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Der Mechanismus von post-ER assozierter Protein Degradation

The mechanism of post-ER organelle associated degradation

David Teis (ORCID: 0000-0002-8181-0253)
  • Grant-DOI 10.55776/P32161
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.07.2019
  • Projektende 31.12.2023
  • Bewilligungssumme 407.568 €
  • Projekt-Website

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Degradation, Membrane Proteins, Organelles, ERAD, ESCRT, Ubiquitin

Abstract Endbericht

Die Funktion jeder Zelle hängt davon ab, dass alle Proteine voll einsatzfähig sind. Einzellige Eukaryoten haben ca. 50 Millionen Proteine (Bäcker-Hefe) und menschliche Zellen haben ca. 2 Milliarden Proteine. Bei dieser ungeheuren Anzahl überrascht es nicht, dass manche Proteine im Laufe der Zeit defekt werden. Diese defekten Proteine müssen gezielt abgebaut und entsorgt (degradiert) werden. Wenn das nicht passiert häufen sich defekte Proteine an und werden so giftig, dass die Zellen daran sterben und Krankheiten entstehen. In Zellen von Eukaryoten bauen zwei unterschiedliche Mechanismen Membran-Proteine ab. Die sogenannte Endoplasmatisches Retikulum (ER) assoziierte Degradation (ERAD) markiert mit einen kleinen Molekül, das Ubiquitin heißt, Membran-Protein für den Abbau. Ubiquitinierte Membran- Proteine werden aus dem ER gezogen und dann am Proteasome zerstört. Wenn Membran-Proteine aus dem ER transportiert werden und den Golgi, die Endosomen oder die Plasma-Membran erreichen, werden sie von den endosomal sorting complexes required for transport (ESCRT) in Lysosomen gebracht, wo sie dann verdaut werden. Bisher hat man angenommen, dass es neben ERAD und ESCRT keine anderen selektiven Abbauwege für Membran-Proteine gibt. Wir haben nun mithilfe von Genetik im Modelsystem Bäckerhefe einen neuen Membran-Protein- Abbauweg identifiziert, der auf post-ER Organellen (Golgi, Endosomen) operiert, so wie die dazu benötigten Gene, die molekularen Regulatoren und das erste Substrat. Wir haben dieses neue Protein- Abbau System pERAD (post-Endoplasmatisches Retikulum (ER) assoziierte Degradation (ERAD) genannt. Das erste pERAD Substrat ist ein Protein der ORM Familie und steuert die Biosynthese von Sphingolipiden. Sphingolipide sind essentielle Bausteine für die Membranen von eukaryotischen Zellen. Zellen im menschlichen Körper die übermäßig ORM Proteine produzieren, können nicht mehr genug Sphingolipide bilden und als Folge entwickeln sich entzündliche Erkrankungen wie Diabetes, Colitis ulcerosa, Morbus Crohn and Asthma. Wir gehen davon aus dass pERAD eine zentrale Stellung in der zellulären Membran- und Protein- Homöostase von Eukaryoten einnimmt und daher auch für die wichtige Rolle Vermeidung von Krankheiten spielen könnte. Unsere Entdeckung ist der Ausgangspunkt um pERAD besser zu charakterisieren. In diesem Projekt werden wir zunächst versuchen, mit Bäcker-Hefe als Modelsystem, folgende Fragen zu beantworten: (1) Wie erkennt pERAD seine Substrate (2) wie ist pERAD in zelluläre Qualitätskontrolle eingebunden (3) Wie funktioniert der pERAD Mechanismus. Wir erwarten uns, dass die Resultate unserer Studie ein genaues mechanistisches Konzept zu pERAD liefern, dass sich dann relativ einfach auf Zellen von Pflanzen und von Menschen übertragen lässt.

Unsere Forschung präsentiert einen neuen molekularen Mechanismus, der die subzelluläre Organisation von Zellen aufrechterhält, wobei der sogenannte Golgi-Apparat (kurz Golgi) eine bedeutende Rolle spielt. Es war bereits bekannt, dass der Golgi als Hauptsortierstation für Proteine und Lipide dient. Unsere Arbeit enthüllt nun, dass der Golgi auch eine entscheidende Rolle bei der Kontrolle der Membranqualität spielt. Wir haben dabei auch den zugrundeliegenden molekularen Mechanismus entdeckt. Am Golgi befindet sich ein Ubiquitin-Ligase-Komplex, bekannt als der Dsc-Komplex, der in der Lage ist zu erkennen, ob Proteine in dieses Organell gehören oder nicht. Verirrte oder verwaiste Proteine werden erkannt und gezielt abgebaut. Auf diese Weise verhindert der Dsc-Komplex die Ausbreitung verwaister Proteine vom Golgi in andere Zellorganellen und bewahrt so die zelluläre Protein- und Lipidzusammensetzung. Wir sind zuversichtlich, dass unsere Ergebnisse das Verständnis der zellulären Qualitätskontrolle vorantreiben - ein entscheidender Bereich in der Pathologie und in der Biologie im Allgemeinen.

Forschungsstätte(n)
  • Medizinische Universität Innsbruck - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Lynn Kamerlin, University of Uppsala - Schweden

Research Output

  • 140 Zitationen
  • 8 Publikationen
  • 1 Methoden & Materialien
  • 2 Disseminationen
  • 1 Wissenschaftliche Auszeichnungen
Publikationen
  • 2024
    Titel The Dsc ubiquitin ligase complex identifies transmembrane degrons to degrade orphaned proteins at the Golgi
    DOI 10.1101/2024.03.11.584465
    Typ Preprint
    Autor Weyer Y
    Seiten 2024.03.11.584465
    Link Publikation
  • 2024
    Titel The structure of the Orm2-containing serine palmitoyltransferase complex reveals distinct inhibitory potentials of yeast Orm proteins
    DOI 10.1016/j.celrep.2024.114627
    Typ Journal Article
    Autor Körner C
    Journal Cell Reports
    Seiten 114627
    Link Publikation
  • 2024
    Titel The Dsc complex and its role in Golgi quality control
    DOI 10.1042/bst20230375
    Typ Journal Article
    Autor Weyer Y
    Journal Biochemical Society Transactions
    Seiten 2023-2034
    Link Publikation
  • 2024
    Titel The Dsc ubiquitin ligase complex identifies transmembrane degrons to degrade orphaned proteins at the Golgi
    DOI 10.1038/s41467-024-53676-6
    Typ Journal Article
    Autor Weyer Y
    Journal Nature Communications
    Seiten 9257
    Link Publikation
  • 2024
    Titel The structure of the Orm2-containing serine palmitoyltransferase complex reveals distinct inhibitory potentials of yeast Orm proteins
    DOI 10.1101/2024.01.30.577963
    Typ Preprint
    Autor Körner C
    Seiten 2024.01.30.577963
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Protein quality control at the Golgi
    DOI 10.1016/j.ceb.2022.02.008
    Typ Journal Article
    Autor Schwabl S
    Journal Current Opinion in Cell Biology
    Seiten 102074
    Link Publikation
  • 2020
    Titel TOR complex 2 (TORC2) signaling and the ESCRT machinery cooperate in the protection of plasma membrane integrity in yeast
    DOI 10.1074/jbc.ra120.013222
    Typ Journal Article
    Autor Schmidt O
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 12028-12044
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Endosome and Golgi-associated degradation (EGAD) of membrane proteins regulates sphingolipid metabolism
    DOI 10.15252/embj.2018101433
    Typ Journal Article
    Autor Schmidt O
    Journal The EMBO Journal
    Link Publikation
Methoden & Materialien
  • 2024
    Titel yeast strains
    Typ Cell line
    Öffentlich zugänglich
Disseminationen
  • 2019
    Titel Sience Day at the Medical University of Innsbruck
    Typ A talk or presentation
  • 2019
    Titel The faculty contributed to the Sience Day at the Medical University of Innsbruck
    Typ A talk or presentation
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2023
    Titel Gordon Research Conference on Molecular Membrane Biology
    Typ Personally asked as a key note speaker to a conference
    Bekanntheitsgrad Continental/International

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