Phytocystatin 6 is a context-dependent, tight-binding inhibitor of Arabidopsis thaliana legumain isoform ß DOI 10.1111/tpj.16458 Typ Journal Article Autor Santos N Journal The Plant Journal Seiten 1681-1695 Link Publikation
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2022
Titel Crystal structure of human legumain in complex with macrocypin 1a DOI 10.2210/pdb8ae5/pdb Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich -
2022
Titel Crystal structure of human legumain in complex with Clitocypin 2 DOI 10.2210/pdb8ae4/pdb Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich
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2022
Titel FWF START prize Typ Research prize Bekanntheitsgrad National (any country) -
2022
Titel Invited speaker at Plant Protease Meeting 2022 in Ljubljana Typ Personally asked as a key note speaker to a conference Bekanntheitsgrad Continental/International -
2021
Titel Prize for best poster presentation at the Winterschool on Proteinases and their Inhibitors 2021 Typ Poster/abstract prize Bekanntheitsgrad Continental/International
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2022
Titel Ready to use Legumain Typ Capital/infrastructure (including equipment) Förderbeginn 2022 -
2021
Titel Poster Prize to NPS Typ Travel/small personal Förderbeginn 2021 Geldgeber Henner Graeff Foundation -
2022
Titel Travel grant to NPS for the participation at the Plant Proteases meeting 2022 in Ljubljana, Slovenia Typ Travel/small personal Förderbeginn 2022