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Das Schwefel-Mikrobiom der Feuchtgebiete

The wetland sulfur microbiome

Alexander Loy (ORCID: 0000-0001-8923-5882)
  • Grant-DOI 10.55776/P31996
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.09.2019
  • Projektende 28.02.2025
  • Bewilligungssumme 399.000 €
  • Projekt-Website
  • E-Mail

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Metagenomics, Green House Gas, Microbial Ecology, Wetland, Sulfur Cycle, Sulfur Metabolism

Abstract

Feuchtgebiete sind für etwa ein Drittel der weltweiten jährlichen Emission des potenten Treibhausgases Methan verantwortlich und sind dadurch für den globalen Kohlenstoffkreislauf und den Klimawandel von entscheidenderBedeutung.Schwefel-Mikroorganismen spielenin Feuchtgebieten eine wichtige, aber bislang unterbewertete Rolle beim Abbau organischen Materials und bei der Kontrolle von Methanemissionen, indem sie die Kohlenstoff-Zufuhr für methanproduzierende Archaeen einschränken. Während einige wenige Studien erste Einblicke in die Identität und ökologische Rolle sulfatreduzierender Bakterien lieferten, ist über Mikroorganismen, die an den vielen einzelnen Schritten des Schwefelkreislaufs in Feuchtgebieten beteiligt sind, bislang wenig bekannt. Ziel dieses Projektes ist es einen ersten umfassenden Überblick über das Schwefel-Mikrobiom in Feuchtgebieten zu erhalten. Ausgewählte Forschungsfragen sind: Was ist die Identität und ökologische Funktion von Mikroorganismen die Schwefelverbindungen mit intermediären Oxidationsstufen, wie z.B. Sulfit, Thiosulfat, Tetrathionat oder elementaren Schwefel, zur Energiegewinnung reduzieren oder oxidieren? Welche physiologischen Interaktionen gibt es zwischen Generalisten, die mehrere Schwefelverbindungen verschiedener Oxidationsstufen verwenden, und Spezialisten, die nur ausgewählte Schwefelverbindungen verwenden? Wie ist der Schwefelstoffwechsel an die Nutzung von Verbindungen anderer Elementzyklen wie Kohlenstoff, Stickstoff und Eisen gekoppelt? Um eine Genom-Sammlung von unkultivierten Schwefel-Mikroorganismen aufzubauen und deren mutmaßlichen physiologischen Funktionen und Interaktionen zu ermitteln, werden wir zunächst auf bereits verfügbare Metagenome, Metatranskriptome und komplementäre biogeochemische Daten aus verschiedenen natürlichen Feuchtgebieten oder Experimenten in Feuchtgebieten zurückgreifen. Genombasierte physiologische Vorhersagen werden anschließend in einer Reihe von definierten Experimenten mit Boden-Mikrokosmen evaluiert. Die Kombination von modernen genom- zentrischen Omics-Ansätzen mit Experimenten zur gezielten Untersuchung spezifischer Hypothesen wird zu einem besseren Verständnis der Identität, Physiologie und Verbreitung von Schwefel- Mikroorganismen in Feuchtgebieten führen. Diese grundlegenden Erkenntnisse zur mikrobiellen Ökologie in Feuchtgebieten sind notwendig, um zu beurteilen, wie die vielseitigen mikrobiellen Gemeinschaften auf den zukünftigen Anstieg der globalen Temperatur reagieren werden und wie sich damit die Treibhausgasemissionen aus diesen empfindlichen Ökosystemen ändern werden.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Wien - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Gene Tyson, University of Queensland - Australien
  • Michael Pester, Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH - Deutschland
  • Tim Urich, Universität Greifswald - Deutschland
  • Klaus-Holger Knorr, Universität Münster - Deutschland
  • Andreas Schramm, Aarhus University - Dänemark
  • Alexander Tveit, The Arctic University of Norway - Norwegen
  • Joel Kostka, Georgia Institute of Technology - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Susannah Tringe, Lawrence Berkeley National Laboratory - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Michael Wilkins, Ohio State University - Vereinigte Staaten von Amerika
  • Karthik Anantharaman, University of Wisconsin-Madison - Vereinigte Staaten von Amerika

Research Output

  • 83 Zitationen
  • 5 Publikationen
Publikationen
  • 2025
    Titel Extensive richness and novel taxa of sulfoquinovose-degrading bacteria in the cow rumen
    DOI 10.1101/2025.05.20.655074
    Typ Preprint
    Autor Krasenbrink J
    Seiten 2025.05.20.655074
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Sulfur and methane oxidation by a single microorganism
    DOI 10.1073/pnas.2114799119
    Typ Journal Article
    Autor Gwak J
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Global diversity and inferred ecophysiology of microorganisms with the potential for dissimilatory sulfate/sulfite reduction
    DOI 10.1093/femsre/fuad058
    Typ Journal Article
    Autor Diao M
    Journal FEMS Microbiology Reviews
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Draft Genome Sequence of Desulfosporosinus sp. Strain Sb-LF, Isolated from an Acidic Peatland in Germany
    DOI 10.1128/mra.00428-19
    Typ Journal Article
    Autor Hausmann B
    Journal Microbiology Resource Announcements
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Draft Genome Sequence of Desulfosporosinus fructosivorans Strain 63.6FT, Isolated from Marine Sediment in the Baltic Sea
    DOI 10.1128/mra.00427-19
    Typ Journal Article
    Autor Hausmann B
    Journal Microbiology Resource Announcements
    Link Publikation

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