Analyse von STIM2-Domänen zur Aktivierung von CRAC-Kanälen
Elucidation of STIM2 domains for CRAC channel activation
Wissenschaftsdisziplinen
Biologie (100%)
Keywords
-
Patch Clamp,
CRAC channel Orai,
Stromal Interaction Molecule STIM1,
Store Operated Calcium Channels
Ziel des vorliegenden Projektantrages ist die detaillierte Untersuchung und Analyse von STIM2 Domänen, welche an essentiellen Prozessen des CRAC Kanal Systems beteiligt sind. Verschiedene Mutanten von STIM und Orai Proteinen den Schlüsselproteinen des CRAC Kanal Komplexes führen zu pathophysiologischer Über bzw. Unterfunktion des zellulären Kalzium Einstrom Systems. Diese Mutanten resultieren in einer Vielzahl an Krankheiten und Symptomen wie eine erhöhte Anfälligkeit auf Infektionen, Autoimmunerkrankungen, das Stormorken Syndrom, die Muskelerkrankung Tubular aggregate myopathy (TAM) und der Blutkrankheit York platelet syndrome (YPS). In den vergangenen Jahren wurde das Hauptaugenmerk auf STIM1 und Orai1 gelegt, wobei das homologe Protein STIM2 nicht in äquivalenter Detailliertheit beschrieben wurde, was eine Wissenslücke darstellt. STIM2 ist Teil des CRAC Kanal Komplexes und daher wichtig für zelluläre (Überlebens-) Funktionen. Eine STIM2 Funktionsstörung würde sich somit auch auf den zellulären Kalzium Haushalt auswirken. Somit ist es unabdingbar das Wissen über STIM2 Domänen und deren regulatorische Funktionen zu erweitern. Experimentell werden hierfür humane Zellen (HEK293) verwendet, welche das zu untersuchende Protein exprimieren. Mit Hilfe von biophysikalischen Methoden wie Patch- Clamp und konfokale FRET Mikroskopie sowie molekularbiologischen und biochemischen Methoden werden diese Zellen analysiert. Erkenntnisse über die Struktur-Funktions Beziehung der STIM2 Domänen ermöglichen eine detaillierte Beschreibung des gesunden STIM2 Proteins sowie von pathophysiologisch relevanten STIM2 Mutanten.
Elucidation of regulatory STIM2 domains for CRAC channel activation Mag. Dr. Marc Fahrner Stromal Interaction Molecule (STIM) entspricht einer intrazellulären Proteinfamilie bestehend aus STIM1 und STIM2, wobei es sowohl von STIM1 als auch STIM2 verschiedene zelltypspezifische Isoformen gibt. Der allgemeine Aufbau dieser Proteine ist bei allen Isoformen gleich. STIM Proteine beinhalten einen ER luminalen N-terminalen Anteil, welcher als Kalziumsensor dient. (Das endoplasmatische Retikulum (ER) dient als intrazellulärer Kalziumspeicher, wobei eine Erniedrigung der ER luminalen Kalzium Konzentration das STIM Protein aktiviert). Im Anschluss an den ER luminalen Anteil besitzt STIM eine Transmembrandomäne und in weiterer Folge einen großen zytosolischen C-terminalen Teil. Dieser beinhaltet sogenannte coiled coil Domänen, welche funktionell und strukturell in den vergangenen Jahren gut beschrieben wurden, sowohl im ruhenden als auch aktiven STIM Protein. Aktiviertes STIM verändert seine Konformation sowie die zelluläre Lokalisation und kann dadurch in der Zellperipherie nahe der Plasmamembran den Kalzium-selektiven Kanal Orai, welcher in der Zellmembran sitzt, koppeln und aktivieren. Konsequenterweise strömt Kalzium entlang des elektrochemischen Gradienten vom extrazellulären Raum in das Zytosol der Zelle ein, um dort als Botenstoff (second messenger) zu agieren. Eine intrazelluläre Signalkaskade ist die Folge und letztendlich resultiert eine zelltypspezifische Antwort auf das initiale Signal, welches für die ER Kalziumspeicher Entleerung verantwortlich ist. Insgesamt werden STIM und Orai als jene Schlüsselproteine betrachtet, welche für den speicherabhängigen Kalziumeinstrom in eine Zelle hauptverantwortlich sind. Allgemein wird das System als "Store Operated Calcium Entry" (SOCE) System beschrieben. Da dieses SOCE System in der Mehrheit der humanen Zellen realisiert wird, resultieren STIM- sowie Orai- Mutanten in diversen Krankheiten, je nachdem ob die genetisch kodierte Mutation in STIM oder Orai einen aktivierenden Effekt (gain of function) oder inaktivierenden Effekt (loss of function) zur Folge hat. Die Krankheiten umfassen schwere Immundefizienz (SCID), das Stormorken Syndrom, Tubuläre Aggregat Myopathie, das York Platelet Syndrom und noch mehr. Dabei kann der Krankheitsverlauf von mild bis letal verlaufen. Allgemein ist es von Vorteil den STIM Aktivierungs- / Inaktivierungs- Mechanismus auf molekularer Ebene zu verstehen. Dies wurde im Kontext des physiologischen "wild type" als auch des pathophysiologischen Systems im Zuge des Projekts untersucht. Vor allem die Stormorken Syndrom induzierende STIM1 R304W Variante stand bei manchen unserer projektrelevanten Publikationen im Fokus. Dank der Forschung auf molekularer Ebene steigen die Chancen auf Therapiemöglichkeiten im Kontext der molekularen Medizin. Im vorliegenden Projekt haben wir die Struktur - Funktionsbeziehung von STIM1 auf molekularer Ebene intensiv untersucht und konnten die Ergebnisse in 9 wissenschaftlichen Publikationen darstellen. Meilensteine, welche in STIM1 erreicht wurden, sollen auf STIM2 angewendet werden, um auch diese STIM Variante auf molekularer Ebene zu charakterisieren.
- Universität Linz - 100%
Research Output
- 258 Zitationen
- 23 Publikationen
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2022
Titel Calcium Signals during SARS-CoV-2 Infection: Assessing the Potential of Emerging Therapies DOI 10.3390/cells11020253 Typ Journal Article Autor Berlansky S Journal Cells Seiten 253 Link Publikation -
2020
Titel A series of Orai1 gating checkpoints in transmembrane and cytosolic regions requires clearance for CRAC channel opening: Clearance and synergy of Orai1 gating checkpoints controls pore opening DOI 10.1101/2020.07.16.207183 Typ Preprint Autor Tiffner A Seiten 2020.07.16.207183 Link Publikation -
2019
Titel Sequential activation of STIM1 links Ca2+ with luminal domain unfolding DOI 10.1126/scisignal.aax3194 Typ Journal Article Autor Schober R Journal Science Signaling -
2021
Titel Transmembrane Domain 3 (TM3) Governs Orai1 and Orai3 Pore Opening in an Isoform-Specific Manner DOI 10.3389/fcell.2021.635705 Typ Journal Article Autor Tiffner A Journal Frontiers in Cell and Developmental Biology Seiten 635705 Link Publikation -
2021
Titel Orai1 Boosts SK3 Channel Activation DOI 10.3390/cancers13246357 Typ Journal Article Autor Tiffner A Journal Cancers Seiten 6357 Link Publikation -
2023
Titel Photocrosslinking-induced CRAC channel-like Orai1 activation independent of STIM1 DOI 10.5281/zenodo.7551827 Typ Journal Article Autor Maltan Lena Link Publikation -
2023
Titel Photocrosslinking-induced CRAC channel-like Orai1 activation independent of STIM1 DOI 10.5281/zenodo.7551826 Typ Journal Article Autor Maltan Lena Link Publikation -
2021
Titel The many states of STIM1 DOI 10.7554/elife.75174 Typ Journal Article Autor Fahrner M Journal eLife Link Publikation -
2021
Titel Resonance assignment of coiled-coil 3 (CC3) domain of human STIM1 DOI 10.1007/s12104-021-10042-7 Typ Journal Article Autor Gupta A Journal Biomolecular NMR Assignments Seiten 433-439 Link Publikation -
2021
Titel Commentary to Baraniak et al. “Orai channel C-terminal peptides are key modulators of STIM-Orai coupling and calcium signal generation” published in cell reports 35: 109322. DOI 10.1016/j.ceca.2021.102455 Typ Journal Article Autor Fahrner M Journal Cell Calcium Seiten 102455 -
2021
Titel Defects in the STIM1 SOARa2 domain affect multiple steps in the CRAC channel activation cascade DOI 10.1007/s00018-021-03933-4 Typ Journal Article Autor Höglinger C Journal Cellular and Molecular Life Sciences Seiten 6645-6667 Link Publikation -
2020
Titel Interhelical interactions within the STIM1 CC1 domain modulate CRAC channel activation DOI 10.1038/s41589-020-00672-8 Typ Journal Article Autor Rathner P Journal Nature Chemical Biology Seiten 196-204 Link Publikation -
2020
Titel Oxidative Stress-Induced STIM2 Cysteine Modifications Suppress Store-Operated Calcium Entry DOI 10.1016/j.celrep.2020.108292 Typ Journal Article Autor Gibhardt C Journal Cell Reports Seiten 108292 Link Publikation -
2020
Titel STIM Proteins: An Ever-Expanding Family DOI 10.3390/ijms22010378 Typ Journal Article Autor Grabmayr H Journal International Journal of Molecular Sciences Seiten 378 Link Publikation -
2020
Titel CRAC channel opening is determined by a series of Orai1 gating checkpoints in the transmembrane and cytosolic regions DOI 10.1074/jbc.ra120.015548 Typ Journal Article Autor Tiffner A Journal Journal of Biological Chemistry Seiten 100224 Link Publikation -
2022
Titel Science CommuniCa2+tion Developing Scientific Literacy on Calcium: The Involvement of CRAC Currents in Human Health and Disease DOI 10.3390/cells11111849 Typ Journal Article Autor Humer C Journal Cells Seiten 1849 Link Publikation -
2023
Titel Swing-out opening of stromal interaction molecule 1 DOI 10.1002/pro.4571 Typ Journal Article Autor Horvath F Journal Protein Science Link Publikation -
2023
Titel Photocrosslinking-induced CRAC channel-like Orai1 activation independent of STIM1 DOI 10.1038/s41467-023-36458-4 Typ Journal Article Autor Maltan L Journal Nature Communications Seiten 1286 Link Publikation -
2025
Titel STIM1 transmembrane helix dimerization captured by AI-guided transition path sampling DOI 10.1073/pnas.2506516122 Typ Journal Article Autor Horvath F Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2020
Titel Mechanism of STIM activation DOI 10.1016/j.cophys.2020.07.006 Typ Journal Article Autor Fahrner M Journal Current Opinion in Physiology Seiten 74-79 Link Publikation -
2024
Titel Essential role of N-terminal SAM regions in STIM1 multimerization and function DOI 10.1073/pnas.2318874121 Typ Journal Article Autor Sallinger M Journal Proceedings of the National Academy of Sciences Link Publikation -
2025
Titel STIM1 transmembrane helix dimerization captured by AI-guided transition path sampling DOI 10.1101/2025.03.09.638703 Typ Preprint Autor Horvath F Seiten 2025.03.09.638703 Link Publikation -
2023
Titel A single amino acid deletion in the ER Ca2+ sensor STIM1 reverses the in vitro and in vivo effects of the Stormorken syndrome-causing R304W mutation. DOI 10.1126/scisignal.add0509 Typ Journal Article Autor Gamage Th Journal Science signaling