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Analyse von STIM2-Domänen zur Aktivierung von CRAC-Kanälen

Elucidation of STIM2 domains for CRAC channel activation

Marc Nikolaus Roger Fahrner (ORCID: 0000-0002-2689-0158)
  • Grant-DOI 10.55776/P32947
  • Förderprogramm Einzelprojekte
  • Status beendet
  • Projektbeginn 16.10.2019
  • Projektende 15.10.2023
  • Bewilligungssumme 395.026 €

Wissenschaftsdisziplinen

Biologie (100%)

Keywords

    Patch Clamp, CRAC channel Orai, Stromal Interaction Molecule STIM1, Store Operated Calcium Channels

Abstract Endbericht

Ziel des vorliegenden Projektantrages ist die detaillierte Untersuchung und Analyse von STIM2 Domänen, welche an essentiellen Prozessen des CRAC Kanal Systems beteiligt sind. Verschiedene Mutanten von STIM und Orai Proteinen den Schlüsselproteinen des CRAC Kanal Komplexes führen zu pathophysiologischer Über bzw. Unterfunktion des zellulären Kalzium Einstrom Systems. Diese Mutanten resultieren in einer Vielzahl an Krankheiten und Symptomen wie eine erhöhte Anfälligkeit auf Infektionen, Autoimmunerkrankungen, das Stormorken Syndrom, die Muskelerkrankung Tubular aggregate myopathy (TAM) und der Blutkrankheit York platelet syndrome (YPS). In den vergangenen Jahren wurde das Hauptaugenmerk auf STIM1 und Orai1 gelegt, wobei das homologe Protein STIM2 nicht in äquivalenter Detailliertheit beschrieben wurde, was eine Wissenslücke darstellt. STIM2 ist Teil des CRAC Kanal Komplexes und daher wichtig für zelluläre (Überlebens-) Funktionen. Eine STIM2 Funktionsstörung würde sich somit auch auf den zellulären Kalzium Haushalt auswirken. Somit ist es unabdingbar das Wissen über STIM2 Domänen und deren regulatorische Funktionen zu erweitern. Experimentell werden hierfür humane Zellen (HEK293) verwendet, welche das zu untersuchende Protein exprimieren. Mit Hilfe von biophysikalischen Methoden wie Patch- Clamp und konfokale FRET Mikroskopie sowie molekularbiologischen und biochemischen Methoden werden diese Zellen analysiert. Erkenntnisse über die Struktur-Funktions Beziehung der STIM2 Domänen ermöglichen eine detaillierte Beschreibung des gesunden STIM2 Proteins sowie von pathophysiologisch relevanten STIM2 Mutanten.

Elucidation of regulatory STIM2 domains for CRAC channel activation Mag. Dr. Marc Fahrner Stromal Interaction Molecule (STIM) entspricht einer intrazellulären Proteinfamilie bestehend aus STIM1 und STIM2, wobei es sowohl von STIM1 als auch STIM2 verschiedene zelltypspezifische Isoformen gibt. Der allgemeine Aufbau dieser Proteine ist bei allen Isoformen gleich. STIM Proteine beinhalten einen ER luminalen N-terminalen Anteil, welcher als Kalziumsensor dient. (Das endoplasmatische Retikulum (ER) dient als intrazellulärer Kalziumspeicher, wobei eine Erniedrigung der ER luminalen Kalzium Konzentration das STIM Protein aktiviert). Im Anschluss an den ER luminalen Anteil besitzt STIM eine Transmembrandomäne und in weiterer Folge einen großen zytosolischen C-terminalen Teil. Dieser beinhaltet sogenannte coiled coil Domänen, welche funktionell und strukturell in den vergangenen Jahren gut beschrieben wurden, sowohl im ruhenden als auch aktiven STIM Protein. Aktiviertes STIM verändert seine Konformation sowie die zelluläre Lokalisation und kann dadurch in der Zellperipherie nahe der Plasmamembran den Kalzium-selektiven Kanal Orai, welcher in der Zellmembran sitzt, koppeln und aktivieren. Konsequenterweise strömt Kalzium entlang des elektrochemischen Gradienten vom extrazellulären Raum in das Zytosol der Zelle ein, um dort als Botenstoff (second messenger) zu agieren. Eine intrazelluläre Signalkaskade ist die Folge und letztendlich resultiert eine zelltypspezifische Antwort auf das initiale Signal, welches für die ER Kalziumspeicher Entleerung verantwortlich ist. Insgesamt werden STIM und Orai als jene Schlüsselproteine betrachtet, welche für den speicherabhängigen Kalziumeinstrom in eine Zelle hauptverantwortlich sind. Allgemein wird das System als "Store Operated Calcium Entry" (SOCE) System beschrieben. Da dieses SOCE System in der Mehrheit der humanen Zellen realisiert wird, resultieren STIM- sowie Orai- Mutanten in diversen Krankheiten, je nachdem ob die genetisch kodierte Mutation in STIM oder Orai einen aktivierenden Effekt (gain of function) oder inaktivierenden Effekt (loss of function) zur Folge hat. Die Krankheiten umfassen schwere Immundefizienz (SCID), das Stormorken Syndrom, Tubuläre Aggregat Myopathie, das York Platelet Syndrom und noch mehr. Dabei kann der Krankheitsverlauf von mild bis letal verlaufen. Allgemein ist es von Vorteil den STIM Aktivierungs- / Inaktivierungs- Mechanismus auf molekularer Ebene zu verstehen. Dies wurde im Kontext des physiologischen "wild type" als auch des pathophysiologischen Systems im Zuge des Projekts untersucht. Vor allem die Stormorken Syndrom induzierende STIM1 R304W Variante stand bei manchen unserer projektrelevanten Publikationen im Fokus. Dank der Forschung auf molekularer Ebene steigen die Chancen auf Therapiemöglichkeiten im Kontext der molekularen Medizin. Im vorliegenden Projekt haben wir die Struktur - Funktionsbeziehung von STIM1 auf molekularer Ebene intensiv untersucht und konnten die Ergebnisse in 9 wissenschaftlichen Publikationen darstellen. Meilensteine, welche in STIM1 erreicht wurden, sollen auf STIM2 angewendet werden, um auch diese STIM Variante auf molekularer Ebene zu charakterisieren.

Forschungsstätte(n)
  • Universität Linz - 100%
Internationale Projektbeteiligte
  • Mitsuhiko Ikura, University of Toronto - Kanada

Research Output

  • 258 Zitationen
  • 23 Publikationen
Publikationen
  • 2022
    Titel Calcium Signals during SARS-CoV-2 Infection: Assessing the Potential of Emerging Therapies
    DOI 10.3390/cells11020253
    Typ Journal Article
    Autor Berlansky S
    Journal Cells
    Seiten 253
    Link Publikation
  • 2020
    Titel A series of Orai1 gating checkpoints in transmembrane and cytosolic regions requires clearance for CRAC channel opening: Clearance and synergy of Orai1 gating checkpoints controls pore opening
    DOI 10.1101/2020.07.16.207183
    Typ Preprint
    Autor Tiffner A
    Seiten 2020.07.16.207183
    Link Publikation
  • 2019
    Titel Sequential activation of STIM1 links Ca2+ with luminal domain unfolding
    DOI 10.1126/scisignal.aax3194
    Typ Journal Article
    Autor Schober R
    Journal Science Signaling
  • 2021
    Titel Transmembrane Domain 3 (TM3) Governs Orai1 and Orai3 Pore Opening in an Isoform-Specific Manner
    DOI 10.3389/fcell.2021.635705
    Typ Journal Article
    Autor Tiffner A
    Journal Frontiers in Cell and Developmental Biology
    Seiten 635705
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Orai1 Boosts SK3 Channel Activation
    DOI 10.3390/cancers13246357
    Typ Journal Article
    Autor Tiffner A
    Journal Cancers
    Seiten 6357
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Photocrosslinking-induced CRAC channel-like Orai1 activation independent of STIM1
    DOI 10.5281/zenodo.7551827
    Typ Journal Article
    Autor Maltan Lena
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Photocrosslinking-induced CRAC channel-like Orai1 activation independent of STIM1
    DOI 10.5281/zenodo.7551826
    Typ Journal Article
    Autor Maltan Lena
    Link Publikation
  • 2021
    Titel The many states of STIM1
    DOI 10.7554/elife.75174
    Typ Journal Article
    Autor Fahrner M
    Journal eLife
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Resonance assignment of coiled-coil 3 (CC3) domain of human STIM1
    DOI 10.1007/s12104-021-10042-7
    Typ Journal Article
    Autor Gupta A
    Journal Biomolecular NMR Assignments
    Seiten 433-439
    Link Publikation
  • 2021
    Titel Commentary to Baraniak et al. “Orai channel C-terminal peptides are key modulators of STIM-Orai coupling and calcium signal generation” published in cell reports 35: 109322.
    DOI 10.1016/j.ceca.2021.102455
    Typ Journal Article
    Autor Fahrner M
    Journal Cell Calcium
    Seiten 102455
  • 2021
    Titel Defects in the STIM1 SOARa2 domain affect multiple steps in the CRAC channel activation cascade
    DOI 10.1007/s00018-021-03933-4
    Typ Journal Article
    Autor Höglinger C
    Journal Cellular and Molecular Life Sciences
    Seiten 6645-6667
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Interhelical interactions within the STIM1 CC1 domain modulate CRAC channel activation
    DOI 10.1038/s41589-020-00672-8
    Typ Journal Article
    Autor Rathner P
    Journal Nature Chemical Biology
    Seiten 196-204
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Oxidative Stress-Induced STIM2 Cysteine Modifications Suppress Store-Operated Calcium Entry
    DOI 10.1016/j.celrep.2020.108292
    Typ Journal Article
    Autor Gibhardt C
    Journal Cell Reports
    Seiten 108292
    Link Publikation
  • 2020
    Titel STIM Proteins: An Ever-Expanding Family
    DOI 10.3390/ijms22010378
    Typ Journal Article
    Autor Grabmayr H
    Journal International Journal of Molecular Sciences
    Seiten 378
    Link Publikation
  • 2020
    Titel CRAC channel opening is determined by a series of Orai1 gating checkpoints in the transmembrane and cytosolic regions
    DOI 10.1074/jbc.ra120.015548
    Typ Journal Article
    Autor Tiffner A
    Journal Journal of Biological Chemistry
    Seiten 100224
    Link Publikation
  • 2022
    Titel Science CommuniCa2+tion Developing Scientific Literacy on Calcium: The Involvement of CRAC Currents in Human Health and Disease
    DOI 10.3390/cells11111849
    Typ Journal Article
    Autor Humer C
    Journal Cells
    Seiten 1849
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Swing-out opening of stromal interaction molecule 1
    DOI 10.1002/pro.4571
    Typ Journal Article
    Autor Horvath F
    Journal Protein Science
    Link Publikation
  • 2023
    Titel Photocrosslinking-induced CRAC channel-like Orai1 activation independent of STIM1
    DOI 10.1038/s41467-023-36458-4
    Typ Journal Article
    Autor Maltan L
    Journal Nature Communications
    Seiten 1286
    Link Publikation
  • 2025
    Titel STIM1 transmembrane helix dimerization captured by AI-guided transition path sampling
    DOI 10.1073/pnas.2506516122
    Typ Journal Article
    Autor Horvath F
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2020
    Titel Mechanism of STIM activation
    DOI 10.1016/j.cophys.2020.07.006
    Typ Journal Article
    Autor Fahrner M
    Journal Current Opinion in Physiology
    Seiten 74-79
    Link Publikation
  • 2024
    Titel Essential role of N-terminal SAM regions in STIM1 multimerization and function
    DOI 10.1073/pnas.2318874121
    Typ Journal Article
    Autor Sallinger M
    Journal Proceedings of the National Academy of Sciences
    Link Publikation
  • 2025
    Titel STIM1 transmembrane helix dimerization captured by AI-guided transition path sampling
    DOI 10.1101/2025.03.09.638703
    Typ Preprint
    Autor Horvath F
    Seiten 2025.03.09.638703
    Link Publikation
  • 2023
    Titel A single amino acid deletion in the ER Ca2+ sensor STIM1 reverses the in vitro and in vivo effects of the Stormorken syndrome-causing R304W mutation.
    DOI 10.1126/scisignal.add0509
    Typ Journal Article
    Autor Gamage Th
    Journal Science signaling

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