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Evolution von Parasitimus in Plattwürmern

Deep evolutionary genomics of Monogenea

Christoph Jochen Hahn (ORCID: 0000-0003-4265-4793)
  • Grant-DOI 10.55776/P32691
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 01.10.2019
  • Projektende 30.09.2024
  • Bewilligungssumme 553.108 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (80%); Gesundheitswissenschaften (20%)

Keywords

    Monogenoidea, Genomics, Co-Evolution, Phylogeny, Parasitology, Platyhelminthes

Abstract Endbericht

Mit geschätzen 40.000 100.000 Arten repräsentieren die Neodermata ein sehr artenreiches Taxon innerhalb der Plattwürmer (Plathelminthes). Die Neodermata umfassen die rein parasitischen Klassen Cestoda (Bandwürmer), Trematoda (Saugwürmer) und Monogenea (Hakensaugwürmer) und sind somit von großer medizinischer, veterinärmedizinischer und auch wirtschaftlicher Bedeutung. Vermutlich repräsentieren die Neodermata die evolutionär erfolgreichste Transition zu Parasitismus im Tierreich. In anderen parasitischen Taxa, wie z.B. den Fadenwürmern (Nematoda), evolvierte Parasitismus an Wirbeltieren mehrfach unabhängig voneinander. Im Gegensatz dazu passierte die Transition zu Parasitismus an Wirbeltieren in den Neodermata vermutlich nur einmal. Die Band- und Saugwürmer sind Endoparasiten, die eine Vielzahl an unterschiedlichen Wirbellosen als Zwischenwirte und Wirbeltiere als Endwirte befallen. Im Gegensatz dazu sind die Hakensaugwürmer vorwiegend Ektoparasiten, die hauptsächlich an aquatisches oder semiaquatisches Wirbeltieren (vor allem Fischen) parasitieren. Der evolutionäre Ursprung der Neodermata und die basalen phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata sind immer noch ungeklärt, obwohl dies zentrale und intensiv beforschte Themen in der rezenteren Forschung zur Plattwurmsystematik sind. Bisherige Forschungsarbeiten basieren entweder auf einzelnen oder einer geringen Anzahl an molekularen Markern, oder, im Fall von phylogenomischen Arbeiten, auf einer sehr geringen Anzahl an Taxa. Genomische Daten sind gegenwärtig v.a. von Band- und Saugwürmern verfügbar, kaum jedoch von Hakensaugwürmern, was insofern erstaunlich ist, da dieses Taxon die wahrscheinlich diverserste Klasse innerhalb der Neodermata repräsentiert. Im Rahmen dieses Projekts sollen nun 50 Genome von Vertretern unterschiedlicher Monogeneenfamilien entschlüsselt werden um, zusammen mit bereits verfügbaren genomischen Daten von Cestoden und Trematoden, sowie anderer nicht parasitischer Plattwürmer, i) die basalen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata und Monogenea zu rekonstruieren, ii) evolutionäre Transitionen in biologisch-ökologischen Merkmalen/Strategien, sowie iii) die zugrunde liegenden genomischen Modifikationen zu entschlüsseln, und iv) auf Co-Speziation von Wirt und Parasit bzw. die Häufigkeit von Wirtswechsel zu testen. Dieses Projekt soll nicht nur neue Erkenntnisse über die phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata (und Monogenea im Speziellen) und die Evolution von Parasitismus in diesem Taxon liefern; die genomischen Daten werden mittel- bis langfristig zudem potentiell die Basis für die Entwicklung von Antihelminthica liefern.

Mit geschätzen 40.000 - 100.000 Arten repräsentieren die Neodermata ein sehr artenreiches Taxon innerhalb der Plattwürmer (Plathelminthes). Die Neodermata umfassen die rein parasitischen Klassen Cestoda (Bandwürmer), Trematoda (Saugwürmer) und Monogenea (Hakensaugwürmer) und sind somit von großer medizinischer, veterinärmedizinischer und auch wirtschaftlicher Bedeutung. Vermutlich repräsentieren die Neodermata die evolutionär erfolgreichste Transition zu Parasitismus im Tierreich. In anderen parasitischen Taxa, wie z.B. den Fadenwürmern (Nematoda), evolvierte Parasitismus an Wirbeltieren mehrfach unabhängig voneinander. Im Gegensatz dazu passierte die Transition zu Parasitismus an Wirbeltieren in den Neodermata vermutlich nur einmal. Die Band- und Saugwürmer sind Endoparasiten, die eine Vielzahl unterschiedlicher Wirbellosen als Zwischenwirte und Wirbeltiere als Endwirte befallen. Im Gegensatz dazu sind die Hakensaugwürmer vorwiegend Ektoparasiten, die hauptsächlich an aquatisches oder semiaquatisches Wirbeltieren (vor allem Fischen) parasitieren. Der evolutionäre Ursprung der Neodermata und die basalen phylogenetischen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata sind umstritten, obwohl diese zentrale und intensiv beforschte Themen in der rezenteren Forschung zur Plattwurmsystematik sind. Bisherige Forschungsarbeiten basieren entweder auf einzelnen oder einer geringen Anzahl an molekularen Markern, oder, im Fall von phylogenomischen Arbeiten, auf einer sehr geringen Anzahl an Taxa. Genomische Daten waren vor Beginn des Projektes v.a. von Band- und Saugwürmern verfügbar, kaum jedoch von Hakensaugwürmern, was insofern erstaunlich ist, da dieses Taxon die wahrscheinlich diverserste Klasse innerhalb der Neodermata repräsentiert. Im Rahmen dieses Projekts sind nun rund 70 mitochondriale- und 40 Kerngenome von Vertretern aus insgesamt 25 Monogeneenfamilien characterisiert und annotiert (identifizieren der Gene innerhalb des Genomes) worden. Hakensaugwuermer sind weltweit verbreitet und das Projekt wurde durch ein globales Netzwerk aus Wissenschafter*innen mit Gewebeproben und taxonomischer Expertise unterstuetzt. Die gewonnenen Daten werden genutzt um, zusammen mit bereits verfügbaren genomischen Daten von parasitischen, sowie anderer nicht parasitischer, Plattwürmer, i) die basalen Verwandtschaftsverhältnisse innerhalb der Neodermata und Monogenea zu rekonstruieren, ii) evolutionäre Transitionen in biologisch-ökologischen Merkmalen/Strategien zu identifizieren, iii) die zugrunde liegenden genomischen Modifikationen zu entschlüsseln, und iv) auf Co-Speziation von Wirt und Parasit bzw. die Häufigkeit von Wirtswechsel zu testen. Erkenntnisse aus diesen Analysen sowie die zugrundeliegenden Daten werden laufend veröffentlicht. Die genomischen Daten werden zudem mittel- bis langfristig (nicht unmittelbares Ziel des Projektes) als Basis für die Entwicklung von Antihelminthica dienen.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Graz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Maarten Vanhove, Universiteit Hasselt - Belgien
  • Martin Kasny, Masarykova Univerzita - Tschechien

Research Output

  • 43 Zitationen
  • 14 Publikationen
  • 1 Künstlerischer Output
  • 1 Methoden & Materialien
  • 5 Datasets & Models
  • 1 Software
Publikationen
  • 2025
    Titel First insights into the ectoparasitic helminth fauna of freshwater fish on an Adriatic island
    DOI 10.1017/s0022149x24000889
    Typ Journal Article
    Autor Škugor T
    Journal Journal of Helminthology
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Adaptive evolution of stress response genes in parasites aligns with host niche diversity
    DOI 10.1186/s12915-024-02091-w
    Typ Journal Article
    Autor Cruz-Laufer A
    Journal BMC Biology
    Seiten 10
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Monogeneans on exotic Indian freshwater fish. 7. Results of a national study on ornamental fishes from 2019–2022
    DOI 10.1051/parasite/2025021
    Typ Journal Article
    Autor Tripathi A
    Journal Parasite
    Seiten 28
    Link Publikation
  • 2025
    Titel Cichlid fishes are promising underutilized models to investigate helminth-host-microbiome interactions
    DOI 10.3389/fimmu.2025.1527184
    Typ Journal Article
    Autor Vanhove M
    Journal Frontiers in Immunology
    Seiten 1527184
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Contrasting Host-Parasite Population Structure: Morphology and Mitogenomics of a Parasitic Flatworm on Pelagic Deepwater Cichlid Fishes from Lake Tanganyika
    DOI 10.3390/biology10080797
    Typ Journal Article
    Autor Kmentová N
    Journal Biology
    Seiten 797
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Ectoparasitism in Polystomatidae (Neodermata, Monogenea): phylogenetic position and mitogenome of Sphyranura euryceae, a parasite of the Oklahoma salamander
    DOI 10.1101/2022.06.24.497348
    Typ Preprint
    Autor Leeming S
    Seiten 2022.06.24.497348
    Link Publikation
  • 2024
    Titel The European Reference Genome Atlas: piloting a decentralised approach to equitable biodiversity genomics.
    DOI 10.1038/s44185-024-00054-6
    Typ Journal Article
    Autor Formenti G
    Journal npj biodiversity
    Seiten 28
  • 2024
    Titel Non-lethal detection of Eubothrium crassum (Cestoda) in farmed Atlantic salmon, Salmo salar, using anal swabs and real-time PCR
    DOI 10.1111/jfd.13918
    Typ Journal Article
    Autor Hansen H
    Journal Journal of Fish Diseases
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Deep evolutionary relationships of Monogenea: a window on how parasitic flatworms colonized vertebrate hosts
    Typ PhD Thesis
    Autor Samuel Leeming
    Link Publikation
  • 2023
    Titel An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.21203/rs.3.rs-2679226/v1
    Typ Preprint
    Autor Vorel J
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Understanding the Influence of Host Radiation on Symbiont Speciation through Parasites of Species Flocks.
    DOI 10.1101/cshperspect.a041450
    Typ Journal Article
    Autor Vanhove M
    Journal Cold Spring Harbor perspectives in biology
  • 2023
    Titel Phylociraptor – A unified computational framework for reproducible phylogenomic inference
    DOI 10.1101/2023.09.22.558970
    Typ Preprint
    Autor Resl P
    Seiten 2023.09.22.558970
    Link Publikation
  • 2023
    Titel An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.1186/s12864-023-09461-8
    Typ Journal Article
    Autor Vorel J
    Journal BMC Genomics
    Seiten 363
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Amended diagnosis, mitochondrial genome, and phylogenetic position of Sphyranura euryceae (Neodermata, Monogenea, Polystomatidae), a parasite of the Oklahoma salamander
    DOI 10.1051/parasite/2023025
    Typ Journal Article
    Autor Leeming S
    Journal Parasite
    Seiten 27
    Link Publikation
Künstlerischer Output
  • 2024 Link
    Titel Additional file 4 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.6084/m9.figshare.26988442
    Typ Image
    Link Link
Methoden & Materialien
  • 2023 Link
    Titel phylociraptor
    DOI 10.5281/zenodo.8365887
    Typ Improvements to research infrastructure
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Datasets & Models
  • 2024 Link
    Titel Additional file 1 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.6084/m9.figshare.26988433
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel Additional file 2 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.6084/m9.figshare.26988436
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel Additional file 3 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.6084/m9.figshare.26988439
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel Additional file 5 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.6084/m9.figshare.26988445
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
  • 2024 Link
    Titel Additional file 6 of An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
    DOI 10.6084/m9.figshare.26988448
    Typ Database/Collection of data
    Öffentlich zugänglich
    Link Link
Software
  • 2023 Link
    Titel reslp/phylociraptor: phylociraptor v1.0.0
    DOI 10.5281/zenodo.8365887
    Link Link

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