Protein O-Glycosylierungskontrolle
Protein O-Glycosylation Checkpoint
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
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Plant Cell Wall,
GPI-anchor,
Proteostasis,
Galactosyltransferase,
O-glycosylation,
Arabinogalactan Proteins
Bei allen Lebensvorgängen in einer Zelle müssen Proteine genau zur richtigen Zeit am richtigen Ort aktiv sein. Viele bekannte und unbekannte molekulare Mechanismen tragen dazu bei, diese Vorgabe zu erfüllen indem sie das Schicksal von einzelnen Proteinen oder Proteinfamilien regulieren. Die meisten Proteine werden nach ihrer Entstehung modifiziert - zum Beispiel durch Anhängen von Zuckergruppen also Glykosylierung. Protein Modifikationen funktionieren manchmal wie Etiketten um zusammen mit anderen Faktoren ein Protein an einen vorgesehenen Wirkungsort zu lotsen oder sein Ablaufdatum zu festzulegen. Wenn Zuckergruppen an Sauerstoffatome eines Proteins gehängt werden spricht man von O- Glykosylierung. Obwohl in jedem höheren Lebewesen hunderte wenn nicht tausende verschiedene Proteine O-glykosyliert sind, weiß man nur wenig über die Funktion dieser Proteinmodifikation. Eine für das Pflanzenreich typische Form der O-Glykosylierung besteht in der Koppelung Zuckergruppen an die Aminosäure Hydroxyprolin. Die Funktion dieser Modifikation ist jedoch kaum erforscht. In diesem Projekt wird erstmals gezielt die mögliche Funktion der O-Glycosylierung für das Schicksal von Proteinen in der Pflanzenzelle untersucht. Erst vor kurzem wurden Enzyme entdeckt welche Zuckerreste an Hydroxyprolin anhängen und genetische Defekte in diesen Enzymen führen zu abnormalem Wurzelwachstum und unvollständiger Samenentwicklung. Identische Entwicklungsdefekte liegen bei einem Fehlen des Zellwandeiweißstoffes FASCICLIN LIKE ARABINOGALACTAN PROTEIN 4 (FLA4) vor. Jüngste Forschungen weisen darauf hin, dass FLA4 O-glykosyliert ist. Somit stellt FLA4 ein ausgezeichnetes Fallbeispiel zur Untersuchung der Funktion der O-Gycosylierung eines definierten Proteins in einem intakten Organismus dar. Tatsächlich zeigen neueste Beobachtungen, dass Defekte im O-Glycosylierungsapparat zu starker Unterdrückung des Gehaltes von FLA4 in der Pflanze und Änderung seines Aufenthaltsortes in der Zelle führen. Es könnte also die O-glycosylierung von FLA4 und anderen Proteinen entscheidenden Einfluss auf deren Lokalisierung und Stabilität und dadurch auf deren Funktion haben. Auf dieser Hypothese beruht dieses Projekt und stellt folgende Fragen. In welchen Zellorganellen wird der Grad der Protein O-Glycosylierung wahrgenommen? Wie wird das Schicksal von Proteinen durch ihre O- Glycosylierung bestimmt? Welche genetischen und biochemischen Prozesse spielen dabei eine Rolle? Antworten auf diese Fragen sollen helfen den hier postulierten "O-glycosylation checkpoint" zu definieren. Mittels genetisch markiertem FLA4 wird in diesem Projekt untersucht welche Struktur die O-gLycosylierung aufweist und wie diese von der Entwicklung abhängt. Danach wird bestimmt in welche Zellorganellen FLA4 in Abhängigkeit seiner O- Glykosylierung transportiert wird und wie es stabilisiert bzw. abgebaut wird. Dies dient einerseits zum Verständnis der Regulation von Wurzelwachstum und Samenentwicklung und andererseits als Grundlage eines für Pflanzen neuartigen Regulationsprozesses durch welchen möglicherweise auch viele andere wichtige Proteine beeinflusst werden. Einsichten in die hier untersuchten grundlegenden zellulären Vorgänge werden zu einem besseren Verständnis von Wachstum und Entwicklung von frei lebenden und von Kulturpflanzen in Zeiten des globalen Klimawandels führen.
Proteine sind ein wichtiger Bestandteil jedes lebenden Organismus. Jedes Protein muss in einer Zelle zur richtigen Zeit an der richtigen Stelle vorhanden sein. Wenn Proteine nicht mehr gebraucht werden oder beschädigt sind werden sie von der Zelle auch wieder entsorgt. Die Mechanismen wie das Schicksal einzelner Proteine reguliert wird gehören zum wichtigsten Grundverständnis von Lebensprozesse. Viele Pflanzenproteine besitzen Markierungen aus Zuckermolekülen, sogenannte Protein Glykosylierungen deren Funktion oft wenig erforscht ist. Eine Gruppe von Glykosylierungen, die zwar sehr häufig vorkommen aber noch wenig erforscht sind, befindet sich auf Arabinogalaktan Proteinen (AGPs). Unser Projekt stellt die Frage ob AGP Glykosylierungen dazu dienen könnten das Schicksal von Proteinen zu markieren, sie zum Beispiel dafür zu markieren von der Zelle ausgesandt oder auch wieder aufgenommen und entsorgt zu werden. Wir haben dabei die Glykosylierung eines bestimmten AGPs namens FLA4, welches das Wurzelwachstum und die Samenentwicklung beeinflusst, genauer untersucht. Wir konnten feststellen, dass sich an einer bestimmten Stelle von FLA4 Glycosylierungen befinden müssen um normal zu funktionieren wobei sich aber überraschenderweise verschiedene Typen der Glycosylierung eignen. Zu den zellulären Prozessen die zur Protein Entsorgung in Abhängigkeit der Glycosylierung beitragen wurden zwei Gene und eine Gruppe Protein abbauender Enzyme identifiziert. Interessanterweise sind aber viele andere Mechanismen die zur Entsorgung anderen Proteinen beteiligt sind für das Schicksal von FLA4 unwichtig. Unsere Arbeit deutet also erstmals auf einen neuen fundamentalen Mechanismus zur Proteinkontrolle bei Pflanzen hin der von AGP Glycosylierung abhängt. Einsichten in dieses Gebiet werden zum besseren Verständnis des Pflanzenwachstums beitragen.
- Markus Pauly, Technische Universität Dortmund - Deutschland
- Michael Held, Ohio University - Vereinigte Staaten von Amerika
- Li Tan, University of Georgia at Athens - Vereinigte Staaten von Amerika
Research Output
- 126 Zitationen
- 14 Publikationen
- 2 Methoden & Materialien
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2021
Titel To be or not to AGP: Intracellular fate of FLA4 is regulated by type II O-glycosylation Typ Conference Proceeding Abstract Autor Seifert G.J. Konferenz 7th International Conference on Plant Cell Wall Biology, June 27 -July 1 2021 (online) -
2021
Titel To be or not to AGP: Intracellular fate of FLA4 is regulated by type II O-glycosylation. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Seifert G.J. Konferenz 6th Latin American Congress of Glycobiology October 5-8 2021 online -
2021
Titel Editorial: Plant Glycobiology - A Sweet World of Glycans, Glycoproteins, Glycolipids, and Carbohydrate-Binding Proteins DOI 10.3389/fpls.2021.751923 Typ Journal Article Autor Seifert G Journal Frontiers in Plant Science Seiten 751923 Link Publikation -
2020
Titel On the Potential Function of Type II Arabinogalactan O-Glycosylation in Regulating the Fate of Plant Secretory Proteins DOI 10.3389/fpls.2020.563735 Typ Journal Article Autor Seifert G Journal Frontiers in Plant Science Seiten 563735 Link Publikation -
2024
Titel Cytosolic UDP-L-arabinose synthesis by bifunctional UDP-glucose 4-epimerases in Arabidopsis DOI 10.1111/tpj.16779 Typ Journal Article Autor Umezawa A Journal The Plant Journal Seiten 508-524 Link Publikation -
2021
Titel Cracking the "Sugar Code": A Snapshot of N- and O-Glycosylation Pathways and Functions in Plants Cells DOI 10.26181/6073d326aa23f Typ Other Autor G Seifert Link Publikation -
2021
Titel Cracking the "Sugar Code": A Snapshot of N- and O-Glycosylation Pathways and Functions in Plants Cells DOI 10.60692/chync-wm274 Typ Other Autor Georg J. Seifert Link Publikation -
2021
Titel Cracking the "Sugar Code": A Snapshot of N- and O-Glycosylation Pathways and Functions in Plants Cells DOI 10.60692/ttmhf-67h27 Typ Other Autor Georg J. Seifert Link Publikation -
2024
Titel Role of O-glycosylation of protein fate of FLA4 (provisional title) Typ PhD Thesis Autor Chaitra Hiremath -
2019
Titel FLA4 acts as a glycan stabilized secreted factor in the control of root elongation. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Seifert G.J. Konferenz XV Cell Wall Meeting 7-12- July 2019 Cambridge, UK -
2021
Titel Cracking the “Sugar Code”: A Snapshot of N- and O-Glycosylation Pathways and Functions in Plants Cells DOI 10.3389/fpls.2021.640919 Typ Journal Article Autor Strasser R Journal Frontiers in Plant Science Seiten 640919 Link Publikation -
2021
Titel The FLA4-FEI Pathway: A Unique and Mysterious Signaling Module Related to Cell Wall Structure and Stress Signaling DOI 10.3390/genes12020145 Typ Journal Article Autor Seifert G Journal Genes Seiten 145 Link Publikation -
2022
Titel To be or not to AGP: Type II arabinogalactan as a tag for protein fate. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Seifert G.J. Konferenz International Conference on Plant Proteostasis 21- 23 September 2022, Madrid, Spain -
2022
Titel To be or not to AGP: Intracellular fate of FLA4 is regulated by type II O-glycosylation. Typ Conference Proceeding Abstract Autor Seifert G.J. Konferenz IX Cell Wall Reseach Conference, 13-17 June 2022, East Lansing Michigan USA
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Titel A tandem GLucM23-mTurq tag is fully functional on GPI-anchored FLA4 but more work is needed for its use in a forward genetic suppressor screen Typ Technology assay or reagent Öffentlich zugänglich -
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Titel Utilization of Nicotiana benthamiana as platform to purify analytically meaningful amounts of recombinant FLA4 from plant tissue Typ Biological samples Öffentlich zugänglich