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Ablösung von Faktoren in der Reifung der 40S-Untereinheit

Assembly factor release in 40S ribosomal subunit maturation

Brigitte Pertschy (ORCID: 0000-0003-3558-0191)
  • Grant-DOI 10.55776/P32320
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.05.2019
  • Projektende 30.06.2024
  • Bewilligungssumme 402.108 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Ribosome Biogenesis, 40S subunit maturation, Ltv1, Enp1, Yeast, Assembly Factor Release

Abstract Endbericht

Ribosomen sind extrem wichtige Nanomaschinen, die für die Produktion von Proteinen in jeder Zelle verantwortlich sind. Dabei ist der Proteinbedarf so hoch, daß jede Zelle etwa 100,000 Ribosomen benötigt, die meist durchgehend Proteine produzieren. Ribosomen müssen aber auch selbst in der Zelle hergestellt werden, und zwar vor allem dann, wenn eine Zelle sich teilt und 100,000 Ribosomen für die Tochterzelle zur Verfügung stellen muß. Aus diesem Grund ist die Ribosomensynthese ein zentraler Prozeß in jeder Zelle, und Fehler in diesem Prozeß stehen in enger Verbindung mit Krankheiten wie Krebs und Knochenmarkserkrankungen. Deshalb ist es sehr wichtig, besser zu verstehen, wie genau die Synthese von neuen Ribosomen funktioniert. Jedes Ribosom ist aus den selben Bausteinen aufgebaut, und zwar aus vier ribosomalen RNAs und 80 verschiedenen ribosomalen Proteinen. Man kann sich die Synthese von Ribosomen wie eine Baustelle vorstellen, in der verschiedene Arbeiter die einzelnen Bausteine in der richtigen Reihenfolge zusammenfügen und dann auch die Struktur der entstehenden Ribosomen weiter formen. Insgesamt sind mehr als 200 verschiedene solche Arbeiter, genannt Assemblierungsfaktoren, an der Produktion jedes einzelnen Ribosoms beteiligt. Die meisten von ihnen sind während ihrer Arbeit sehr fest mit dem Ribosom verbunden, und die Zelle muß sicherstellen, daß sie anschließend auch wieder vollständig entfernt werden. Dies ist wichtig, da einerseits nachfolgende Faktoren nicht richtig arbeiten können undandererseitsauch fertige Ribosomennicht funktionsfähig sind, solange noch Assemblierungsfaktoren anwesend sind. In diesem Projekt wollen wir herausfinden, wie die Zelle die schrittweise Modellierung der Ribosomen mit der Entfernung von Assemblierungsfaktoren koordiniert. Zu diesem Zweck werden wir Hefe-Mutanten herstellen, in denen die Entfernung einzelner Assemblierungsfaktoren blockiert ist. So wollen wir den Ribosomensyntheseprozeß bei dem Schritt, bei dem der Faktor normalerweise entfernt wird, einfrieren. Indem wir anschließend untersuchen, welche Defekte so entstehen, können wir besser verstehen, wie der Prozeß genau abläuft. Darüber hinaus können wir durch Strukturanalysenherausfinden, wie diese "eingefrorenen" Ribosomenvorläufer aussehen. Indem wir solche Analysen mit verschiedenen einzelnen Mutanten durchführen, in denen aufeinanderfolgende Schritte blockiert sind, können wir untersuchen, wie sich die Zusammensetzung und Struktur dieser Ribosomenvorläufer ändert und eine Art "Zeitlupenvideo" über die Abläufe des Prozesses erstellen. Wir erwarten, daß unsere Arbeit zu einem besseren Verständnis darüber führen wird, wie der Ribosomenbiogeneseprozeß funktioniert. Dies wird auch helfen, besser zu verstehen, was die Ursachen von Krankheiten sind, die durch Fehler in der Ribosomensynthese zustande kommen.

Ribosomen sind winzige, essenzielle Maschinen in jeder Zelle, die dafür verantwortlich sind, die Proteine zu produzieren, die unser Körper benötigt, um richtig zu funktionieren. Da diese Maschinen so wichtig sind, müssen Zellen sie sorgfältig in einem komplexen Prozess namens Ribosomenbiogenese zusammenbauen. Fehler in diesem Prozess können schwerwiegende Krankheiten wie Krebs und Knochenmarkserkrankungen verursachen. Um besser zu verstehen, wie Ribosomen entstehen, untersuchen wir diesen Prozess in Hefe, die in den Abläufen der Ribosomenbiogenese dem Menschen ähnelt. Jedes Ribosom besteht aus vier ribosomalen RNAs und etwa 80 verschiedenen ribosomalen Proteinen. Diese Bausteine müssen in einer präzisen Reihenfolge zusammengefügt werden, unterstützt von über 200 spezialisierten Helferproteinen, den Ribosomen-Assemblierungsfaktoren. Da diese in verschiedenen Bereichen des Ribosoms tätig sind, wollten wir verstehen, wie ihre Aktionen koordiniert werden und wie ribosomale Proteine zu diesem komplexen Prozess beitragen. Um dies zu untersuchen, konzentrierten wir uns auf die Wechselwirkungen zwischen den Assemblierungsfaktoren und den Ribosomen in den letzten Bauphasen des Ribosoms. Unsere Forschung zeigte, dass das ribosomale Protein Rps15 in diesen späten Stadien eine entscheidende Rolle spielt, indem es mit mehreren Assemblierungsfaktoren interagiert. Mutationen in Rps15 stören diese wichtigen Schritte und führen zur Herstellung von fehlerhaften Ribosomen mit einer höheren Fehlerquote bei der Proteinsynthese. Dies ist besonders relevant, da ähnliche Mutationen bei Patienten mit chronischer lymphatischer Leukämie gefunden wurden. Unsere Entdeckung unterstreicht die Bedeutung der Erforschung von Rps15, um sowohl die Ribosomenbiogenese, als auch die Ursachen der chronischen lymphatischen Leukämie besser zu verstehen und in Zukunft bessere Behandlungsmöglichkeiten entwickeln zu können. Zusätzlich haben wir untersucht, wie sich Assemblierungsfaktoren schlussendlich vom Ribosom lösen, ein entscheidender Schritt, damit ein neu hergestelltes Ribosom voll funktionsfähig wird. Wir haben entdeckt, dass dieser Prozess eine Reihe sorgfältig koordinierter, voneinander abhängiger Ereignisse und eine komplexe Kommunikation zwischen den Assemblierungsfaktoren erfordert. Wenn ein Teil dieser Reifungskaskade gestört wird, wird der gesamte Prozess unterbrochen, was die endgültige Freisetzung der Assemblierungsfaktoren verhindert. Erst nach dieser Freisetzung kann einer der letzten kritischen Bausteine, das ribosomale Protein Rps10, in das Ribosom integriert werden. Zusammenfassend hat unsere Forschung wichtige neue Erkenntnisse über den komplexen Prozess der Ribosomenbiogenese geliefert. Diese Erkenntnisse könnten unser Verständnis von Krankheiten wie chronischer lymphatischer Leukämie verbessern und den Weg für neue Ansätze zur zukünftigen Prävention und Behandlung solcher Erkrankungen ebnen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Sebastien Ferreira-Cerca, Universität Regensburg - Deutschland
  • Celia Pilsson-Chastang, Université Toulouse III Paul Sabatier - Frankreich
  • Dieter Kressler, Universität Freiburg - Schweiz

Research Output

  • 54 Zitationen
  • 5 Publikationen
  • 3 Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 1 Weitere Förderungen
Publikationen
  • 2022
    Titel Rbp95 binds to 25S rRNA helix H95 and cooperates with the Npa1 complex during early pre-60S particle maturation
    DOI 10.1093/nar/gkac724
    Typ Journal Article
    Autor Bhutada P
    Journal Nucleic Acids Research
    Seiten 10053-10077
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Effects of Ribosomal Protein S10 Flexible Loop Mutations on Tetracycline and Tigecycline Susceptibility of Escherichia coli
    DOI 10.3389/fmicb.2021.663835
    Typ Journal Article
    Autor Izghirean N
    Journal Frontiers in Microbiology
    Seiten 663835
    Link Publikation
  • 2022
    Titel RNA folding and functions of RNA helicases in ribosome biogenesis
    DOI 10.1080/15476286.2022.2079890
    Typ Journal Article
    Autor Mitterer V
    Journal RNA Biology
    Seiten 781-810
    Link Publikation
  • 2022
    Titel The C-terminal tail of ribosomal protein Rps15 is engaged in cytoplasmic pre-40S maturation
    DOI 10.1080/15476286.2022.2064073
    Typ Journal Article
    Autor Rössler I
    Journal RNA Biology
    Seiten 560-574
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Functional characterization of novel ribosome biogenesis factor Gaf1
    Typ PhD Thesis
    Autor Priya Bhutada
Wissenschaftliche Auszeichnungen
  • 2024
    Titel Best poster prize at RNA 2024 in Edinburgh
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
  • 2023
    Titel Best talk award DocDay Uni and TU Graz
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Regional (any country)
  • 2023
    Titel best poster award at RNA 2023 meeting in Singapour
    Typ Poster/abstract prize
    Bekanntheitsgrad Continental/International
Weitere Förderungen
  • 2022
    Titel Exit The Ribosome
    Typ Research grant (including intramural programme)
    Förderbeginn 2022
    Geldgeber Austrian Science Fund (FWF)

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