Evolution von Parasitimus in Plattwürmern
Deep evolutionary genomics of Monogenea
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (80%); Gesundheitswissenschaften (20%)
Keywords
-
Monogenoidea,
Genomics,
Co-Evolution,
Phylogeny,
Parasitology,
Platyhelminthes
Mit geschätzen 40.000 100.000 Arten repräsentieren die Neodermata ein sehr artenreiches Taxon innerhalb der Plattwürmer (Plathelminthes). Die Neodermata umfassen die rein parasitischen Klassen Cestoda (Bandwürmer), Trematoda (Saugwürmer) und Monogenea (Hakensaugwürmer) und sind somit von großer medizinischer, veterinärmedizinischer und auch wirtschaftlicher Bedeutung. Vermutlich repräsentieren die Neodermata die evolutionär erfolgreichste Transition zu Parasitismus im Tierreich. In anderen parasitischen Taxa, wie z.B. den Fadenwürmern (Nematoda), evolvierte Parasitismus an Wirbeltieren mehrfach unabhängig voneinander. Im Gegensatz dazu passierte die Transition zu Parasitismus an Wirbeltieren in den Neodermata vermutlich nur einmal. Die Band- und Saugwürmer sind Endoparasiten, die eine Vielzahl an unterschiedlichen Wirbellosen als Zwischenwirte und Wirbeltiere als Endwirte befallen. Im Gegensatz dazu sind die Hakensaugwürmer vorwiegend Ektoparasiten, die hauptsächlich an aquatisches oder semiaquatisches Wirbeltieren (vor allem Fischen) parasitieren. Der evolutionäre Ursprung der Neodermata und die basalen phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata sind immer noch ungeklärt, obwohl dies zentrale und intensiv beforschte Themen in der rezenteren Forschung zur Plattwurmsystematik sind. Bisherige Forschungsarbeiten basieren entweder auf einzelnen oder einer geringen Anzahl an molekularen Markern, oder, im Fall von phylogenomischen Arbeiten, auf einer sehr geringen Anzahl an Taxa. Genomische Daten sind gegenwärtig v.a. von Band- und Saugwürmern verfügbar, kaum jedoch von Hakensaugwürmern, was insofern erstaunlich ist, da dieses Taxon die wahrscheinlich diverserste Klasse innerhalb der Neodermata repräsentiert. Im Rahmen dieses Projekts sollen nun 50 Genome von Vertretern unterschiedlicher Monogeneenfamilien entschlüsselt werden um, zusammen mit bereits verfügbaren genomischen Daten von Cestoden und Trematoden, sowie anderer nicht parasitischer Plattwürmer, i) die basalen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata und Monogenea zu rekonstruieren, ii) evolutionäre Transitionen in biologisch-ökologischen Merkmalen/Strategien, sowie iii) die zugrunde liegenden genomischen Modifikationen zu entschlüsseln, und iv) auf Co-Speziation von Wirt und Parasit bzw. die Häufigkeit von Wirtswechsel zu testen. Dieses Projekt soll nicht nur neue Erkenntnisse über die phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata (und Monogenea im Speziellen) und die Evolution von Parasitismus in diesem Taxon liefern; die genomischen Daten werden mittel- bis langfristig zudem potentiell die Basis für die Entwicklung von Antihelminthica liefern.
Mit geschätzen 40.000 - 100.000 Arten repräsentieren die Neodermata ein sehr artenreiches Taxon innerhalb der Plattwürmer (Plathelminthes). Die Neodermata umfassen die rein parasitischen Klassen Cestoda (Bandwürmer), Trematoda (Saugwürmer) und Monogenea (Hakensaugwürmer) und sind somit von großer medizinischer, veterinärmedizinischer und auch wirtschaftlicher Bedeutung. Vermutlich repräsentieren die Neodermata die evolutionär erfolgreichste Transition zu Parasitismus im Tierreich. In anderen parasitischen Taxa, wie z.B. den Fadenwürmern (Nematoda), evolvierte Parasitismus an Wirbeltieren mehrfach unabhängig voneinander. Im Gegensatz dazu passierte die Transition zu Parasitismus an Wirbeltieren in den Neodermata vermutlich nur einmal. Die Band- und Saugwürmer sind Endoparasiten, die eine Vielzahl unterschiedlicher Wirbellosen als Zwischenwirte und Wirbeltiere als Endwirte befallen. Im Gegensatz dazu sind die Hakensaugwürmer vorwiegend Ektoparasiten, die hauptsächlich an aquatisches oder semiaquatisches Wirbeltieren (vor allem Fischen) parasitieren. Der evolutionäre Ursprung der Neodermata und die basalen phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata sind umstritten, obwohl diese zentrale und intensiv beforschte Themen in der rezenteren Forschung zur Plattwurmsystematik sind. Bisherige Forschungsarbeiten basieren entweder auf einzelnen oder einer geringen Anzahl an molekularen Markern, oder, im Fall von phylogenomischen Arbeiten, auf einer sehr geringen Anzahl an Taxa. Genomische Daten waren vor Beginn des Projektes v.a. von Band- und Saugwürmern verfügbar, kaum jedoch von Hakensaugwürmern, was insofern erstaunlich ist, da dieses Taxon die wahrscheinlich diverserste Klasse innerhalb der Neodermata repräsentiert. Im Rahmen dieses Projekts sind nun rund 70 mitochondriale- und 40 Kerngenome von Vertretern aus insgesamt 25 Monogeneenfamilien characterisiert und annotiert (identifizieren der Gene innerhalb des Genomes) worden. Hakensaugwuermer sind weltweit verbreitet und das Projekt wurde durch ein globales Netzwerk aus Wissenschafter*innen mit Gewebeproben und taxonomischer Expertise unterstuetzt. Die gewonnenen Daten werden genutzt um, zusammen mit bereits verfügbaren genomischen Daten von parasitischen, sowie anderer nicht parasitischer, Plattwürmer, i) die basalen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata und Monogenea zu rekonstruieren, ii) evolutionäre Transitionen in biologisch-ökologischen Merkmalen/Strategien zu identifizieren, iii) die zugrunde liegenden genomischen Modifikationen zu entschlüsseln, und iv) auf Co-Speziation von Wirt und Parasit bzw. die Häufigkeit von Wirtswechsel zu testen. Erkenntnisse aus diesen Analysen sowie die zugrundeliegenden Daten werden laufend veröffentlicht. Die genomischen Daten werden zudem mittel- bis langfristig (nicht unmittelbares Ziel des Projektes) als Basis für die Entwicklung von Antihelminthica dienen.
- Universität Graz - 100%
- Maarten Vanhove, Universiteit Hasselt - Belgien
- Martin Kasny, Masarykova Univerzita - Tschechien
Research Output
- 43 Zitationen
- 14 Publikationen
- 1 Künstlerischer Output
- 1 Methoden & Materialien
- 5 Datasets & Models
- 1 Software
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2025
Titel First insights into the ectoparasitic helminth fauna of freshwater fish on an Adriatic island DOI 10.1017/s0022149x24000889 Typ Journal Article Autor Škugor T Journal Journal of Helminthology Link Publikation -
2025
Titel Adaptive evolution of stress response genes in parasites aligns with host niche diversity DOI 10.1186/s12915-024-02091-w Typ Journal Article Autor Cruz-Laufer A Journal BMC Biology Seiten 10 Link Publikation -
2025
Titel Monogeneans on exotic Indian freshwater fish. 7. Results of a national study on ornamental fishes from 2019–2022 DOI 10.1051/parasite/2025021 Typ Journal Article Autor Tripathi A Journal Parasite Seiten 28 Link Publikation -
2025
Titel Cichlid fishes are promising underutilized models to investigate helminth-host-microbiome interactions DOI 10.3389/fimmu.2025.1527184 Typ Journal Article Autor Vanhove M Journal Frontiers in Immunology Seiten 1527184 Link Publikation -
2021
Titel Contrasting Host-Parasite Population Structure: Morphology and Mitogenomics of a Parasitic Flatworm on Pelagic Deepwater Cichlid Fishes from Lake Tanganyika DOI 10.3390/biology10080797 Typ Journal Article Autor Kmentová N Journal Biology Seiten 797 Link Publikation -
2022
Titel Ectoparasitism in Polystomatidae (Neodermata, Monogenea): phylogenetic position and mitogenome of Sphyranura euryceae, a parasite of the Oklahoma salamander DOI 10.1101/2022.06.24.497348 Typ Preprint Autor Leeming S Seiten 2022.06.24.497348 Link Publikation -
2024
Titel The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics. DOI 10.1038/s44185-024-00054-6 Typ Journal Article Autor Formenti G Journal npj biodiversity Seiten 28 -
2024
Titel Non-lethal detection of Eubothrium crassum (Cestoda) in farmed Atlantic salmon, Salmo salar, using anal swabs and real-time PCR DOI 10.1111/jfd.13918 Typ Journal Article Autor Hansen H Journal Journal of Fish Diseases Link Publikation -
2024
Titel Deep evolutionary relationships of Monogenea: a window on how parasitic flatworms colonized vertebrate hosts Typ PhD Thesis Autor Samuel Leeming Link Publikation -
2023
Titel An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.21203/rs.3.rs-2679226/v1 Typ Preprint Autor Vorel J Link Publikation -
2024
Titel Understanding the Influence of Host Radiation on Symbiont Speciation through Parasites of Species Flocks. DOI 10.1101/cshperspect.a041450 Typ Journal Article Autor Vanhove M Journal Cold Spring Harbor perspectives in biology -
2023
Titel Phylociraptor – A unified computational framework for reproducible phylogenomic inference DOI 10.1101/2023.09.22.558970 Typ Preprint Autor Resl P Seiten 2023.09.22.558970 Link Publikation -
2023
Titel An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.1186/s12864-023-09461-8 Typ Journal Article Autor Vorel J Journal BMC Genomics Seiten 363 Link Publikation -
2023
Titel Amended diagnosis, mitochondrial genome, and phylogenetic position of Sphyranura euryceae (Neodermata, Monogenea, Polystomatidae), a parasite of the Oklahoma salamander DOI 10.1051/parasite/2023025 Typ Journal Article Autor Leeming S Journal Parasite Seiten 27 Link Publikation
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2024
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Titel Additional file 4 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.6084/m9.figshare.26988442 Typ Image Link Link
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2023
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Titel phylociraptor DOI 10.5281/zenodo.8365887 Typ Improvements to research infrastructure Öffentlich zugänglich Link Link
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2024
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Titel Additional file 1 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.6084/m9.figshare.26988433 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Additional file 2 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.6084/m9.figshare.26988436 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Additional file 3 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.6084/m9.figshare.26988439 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Additional file 5 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.6084/m9.figshare.26988445 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link -
2024
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Titel Additional file 6 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio DOI 10.6084/m9.figshare.26988448 Typ Database/Collection of data Öffentlich zugänglich Link Link
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2023
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Titel reslp/phylociraptor: phylociraptor v1.0.0 DOI 10.5281/zenodo.8365887 Link Link